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Method Article
Una técnica para sondear la compartimentación balsa lipídica de proteínas fluorescentes en la membrana plasmática de las células vivas se describe. Se aprovecha de la disparidad en los tiempos de difusión de proteínas localizadas dentro o fuera de las balsas lipídicas. Adquisición puede llevar a cabo dinámicamente en condiciones de control o después de la adición del fármaco.
En los últimos quince años la idea de que las membranas celulares no son homogéneas y se basan en microdominios de ejercer sus funciones ha sido ampliamente aceptada. Las balsas de lípidos son microdominios de membrana enriquecidos en colesterol y esfingolípidos. Ellos juegan un papel importante en procesos fisiológicos celulares, tales como la señalización y el tráfico de 1,2, pero también se cree que ser los principales actores en varias enfermedades, incluyendo infecciones virales o bacterianas y las enfermedades neurodegenerativas 3.
Sin embargo, su existencia sigue siendo un tema de controversia 4,5. De hecho, el tamaño de lípidos balsa ha sido estimada en alrededor de 20 nm, 6, ahora bajo el límite de resolución de la microscopía convencional (alrededor de 200 nm), lo que impide su imagen directa. Hasta ahora, las principales técnicas utilizadas para evaluar la partición de proteínas de interés dentro de las balsas de lípidos son las membranas resistente a detergentes (DRM) de aislamiento y co-parches con anticuerpos. Aunque ampliamente utilizado becael uso de su puesta en práctica bastante fácil, estas técnicas eran propensos a objetos y, por tanto criticó 7,8. Las mejoras técnicas fueron por tanto, necesario para superar estos artefactos y ser capaz de sondear lípidos partición balsas en células vivas.
Aquí presentamos un método para el análisis de sensibilidad de los lípidos balsas partición de las proteínas marcadas con fluorescencia o lípidos en la membrana plasmática de las células vivas. Este método, denominado espectroscopía de correlación de fluorescencia (FCS), se basa en la disparidad de tiempos de difusión de sondas fluorescentes situados dentro o fuera de las balsas de lípidos. De hecho, como se evidencia en las dos membranas artificiales y cultivos de células, las sondas se difundiría mucho más rápido fuera que dentro de las balsas de lípidos densos 9,10. Para determinar los tiempos de difusión, minuto fluctuaciones de fluorescencia se mide como una función del tiempo en un volumen focal (aproximadamente 1 femtoliter), situado en la membrana plasmática de las células con un microscopio confocal (fig.1). Las curvas de correlación automática, entonces se puede extraer de estas fluctuaciones y provistos de adecuados modelos de difusión matemáticos 11.
FCS puede ser utilizado para determinar la balsa lipídica de partición de sondas diferentes, siempre y cuando se fluorescentemente marcados. Fluorescente de marcado se puede lograr mediante la expresión de proteínas de fusión fluorescentes o mediante la unión de ligandos fluorescentes. Además, FCS puede ser utilizado no sólo en membranas artificiales y líneas celulares, sino también en cultivos primarios, como se ha descrito recientemente 12. También puede ser utilizado para seguir la dinámica de la partición de lípidos balsa después de la adición de drogas o lípidos de membrana cambio composición 12.
1. La calibración de la instalación de FCS
2. La tinción de las células vivas con el marcador de lípidos balsas
3. FCS de adquisición de datos en las células vivas
4. FCS Análisis de Datos
5. Los resultados representativos
Un ejemplo de una calibración de FCS con una toxina del cólera-Alexa488 solución se muestra en la Figura 3 . Después de comprobar que las medidas individuales de fluorescencia como una función del tiempo no mostró ninguna fotoblanqueo (Figura 3A), individual y medio de curvas de FCS se calcularon. Mean curvas FCS se ajustaron con las ecuaciones que corresponden a diferentes modelos de difusión (ejemplos de la Figura 2). El parámetro clásicamente considerados para determinar la calidad de un ajuste es el coeficiente de determinación R 2. Cuanto más cerca R 2 a 1, mejor será el ajuste. En este caso, el modelo más exacto para adaptarse a la curva media FCS es la que describe una una población de moléculas que se difunden libremente fluorescentes en tres dimensiones (Ecuación 1 en la Figura 2 y Figura 3B). El tiempo de difusión derivado del ajuste es de 0,32 ms. Residuos de ajuste de curvas (Figura 3C) y R 2 factores (0,99906) dar una estimación de la calidad del ajuste.
Un ejemplo de análisis de FCS de la toxina del cólera Alexa488 manchada HEK293 células se muestra en la Figura 5. La media multifásica forma de la curva de FCS pone de manifiesto la existencia de poblaciones de moléculas fluorescentes con diferentes tiempos de difusión. El mejor ajuste para esta curva corresponde a un modelo con tres poblaciones de sondas fluorescentes: dos con una difusión obstaculizado (difusión en dos dimensiones como en el plano de membrana) y un difusor libremente en tres dimensiones (ecuación 2 en la Figura 2 y Figura 5) . Esta última población corresponde a moléculas fluorescentes que se desplazan fuera del plano de la membrana, es decir, ya sea vinculante o no vinculante a sus objetivos de la membrana, alcanzando la membrana a través de la vía de secreción o reciclado, o salir de la membrana por endocitosis. Los dos tiempos de difusión en la membrana, que corresponden a la toxina del cólera obligado a GM1, eran de 2 ms (25% de las moléculas), correspondiente a la difusión fuera de las balsas de lípidos, y 75 ms (50% de las moléculas), correspondiente a la difusión en las balsas de lípidos . Tenga en cuenta que cualquier fotoblanquearción durante la adquisición dará lugar a largos tiempos de difusión artificiales por lo tanto, posiblemente, la creación de un sesgo hacia la localización de GM1 en los dominios de balsas lipídicas.
Figura 1. Representación esquemática de la FCS de configuración (foto modificada de Marquer et al. 12)
Figura 2. Ejemplo de modelos de difusión y las ecuaciones correspondientes se utilizan para ajustar las curvas de autocorrelación. El parámetro estructura S se puede escribir como S = 0 z / w 0 con z 0 el radio focal efectiva a lo largo del eje óptico en 1/2 e intensidad y la w0 efectiva lateral de coordinación en la radio de 1/2 e intensidad. Estos valores se pueden extraer de un diferencial clásica función de punto (PSF) de medición.
Figura 3. Evaluación de tiempo de difusión de la toxina del cólera-Alexa488 en solución para la calibración de FCS. A) fluctuación de fluorescencia como una función del tiempo para un ejemplo representativo de una adquisición de 30 segundos. B) La media de la curva de autocorrelación obtenido a partir de 10 muestras de 30 segundos de adquisición equipados con la ecuación 1 (ver Figura 2). C) Residuos de ajuste de la curva.
Figura 4. HEK-293 células se tiñeron con la toxina del cólera Alexa488. Las celdas eran imágenes en un microscopio confocal SP5 (Leica Microsystems, Wetzlar, Alemania) con la línea de láser de 488 nm interna. La fluorescencia se recogió con un objetivo x60 apocromático plan de inmersión en aceite entre 500y 650 nm.
Figura 5. Evaluación de tiempo de difusión de la toxina del cólera-Alexa488 en la membrana plasmática de las células HEK293. A) La media de la curva de autocorrelación equipado con la ecuación 2 (véase Figura 2). B) Residuos de ajuste de la curva. (Modificado de Marquer et al. 12)
El método de FCS se presenta aquí permite un análisis sensible y rápido de la compartimentación balsa lipídica de sondas fluorescentes de interés en células vivas. FCS combina la precisión de la localización de la microscopía confocal con la sensibilidad de conteo de fotones individuales. La diferencia principal entre FCS y técnicas estándar bioquímicos es que FCS permite la determinación absoluta de la partición de lípidos balsas de la diana y no la partición relativa como es el caso para el aislamien...
No hay conflictos de interés declarado.
Este trabajo fue apoyado por una beca de la Agence Nationale de la Recherche (ChoAD). También estamos agradecidos a la Fundación ICM (Instituto del Cerveau et de la Moelle) por su apoyo financiero.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Nombre del reactivo | Empresa | Número de catálogo | Comentarios |
El cólera subunidad B de la toxina-Alexa 488 | Invitrogen | C-34775 | MW (pentámero) = 57 kg / mol |
Microscopio confocal | Leica | SP5 | |
Incubadora de la temperatura y el CO 2 de control | La vida de imágenes de servicios | El Cubo y la Caja de | |
SPAD (solo diodo avalancha de fotones) | MPD (Micro Devices fotón) | PDM serie (100 m zona sensible) | |
Paso alto 488 nm filtro | Semrock | 488 nm de bloqueo borde Brightline largo filtro de paso Parte #ails.aspx? id = FF01-488/LP-25 "target =" _blank "> FF01-488/LP-25 | |
FCS unidad de detección | Picoquant | Picoharp 300 módulos | |
Adquisición y software de auto-correlación | Picoquant | SymPhoTime | |
Software de adaptación | OriginLab | OriginPro8 |
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