Sviluppiamo strumenti software per l'imaging preclinico, tra cui la ricostruzione, la fusione, la segmentazione e la quantificazione delle immagini. Il nostro software è pensato per essere facile da usare, efficiente e compatibile con qualsiasi dispositivo di imaging di piccoli animali per consentire un'analisi quantitativa riproducibile dei dati di immagine multimodale acquisiti. L'automazione è un argomento importante nel nostro campo perché l'analisi manuale è spesso troppo dispendiosa in termini di tempo, soggetta a errori e difficilmente riproducibile.
L'automazione basata su software può rendere l'analisi efficiente e riproducibile, ma la sfida consiste nel rendere l'automazione sufficientemente robusta. I dispositivi di imaging per piccoli animali forniscono dati di immagine volumetrica di topi e ratti di laboratorio anestetizzati e consentono una valutazione non invasiva dei cambiamenti patologici e fisiologici. I dispositivi multimodali integrati combinano i punti di forza di più modalità, come la Micro-CT e la PET.
È anche possibile combinare due dispositivi separati. Abbiamo sviluppato software per la fusione automatizzata di modalità speciali, come Micro-CT e FMT. Abbiamo anche fornito un software efficiente per la fusione interattiva delle immagini e definito un nuovo formato di file per memorizzare i dati delle immagini, considerando gli aspetti della cura dei dati.
L'anno scorso abbiamo pubblicato un approccio per il gating respiratorio retrospettivo in contesti ad alto rendimento. Il nostro protocollo risiede in una matrice di trasformazione, che viene generata utilizzando una fase di calibrazione che coinvolge strutture visibili come i marcatori fiduciali. Quindi, la fusione delle immagini può essere automatizzata utilizzando questa matrice di trasformazione, che elimina la necessità di marcatori.
