Yazar Spotlight: Birden Fazla Preklinik Görüntüleme Modalitesinin Otomatik Füzyonu için Verimli ve Sağlam Bir Yazılım

Görüntü rekonstrüksiyonu, füzyon, segmentasyon ve niceleme dahil olmak üzere klinik öncesi görüntüleme için yazılım araçları geliştiriyoruz. Yazılımımızın, elde edilen multimodal görüntü verilerinin tekrarlanabilir kantitatif analizini sağlamak için kullanıcı dostu, verimli ve herhangi bir küçük hayvan görüntüleme cihazıyla uyumlu olması amaçlanmıştır. Otomasyon, alanımızda önemli bir konudur, çünkü manuel analiz genellikle çok zaman alıcıdır, hataya açıktır ve neredeyse hiç tekrarlanabilir değildir.

Yazılım tabanlı otomasyon, analizi verimli ve tekrarlanabilir hale getirebilir, ancak zorluk, otomasyonu yeterince sağlam hale getirmektir. Küçük hayvan görüntüleme cihazları, anestezi uygulanmış laboratuvar fareleri ve sıçanlarının hacimsel görüntü verilerini sağlar ve patolojik ve fizyolojik değişikliklerin invaziv olmayan değerlendirmesine izin verir. Entegre multimodal cihazlar, Mikro-CT ve PET gibi çoklu modalitelerin güçlü yönlerini birleştirir.

İki ayrı cihazı birleştirmek de mümkündür. Micro-CT ve FMT gibi özel modalitelerin otomatik füzyonu için yazılım geliştirdik. Ayrıca etkileşimli görüntü füzyonu için verimli bir yazılım sağladık ve veri iyileştirmenin yönlerini göz önünde bulundurarak görüntü verilerini depolamak için yeni bir dosya formatı tanımladık.

Geçen yıl, yüksek verimli ortamlarda retrospektif solunum kapısı için bir yaklaşım yayınladık. Protokolümüz, referans belirteçleri gibi görünür yapıları içeren bir kalibrasyon adımı kullanılarak oluşturulan bir dönüşüm matrisinde bulunur. Ardından, görüntü füzyonu, işaretleyicilere olan ihtiyacı ortadan kaldıran bu dönüştürme matrisi kullanılarak otomatikleştirilebilir.