Nous développons des outils logiciels pour l’imagerie préclinique, y compris la reconstruction, la fusion, la segmentation et la quantification d’images. Notre logiciel se veut convivial, efficace et compatible avec tout appareil d’imagerie de petits animaux afin de permettre une analyse quantitative reproductible des données d’image multimodales acquises. L’automatisation est un sujet important dans notre domaine, car l’analyse manuelle est souvent trop chronophage, sujette aux erreurs et difficilement reproductible.
L’automatisation logicielle peut rendre l’analyse efficace et reproductible, mais le défi consiste à rendre l’automatisation suffisamment robuste. Les appareils d’imagerie pour petits animaux fournissent des données d’image volumétrique de souris et de rats de laboratoire anesthésiés, et permettent une évaluation non invasive des changements pathologiques et physiologiques. Les dispositifs multimodaux intégrés combinent les forces de plusieurs modalités, telles que le Micro-CT et le PET.
Il est également possible de combiner deux appareils distincts. Nous avons développé un logiciel pour la fusion automatisée de modalités spéciales, telles que Micro-CT et FMT. Nous avons également fourni un logiciel efficace pour la fusion interactive d’images et défini un nouveau format de fichier pour stocker les données d’image, en tenant compte des aspects de la conservation des données.
L’année dernière, nous avons publié une approche pour le déclenchement respiratoire rétrospectif dans des paramètres à haut débit. Notre protocole réside dans une matrice de transformation, qui est générée à l’aide d’une étape de calibrage qui implique des structures visibles telles que des marqueurs repères. Ensuite, la fusion d’images peut être automatisée à l’aide de cette matrice de transformation, ce qui élimine le besoin de marqueurs.
