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Method Article
In this manuscript, we present a high-throughput, semi-automated cryohistology platform to produce aligned composite images of multiple response measures from several rounds of fluorescent imaging on frozen sections of mineralized tissues.
There is an increasing need for efficient phenotyping and histopathology of a variety of tissues. This phenotyping need is evident with the ambitious projects to disrupt every gene in the mouse genome. The research community needs rapid and inexpensive means to phenotype tissues via histology. Histological analyses of skeletal tissues are often time consuming and semi-quantitative at best, regularly requiring subjective interpretation of slides from trained individuals. Here, we present a cryohistological paradigm for efficient and inexpensive phenotyping of mineralized tissues. First, we present a novel method of tape-stabilized cryosectioning that preserves the morphology of mineralized tissues. These sections are then adhered rigidly to glass slides and imaged repeatedly over several rounds of staining. The resultant images are then aligned either manually or via computer software to yield composite stacks of several layered images. The protocol allows for co-localization of numerous molecular signals to specific cells within a given section. In addition, these fluorescent signals can be quantified objectively via computer software. This protocol overcomes many of the shortcomings associated with histology of mineralized tissues and can serve as a platform for high-throughput, high-content phenotyping of musculoskeletal tissues moving forward.
Biologische Forschung erfordert oft effizienter Phänotypisierung, die häufig mit irgendeiner Art von histologischen Analyse 1-3 zugeordnet ist. Dieser Bedarf wird noch deutlicher , mit den ehrgeizigen Projekten jedes Gen im Mausgenom 4 zu stören. Diese histologischen Analysen können von der Beurteilung der Zellmorphologie und / oder anatomischen Merkmale zu Abbildungs Expression spezifischer Gene oder Proteine auf einzelne Zellen liegen. In der Tat ist einer der grundlegenden Beiträge der Histologie auf das Gebiet der Genomik ist die Fähigkeit, ein spezifisches molekulares Signal auf einen bestimmten Bereich oder Zelltyp zu assoziieren.
Traditionelle Methoden der Histologie, vor allem für Muskel-Skelett-Gewebe, sind oft zeitaufwendig und mühsam und erfordert manchmal Wochen zu beheben, entkalken, Abschnitt, Fleck, und Bild die Probe dann analysieren die Bilder über die menschliche Interpretation. Analysieren von mehreren molekularen Signale, ob über Immunhistochemie, in situ hybridizatIon oder spezielle Flecken, erfordert mehrere Abschnitte und sogar mehrere Proben in geeigneter Weise durchzuführen. Darüber hinaus können diese mehreren Reaktionen auf dieselbe Zelle nicht zusammen lokalisiert und manchmal nicht auf einen bestimmten Bereich innerhalb einer gegebenen Probe co-lokalisiert werden kann. Wie die Genomik und epigenomics Feld in das digitale Zeitalter bewegt, muss die histologische Feld auch nachziehen effizient mit hohem Durchsatz und automatisierte Analyse einer Vielzahl von molekularen Signalen innerhalb eines einzigen histologischen Schnitt zu liefern.
Tatsächlich gibt es eine Nachfrage nach verbesserten histologische Techniken, die mehrfache molekulare Signale zu spezifischen Zellen innerhalb eines gegebenen Probe zuordnen können. Vor kurzem haben wir einen neuen Hochdurchsatz - cryohistological Methode zur Beurteilung mehrerer Reaktionsmaßnahmen in einem bestimmten Abschnitt von mineralisiertem Gewebe 14.05 veröffentlicht. Das Verfahren beinhaltet die Kryoschnitt mit gefrorenen cryotape Stabilisierung der verschweißte Abschnitt anhaftenden starr an einem Mikroskop-Objektträger, undDurchführung von mehreren Runden der Färbung und Bildgebung auf jedem Abschnitt. Diese Runden der Bilder werden dann manuell oder über Computerautomatisierung vor der Bildanalyse (Figur 1) ausgerichtet ist . Hier stellen wir ausführliche Protokolle dieses Verfahrens und Beispiele geben, wo diese Techniken unser Verständnis von verschiedenen biologischen Prozessen verbessert.
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Die University of Connecticut Health Center institutionellen Tierpflege und Verwendung Ausschuss genehmigt alle Tierverfahren.
1. Fixation and Embedding
2. Band-stabilisiertes Gewebe Sectioning
3. Die Haftung der Abschnitte auf Objektträger
4. Anwendung der Referenzmarken auf Folien
5. Mehrere Runden von Anfärben
HINWEIS: Viele biologische Signale auf dem gleichen Gewebeabschnitt durch eine kompatible Sequenz von Abbildungs, Färbung und Wiederabbildungs Schritte der Auswahl ist es möglich, zu erkennen und zu co-lokalisieren. Jede Runde der Bildgebung / Färbung / Re-Imaging hat für die jeweilige histologische Frage entwickelt werden. Die Abbildungs / Färbungs / Wiederabbildungssequenz beinhaltet typischerweise die endogenen Fluoreszenzsignale Erfassen (zB zellulare GFP, Mineralisation Farbstoffe, in vivo Bildgebungssonden) auf der ersten Runde der Bildgebung durch Fluoreszenz gemultiplexten Immunofärbung und mehrere Runden von enzymatischer Aktivität Flecken gefolgt. Schließlich kann der Abschnitt mit chromogenen Farbstoffen gefärbt werden (zB H & E, Toluidinblau, Safranin O, etc.) , um die Gewebearchitektur hervorzuheben. Präsentiert in diesem Abschnitt sind benutzerdefinierte Methoden angepasst vonkommerziell verfügbaren Protokolle.
6. Mehrere Runden von Imaging
7. Bildmontage
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Ein Allgemeiner Workflow für die Hochdurchsatz, Multi-Bild Cryohistology
Abbildung 1 stellt die allgemeine Arbeitsablauf für diese Technik verwendet. Es umfasst mehrere Schritte, von der Fixierung durch mehrere Runden von Bildgebung und schließlich Ausrichtung / Bildanalyse. Der Prozess kann so wenig nehmen, wie in der Woche von Probe Fixierung durch 4 Runden der Bildgebung zu gehen, die we...
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Hier haben wir ein detailliertes cryohistology Protokoll vorgestellt zusammen lokalisieren und verschiedene biologische Maßnahmen quantifizieren durch Bilder von mehreren Runden der Färbung / Bildgebung auf einem einzigen Abschnitt auszurichten. Das Verfahren den cryotape umrissenen Verwendung ist besonders nützlich , da es die Morphologie schwierig Abschnitt Gewebe (zB mineralisiertem Knochen und Knorpel) beibehält. Zusätzlich wird das geschnittene Gewebe fest mit dem Glasträger, so dass für mehrere Run...
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The authors declare that they have no competing financial interests.
The authors would like to acknowledge the following funding sources: NIH R01-AR063702, R21-AR064941, K99-AR067283, and T90-DE021989.
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Name | Company | Catalog Number | Comments |
10% neutral buffered formalin | Sigma Aldrich | HT501128-4L | Multiple suppliers available. Toxic. Can be substituted with 4% paraformaldehyde. |
Sucrose | Sigma Aldrich | S9378 | Multiple suppliers available. |
PBS | Sigma Aldrich | P5368 | Multiple suppliers available. |
Cryomolds | Fisher Scientific | Fisherbrand #22-363-554 | Different sizes can be used depending on tissue |
Cryomatrix | Thermo Scientific | 6769006 | Can be substitituted with other cryomatrices. However, PVA/PEG-based resins have worked best in our hands. |
2-methyl-butane | Sigma Aldrich | M32631 | Multiple suppliers available. |
Cryostat | Leica Biosystems | 3050s | Can be substituted with other brands/models. |
Specimen disc | Leica Biosystems | 14037008587 | Can be substituted with other brands/models. |
Cryostat blades | Thermo Scientific | 3051835 | Can be substituted with other brands/models. |
Cryotape | Section Lab | Cryofilm 2C | |
Roller | Electron Microscopy Sciences | 62800-46 | Can be substituted with other brands/models. |
Plastic microscope slides | Electron Microscopy Sciences | 71890-01 | Can be substituted with other brands/models. |
Glass microscope slides | Thermo Scientific | 3051 | Can be substituted with other brands/models. |
Norland Optical Adhesive, 61 | Norland Optical | Norland Optical Adhesive, 61 | |
UV Black Light | General Electric | F15T8-BLB | |
Glacial acetic acid | Sigma Aldrich | ARK2183 | Multiple suppliers available. |
Chitosan | Sigma Aldrich | C3646 | Multiple suppliers available. |
InSpeck red microscopheres | ThermoFisher Scientific | I-14787 | |
InSpeck green microspheres | ThermoFisher Scientific | I-14785 | |
Calcein Blue | Sigma Aldrich | M1255 | Multiple suppliers available. |
Calcein | Sigma Aldrich | C0875 | Multiple suppliers available. |
Alizarin complexone | Sigma Aldrich | A3882 | Multiple suppliers available. |
Demeclocycline | Sigma Aldrich | D6140 | Multiple suppliers available. |
NaHCO3 | Sigma Aldrich | S5761 | Multiple suppliers available. |
Glycerol | Sigma Aldrich | G5516 | Multiple suppliers available. |
ELF 97 yellow fluorescent acid phosphatase substrate | ThermoFisher Scientific | E-6588 | |
DAPI | ThermoFisher Scientific | 62247 | Multiple suppliers available. Can be substituted with Hoechst 33342 or other nuclear dyes. |
TO-PRO-3 (Cy5 nuclear counterstain) | ThermoFisher Scientific | T3605 | |
Propidium Iodide | ThermoFisher Scientific | R37108 | Multiple suppliers available. |
Sodium acetate anhydrous | Sigma Aldrich | S2889 | Multiple suppliers available. |
sodium tartrate dibasic dihydrate | Sigma Aldrich | T6521 | Multiple suppliers available. |
Sodium nitrite | Sigma Aldrich | S2252 | Multiple suppliers available. |
Tris | Sigma Aldrich | 15504 | Multiple suppliers available. |
MgCl2 hexahydrate | Sigma Aldrich | M9272 | Multiple suppliers available. |
NaCl | Sigma Aldrich | S7653 | Multiple suppliers available. |
Fast Red TR Salt | Sigma Aldrich | F8764 | Multiple suppliers available. Can also be substituted with other substrate kits such as Vector Blue (Vector Laboratories, Cat# SK-5300) |
Naphthol AS-MX | Sigma Aldrich | N4875 | Multiple suppliers available. |
N,N dimethylformamide | Sigma Aldrich | D158550 | Multiple suppliers available. |
Toluidine blue O | Sigma Aldrich | T3260 | Multiple suppliers available. |
Axio Scan.Z1 | Carl Zeiss AG | Axio Scan.Z1 | Other linear or tiled scanners may also be used. |
DAPI Filter Set | Chroma Technology Corp. | 49000 | |
CFP Filter Set | Chroma Technology Corp. | 49001 | |
GFP Filter Set | Chroma Technology Corp. | 49020 | |
YFP Filter Set | Chroma Technology Corp. | 49003 | |
Custom yellow (ELF 97) Filter Set | Chroma Technology Corp. | custom; HQ409sp, HQ555/30m, 425dxcr | |
TRITC Filter Set | Chroma Technology Corp. | 49004 | |
Cy5 Filter Set | Chroma Technology Corp. | 49009 | |
CryoJane Tape Transfer System | Electron Microscopy Sciences | 62800-10 | Multiple suppliers available. |
CryoJane Tape Windows | Electron Microscopy Sciences | 62800-72 | Multiple suppliers available. |
CryoJane Adhesive Slides | Electron Microscopy Sciences | 62800-4X | Multiple suppliers available. |
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