Kosteneffizientes transkriptomisches Wirkstoff-Screening

Die Transkriptomik ermöglicht es uns, ein tiefes Verständnis des zellulären Programms und seiner Reaktion auf äußere Veränderungen zu erlangen. Trotz einer erheblichen Reduzierung der Kosten für die Bibliotheksproduktion und die Sequenzierung in den letzten Jahrzehnten ist die Anwendung dieser Technologie in dem für das Drogenscreening erforderlichen Umfang immer noch unerschwinglich, was das große Potenzial dieser Methoden behindert. Unsere Studie stellt ein kostengünstiges System für das Transkriptom-basierte Wirkstoff-Screening vor, das miniaturisierte Störungskulturen mit Mini-Bulk-Transkriptomik kombiniert.

Das optimierte Mini-Bulk-Protokoll liefert informative biologische Signale in kostengünstiger Sequenzierungstiefe und ermöglicht so ein umfangreiches Screening bekannter Medikamente und neuer Moleküle. Einer der Hauptvorteile der Kombination von Transkriptomik und unvoreingenommenem Wirkstoff-Screening ist das Potenzial, neue Wirkstoffziele zu identifizieren, die bisher nicht in Betracht gezogen wurden. Herkömmliche Wirkstoff-Screening-Ansätze konzentrieren sich oft auf etablierte Zielmoleküle oder -wege, was die Identifizierung neuer Zielmoleküle behindert und möglicherweise zu Medikamenten mit unvorhergesehenen Nebenwirkungen und eingeschränkter Wirksamkeit führt.