Registro conjunto multimodal entre dispositivos y sin marcadores de modalidades de imagen preclínica

Desarrollamos herramientas de software para la obtención de imágenes preclínicas, incluida la reconstrucción, fusión, segmentación y cuantificación de imágenes. Nuestro software está diseñado para ser fácil de usar, eficiente y compatible con cualquier dispositivo de imagen de animales pequeños para permitir un análisis cuantitativo reproducible de los datos de imagen multimodal adquiridos. La automatización es un tema importante en nuestro campo porque el análisis manual suele llevar demasiado tiempo, es propenso a errores y difícilmente reproducible.

La automatización basada en software puede hacer que el análisis sea eficiente y reproducible, pero el desafío está en hacer que la automatización sea lo suficientemente robusta. Los dispositivos de imagen para animales pequeños proporcionan datos de imagen volumétrica de ratones y ratas de laboratorio anestesiados, y permiten la evaluación no invasiva de los cambios patológicos y fisiológicos. Los dispositivos multimodales integrados combinan los puntos fuertes de múltiples modalidades, como Micro-CT y PET.

También es posible combinar dos dispositivos separados. Desarrollamos software para la fusión automatizada de modalidades especiales, como Micro-CT y FMT. También proporcionamos un software eficiente para la fusión interactiva de imágenes y definimos un nuevo formato de archivo para almacenar los datos de la imagen, considerando aspectos de la curación de datos.

El año pasado, publicamos un enfoque para la compuerta respiratoria retrospectiva en entornos de alto rendimiento. Nuestro protocolo reside en una matriz de transformación, que se genera mediante un paso de calibración que involucra estructuras visibles como marcadores de referencia. Luego, la fusión de imágenes se puede automatizar utilizando esta matriz de transformación, lo que elimina la necesidad de marcadores.