Desenvolvemos ferramentas de software para imagens pré-clínicas, incluindo reconstrução, fusão, segmentação e quantificação de imagens. Nosso software deve ser fácil de usar, eficiente e compatível com qualquer dispositivo de imagem de pequenos animais para permitir a análise quantitativa reprodutível dos dados de imagem multimodal adquiridos. A automação é um tópico importante em nosso campo porque a análise manual geralmente é muito demorada, propensa a erros e dificilmente reproduzível.
A automação baseada em software pode tornar a análise eficiente e reproduzível, mas o desafio está em tornar a automação robusta o suficiente. Os dispositivos de imagem de pequenos animais fornecem dados de imagem volumétrica de camundongos e ratos de laboratório anestesiados e permitem a avaliação não invasiva de alterações patológicas e fisiológicas. Dispositivos multimodais integrados combinam os pontos fortes de várias modalidades, como Micro-CT e PET.
Também é possível combinar dois dispositivos separados. Desenvolvemos softwares para a fusão automatizada de modalidades especiais, como Micro-CT e FMT. Também fornecemos um software eficiente para fusão interativa de imagens e definimos um novo formato de arquivo para armazenar os dados da imagem, considerando aspectos da curadoria de dados.
No ano passado, publicamos uma abordagem para gating respiratório retrospectivo em configurações de alto rendimento. Nosso protocolo reside em uma matriz de transformação, que é gerada usando uma etapa de calibração que envolve estruturas visíveis, como marcadores fiduciais. Em seguida, a fusão de imagens pode ser automatizada usando essa matriz de transformação, o que elimina a necessidade de marcadores.
