突变全小鼠胚胎的单细胞 RNA 测序:从上胚层到原肠胚形成结束

我们专注于破译胚胎干细胞分化过程中控制早期细胞命运决策的机制，无论是在体外还是在小鼠模型中。复杂的调控网络指导发育过程中的分化，我们研究了信号通路、转录因子和表观遗传调节因子的相互作用如何促进不同的细胞命运。研究小鼠原肠胚形成的动态和快速过程在技术上具有挑战性，因为每个胚胎的细胞数量较少，而且每窝具有所需基因型的胚胎数量有限。

虽然文献广泛表明使用野生型或荧光激活细胞分选胚胎群对单细胞进行研究，但对具有谱系突变的胚胎的全面分析仍然有限。我们的协议提供了从携带谱系突变的原纤维胚胎生成单细胞组学数据集的可能性。它将帮助没有或有限的小鼠处理经验或想要学习早期胚胎操作或单细胞方法的科学家。

我们的方案将有助于回答原肠胚形成和早期器官发生（包括心脏发育）中的新科学问题。我们提供了一个以单细胞分辨率分析谱系特异性突变胚胎的管道，这将有助于分析特定基因在谱系定型中的作用。我们希望使用这种方法来了解原肠胚形成快速动态过程中细胞命运决定的调控机制。