Bu çalışma Finlandiya Akademisi'nden [315948, 314387'den N.K.'ye] hibelerle desteklendi; Sigrid Jusélius Vakfı [N.K., J.T.'ye]; Emil Aaltonen Vakfı [J.-A.M., T.L.]; Turku Moleküler Tıp Doktora Programı [S.C.-M., O.O.].

Laboratuvar farelerinin bakımı ve tüm hayvan deneyleri Türkü Üniversitesi'nde laboratuvar hayvanlarının bakımı ve kullanımına yönelik ilgili kılavuz ve yönetmeliklere uygun olarak yapılmıştır.
1. Mikrodisseksiyon için seminifer tübüllerin hazırlanması
<ol><li>Co 2 boğulması ve ardından servikal çıkık yoluyla yetişkin bir erkek fareyi (≥8 haftalık, suş ve yaşa bağlı olarak testis80-120 mg) kurban edin. NOT: Fare cinsel olarak olgun ve tercihen en az 8 haftalık olmalıdır. Yavru farelerin transilluminasyon deseni yetişkinden farklıdır, çünkü seminifer epitel dalgası henüz tam olarak belirlenmemiştir ve ilk spermatogenez dalgasının zamanlaması21,22 'dir. <4 haftalık erkek farelerde uzun süreli spermatid eksikliği, transilluminasyon destekli mikrodiseksiyon için kullanımlarını engeller. Normal spermatogenez içeren tüm fare suşları kullanılabilir.</li>
	<li>Ventral karına% 70 etanol püskürtün. Abdominopelvic boşluğunu steril makas kullanarak açın, V şeklinde bir açıklık açın.</li>
	<li>Epididimal yağ yastığını steril epekslerle çekerek testisleri bulun, makas kullanarak parçalara ayırın ve PBS içeren steril 100 mm Petri kabına yerleştirin. NOT: Steriliteyi korumak için tüm labware ve cerrahi aletlerin steril olduğundan emin olun.</li>
	<li>İnce uçlu makas kullanarak testisleri kapsülleyen kalın lifli levha olan tunica albuginea'dabir yarık keserek testislerin başını koparın. Sonra bir çift yaban arısı kullanarak tunicayı yırtın. Tübülleri tokalarla bastırarak dışarı çıkmaya zorlayın ve tunicayı atın. NOT: Tunica atılırken, arteri testislerinin tunica ile birlikte çıkarılması bazı aşağı akış uygulamaları için yararlı olabilir. Seminifer tübüllere zarar vermekten kaçının.</li>
	<li>Seminifer tübülleri yeni bir Petri kabına taşıyın ve Petri kabının altını kaplayacak kadar steril PBS dökün. Daha sonra, tübülleri yavaşça ayırın, ancak tübüllere zarar vermekten kaçının. NOT: Çok fazla mekanik stres transilluminasyon paternini etkileyecek ve dokunun canlılığını ve hücresel mimarisini etkileyecektir. Tübüller ayrıca bu noktadan itibaren tüm montajlı immünostainingler için evreleme olmadan işlenebilir (3B). Bazen SALL4, c-KIT ve DNMT3A18,23gibi spermatogonianın ayırt edilmesinde ifade edilen proteinlere karşı antikorları dahil ederek aşamayı retrospektif olarak tanımlamak yeterlidir. Spermatogonia yoğunluğu nispeten güvenilir bir aşama göstergesidir (Şekil 2).</li>
</ol>2. Transilluminasyon destekli mikrodiseksiyon
<ol><li>Petri kabını sahneye bantlayarak sıkıca bir diseksiyon mikroskobu altına yerleştirin. NOT: Toplanan kademeli seminifer tübül segmentlerinin karıştırılmasına neden olabilecek hareketini önlemek için Petri kabını iyi bantlamak önemlidir.</li>
	<li>Odak altındaki seminifer tübüllerin ışık emme desenini ortaya çıkarmak için, numunenin aşağıdan aydınlatıldığından ve ışığın numuneden geçtiğinden, yanitransilüme olduğundan emin olun. NOT: Emilen / saçılan ışık miktarı, uzun spermatidlerdeki kromatin yoğuşma seviyesine ve seminifer tübül içindeki tomurcuklanmalarına göredir: ne kadar yoğun olursa, o kadar fazla ışık emilir, yanidaha koyu görünür.</li>
	<li>İnce tokalar kullanarak tübül demetlerini dikkatlice hareket ettirerek Şekil 2, Şekil 5A ve Şekil S1'de açıklandığı gibi farklı aşamaların ışık emme desenini tanıyın. NOT: Aşamalar her zaman birbirini mantıksal bir düzende takip ederek seminifer epitel dalgasını oluşturur. Bununla birlikte, spermatojenik dalganın yönünün zaman zaman tersine döndüğünü ve daha sonra tekrar geri döndüğünü bilmek önemlidir (modülasyonlar olarak da bilinir4,9), bazen prosedürü zorlaştırır. Ayrıca, her aşamanın uzunluğu, kaç mm tübül açısından önemli ölçüde değişir.</li>
	<li>Kancalı uçlu önseçimleri kullanarak ilgi borularını dikkatlice kaldırın ve ardından mikrodiseksiyon makası kullanarak uygun uzunlukta bir segment kesin (bkz. Ek Video 1). Yabanatı ucundaki bir kanca, bir tübül kaldırmayı ve tutmayı kolaylaştırır ve sıkmaktan kaçınmaya yardımcı olur. NOT: Kesilecek parçaların uzunluğu aşağı akış uygulamalarına bağlıdır. Protein veya RNA analizi12 , 13(II–V, VII–VIII ve IX–XI, Şekil 5B)için belirli bir aşamanın havuzlu tübüle parçalarının toplanması için uzunluk tipik olarak 2-5 mm'dir. Standart fenol-kloroform ekstraksiyonu kullanıldığında, 1 mm tübülden yaklaşık 200 ng RNA elde edilebilir. Kademeli tübül parçalarının tam montajlı boyanması için, parçaların uzunluğu >5 mm olmalıdır. Kabak preparatları için segmentlerin uzunluğu 1-2 mm'yi geçmemelidir, çünkü segmentin ortasındaki hücreler çok uzunsa çıkamayabilir. Boru uzunluğunun doğru ölçümü için Petri kabının altında bir mm ölçek kullanın.</li>
</ol>3. Farklı preparatların immünostaining
<ol><li>Kabak hazırlama: aşama doğrulaması ve immünostaining NOT: Aşamaya özgü tübül parçaları, faz kontrastlı mikroskopi ve sonraki immünostaining ile canlı hücrelerin morfolojik analizini yapmak için bir kapak camı ile mikroskop kaydırağı üzerinde ezilebilir. Transillumination destekli mikrodiseksiyon yöntemi ile tanışırken aşamaları doğrulamak için yeni başlayanların bu yaklaşımı kullanması önerilir.<ol>
<li>Segmenti pipet kullanarak 10 μL hacimde toplayın ve mikroskop slaydına taşıyın.</li>
		<li>Tübül üzerine dikkatlice bir kapak camı (20 mm x 20 mm) yerleştirerek tübülleri ezin. Sonuç olarak, hücreler tübülden akacak ve canlı hücreli bir monolayer oluşturacaktır. Hücrelerin yayılmasını kolaylaştırmak için kapak camının kenarına bir filtre kağıdı yerleştirin. Hücreleri hayatta tutmak için çok fazla ezmekten kaçının.</li>
		<li>Mikroskop altında yayılan hücreyi izleyin. Mevcut hücre tiplerini inceleyerek sahne tanımayı doğrulamak için 40x hedefinde bir faz kontrastı mikroskobu kullanın (Şekil 2, Şekil S2).</li>
		<li>Hücreler tübüllerin her iki ucundan yuvarlak bir monolayer oluşturmak için yayıldıktan sonra, kaydırağı forsepsle tutarken sıvı azot içeren bir kaba batırın. 10 sn su altında tutun. Alternatif olarak, kaydırağı donmak için kuru bir buz plakasına yerleştirin.</li>
		<li>Kapak camını neşter kullanarak kapatarak çıkarın.</li>
		<li>Gecikmeden, sabitleme işlemine devam edin ve slaydı 2-5 dakika boyunca% 90 etanol içeren bir kaba hızlı bir şekilde yerleştirin. NOT: % 90 etanol'e yerleştirmeden önce kabak hazırlığının çözülmediğinden emin olun. Aseton gibi diğer fiksatifler de 10 dakika boyunca kullanılabilir.</li>
		<li>Hava kurutun ve oda sıcaklığında (RT) (bazı günlere kadar) veya -80 °C'de (uzun süreli) saklayın.</li>
		<li>İmmün yetinme için, örnekleri RT'de 10 dakika boyunca% 4 paraformaldehitte (PFA) düzeltin.</li>
		<li>PBS'de durulayın ve PBS'de %0,1 Triton X-100 ile 5 dakika geçirgenlik sağlar.</li>
		<li>PBS'de durulayın ve her kabak örneğinin etrafına bir gres halkası çizin.</li>
		<li>Gres halkasının içine PBS'de (PBST) %0,1 Araya %10 BSA (sığır serum albümini) 50–100 μL ekleyin ve RT'de 30 dakika boyunca örnekleri engelleyin.</li>
		<li>BSA çözeltisini çıkarın ve PBST'de % 10 BSA'da seyreltilmiş birincil antikorla RT'de 1 saat boyunca kuluçkaya yatırın.</li>
		<li>PBST ile 5 dakika boyunca 3x yıkayın.</li>
		<li>PBST'de %10 BSA'da seyreltilmiş ikincil bir antikor ile kuluçkaya yatır. NOT: Acrosomes leke için, örnekler rhodamin etiketli Yer fıstığı agglutinin antikoru (PNA, 1:1000) ile pbst%10 BSA'da 1 saat rt(Şekil S3)yerine spesifik primer ve sekonder antikorlar yerine inkübe edilebilir.</li>
		<li>PBST ile her biri 5 dakika boyunca 3x yıkayın, PBS ile durulayın ve DAPI içeren bir montajcı ile monte edin.</li>
	</ol></li>
	<li>Seminifer tübüllerin tüm montajlı immünostainingi NOT: Aşağıdaki protokol, aşamalı (adım 2.4'ten itibaren) tübül segmentleri için tam montajlı boyamayı açıklar. Bir araştırmacı evreleme yapmadan tam montajlı boyama yapmak istiyorsa (adım 1.5'ten itibaren), 3.2.1 ve 3.2.7'deki notlara dikkat edin.<ol>
<li>Pipet kullanarak, tübül parçalarını (adım 2.4'ten itibaren) buz gibi PBS'deki 15 mL konik bir tüpe aktarın ve buz üzerinde tortulanmalarını sağlar. NOT: 1,5.'den itibaren etiketlenmemiş tübüller kullanıyorsanız, bir Petri kabındaki tübülleri birkaç kez eğik bir tabağa borulayarak ayırın. Kesik uçlu 1 mL pipet kullanın. Bu adım, dokunun yapısını açmak için tasarlanmıştır. Ancak, tübüllere zarar verebileceğinden çok fazla pipetlemeden kaçının. Tübüllerin çökeltilmesi birkaç saniye sürecektir. Küçük tübül parçaları, interstisyel hücreler ve hücre kalıntıları süpernatantta kalır.</li>
		<li>Borulama veya aspiratör ile süpernatant (SN) dikkatlice çıkarın. 10 mL buz gibi PBS ekleyin ve ters çevrilerek karıştırın.</li>
		<li>Tortuya izin verin ve daha önce olduğu gibi SN'yi çıkarın.</li>
		<li>%4 PFA'nın 5 mL'sini ekleyin ve +4 °C'de dönen bir masaya (20-30 rpm) 5 saat sabitleyin. NOT: Fiksasyon süresi, ilgi çekici proteinlere ve bunların hücre altı lokalizasyonuna bağlıdır. Nükleer ve sitoplazmik proteinler için, 2 saat fiksasyon tipik olarak yeterlidir, ancak GFRα1 (GDNF aile reseptörü alfa 1; Şekil 6A,B), 6 saate kadar daha uzun bir fiksasyondan yararlanın.</li>
		<li>Tortuya izin verin, SN'yi (PFA) daha önce olduğu gibi çıkarın ve 10 mL PBS ekleyerek ve tüpü ters çevirerek kısa bir süre durulayın.</li>
		<li>Tortuya izin verin, SN'yi daha önce olduğu gibi çıkarın ve PBS yıkama adımını +4 °C'de dönen bir masada her biri en az 10 dakika boyunca üç kez tekrarlayın ve boyamaya devam edin veya +4 °C'de saklayın. NOT: Çalışma koşulları sterilse ve temizlenirse numuneler en az birkaç hafta saklanabilir ve kullanılabilir. Alternatif olarak, +4 °C'de depolamadan önce tübüllerin korunmasına yardımcı olmak için% 2 stok çözeltisinden% 0.02 (w / v) nihai konsantrasyona Sodyum Azide ekleyin.</li>
		<li>1 mL pipet kullanarak, 10-20 sabit boru segmentini 2 mL yuvarlak tabanlı bir tüpe taşıyın. Tortuya izin verin ve SN'yi çıkarın. NOT: Sahnelendirilmemiş uzun tübüllerle çalışıyorsanız, tübülleri bir Petri kabına dökün ve mikrodiseksiyon makası ve yaklaşık 5-20 mm'lik kesme parçaları kullanarak. Boyama işlemi sırasında çok uzun segmentler karışırken, çok kısa segmentler kolayca kaybolur.</li>
		<li>PBS'de (PBSX) %0,3 Triton X-100'e %2 BSA + %10 FBS (fetal sığır serumu) 1 mL ekleyin. RT'de dönen bir masada (20-30 rpm) en az 1 saat boyunca bloklayın.</li>
		<li>1 mL PBSX ile durulayın, pipetleme ile SN'yi çıkarın ve PBSX'te % 1 BSA'da seyreltilmiş 250 μL birincil antikor ekleyin (1:100–1:2000 seyreltme). RT'de 2 saat veya dönen bir masada (20-30 rpm) +4 °C'de gece boyunca kuluçkaya yatırın.</li>
		<li>Antikor çözeltisini pipetleme ile çıkarın ve tübülleri yukarıdaki gibi 1 mL PBSX ile durulayın. PBSX'te RT'de dönen bir masada (20-30 rpm) 1 saat boyunca üç kez yıkayın. NOT: Bu ilk yıkamadan sonra numune gerekirse gece boyunca +4 °C'de bırakılabilir.</li>
		<li>SN'yi çıkarın ve PBSX'te % 1 BSA'da seyreltilmiş 250 μL ikincil antikor ekleyin (tipik olarak floresan etiketli bir antikorun 1:500 seyreltilmesi). Folyoya örtün ve 1 saat boyunca RT'de dönen bir masada (20-30 rpm) kuluçkaya yatırın.</li>
		<li>3.2.10'ı tekrarlayın.</li>
		<li>Son olarak SN'yi çıkarın ve tübülleri bir mikroskop slaydına dökün. Jel yükleme uçlarını kullanarak tübülleri doğrusal şeritler halinde hafifçe ayırın ve düzenleyin. Fazla tamponu boşaltın ve montaj ortamı ve kapak kılıfı ekleyin. NOT: Tübülleri düzenlerken kurutmaktan kaçının. Çekirdeklerin DAPI ile karşı lekelenmesi çoğu durumda gerekli değildir. Numunenin kurumasını ve bozulmasını önlemek için kapak kapağının kenarını oje ile kapatın. Slaytlar görüntülemeden önce +4 °C'de 1-2 hafta saklanabilir.</li>
	</ol></li>
</ol>

<ol>
	<li>M&#228;kel&#228;, J. A., Toppari, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Testis+Physiology:+Seminiferous+Cycle.">Testis Physiology: Seminiferous Cycle.</a> Encyclopedia of Reproduction. , (2018).</li><li>Oakberg, E. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Duration+of+spermatogenesis+in+the+mouse+and+timing+of+stages+of+the+cycle+of+the+seminiferous+epithelium.">Duration of spermatogenesis in the mouse and timing of stages of the cycle of the seminiferous epithelium.</a> The American Journal of Anatomy. 99 (3), 507-516 (1956).</li><li>Clermont, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kinetics+of+spermatogenesis+in+mammals:+seminiferous+epithelium+cycle+and+spermatogonial+renewal.">Kinetics of spermatogenesis in mammals: seminiferous epithelium cycle and spermatogonial renewal.</a> Physiological Reviews. 52 (1), 198-236 (1972).</li><li>Perey, B., Clermont, Y., Leblond, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+wave+of+the+seminiferous+epithelium+in+the+rat.">The wave of the seminiferous epithelium in the rat.</a> American Journal of Anatomy. 108 (1), 47-77 (1961).</li><li>de Lima e Martins Lara, N., Costa, G., Avelar, G., Lacerda, S., Hess, R., Fran&#231;a, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Testis+Physiology-Overview+and+Histology.">Testis Physiology-Overview and Histology.</a> Encyclopedia of Reproduction. , (2018).</li><li>Leblond, C. P., Clermont, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Definition+of+the+stages+of+the+cycle+of+the+seminiferous+epithelium+in+the+rat.">Definition of the stages of the cycle of the seminiferous epithelium in the rat.</a> Annals of the New York Academy of Sciences. 55 (4), 548-573 (1952).</li><li>Parvinen, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulation+of+the+seminiferous+epithelium.">Regulation of the seminiferous epithelium.</a> Endocrine Reviews. 3 (4), 404-417 (1982).</li><li>Kotaja, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preparation,+isolation+and+characterization+of+stage-specific+spermatogenic+cells+for+cellular+and+molecular+analysis.">Preparation, isolation and characterization of stage-specific spermatogenic cells for cellular and molecular analysis.</a> Nature Methods. 1 (3), 249-254 (2004).</li><li>Nakata, H., Sonomura, T., Iseki, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Three-dimensional+analysis+of+seminiferous+tubules+and+spermatogenic+waves+in+mice.">Three-dimensional analysis of seminiferous tubules and spermatogenic waves in mice.</a> Reproduction. 154 (5), 569-579 (2017).</li><li>Russell, L. D., Ettlin, R. A., SinhaHikim, A. P., Clegg, E. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Histological and histopathological evaluation of the testis. , (1990).</li><li>Parvinen, M., Hecht, N. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+living+spermatogenic+cells+of+the+mouse+by+transillumination-phase+contrast+microscopic+technique+for+"in+situ"+analyses+of+DNA+polymerase+activities.">Identification of living spermatogenic cells of the mouse by transillumination-phase contrast microscopic technique for "in situ" analyses of DNA polymerase activities.</a> Histochemistry. 71 (4), 567-579 (1981).</li><li>Ventel&#228;, S., M&#228;kel&#228;, J. A., Kulmala, J., Westermarck, J., Toppari, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+and+regulation+of+a+stage-specific+stem+cell+niche+enriched+by+Nanog-positive+spermatogonial+stem+cells+in+the+mouse+testis.">Identification and regulation of a stage-specific stem cell niche enriched by Nanog-positive spermatogonial stem cells in the mouse testis.</a> Stem Cells. 30 (5), 1008-1020 (2012).</li><li>Faisal, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transcription+factor+USF1+is+required+for+maintenance+of+germline+stem+cells+in+male+mice.">Transcription factor USF1 is required for maintenance of germline stem cells in male mice.</a> Endocrinology. 160 (5), 1119-1136 (2019).</li><li>Wright, W. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+stage-specific+proteins+synthesized+by+rat+seminiferous+tubules.">Identification of stage-specific proteins synthesized by rat seminiferous tubules.</a> Biology of Reproduction. 29 (1), 257-270 (1983).</li><li>Johnston, D. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stage-specific+gene+expression+is+a+fundamental+characteristic+of+rat+spermatogenic+cells+and+Sertoli+cells.">Stage-specific gene expression is a fundamental characteristic of rat spermatogenic cells and Sertoli cells.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105 (24), 8315-8320 (2008).</li><li>Toppari, J., Bishop, P. C., Parker, J. W., diZerega, G. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=DNA+flow+cytometric+analysis+of+mouse+seminiferous+epithelium.">DNA flow cytometric analysis of mouse seminiferous epithelium.</a> Cytometry. 9 (5), 456-462 (1988).</li><li>M&#228;kel&#228;, J. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hedgehog+signalling+promotes+germ+cell+survival+in+the+rat+testis.">Hedgehog signalling promotes germ cell survival in the rat testis.</a> Reproduction. 142 (5), 711-721 (2011).</li><li>La, H. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+dynamic+undifferentiated+cell+states+within+the+male+germline.">Identification of dynamic undifferentiated cell states within the male germline.</a> Nature Communications. 9 (1), 04827 (2018).</li><li>Toppari, J., Parvinen, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vitro+differentiation+of+rat+seminiferous+tubular+segments+from+defined+stages+of+the+epithelial+cycle+morphologic+and+immunolocalization+analysis.">In vitro differentiation of rat seminiferous tubular segments from defined stages of the epithelial cycle morphologic and immunolocalization analysis.</a> Journal of Andrology. 6 (6), 334-343 (1985).</li><li>Parvinen, M., Vanha-Perttula, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+and+enzyme+quantitation+of+the+stages+of+the+seminiferous+epithelial+wave+in+the+rat.">Identification and enzyme quantitation of the stages of the seminiferous epithelial wave in the rat.</a> The Anatomical Record. 174 (4), 435-449 (1972).</li><li>Kluin, P. M., Kramer, M. F., de Rooij, D. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spermatogenesis+in+the+immature+mouse+proceeds+faster+than+in+the+adult.">Spermatogenesis in the immature mouse proceeds faster than in the adult.</a> International Journal of Andrology. 5 (3), 282-294 (1982).</li><li>Yoshida, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+first+round+of+mouse+spermatogenesis+is+a+distinctive+program+that+lacks+the+self-renewing+spermatogonia+stage.">The first round of mouse spermatogenesis is a distinctive program that lacks the self-renewing spermatogonia stage.</a> Development. 133 (8), 1495-1505 (2006).</li><li>Chan, A. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Germline+stem+cell+activity+is+sustained+by+SALL4-dependent+silencing+of+distinct+tumor+suppressor+genes.">Germline stem cell activity is sustained by SALL4-dependent silencing of distinct tumor suppressor genes.</a> Stem Cell Reports. 9 (3), 956-971 (2017).</li><li>Lokka, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Generation,+localization+and+functions+of+macrophages+during+the+development+of+testis.">Generation, localization and functions of macrophages during the development of testis.</a> Nat Commun. 11 (1), 4375 (2020).</li><li>M&#228;kel&#228;, J. A., Toppari, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Testis+physiology:+Spermatogenic+cell+syncytium.">Testis physiology: Spermatogenic cell syncytium.</a> Encyclopedia of Reproduction. , (2018).</li><li>Griswold, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spermatogenesis:+The+commitment+to+meiosis.">Spermatogenesis: The commitment to meiosis.</a> Physiological Reviews. 96 (1), 1-17 (2016).</li><li>M&#228;kel&#228;, J. A., Toppari, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spermatogenesis.">Spermatogenesis.</a> Endocrinology of the Testis and Male Reproduction. , 1-39 (2017).</li><li>Ventela, S., Toppari, J., Parvinen, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intercellular+organelle+traffic+through+cytoplasmic+bridges+in+early+spermatids+of+the+rat:+mechanisms+of+haploid+gene+product+sharing.">Intercellular organelle traffic through cytoplasmic bridges in early spermatids of the rat: mechanisms of haploid gene product sharing.</a> Molecular Biology of the Cell. 14 (7), 2768-2780 (2003).</li><li>Parvinen, M., Parvinen, L. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Active+movements+of+the+chromatoid+body.+A+possible+transport+mechanism+for+haploid+gene+products.">Active movements of the chromatoid body. A possible transport mechanism for haploid gene products.</a> The Journal of Cell Biology. 80 (3), 621-628 (1979).</li><li>Parvinen, M., S&#246;derstr&#246;m, K. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chromosome+rotation+and+formation+of+synapsis.">Chromosome rotation and formation of synapsis.</a> Nature. 260 (5551), 534-535 (1976).</li></ol>

Yazarların açıklayacak bir şeyi yok.

Yukarıda açıkladığımız transilluminasyon destekli mikrodispeksiyon yöntemi spermatogenez çalışması için aşama odaklı bir yaklaşım sağlamaktadır. Spermatogenez son derece senkronize bir süreçtir, ve spermatojenik farklılaşma sırasındaki tüm önemli adımlar, farklılaşma taahhüdü (VII-VIII aşamalarında), meiosis başlangıcı (VII-VIII), meiotik bölünmeler (XII), spermatid uzama (VIII) başlangıcı ve spermiasyon (VIII) 1,26,27gibi aşamaya bağlı bir şekilde düzenlenir ve yürütülür. Aşama odaklı analiz, spermatogenezin belirli adımlarıyla sınırlı olan ve bu nedenle sadece seminifer epitel döngüsünün tanımlanmış aşamalarında bulunan bu özel olayları incelemek için güçlü bir araç sağlar. Yöntemde ustalaşmak biraz pratik gerektirir ve kaliteli bir diseksiyon mikroskobu ve uygun aydınlatıcı koşulların kullanılması başarının anahtarıdır. Bu yöntemin günlük araç setinin bir parçası olarak uygulanması, spermatogenez sırasında moleküler olayların daha doğru bir şekilde parçalanmasına izin vererek araştırmaların erkek üreme fonksiyonları üzerindeki etkisini ve biyolojik alaka düzeyini büyük ölçüde iyileştirme kapasitesine sahiptir.
Üzerinde incelediğimiz tüm WT fare suşları benzer bir transilüminasyon deseni gösterir ve seminifer epitel döngüsünün aşamalarında korunmuş hücre ilişkileri sergiler. Mikrop hücrelerinin spermiojenik farklılaşması WT farelerinden çok farklı olmamak koşuluyla, aynı şey incelediğimiz tüm nakavt fare modelleri için de geçerlidir. Ayrıca, seminifer epitel döngüsünün aşamalarının boyuna segmental düzenlemesini sergileyen diğer türlere uygulanabilir7. Bununla birlikte, segmental olmayan aşamalara sahip türler (insan gibi) kullanılamaz. Kromatin yoğuşmasının transilluminasyon desenini tanımlamada spermatidlerin uzamasındaki temel rolü göz önüne alındığında, bu sürecin herhangi bir yanlış tanımlanmasının kaçınılmaz olarak bu yöntemin uygulanmasına engel olacağı açıktır. Genç farelerde ve genç yetişkinlerde (5-6 hafta) transilluminasyon deseni henüz tam olarak belirlenmemiştir ve bu nedenle sadece 8 haftadan büyük fareler kullanılmalıdır. Tübülleri sıkmanın ve çekmenin kaçınılmaz olarak transilluminasyon desenini engelleyeceğini akılda tutulması da önemlidir, çünkü seminifer epitel içindeki hücresel mimariyi bozar.
İzole seminifer tübül segmentleri, meiosis de dahil olmak üzere spermatogenez bağlantılı süreçlerin ek vivo gözlem ve manipülasyonu sağlayan kültüre edilebilir. Dokunun canlılığını sağlamak ve RNA ve protein bozulmasını önlemek için, örnekler toplanması ve fareden ödün verdikten en fazla 2 saat sonra işlenmesi gerekir. Seminifer tübüllerin ex vivo kültürü için, fedakarlıktan kültürün başlangıcına kadar geçen süre 1 saati geçmemelidir. Tübül parçalarının bütünlüğü, uygun şekilde hasat edilirse tipik olarak 72 saate kadar in vitro olarak korunabilir.
Seminifer epitel döngüsünün aşaması, kabak preparatlarının faz kontrastlı mikrokroskopisi kullanılarak doğrulanabilir ve daha da doğru tanımlanabilir16. Mikroskopi, analize ek bir boyut sağlayan ve spermatogenez28 , 29,30'unbelirli aşamalarında organel veya hücre hareketlerinin gözlemlenmesini sağlayan canlı hücreler üzerinde gerçekleştirilir. Faz kontrastlı mikroskopi, spermatogenez sırasında protein ekspresyolü ve lokalizasyon dinamiklerinin çok ayrıntılı analizini sağlayan, evreye özgü değişiklikler de dahil olmak üzere sonraki immünostaining için tam evreleme sağlar.
Hücreler kabak preparatlarında epitel bağlamından salınırken, tübül segmentlerinin bütün montajlı immünostainleri spermatojenik hücrelerin fizyolojik ortamlarında incelenmesini sağlar. Bu nedenle, tüm montaj preparatları, seminifer tübül mimarisinin ve hücreler arası temaslarının kesitlerde immünostainlemeden daha iyi bir görselleştirilmesini sağlayabilir. Daha da önemlisi, tübül segmentlerinin immünostainasyondan önce transilluminasyon destekli evrelemesi, belirli bir segmentin belirli aşaması hakkında bilgi vererek yaklaşımı daha da güçlü hale getirir. Tüm montajlı boyama, peritubular miyoid hücreler, peritubuler makrofajlar ve spermatogonia gibi seminifer tübüllerin çevresindeki hücrelerin incelenmesi için özellikle yararlı bir araçtır, ancak meiotik ve postmeiotik mikrop hücreleri hakkındaki araştırmalara yeni içgörüler de açabilir.

Erkek mikrop hücrelerinin diploid spermatogonia'dan olgun haploid spermatozoa, yanispermatogenez'e farklılaşması, cinsel olarak olgunlaşmış bir bireyin testislerinde seminifer tübüllerin epitelinde gerçekleşen karmaşık bir süreçtir1. A1 spermatogonia'nın mitotik torunları, farklılaşmaya bağlı popülasyonu genişletmek için önce beş kez bölünür, daha sonra sonuçta haploid spermatidlere yol açan spermatositler olarak meyoza girerler. Yuvarlak spermatidlerin spermatozoa, yanispermiogenez olarak farklılaştırılması, nükleer sıkıştırma ve akrozom ve flagellum gibi sperme özgü yapıların inşası da dahil olmak üzere hücresel morfolojide karmaşık değişiklikler içerir. Farede, spermatogenezin tüm sürecinin tamamlanması 35 gün sürer2,3.
Herhangi bir lokalde, seminifer epitel, farklılaşan mikrop hücrelerinin beş kohortunun yanı sıra germline kök / progenitör hücreler ve somatik Sertoli hücreleri1'ekadar barındırır. Farklılaşan mikrop hücreleri, bileşimi öngörülebilir olan eşmerkezli katmanlar oluşturur ve belirli bir gelişim adımındaki haploid hücreler her zaman belirli spermatosit türleri ve spermatogonia4,5ile ilişkilendirilir. Bu nedenle, bir tübüllerin herhangi bir kesiti, sabit bir bileşimin mikrop hücrelerinin kohortlarını barındırır. Bu spesifik hücre ilişkileri seminifer epitelyumun evreleri olarak tanımlanır. Kendi başına aşamalar durgun kontrol noktası benzeri durumlar sunmaz, ancak mikrop hücre kohortlarının farklılaşması senkron 1 ,2,6'dailerledikçe sürekli olarak gelişir. Farelerde, seminifer tübülünün boyuna ekseni boyunca segmental bir şekilde düzenlenmiş12 aşama (I-XII) 2 vardır ve birbirlerini mantıksal bir düzende takip ederler, böylece seminifer epitel dalgasını veya spermatojenik dalga 7,8,9 (Şekil 1)oluştururlar. Spermatogenezin tamamlanması dört döngü sürer ve herhangi bir seminifer tübül kesiti içindeki farklılaşan mikrop hücrelerinin hiyerarşik katmanları veya kohortları zamansal olarak birbirinden bir seminifer döngüsüdir. Döngünün uzunluğu türlere bağlıdır ve farede her döngü 8,6 günsürer 10.
Aşamalar histolojik testis bölümleri5 (Şekil 1 ve Şekil 2)üzerinde seminifer epitel hücresel bileşimi ve organizasyonu temelinde tanımlanabilir. Bununla birlikte, histolojik analiz zahmetli, zaman alıcıdır ve sabitleme ve lekeleme gerektirir ve bu nedenle canlı dokuya uygulanamaz. Daha da önemlisi, döngünün farklı aşamaları tarafından sergilenen farklı ışık emme/saçılma desenlerinden yararlanılarak diseksiyon mikroskobu altında canlı doku üzerinde de evreleme yapılabilir (Şekil 2). Her aşamanın ışığı emme ve dağıtma yeteneği, herhangi bir aşama konakçısının geç meyotik spermatidlerin kromatin yoğuşma seviyesine ve bu hücrelerindemetler halinde paketlenmesinegöredir 7,11. Spermatid farklılaşması, yanispermiogenez, 8 adım yuvarlak spermatid (adım 1-8) ve 8 adım spermatid (adım 9-16) farklılaşması (Şekil 1)dahil olmak üzere 16 gelişimsel adıma ayrılmıştır. Adım 9-11 uzamış spermatidler (aşama IX-XI) sadece düşük miktarda kromatin yoğuşması gösterir ve bu da düşük miktarda ışığın emilmesine neden olur. Kromatin yoğuşması adım 11 spermatidlerde (aşama XI) başlar ve adım 15-16 uzun spermatidler (aşama IV-VIII) tamamen yoğun kromatin içerir ve bu nedenle maksimal ışık emilimi sergiler (Şekil 3). Kromatin sperm kafasına sıkıca paketlenmesi için yoğunlaştırılmalıdır. Işık emilim paternine katkıda bulunan ek faktörler, epitel içindeki spermatidlerin uzama yeridir (bazal ve apikal) ve uzun spermatidlerin bundling 'idir (aşama II-V'de telaffuz edilir)11 (Şekil 3). Demetler, tübüllerin ortasında ve bir diseksiyon mikroskobu altında kenarlarda çizgiler olarak görülür ve kromatin ne kadar yoğunlaştıysa, nokta / şerit11daha koyudur.
Bu makalede, seminifer epitel döngüsünün belirli aşamalarını temsil eden seminifer tübül segmentlerinin izolasyonu için transilluminasyon destekli mikrodiseksiyon yönteminin kullanımı açıklanmaktadır. İzole edildikten sonra, aşamalı tübül segmentleri biyokimyasal RNA ve protein analizleri12 , 13,14, 15,akış sitometrisi16, ex vivo tübül kültürü17ve immünostaining18 dahil olmak üzere çeşitli aşağı akış analizlerine tabi tutulabilir. Burada ayrıca, canlı hücre morfolojik analizi ve sonraki immünostaining için sahnelenmiş tübül segmentlerinin ezilmiş monolayerlerini ve tübül segmentlerinin tam montajlı immünostaininglerini hazırlamak için ayrıntılı aşağı akış protokolleri sunuyoruz. Şekil 4'teaçıklanan özetle iş akışı.
Transilluminasyon destekli mikrodiseksiyon yöntemi, aşamaların senkronize hücresel bileşimi sayesinde mikrop hücrelerinin belirli farklılaşma adımlarında doğru tanımlanmasını ve izolasyonunu sağlar. Daha da önemlisi, spermatogenez sırasında evreye bağlı olayların canlı doku üzerinde incelenmesini sağlar. Spermatogenez için ölçeklenebilir in vitro modellerin eksikliği göz önüne alındığında, bu yöntem aynı zamanda sahneye özgü tübül segmentleri üzerinde hedeflenen kısa vadeli gelişimsel ve toksikolojik çalışmalara izin vermenin benzersiz bir avantajına sahiptir ex vivo12,17. Burada fare için yöntemi açıklarken, aynı prosedür sıçan 4 , 7,15 , 19,20gibiseminifer epitel aşamalarının boyuna ve segmental düzenlemesine sahip herhangi birmemelitürüne uygulanabilir.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>bovine serum albumin (BSA)</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>A9647</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>cover glass 20x20 mm</td>
			<td>Menzel Gl&#228;ser</td>
			<td>11961988</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Falcon conical tube 15-ml</td>
			<td>Sarstedt</td>
			<td>62.554.502</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>fetal bovine serum (FBS)</td>
			<td>Biowest</td>
			<td>S1810</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>grease pen (ImmEdge)</td>
			<td>Vector Laboratories</td>
			<td>H-4000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>microscope slide Superfrost Plus</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>22-037-246</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Parafolmaldehyde (PFA)</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>15714</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Petri dish (100-mm)</td>
			<td>Greiner</td>
			<td>664160</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>phosphate-buffered saline (PBS)</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>11503387</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ProLong Diamond Antifade Mountant</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>P36962</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>rhodamine-labelled Peanut agglutinin (PNA)</td>
			<td>Vector Laboratories</td>
			<td>RL-1072</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Triton X-100</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>93443</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tween-20</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P2287</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

transillumination-assisted dissection of specific stages of the mouse seminiferous epithelial cycle for downstream immunostaining analyses

Spermatogenez, sonuçta vücudun en farklı hücre türlerinden biri olan sperme yol açan benzersiz bir farklılaşma sürecidir. Mikrop hücrelerinin farklılaşması, 4 ila 5 nesil mikrop hücresine aynı anda ev sahipliği yapan ve gelişimlerini koordine eden ve senkronize eden somatik Sertoli hücrelerinin sitoplazmik ceplerinde gerçekleşir. Bu nedenle, bir kesit içindeki mikrop hücre tiplerinin bileşimi sabittir ve bu hücre ilişkileri seminifer epitel döngüsünün aşamaları (I–XII) olarak da bilinir. Daha da önemlisi, aşamalar, transilüminasyon ile ortaya çıkan diferansiyel ışık emilimi / saçılma özelliklerine ve aşamaların tübül boyunca birbirini sayısal bir sırada takip etmesine bağlı olarak bozulmamış seminifer tübüllerden de tanımlanabilir. Bu makalede, fare seminifer epitel döngüsünün belirli aşamalarını temsil eden seminifer tübül segmentlerinin izolasyonu için transilluminasyon destekli bir mikrodispeksiyon yöntemi açıklanmaktadır. Seminifer tübüllerin ışık emme deseni önce diseksiyon mikroskobu altında incelenir ve daha sonra belirli aşamaları temsil eden tübüle segmentleri kesilir ve aşağı akış uygulamaları için kullanılır. Burada, aşamaya özgü kabak preparatları ve sağlam tübül segmentleri için immünostaining protokollerini açıklıyoruz. Bu yöntem, bir araştırmacının spermatogenezin belirli aşamalarında gerçekleşen biyolojik olaylara odaklanmasını sağlar, böylece spermatogenez ve alttaki moleküler mekanizmaların gelişimsel, toksikolojik ve sitolojik çalışmaları için benzersiz bir araç sağlar.

Fare seminifer tübüllerinin başarılı bir transilluminasyon destekli evrelemesi ve mikro dezenfeksiyonu, öncelikle uygun aydınlatma koşullarını ve uygun bir diseksiyon mikroskobu ve her aşamayı karakterize eden belirli özellikleri tanıma yeteneğine bağlıdır. Vii-VIII aşamaları homojen bir şekilde karanlık görünür, çünkü epitelin apikal yüzeyine hizalanmış çok sayıda tam yoğunlaştırılmış uzun spermatid içerirler (Şekil 5A ve Şekil S1). Olgun spermatozoa spermiasyonda lümene salındıktan sonra, tübül epitelde yoğunlaştırılmış uzun spermatidlerin bulunmaması nedeniyle IX-XI aşamalarında çok solgun görünür. Transilluminated tübüllerde tanımlanması en kolay özellik spermiasyon noktasıdır (Şekil 5A ve Şekil S1'dekiyıldız işareti), yani karanlık bölgeden (VII-VIII) soluk bölgeye (IX–XI) ani geçiştir. Soluk bölgeyi zayıf nokta bölgesi (XII-I) takip ediyor. Sivilceli görünüm, demetler halinde yoğunlaştırılmış kromatin ile uzun spermatidlerin organizasyonundan kaynaklanır. Demetler aşağıdaki güçlü nokta bölgesinde (II-V) çok belirgin hale gelir. Ayrıca, spermatid demetleri bazal laminaya yakın bulunan Sertoli hücre çekirdeklerine doğru göç eder, bu da transilüme edildiğinde aşama II-V tübülünün çizgili görünümü olarak yansır (Şekil 2, Şekil 5A,B ve Şekil S1). Demetler sonunda vi aşamasında dağılır ve yoğunlaşan uzun spermatidler, viii aşamasında epitelden salınacak lümene yakın hareket eder.
Tübül segmentinin tam aşaması, kabak preparatlarının faz kontrastlı mikroskopisi ile doğru bir şekilde doğrulanabilir (Şekil 2 ve Şekil S2). Kabak preparatlarındaki spesifik aşamalar, adım 1-8 yuvarlak spermatidlerin akrozomal gelişimi, uzun spermatidlerde kromatin yoğuşma durumu ve spermatid demetlerinin varlığı16 (Şekil 3 ve Şekil S2)temelinde kabul edilir. Ayrıca, morfolojik özelliklerine dayanarak tanınabilen B tipi spermatogonia ve leptoten veya zigoten spermatositler gibi daha erken hücre tiplerinin varlığı, evre tanımayı desteklemek için kullanılabilir. Pachytene spermatosit çekirdeğinin büyüklüğü, vi evre civarında artar ve bu da evrelemede ek yardım sağlayabilir.
Aşamalı kabak preparatları, immünostaining kullanılarak seminifer epitelde ilgi çekici proteinlerin ekspresyonunu ve lokalizasyonunu incelemek için kullanılabilir. Bu, her aşamada iyi tanımlanmış hücresel bileşim nedeniyle hücre tipine özgü ifadenin çok doğru analizini sağlar. Evreye özgü ifade, yuvarlak spermatid farklılaşmasının farklı adımlarının görselleştirilmesini sağlayan akrozomun(örneğinPNA ile) birlikte boyanmasıyla daha da arttırılabilir. Çeşitli aşamalarda PNA lekeli akrozomların temsili görüntüleri Şekil S3 'te verilmiştir. Akrozomal lekeleme, aşamayı geriye dönük olarak tanımlamak için de kullanılabilir. Bununla birlikte, transilluminasyon destekli evreleme, istenmeyen parçaları gelişigüzel bir şekilde kullanmaktansa istenen aşamayı bulmak için oldukça kolay ve hızlı bir yöntemdir.
Seminifer tübül bütün montajlı boyama tipik olarak tübüler tarafta (spermatogonia, preleptotene spermatositler ve Sertoli hücreleri) seminifer epitelin bodrum zarı ile temas eden hücre tiplerini incelemek için kullanılır; Şekil 6A,B) veya geçiş tarafı (peritubuler miyoid hücreler ve peritubuler makrofajlar); Şekil 6C ve Şekil S4A)24. Bununla birlikte, yöntem, kan testis bariyeri (Espin, Şekil S4B)veya postmeiotik mikrop hücreleri (akrozom belirteci PNA, Şekil S4C)gibi epitelde daha derinde bulunan hücreleri veya yapıları incelemek için de kullanılabilir. Etiketlenmemiş tübül segmentleri kullanıyorsanız, spermatogonia (A1, A2, A3, A4, In ve B; toplu olarak Adiff)ayırt edici olarak ifade edilen bir proteine karşı antikor kullanarak belirli bir aşamayı retrospektif olarak tahmin etmek mümkündür (Şekil 2). Evreleme daha sonra, spermatojenik farklılaşmanın ilk döngüsü1sırasında sahneye bağlı bir şekilde altı mitotik bölünmeye maruz kalan bir fark yoğunluğuna dayanır, bu nedenle her bölümden sonra syncytia'daki Adiff spermatogonia sayısını iki katına çıkarır1,25. Bununla birlikte, geriye dönük evreleme, transilluminasyon destekli hazırlamadan daha az doğrudur, çünkü farklı Adif nesilleri için belirli bir belirteç yoktur ve Afark yoğunluğunun değerlendirilmesi hataya eğilimli olabilir.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61800/61800fig01.jpg"> Şekil 1: Fare spermatogenezinin evrelemesi için seminifer epitel döngüsü haritası. Dikey sütunlar, seminifer epitel döngüsünün farklı aşamalarında hücre ilişkilerini gösterir (Roma rakamları I–XII ile işaretlenmiştir). En olgunlaşmamış mikrop hücreleri altta, en farklılaşmış hücreler ise en üsttedir. Mikrop hücre farklılaşmasındaki ilerlemeyi takip etmek için soldan sağa ve aşağıdan yukarıya doğru hareket etmek zorundadır. Seminifer epitel döngüsü, birbirini sayısal olarak takip eden eksiksiz bir aşama serisidir. Und, farklılaşmamış spermatogonia; A1–4, tip A1–A4 spermatogonia; in, ara spermatogonia; B, B tipi spermatogonia; Pl, preleptoten spermatositler; L, leptoten spermatositler; Z, zigoten spermatositler; P, pachytene spermatositler; D, diploten spermatositler; 2°, sekonder spermatositler artı meiotik bölünmeler. Arap rakamları 1-16 meiotik spermatid olgunlaşma sonrası basamakları (spermiogenezis) ifade eder. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61800/61800fig01large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61800/61800fig02.jpg"> Şekil 2: Fare seminifer epitel döngüsünün aşamalarında hücre ilişkileri. Seminifer epitel döngüsünün aşamaları birbirini mantıksal bir düzende takip eder ve böylece seminifer bir tübülünün boyuna ekseni boyunca spermatojenik dalgayı oluşturur. Üst panel, mikrop hücre ilişkilerini farklı aşamalarda ve hücre tiplerinin seminifer epiteldeki Sertoli hücrelerinin sitoplazmik cepleri (açık gri) içindeki konumunu göstermektedir. Seminifer tübül çizimi, soluk, zayıf nokta, güçlü nokta ve karanlık bölgelerin spermatojenik dalgasını ve spesifik transilluminasyon kalıplarını görselleştirir. Belirtilen her aşamadan, kabak preparatlarının temsili canlı hücre faz kontrast görüntüleri ve periyodik asit-Schiff (PAS) lekeli testis kesitleri gösterilir. Alt iki panel, transilluminasyondan sonra seminifer tübül segmentlerini gösterir (üstte) veya SALL4 (kırmızı, pan-spermatogonial belirteç) ve DNMT3A'ya (yeşil, birfark işaretleyicisi) karşı antikorlarla (altta) lekelenme. IX-XI, XII ve VI aşamaları için transilluminasyon desenleri kutulu alanlarla vurgulanır. Seminifer döngüsünün (yaklaşık) aşamasını tanımlamak için hem ışık emme deseni (üstte) hem de DNMT3A pozitif farklılaşan spermatogonia (altta) yoğunluğu kullanılabilir. Ardışık Adif nesilleri A1-A4 tipi, orta (in) ve B tipi spermatogonia olarak adlandırılır. Her birinin bölünmesi spermatogoniyel hücre yoğunluğunun iki katına çıkmasına neden olur. Seminifer epitelin bodrum zarındaki en yüksek hücre yoğunluğu, meiotik preleptoten spermatositler (Pl) gözlendiğinde VI–VIII evrelerinde görülür. Ölçek çubukları: kabak hazırlığı 10 μm, diğerleri 50μm. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61800/61800fig02large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61800/61800fig03.jpg"> Şekil 3: Spermiogenez adımları. Spermiogenezin farklı adımlarında spermatidlerin ayırt edici özellikleri. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61800/61800fig03large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61800/61800fig04.jpg"> Şekil 4: Bu çalışmanın iş akışı. Transillumination deseni yetişkin (>8 haftalık) bir farede tam olarak oluşturulmuştur. Fareyi feda edin ve gecikmeden testis diseksiyonu ve kafa kesme ile devam edin. Tübülleri bir Petri kabında yavaşça çekin. Tüm montajlı lekeler için tübülleri sabitlenin veya transilluminasyona devam edin. Transillumination 1) kabak preparatları (kalite kontrolü veya immünostaining için) için belirli aşamaların kısa tübüle segmentlerini kesin veya 2) RNA ve proteomik analizler, doku kültürü veya tam montajlı boyamalar için sahne havuzlarını toplamak için daha uzun segmentler kesin. Kısa tübül parçalarını 10 μL PBS hacminde mikroskop slaydına aktarın. Hücreleri zorlamak ve canlı bir hücre monolayer oluşturmak için segmente bir kapak kayması yerleştirin. Mikroskop altında hücre tiplerini gözlemleyin, sonra düzeltin ve lekeleyin. WMS, bütün montajlı boyama. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61800/61800fig04large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
<img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61800/61800fig05.jpg"> Şekil 5: Transilluminasyon mikroskopisi altında görüldüğü gibi yetişkin bir farenin seminifer tübül. (A) Transilluminasyon altında görüldüğü gibi seminifer epitel dalgasını gösteren uzun bir seminifer tübül segmenti. Spermatidlerde kromatin sıkışması ve epitel içindeki lokalizasyonlarına göre dört farklı bölge tanımlanabilir: karanlık bölge (aşama VII–VIII), soluk bölge (aşama IX-XI), zayıf nokta bölgesi (aşama XII-I) ve güçlü nokta bölgesi (aşama II-VI). Yıldız, spermiasyon noktası. Oklar, zayıf nokta bölgesinde tübül üzerindeki mekanik stres nedeniyle soluk bir görünüme sahip iki kısa segmenti gösterir. Ölçek çubuğu: 500 μm. 1–5 iç kesimleri, seçilen tübül segmentlerinden daha yüksek büyütmelerdir. (B) II–V (güçlü nokta bölgesi), VII–VIII (karanlık bölge) ve IX–XI (soluk bölge) aşamalarını temsil eden seminifer tübüllerin havuza alınan parçaları. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61800/61800fig05large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
<img alt="Figure 6" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61800/61800fig06.jpg"> Şekil 6: Spermatogonial, Sertoli hücre ve peritubuler makrofaj belirteçleri kullanılarak tüm montajlı immünostainingler. (A) GFRα1 (kırmızı), SALL4 (yeşil) ve DNMT3B (mavi) karşı antikorlarla evre XI–II'yi temsil eden bir segment için tam montajlı boyama. Boyama üç farklı spermatogonia popülasyonunu ortaya koymaktadır: tekil olarak izole edilmiş (As)veya eşleştirilmiş (Apr)farklılaşmamış kök spermatogonia (GFRα1+/ SALL4+/ DNMT3B-; beyaz noktalı alanlar), kısa senktial (burada 4 hizalanmış hücre; Aal4) progenitör spermatogonia (GFRα1-/SALL4+/DNMT3B-; sarı noktalı alanlar) ve farklılaşan spermatogonia (GFRα1-/SALL4+/DNMT3B+). SALL4+/DNMT3B+ hücreler A3–A4 spermatogonia tiplidir. (B) GFRα1 (kırmızı), USF1 (yeşil) ve SOX9 (mavi) karşı antikorlar ile tüm mount seminiferöz tübül boyama. GFRα1 spermatogonia'nın kök alt kümesini lekeler. USF1 hem spermatogonia hem de SOX9+ Sertoli hücreleri ile ifade edilir. (C) Yetişkin farelerde peritubuler makrofajlar hem F4/80 (kırmızı) hem de MHCII (mavi) için pozitiftir. DAPI DNA lekeleri (yeşil). Parlak büyük çekirdekler peritubular miyoid hücre çekirdekleridir. Ölçek çubukları: 50 μm. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61800/61800fig06large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
Şekil S1: Transilluminasyon altında görüldüğü gibi seminifer epitel dalgasını gösteren uzun bir seminifer tübül segmenti. Spermatidlerde kromatin sıkışması ve epitel içindeki lokalizasyonlarına göre dört farklı bölge tanımlanabilir: zayıf nokta bölgesi (aşama XII-I), güçlü nokta bölgesi (aşama II-VI), karanlık bölge (aşama VII-VIII) ve soluk bölge (aşama IX-XI). Spermiasyon noktası (yıldız işareti), karanlık bölge aniden soluk bölgeye geçerken tanınabilir. Ölçek çubuğu: 500 μm. 1–4 iç kesimleri, seçilen tübül segmentlerinden daha yüksek büyütmelerdir. <a href="https://cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/61800/61800supfig01.jpg" target="_blank">Bu rakamı indirmek için lütfen tıklayınız.</a>
Şekil S2: Seminifer epitel döngüsünün farklı aşamalarındaki canlı hücreli monolayerlerin faz kontrastlı mikroskopisi. (A) Evre I. Adım 1 yuvarlak spermatidler hala akrozomal yapıdan yoksundur. Ayırt edici tek bir kromomer (beyaz oklar) ile küçük bir yuvarlak çekirdek (kırmızı daireler) ile karakterize edilirler. Kromatoid gövde sitoplazmada nükleer membranla (mavi oklar) yakın temas halinde koyu bir granül olarak görülebilir. Sertoli hücre çekirdeği (beyaz daire) üç karanlık odak içerir: iki uydu kromosente sahip büyük bir çekirdek. Sertoli hücreleri kabak preparatlarında görülmez, ancak zaman zaman mikrop hücreleriyle birlikte tübülden akarlar. (B) Aşama II–IV. 4. adım yuvarlak spermatidlerde (kırmızı daireler), akrozomal yapı (kırmızı oklar) nükleer zarfa bağlı beyaz hafif düzleştirilmiş bir veziklin olarak görünür. Uzun spermatidler demetler oluşturur ve sperm kuyruğunun orta parçasında mitokondriyal kılım varlığını gösteren kalın bir flagelluma (beyaz oklar) sahiptir. Pachytene spermatositlerinin (PSpc) çekirdekleri yuvarlak spermatidlerden yaklaşık iki kat daha büyüktür ve çekirdeğe dağılmış koyu kromatin bölgeleri ile karakterizedir. (C) Aşama V–VI. 5-6. adımda yuvarlak spermatidler (kırmızı daire), akrozom daha da düzleştirilir ve çekirdeğe (kırmızı oklar) yayılır. Nükleer zarfın akroza bakan bölgesi, akrozomal membran ile nükleer membran arasında protein bakımından zengin bir plaka olan akroplaxome varlığı nedeniyle karanlık görünür. Uzun spermatidler demetlerden (beyaz oklar) salınır. Pachytene spermatositler (PSpc) epitelde sıklıkla görülür. (D) Sahne VII-VIII. Beyaz gölgeli nükleer zarf üzerinde koyu bir astar olan akrozom (kırmızı oklar) tamamen genişletilmiştir ve 7-8. Bu aşama, kabak hazırlığının birçok yerinde bol miktarda bulunan olgun spermatidler (beyaz oklar) ile karakterizedir. Pachytene spermatositlerinin (PSpc) çekirdeği gelişim sırasında büyür ve vii-VIII evresinde önceki aşamalara göre daha büyük görünür. Pachytene spermatositlerinin (PSpc) çekirdeğinin içindeki koyu kromatin alanları, yüksek transkripsiyon aktivitesi ve meiotik olaylar nedeniyle bulanık görünür. (E) Evre X. Adım 10 spermatid çekirdekleri (beyaz oklar) uzamaya başlandı, ancak kromatin henüz yoğunlaşmadı. Akrozomlar nükleer uçta (kırmızı ok) bir kanca oluşturmaya başlar. Pachytene spermatositlerinin (PSpc) çekirdekleri, meiotik bölünmelere hazırlanırken çok büyük görünür. (F) Aşama XII. Aşama XII, meiotik metafaz plakalarının (beyaz kesikli daireler) varlığı ile karakterizedir. Tipik yoğun kromatin desenine sahip küçük yuvarlak hücreler, kardeş kromozomların sinaptonemal kompleks oluşumunu başlatmak için hizalandıklarına sahip zigoten spermatositlerdir (ZSpc). Ölçek çubukları: 10 μm. <a href="https://cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/61800/61800supfig02.jpg" target="_blank">Bu rakamı indirmek için lütfen tıklayınız.</a>
Şekil S3: Akrozomal ve nükleer lekelenme temelinde seminifer epitel döngüsünün evresinin tanımlanması. Aseton sabit squash preparatları Rhodamine konjuge PNA ve DAPI ile boyandı. Aşama I: 1. adım yuvarlak spermatidlerde akrozom bulunmazken, uzun spermatidlerde tamamen gelişmiş bir akrozom tespit edilebilir. Evre II–IV: Akrozomal gelişim yuvarlak spermatidlerde proacrosomal/akrozomal granüllerin ortaya çıkmasıyla başlar. Nükleer yüzeydeki akrozomal veziklikül, 3. Aşama V: Akrozomun subtended açısı 40 dereceden maksimum 95 ° 'ye kadar uzanır. Aşama VI–VII: Akrozomun altında yer alan açı 95 dereceden 120 dereceye kadar uzanır. Aşama VIII-IX: Akrozom adım 8 spermatidlerde (evre VIII) tamamen uzatılır ve hücrenin plazma zarı ile temas eden apikal tarafında çekirdek polarize olur (gösterilmez). Aşama IX spermatids çekirdeği deforme olur; dorsal ve ventral yüzeyler ilk kez görülür. Aşama X-XI: Spermatidler sırt açısını gösterir. Aşama XII: Bu aşama en iyi meiotik bölünmelerin ortaya çıkması ile karakterizedir; metafaz plakaları beyaz oklarla gösterilir. Akrozomları ile uzun spermatidler de görülür. Ölçek çubukları: 10μm. <a href="https://cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/61800/61800supfig03.jpg" target="_blank">Bu rakamı indirmek için lütfen tıklayınız.</a>
Şekil S4: Geleneksel olmayan belirteçler için tam montajlı boyama. (A) Alfa düz kas aksini (aSMA) peritubuler miyoid hücreler tarafından ifade edilir. (B) Espin, Sertoli hücre sıkı kavşaklarına lokalize olur ve kan testis bariyerine katkıda bulunur. (C) PNA spermatid akrozomlarına lokalize olur. Ölçek çubukları: 50μm. <a href="https://cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/61800/61800supfig04.jpg" target="_blank">Bu rakamı indirmek için lütfen tıklayınız.</a>
Ek video 1: Aşama VII-VIII'i temsil eden seminifer tübüllerin kısa bir bölümünü kesmek. <a href="https://cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/61800/Supplementary%20video%201.mov" target="_blank">Bu videoyu indirmek için lütfen tıklayınız.</a>

Watch this Scientific Journal Video about Transillumination-Assisted Dissection of Specific Stages of the Mouse Seminiferous Epithelial Cycle for Downstream Immunostaining Analyses at JoVE.com

Transillumination-Assisted Dissection of Specific Stages of the Mouse Seminiferous Epithelial Cycle for Downstream Immunostaining Analyses

Bu protokol, seminifer epitel döngüsünün belirli aşamalarını temsil eden yetişkin fare seminifer tübüllerinin segmentlerinin transilluminasyon destekli mikroseksiyonunu ve buradaki hücre tiplerini ve daha sonra kabak preparatlarının ve bozulmamış tübül segmentlerinin immünostainasyonunu açıklar.

Aşağı Akış İmmünasyon Analizleri için Fare Seminifer Epitel Döngüsünün Belirli Aşamalarının Transilluminasyon Destekli Diseksiyonu

Spermatogenesis is a unique differentiation process that ultimately gives rise to one of the most distinct cell types of the body, the sperm. ...

transillumination-assisted-dissection-specific-stages-mouse

Research

Education

JoVE Core

JoVE Journal

Anatomy and Physiology

Developmental Biology

Unit 1

The Reproductive System

SCIENTISTS IN ACTION

6.8K Görüntüleme.  University of Turku, Turku, Finland. Bu protokol, seminifer epitel döngüsünün belirli aşamalarını temsil eden yetişkin fare seminifer tübüllerinin segmentlerinin transilluminasyon destekli mikroseksiyonunu ve buradaki hücre tiplerini ve daha sonra kabak preparatlarının ve bozulmamış tübül segmentlerinin immünostainasyonunu açıklar.

Video: Transillumination-Assisted Dissection of Specific Stages of the Mouse Seminiferous Epithelial Cycle for Downstream Immunostaining Analyses

Step-specific Sorting of Mouse Spermatids by Flow Cytometry

The differentiation of mouse spermatids is one critical process for the production of a functional male gamete with an intact genome to be transmitted to the next generation. So far, molecular studies of this morphological transition have been hampered by the lack of a method allowing adequate separation of these important steps of spermatid differentiation for subsequent analyses. Earlier attempts at proper gating of these cells using flow cytometry may have been difficult because of a peculiar increase in DNA fluorescence in spermatids undergoing chromatin remodeling. Based on this observation, we provide details of a simple flow cytometry scheme, allowing reproducible purification of four populations of mouse spermatids fixed with ethanol, each representing a different state in the nuclear remodeling process. Population enrichment is confirmed using step-specific markers and morphological criterions. The purified spermatids can be used for genomic and proteomic analyses.

We describe a sorting strategy for mouse spermatids using flow cytometry. Spermatids are sorted into four highly pure populations, including round (spermiogenesis steps 1-9), early elongating (spermiogenesis steps 10-12), late elongating (spermiogenesis steps 13-14) and elongated spermatids (spermiogenesis steps 15-16). DNA staining, size and granulosity are used as selection parameters.

Adım özgü Fare spermatidlerin Sıralama&#39;yı Akışı Sitometrinin tarafından

The differentiation of mouse spermatids is one critical process for the production of a functional male gamete with an intact genome to be transmitted to ...

Gelişim Biyolojisi

Isolation of Mouse Endometrial Epithelial and Stromal Cells for In Vitro Decidualization

Decidualization is a progesterone-dependent differentiation process of endometrial stromal cells and is a prerequisite for successful embryo implantation. Although many efforts have been made to reveal the underlying mechanisms of decidualization, the exact signaling between the epithelial cells that are in contact with the embryo and the underlying stromal cells remains poorly understood. Therefore, studying decidualization in a way that takes both the epithelial and stromal cells into account could improve our knowledge about the molecular details of decidualization. For this purpose, in vivo models of artificial decidualization are physiologically the most relevant; however, manipulation of intercellular communication is limited. Currently, in vitro cultures of endometrial stromal cells are being used to investigate the modulation of decidualization by several signaling molecules. Conventionally, human or mouse endometrial stromal cells are used. However, the availability of human samples is very often limited. Furthermore, the use of murine tissues is accompanied with variety in the method of culturing. This study presents a validated and standardized method to obtain pure Endometrial Epithelial Cell (EEC) and Stromal Cell (ESC) cultures using adult intact mice treated with estrogen for three consecutive days. The protocol is optimized to improve the yield, viability, and purity of the cells and was further extended in order to study decidualization in a coculture of EEC and ESC. This model may be suitable to exploit the importance of both cell types in decidualization and to evaluate the contribution of significant signaling molecules secreted by EEC or ESC during the intercellular communication.

Isolation of Mouse Endometrial Epithelial and Stromal Cells for In Vitro Decidualization

This study presents a standardized and validated method for the isolation and culture of primary mouse endometrial stromal and epithelial cells, which can be used in a coculture system to study in vitro decidualization.

Fare Endometrial stromal ve epitelyal hücrelerin izolasyonu için<em&gt; İn Vitro</em&gt; sidualizasyonu

Decidualization is a progesterone-dependent differentiation process of endometrial stromal cells and is a prerequisite for successful embryo implantation. ...

Whole-cell Patch-clamp Recordings of Isolated Primary Epithelial Cells from the Epididymis

The epididymis is an essential organ for sperm maturation and reproductive health. The epididymal epithelium consists of intricately connected cell types that are distinct not only in molecular and morphological features but also in physiological properties. These differences reflect their diverse functions, which together establish the necessary microenvironment for the post-testicular sperm development in the epididymal lumen. The understanding of the biophysical properties of the epididymal epithelial cells is critical for revealing their functions in sperm and reproductive health, under both physiological and pathophysiological conditions. While their functional properties have yet to be fully elucidated, the epididymal epithelial cells can be studied using the patch-clamp technique, a tool for measuring the cellular events and the membrane properties of single cells. Here, we describe the methods of cell isolation and whole-cell patch-clamp recording to measure the electrical properties of primary dissociated epithelial cells from the rat cauda epididymides.

We present a protocol that combines cell isolation and whole-cell patch-clamp recording to measure the electrical properties of the primary dissociated epithelial cells from the rat cauda epididymides. This protocol allows for investigation of the functional properties of primary epididymal epithelial cells to further elucidate the physiological role of the epididymis.

Epididimden İzole Edilmiş Primer Epitelyal Hücrelerin Tüm Hücreli Yama-Kelepçesi Kayıtları

The epididymis is an essential organ for sperm maturation and reproductive health. The epididymal epithelium consists of intricately connected cell types ...

Dissection and Culture of Mouse Embryonic Kidney

The goal of this protocol is to describe a method for the dissection, isolation, and culture of mouse metanephric rudiments. 
During mammalian kidney development, the two progenitor tissues, the ureteric bud and the metanephric mesenchyme, communicate and reciprocally induce cellular mechanisms to eventually form the collecting system and the nephrons of the kidney. As mammalian embryos grow intrauterine and therefore are inaccessible to the observer, an organ culture has been developed. With this method, it is possible to study epithelial-mesenchymal interactions and cellular behavior during kidney organogenesis. Furthermore, the origin of congenital kidney and urogenital tract malformations can be investigated. After careful dissection, the metanephric rudiments are transferred onto a filter that floats on culture medium and can be kept in a cell culture incubator for several days. However, one must be aware that the conditions are artificial and could influence the metabolism in the tissue. Also, the penetration of test substances could be limited due to the extracellular matrix and basal membrane present in the explant.
One main advantage of organ culture is that the experimenter can gain direct access to the organ. This technology is cheap, simple, and allows a large number of modifications, such as the addition of biologically active substances, the study of genetic variants, and the application of advanced imaging techniques.

This protocol describes a method for isolating and culturing metanephric rudiments from mouse embryos.

Fare Embriyonik Böbreklerinin Diseksiyonu ve Kültürü

The goal of this protocol is to describe a method for the dissection, isolation, and culture of mouse metanephric rudiments. 
During mammalian kidney ...

Dissection and Coronal Slice Preparation of Developing Mouse Pituitary Gland

The pituitary gland or hypophysis is an important endocrine organ secreting hormones essential for homeostasis. It consists of two glands with separate embryonic origins and functions &#8212; the neurohypophysis and the adenohypophysis. The developing mouse pituitary gland is tiny and delicate with an elongated oval shape. A coronal section is preferred to display both the adenohypophysis and neurohypophysis in a single slice of the mouse pituitary.
The goal of this protocol is to achieve proper pituitary coronal sections with well-preserved tissue architectures from developing mice. In this protocol, we describe in detail how to dissect and process pituitary glands properly from developing mice. First, mice are fixed by transcardial perfusion of formaldehyde prior to dissection. Then three different dissecting techniques are applied to obtain intact pituitary glands depending on the age of mice. For fetal mice aged embryonic days (E) 17.5 - 18.5 and neonates up to 4 days, the entire sella regions including the sphenoid bone, gland, and trigeminal nerves are dissected. For pups aged postnatal days (P) 5 - 14, the pituitary glands connected with trigeminal nerves are dissected as a whole. For mice over 3 weeks old, the pituitary glands are carefully dissected free from the surrounding tissues. We also display how to embed the pituitary glands in a proper orientation by using the surrounding tissues as landmarks to obtain satisfying coronal sections. These methods are useful in analyzing histological and developmental features of pituitary glands in developing mice.

We present a protocol to dissect pituitary glands and prepare pituitary coronal sections from developing mice.

Diseksiyon ve fare hipofiz bezi geliştirme koronal dilim hazırlık

The pituitary gland or hypophysis is an important endocrine organ secreting hormones essential for homeostasis. It consists of two glands with separate ...

A Seminiferous Tubule Squash Technique for the Cytological Analysis of Spermatogenesis Using the Mouse Model

Meiotic progression in males is a process that requires the concerted action of a number of highly regulated cellular events. Errors occurring during meiosis can lead to infertility, pregnancy loss or genetic defects. Commencing at the onset of puberty and continuing throughout adulthood, continuous semi-synchronous waves of spermatocytes undergo spermatogenesis and ultimately form haploid sperm. The first wave of mouse spermatocytes undergoing meiotic initiation appear at day 10 post-partum (10 dpp) and are released into the lumen of seminiferous tubules as mature sperm at 35 dpp. Therefore, it is advantageous to utilize mice within this developmental time-window in order to obtain highly enriched populations of interest. Analysis of rare cell stages is more difficult in older mice due to the contribution of successive spermatogenic waves, which increase the diversity of the cellular populations within the tubules. The method described here is an easily implemented technique for the cytological evaluation of the cells found within the seminiferous tubules of mice, including spermatogonia, spermatocytes, and spermatids. The tubule squash technique maintains the integrity of isolated male germ cells and allows examination of cellular structures that are not easily visualized with other techniques. To demonstrate the possible applications of this tubule squash technique, spindle assembly was monitored in spermatocytes progressing through the prophase to metaphase I transition (G2/MI transition). In addition, centrosome duplication, meiotic sex chromosome inactivation (MSCI), and chromosome bouquet formation were assessed as examples of the cytological structures that can be observed using this tubule squash method. This technique can be used to pinpoint specific defects during spermatogenesis that are caused by mutation or exogenous perturbation, and thus, contributes to our molecular understanding of spermatogenesis.

The goal of this tubule squash technique is to rapidly assess cytological features of developing mouse spermatocytes while preserving cellular integrity. This method allows for the study of all stages of spermatogenesis, and can be easily implemented alongside other biochemical and molecular biological approaches for the study of mouse meiosis.

Seminifer tübül Squash tekniği fare modeli kullanarak sperma saytolojik analizi için

Meiotic progression in males is a process that requires the concerted action of a number of highly regulated cellular events. Errors occurring during ...

Single-cell Transcriptomic Analyses of Mouse Pancreatic Endocrine Cells

Pancreatic endocrine cells, which are clustered in islets, regulate blood glucose stability and energy metabolism. The distinct cell types in islets, including insulin-secreting &#946; cells, are differentiated from common endocrine progenitors during the embryonic stage. Immature endocrine cells expand via cell proliferation and mature during a long postnatal developmental period. However, the mechanisms underlying these processes are not clearly defined. Single-cell RNA-sequencing is a promising approach for the characterization of distinct cell populations and tracing cell lineage differentiation pathways. Here, we describe a method for the single-cell RNA-sequencing of isolated pancreatic &#946; cells from embryonic, neonatal and postnatal pancreases.

We describe a method for the isolation of endocrine cells from embryonic, neonatal and postnatal pancreases followed by single-cell RNA sequencing. This method allows analyses of pancreatic endocrine lineage development, cell heterogeneity and transcriptomic dynamics.

Fare pankreatik endokrin hücreleri tek hücre Transcriptomic analizleri

Pancreatic endocrine cells, which are clustered in islets, regulate blood glucose stability and energy metabolism. The distinct cell types in islets, ...

Tissue Preparation and Immunostaining of Mouse Craniofacial Tissues and Undecalcified Bone

Tissue immunostaining provides highly specific and reliable detection of proteins of interest within a given tissue. Here we describe a complete and simple protocol to detect protein expression during craniofacial morphogenesis/pathogenesis using mouse craniofacial tissues as examples. The protocol consists of preparation and cryosectioning of tissues, indirect immunofluorescence, image acquisition, and quantification. In addition, a method for preparation and cryosectioning of undecalcified hard tissues for immunostaining is described, using craniofacial tissues and long bones as examples. Those methods are key to determine the protein expression and morphological/anatomical changes in various tissues during craniofacial morphogenesis/pathogenesis. They are also applicable to other tissues with appropriate modifications. Knowledge of the histology and high quality of sections are critical to draw scientific conclusions from experimental outcomes. Potential limitations of this methodology include but are not limited to specificity of antibodies and difficulties of quantification, which are also discussed here.

Here, we present a detailed protocol to detect and quantify protein levels during craniofacial morphogenesis/pathogenesis by immunostaining using mouse craniofacial tissues as examples. In addition, we describe a method for preparation and cryosectioning of undecalcified hard tissues from young mice for immunostaining.

Fare Kraniyofacial dokularda ve Undecalcified kemik doku hazırlama ve Immünostasyon

Tissue immunostaining provides highly specific and reliable detection of proteins of interest within a given tissue. Here we describe a complete and ...

Isolation and Staining of Mouse Skin Keratinocytes for Cell Cycle Specific Analysis of Cellular Protein Expression by Mass Cytometry

The goal of this protocol is to detect and quantify protein expression changes in a cell cycle-dependent manner using single cells isolated from the epidermis of mouse skin. There are seven important steps: separation of the epidermis from the dermis, digestion of the epidermis, staining of the epidermal cell populations with cisplatin, sample barcoding, staining with metal tagged antibodies for cell cycle markers and proteins of interest, detection of metal-tagged antibodies by mass cytometry, and the analysis of expression in the various cell cycle phases. The advantage of this approach over histological methods is the potential to assay the expression pattern of &#62;40 different markers in a single cell at different phases of the cell cycle. This approach also allows for the multivariate correlation analysis of protein expression that is more quantifiable than histological/imaging methods. The disadvantage of this protocol is that a suspension of single cells is needed, which results in the loss of location information provided by the staining of tissue sections. This approach may also require the inclusion of additional markers to identify different cell types in crude cell suspensions. The application of this protocol is evident in the analysis of hyperplastic skin disease models. Moreover, this protocol can be adapted for the analysis of specific sub-type of cells (e.g., stem cells) by the addition of lineage-specific antibodies. This protocol can also be adapted for the analysis of skin cells in other experimental species.

This protocol describes how to isolate skin keratinocytes from mouse models, to stain with metal-tagged antibodies, and to analyze stained cells by mass cytometry in order to profile the expression pattern of proteins of interest in the different cell cycle phases.

Kütle sitometrisi ile hücresel protein Ifadesinin hücre döngüsü spesifik analizi için Mouse cilt keratinositlerin yalıtım ve boyama

The goal of this protocol is to detect and quantify protein expression changes in a cell cycle-dependent manner using single cells isolated from the ...

Dissection, Culture and Analysis of Primary Cranial Neural Crest Cells from Mouse for the Study of Neural Crest Cell Delamination and Migration

Over the past several decades there has been an increased availability of genetically modified mouse models used to mimic human pathologies. However, the ability to study cell movements and differentiation in vivo is still very difficult. Neurocristopathies, or disorders of the neural crest lineage, are particularly challenging to study due to a lack of accessibility of key embryonic stages and the difficulties in separating out the neural crest mesenchyme from adjacent mesodermal mesenchyme. Here, we set out to establish a well-defined, routine protocol for the culture of primary cranial neural crest cells. In our approach we dissect out the mouse neural plate border during the initial neural crest induction stage. The neural plate border region is explanted and cultured. The neural crest cells form in an epithelial sheet surrounding the neural plate border, and by 24 h after explant, begin to delaminate, undergoing an epithelial-mesenchymal transition (EMT) to become fully motile neural crest cells. Due to our two-dimensional culturing approach, the distinct tissue populations (neural plate versus premigratory and migratory neural crest) can be readily distinguished. Using live imaging approaches, we can then identify changes in neural crest induction, EMT and migratory behaviors. The combination of this technique with genetic mutants will be a very powerful approach for understanding normal and pathological neural crest cell biology.

This protocol describes the dissection and culture of cranial neural crest cells from mouse models, primarily for the study of cell migration. We describe the live imaging techniques used and the analysis of speed and cell shape changes.

Nöral Krest Hücre Delaminasyonu ve Göçü Çalışması İçin Fareden Birincil Kranial Nöral Krest Hücrelerinin Diseksiyonu, Kültürü ve Analizi

Over the past several decades there has been an increased availability of genetically modified mouse models used to mimic human pathologies. However, the ...