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Dieses Protokoll beschreibt ein Wirkstoffscreening-Verfahren bei Zebrafischlarven 3-7 Tage nach der Befruchtung, gefolgt von einer morphologischen Beurteilung.
Zebrafische sind zu einem prominenten Modellorganismus für die translationale Forschung am Menschen, Toxizitätstests von kleinen Molekülen und Umweltschadstoffen, die therapeutische Wirkstoffforschung und andere biomedizinische Forschungsanwendungen geworden. Das vorgestellte Protokoll zielt darauf ab, einen klaren Leitfaden für das Wirkstoffscreening und die Toxizitätsprüfung bei Zebrafischlarven im Frühstadium (im Alter von 3-7 Tagen nach der Befruchtung, dpf) zu bieten. Es wurden mehrere Methoden zur Beschreibung von Toxizitätstests an Zebrafischlarven veröffentlicht, allerdings fehlt ein standardisiertes Protokoll für die Expositionsdauer, die Rate der Medienveränderungen und die Morphologiebewertung. Wir bestimmten experimentell das ideale Alter der Larven für die Durchführung der Experimente, die Plattengrößen, die für dieses Alter am besten geeignet sind, die Rate der Medienwechsel, die zuverlässige Ergebnisse liefern und gleichzeitig die Verschwendung der Testsubstanz begrenzen, und ein morphologisches Bewertungssystem, das auf statistische Weise leicht quantifizierbar ist. Das Manuskript beschreibt detailliert ein Protokoll für Toxizitätstests an Zebrafischlarven im Alter zwischen 3 und 7 dpf, das darauf abzielt, die Lücke in der Arzneimitteltoxizitätsprüfung zu schließen und den ersten Schritt zu einer standardisierten Methode ähnlich dem Fish Embryo Acute Toxicity Test zu machen.
Der Zebrafisch (Danio rerio) hat sich in jüngster Zeit zu einem leistungsfähigen Modellorganismus für Wirbeltiere entwickelt, der für Studien zur Förderung der biomedizinischen Forschung immer beliebterwird 1. Etwa 70 % der menschlichen proteinkodierenden Gene haben mindestens ein Zebrafisch-Ortholog, wobei ~82 % der menschlichen krankheitsverursachenden Gene mindestens ein orthologes Gen im Zebrafischhaben 2. Die genetische Konservierung, gepaart mit ähnlichen grundlegenden Organmustern und Morphologien, machen den Zebrafisch zu einem interessanten Modell für die Erforschung menschlicher Krankheiten, das artübergreifende Vergleiche auf molekularer Ebeneermöglicht 1,2,3, was für die Arzneimittelentwicklung von entscheidender Bedeutung ist.
Zebrafische entwickeln sich schnell, wobei sich die Schwanzknospe 10 h nach der Befruchtung (hpf) bildet und die ersten Somiten bei 16 hpf erscheinen. Die Embryonen schlüpfen ~2-3 Tage nach der Befruchtung (dpf) aus dem Chorion. Bei 4 dpf ist ihr Verdauungstrakt voll entwickelt und bei 5 dpf hat sich ihre Schwimmblase aufgebläht, so dass sie frei herumschwimmen und nach Nahrung jagen können. Trotz der Fähigkeit, sich mit 5 dpf zu ernähren, können Larven, die nicht gefüttert werden, ausschließlich mit Nährstoffen aus dem Dotter bis zu mindestens 7 dpf überleben, wodurch die Notwendigkeit einer externen Fütterung umgangen wird, die eine Kontamination verursachen und das Drogenscreening, die Toxikologie und Verhaltenstests beeinträchtigen kann4. Bei 7 dpf entwickeln die Larven auch einen vollständigen Körperbau mit mehreren rudimentären Organsystemen, einschließlich Herz und Gefäßen, Muskeln und Knochen 5,6. Zebrafischembryonen werden auch ex vivo befruchtet, entwickeln sich extern und sind in den frühen Lebensstadien optisch transparent, was sie für die Genbearbeitung und das Screening kleiner Moleküle sehr zugänglich macht3. Darüber hinaus ermöglichen ihre geringe Größe und ihre hohe Fruchtbarkeitsrate die Einbeziehung von mehr Replikaten, was die statistische Aussagekraft erhöht, sowie die Verwendung von Multi-Well-Platten, was das Wirkstoffvolumen einspart und den Durchsatz erhöht.
Das Screening neuartiger kleiner Moleküle in einem Tiermodell ist wichtig, um die Fähigkeit des Arzneimittels zu bestimmen, sowohl positive als auch unerwünschte Wirkungen hervorzurufen, und um so zu identifizieren, welche Verbindungen für weitere Tests geeignet sind und andere, die möglicherweise modifiziert werden müssen, um ihre Aktivität zu verändern. Im Rahmen des Wirkstoffscreenings muss die letale Konzentration 50 (LC50) der Zielsubstanz(en) identifiziert werden. Dies ergibt eine Arbeitskonzentration, die bei 50 % der Versuchstiere im Rahmen der vorläufigen Toxizitätsprüfung zum Tod führt.
Für Toxizitätstests an Zebrafischembryonen bis zu 96 h nach der Befruchtung (hpf) gibt es ein standardisiertes Protokoll, nämlich den Fish Embryo Acute Toxicity (FET) Test (TG236)7. Im FET-Test werden neu befruchtete Eier bis zu 96 Stunden lang fünf Konzentrationen einer Chemikalie ausgesetzt und auf Anzeichen von Letalität beobachtet, nämlich (i) Gerinnung der Eizellen, (ii) fehlende Somitbildung, (iii) fehlende Ablösung der Schwanzknospe vom Dottersack und (iv) fehlender Herzschlag. Der Test ermöglicht die Bestimmung der akuten Toxizität und des LC50. Darüber hinaus gibt es unter anderem Ratschläge zu den für das Screening zu verwendenden Testkammergrößen (24-Well-Platten), zur Verteilung der Eizellen in der Testkammer und zu den Haltungsbedingungen, um gültige und reproduzierbare Ergebnisse zu gewährleisten7.
Der FET-Test eignet sich zwar für Toxizitätstests im Embryonalstadium, geht aber nicht über 4 dpf hinaus. Bei Phänotypen, die sich zu diesem Zeitpunkt zu entwickeln beginnen (z. B. Mineralisierung der Notochord6), muss das Wirkstoffscreening weiter als 4 dpf gehen, um die morphologische Beurteilung dieses Gewebes zu ermöglichen. Darüber hinaus empfehlen wir, dass die Arzneimittelexposition mindestens einen Tag vor der Entwicklung des interessierenden Phänotyps beginnt. Unseres Wissens gibt es kein standardisiertes Protokoll ähnlich dem FET für das Wirkstoffscreening bei Zebrafischlarven im Frühstadium, insbesondere bei Zebrafischen im Alter von 3 bis 7 dpf. Obwohl mehrere Studien veröffentlicht wurden, in denen Drogentests an Zebrafischlarven jenseits von 4 dpf beschrieben wurden, mangelt es an Konsistenz in der verwendeten Methodik, einschließlich der Größe der Testkammern, der Anzahl der biologischen und technischen Replikate, der Rate der Medienwechsel, der Expositionsdauer und der bewerteten morphologischen Defekte 8,9,10,11,12,13 . Aus diesem Grund haben wir ein validiertes Protokoll für standardisierte Toxizitätstests entwickelt, gefolgt von der visuellen Beobachtung morphologischer Veränderungen in Zebrafischlarven bei 3-7 dpf. Das vorgeschlagene Protokoll kann anschließend für andere nachgelagerte Phänotypisierungsassays verwendet werden, wie z. B. Verhaltensanalysen, Genexpressionsprofile und Histomorphometrie.
Die Zebrafische wurden gemäß der EU-Richtlinie 2010/63/EU behandelt. Alle Versuche wurden von der Ethikkommission der Fakultät für Forschung (FREC) und dem Joint FREC Animal Research Sectoral Subcommittee (JFARSS) der Universität Malta genehmigt. Ein Flussdiagramm des vorgeschlagenen Protokolls ist in Abbildung 1 zu finden.
1. Herstellung, Sammlung und Pflege von Eiern
2. Vorbereitung der Testplatte
3. Morphologische Beurteilung
4. LC50 Bestimmung
5. Technische Repliken
Die Anomalien können einzeln oder kumulativ über den experimentellen Zeitraum bis 7 dpf betrachtet werden. Der maximale Morphologie-Score pro Anomalie kann verwendet werden, um morphologische Anomalien als Prozentsatz der Anzahl der verwendeten Larven zu berechnen. Wenn beispielsweise an Tag 7 die Morphologiewerte des Perikardödems bei 19 bzw. 20 für die Bewerter 1 bzw. 2 von 24 liegen, was bedeutet, dass 19 oder 20 Larven von 24 ein Perikardödem aufweisen, kann der prozentuale Wert wie folgt berechnet werden:
Die ergänzende Tabelle S1 zeigt die morphologischen Bewertungsergebnisse (beider Bewerter) bei 4 dpf nach Toxizitätstests für die Substanz Bosutinib, einen Tyrosinkinase-Inhibitor, der zur Behandlung der chronischen myeloischen Leukämie indiziert ist15. Die gleiche morphologische Bewertung wird für exponierte Fische im Alter von 5 dpf bis 7 dpf wiederholt. Die Verbindung wurde in einem Konzentrationsbereich von 100 μM bis 6,25 μM getestet. Drei technische Replikate wurden zu unterschiedlichen Zeitpunkten durchgeführt, und die durchschnittliche kumulative Mortalitätsrate bei 7 dpf wurde verwendet, um LC50 zu bestimmen, die Konzentration, bei der 50 % der Larven überleben. Der LC50 kann zu jedem beliebigen Expositionszeitpunkt bestimmt werden. Wir empfehlen jedoch, diesen mit 7 dpf zu berechnen.
Die kumulative durchschnittliche Mortalität bei 7 dpf wurde verwendet, um eine LC50-Kurve zu erstellen, die in Abbildung 3 zu sehen ist. Für Bosutinib wurde die LC50-Konzentration auf 37,95 μM geschätzt.
HINWEIS: Diese geschätzte LC50-Konzentration gilt ausschließlich für dieses Modellsystem und kann dann für weitere nachgelagerte Phänotypisierungsassays verwendet werden.
Abbildung 1: Schematische Darstellung des vorgeschlagenen Wirkstoffscreenings bei Larven bei 3-7 dpf. Die 96-Well-Testplatten sind für die Untersuchung von fünf Konzentrationen im Bereich von 100 μM bis 6,25 μM für die Substanz Bosutinib ausgelegt. Abkürzung: dpf = Tage nach der Befruchtung. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Abbildung 2: Repräsentative morphologische Defekte, die bei Zebrafischlarven bei 5 dpf bei verschiedenen chemischen Konzentrationen (2 Tage nach der Exposition) beobachtet wurden. (A) Kontroll-Zebrafisch (nicht betroffen), (B) Zebrafischlarve mit leichtem Perikardödem, (C) Zebrafisch mit schwerem Perikardödem und Dotterblutung, (D) Zebrafisch mit Entwicklungsverzögerung, verminderter Pigmentierung, kleiner Schwimmblase, (E) Zebrafisch mit geschwollenem Eigelb und geknickter Schwanzflosse, (F) Zebrafisch ohne Schwanzflosse, (G) Zebrafisch mit gebogenem Notochord, (H) Zebrafisch mit abgeschnittenem Schwanz, und (I) toter Zebrafisch mit Nekrose. Fehler sind mit roten Pfeilspitzen gekennzeichnet. Maßstabsleisten = 1 mm. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Abbildung 3: LC50-Kurve, die die Konzentration im Verhältnis zur %-Mortalität zeigt. Die fünf getesteten Konzentrationen betrugen 100 μM, 50 μM, 25 μM, 12,5 μM und 6,25 μM, wobei die Mortalität in % 100 %, 100 %, 29,2 %, 12,5 % bzw. 12,5 % betrug. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Morphologische Defekte | Beschreibung |
Perikardödem | Flüssigkeitsansammlung um das Herz herum bei gestrecktem Herzen und Fehlfunktion der Durchblutung |
Herzschläge (pro Minute) | Reduzierte Anzahl von Schlägen pro Minute |
Eidotter | Vorhandensein oder Fehlen von Dotterödemen oder Blutungen, die gleichzeitig mit Herzfehlern auftreten können |
Yolk Erweiterung | Eigelb, das geschwollen, dünn oder nicht vorhanden ist |
Gekrümmtes Notochord | Vorhandensein eines geknickten oder wellenförmigen Notochords und/oder eines gekrümmten Schwanzes |
Schwimmblase | Vorhandensein, Fehlen oder teilweise Entwicklung der Schwimmblase |
Pigmentierung | Weniger oder keine Melanozyten im Vergleich zu den unbehandelten Fischen gleichen Alters |
Nekrose | Vorhandensein (leicht oder schwer) oder Abwesenheit von Nekrose in irgendeinem Teil des Körpers |
Verzögerte Entwicklung | Verzögerte oder verzögerte Entwicklung im Vergleich zu Wildtyp-Kontrollen gleichen Alters. |
Reaktion auf Berührung | Verzögerte oder keine Reaktion nach einem Schreck (z. B. mit einer Pipettenspitze) |
Abschneiden | Fehlen eines hinteren Zebrafischkörpers (d.h. Bildung des Schwanzes) |
Flossen | Vorhandensein oder Fehlen der Schwanzflosse, die von einer dünnen Dotterverlängerung begleitet sein kann |
Reduzierte Körperachse | Fische, die normal aussehen, aber bei der Messung kürzer sind |
Tabelle 1: Eine Liste der visuellen morphologischen Defekte, die nach Studien zur Arzneimittelexposition beobachtet werden können.
Ergänzende Tabelle S1: Repräsentative morphologische Ergebnisse für Bosutinib bei 4 dpf (1 Tag nach Exposition). Bitte klicken Sie hier, um diese Tabelle herunterzuladen.
Zebrafische sind zu einem wichtigen Modell für das Drogenscreening geworden. Bei dem Versuch, eine Methodik zur Durchführung von Toxizitätstests zu bestimmen, fanden wir mehrere gegensätzliche Methoden aus verschiedenen Laboratorien 8,9,10,11,12,13. Die beschriebenen Methoden verwenden Larven in unterschiedlichem Alter, variablen experimentellen Zeitplänen, unterschiedlichen Raten von Mediumveränderungen und unterschiedlichen morphologischen Bewertungssystemen. Durch Versuch und Irrtum haben wir die beschriebene Methodik etabliert, die zuverlässige und reproduzierbare Ergebnisse geliefert hat.
Auswählen einer Plattengröße
Zunächst wurden die Versuche in einer 24-Well-Platte durchgeführt, um sicherzustellen, dass die Larven genügend Platz zum Bewegen und Wachsen hatten. Die Platten wurden mit 10 Larven pro Vertiefung, zwei Vertiefungen pro Konzentration und 1 ml Arzneimittellösung pro Vertiefung angeordnet. Diese Anordnung lieferte keine reproduzierbaren Ergebnisse, was zu der Schlussfolgerung führte, dass die Larven nicht die gleichen Mengen des Medikaments aus der Vertiefung aufnahmen. Die Versuche wurden dann mit einer 96-Well- und einer 48-Well-Platte mit einer Larve pro Well durchgeführt, die zeigten, dass Larven in 96-Well-Platten keine Wachstumsprobleme zeigten. Daher wurden die Experimente in einer 96-Well-Platte mit weniger Platz und Wirkstoffvolumen fortgesetzt.
Täglicher Mediumwechsel
Da Zebrafische das Arzneimittel aus dem Medium aufnehmen, stellten wir fest, dass ein gewisses Maß an Medienwechsel erforderlich ist, um eine konstante Konzentration des Arzneimittels im Medium aufrechtzuerhalten. Darüber hinaus werden durch einen Mediumwechsel potenzielle Abfallstoffe entfernt, die sich in der Vertiefung angesammelt haben und eine toxische Umgebung schaffen und zu verzerrten Ergebnissen führen können. Es wurde eine Studie mit Bosutinib durchgeführt, in der drei Platten für dasselbe Medikament aufgestellt wurden, eine ohne täglichen Mediumwechsel, eine mit einem täglichen halben Mediumwechsel und eine mit einem vollständigen täglichen Mediumwechsel. Während die Platte ohne Mediumwechsel eine erhöhte Mortalitätsrate aufwies, führten die Platten mit halbem und vollem Mediumwechsel zum gleichen Ergebnis um 7 dpf. So wurde ein täglicher halber Mediumwechsel gewählt. Diese Wahl sorgt für einen geringeren Verbrauch des teuren und begrenzten Testmaterials, das für weitere nachgelagerte Experimente benötigt werden könnte.
Dauer der Exposition
Das Alter der verwendeten Testlarven und die Dauer der Arzneimittelexposition, die in diesem Protokoll ausgewählt wurde, wurden durch unseren Phänotyp von Interesse, die Knochenmineralisierung, bestimmt. Da die Knochenbildung bei ~4 dpf beginnt, haben wir uns entschieden, mit dem Zebrafisch bei 3 dpf zu beginnen, um festzustellen, ob die Testchemikalien den Beginn der Knochenentwicklung beeinflussen. Anschließend beendeten wir die Studien zur Arzneimittelexposition bei 7 dph, da ab 8 dpf eine hohe Mortalität beobachtet wurde, da die mangelnde Fütterung die Ergebnisse verzerren könnte. Dennoch können die Zeitrahmen je nach Art der Studie und dem Phänotyp des Interesses angepasst werden.
Begrenzungen
Diese Methodik hat einige Einschränkungen. Das Übertragen von 3 dpf Zebrafischen auf Multi-Well-Testplatten ist zeitaufwändig. Ebenso mühsam ist es, das Medium aus den Vertiefungen zu entfernen, ohne die Larven aufzunehmen. Das Medium muss langsam mit einer Einkanalpipette aus jeder Vertiefung entnommen werden, um sicherzustellen, dass die Larven dabei nicht beschädigt werden. Darüber hinaus wird die Testverbindung zwar durch einen täglichen halben Wechsel des Mediums wieder aufgefüllt und die Entfernung von Abfallmaterial aus der Vertiefung sichergestellt, es ist jedoch keine Garantie, dass eine stabile Arzneimittelkonzentration in der Vertiefung während der 5-tägigen Exposition aufrechterhalten werden kann. Während die Hochleistungsflüssigkeitschromatographie-Analyse weitere Einblicke in die tatsächliche Menge des Medikaments geben könnte, die von jeder Larve absorbiert wird, würde der Test nicht mehr als Hochdurchsatz-Screening-Methode gelten.
Zusammenfassend lässt sich sagen, dass diese Methodik darauf abzielt, die Lücke in der Toxizitätsprüfung mit Zebrafischen jenseits von 4 dpf zu schließen, indem Schritte in Richtung eines standardisierten Protokolls unternommen werden, das auf Wildtyp-, Mutanten- und transgene Zebrafischlinien anwendbar ist und dem FET im Embryonalstadium ebenbürtig ist. Dies eröffnet Wege für andere nachgelagerte Phänotypisierungsassays, die in früheren Stadien möglicherweise nicht möglich sind.
Die Autoren erklären, dass keine Interessenkonflikte bestehen.
Die Autoren werden durch die Projekte ZeEBRA (R&I-2019-018), einen Fonds des Technology Development Programme (TDP), STRONG (R&I-2024-007L), einen TDPLite-Fonds, NASDAC (SINO-MALTA-2022-08), einen Zuschuss für wissenschaftliche und technologische Zusammenarbeit, und DEMONSTRATE (R&I-2018-007A), einen Go2Market-Zuschuss, unterstützt, die alle von XjenzaMalta für und im Namen der Stiftung für Wissenschaft und Technologie finanziert werden. Abbildung 1 wurde mit BioRender erstellt.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1.5 mL microcentrifuge tube | Starlab | E1415-1510 | |
10 µL micropipette (P10) | Gilson | F144802 | |
10/20 µL pipette tips | Starlab | S1110-3810 | |
1000 µL micropipette (P1000) | Gilson | F123602 | |
1000 µL pipette tips | Starlab | S1111-6001 | |
12-well plate | Starlab | CC7672-7512 | Sterile, single-wrapped, non-treated, with lid |
20 µL micropipette (P20) | Gilson | F123600 | |
200 µL micropipette (P200) | Gilson | F123601 | |
200 µL multi-channel pipette | Gilson | F81024 | |
200 µL pipette tips | Starlab | S1113-1006 | |
96-well plate | Starlab | CC7672-7596 | Sterile, single-wrapped, flat-bottom, non-treated, with lid |
Breeding tanks with inside grid sloping bottom, tank dividers and lids | Tecniplast | ZB17BTISLOP, ZB17BTE, ZB17BTL, ZB17BTD | Sloped inner tank |
Mesh strainer | / | / | |
Nitrile gloves | Mercator | / | / |
Petri-dish | Starlab | CC7672-3394/CC7672-3359 | 100 x 20 mm or 60 x 15 mm |
Leica M205 FCA Fluorescence stereo microscope | Leica | 10450826 | |
Peltier-cooled incubator including 2 shelves with light module cold white | Memmert | IPP110ecoplus, T8 | Equipped with day/night cycle |
Dimethyl Sulfoxide | Biochem Chemopharma | 504341000 | To prepare a 1% solution in E3 |
Calcium chlorided dihydrate | Biochem Chemopharma | 303080500 | To prepare E3 |
Magnesium sulfate heptahydrate | Biochem Chemopharma | 313060500 | To prepare E3 |
Potassium Chloride | Biochem Chemopharma | 316030500 | To prepare E3 |
SCREEN-WELL Wnt Pathway library (Bosutinib) | Enzo | BML-2838-0500 | |
Sodium Chloride | Fisher Scientific | S/3161/53 | To prepare E3 |
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