Protokol, mitokondriyal DNA moleküllerinin sayısında değişikliklere yol açan işlev bozukluğu olan proteinleri tanımlamayı amaçlamaktadır. Bu araştırma aynı zamanda mitokondriyal DNA'nın mitokondri içindeki dağılımını içeren faktörleri de ortaya çıkarabilir. Mitokondriyal replikasyon ve bakım mekanizmaları hala tam olarak anlaşılamamıştır.
Mitokondriyal genomların organoidler ve içinde yer alan proteinler içindeki dağılımını düzenleme konusunda çok daha az şey bilinmektedir. Sonuç olarak, bazı yeni oyuncuları tanımlamak ve karakterize etmek büyük önem taşıyacaktır. Tekniğin temel avantajı, yüksek verim ve yüksek içerik protokolüdür.
Aynı anda birçok deney koşulunu test edebilir ve tek bir deney sırasında çeşitli parametreleri ölçebiliriz. Genom çapındaki çalışmalarda, önerilen protokol, nükleer kodlanmış genetik bilginin mitokondriyal muadilini nasıl düzenlediğine dair küresel bir resmi özetlemek için bir fırsat sunmaktadır. Ek olarak, işlev bozukluğu mitokondriyal DNA stresine neden olan ve interferon yanıt yolunu aktive eden proteinleri tanımlama potansiyeline sahiptir.