Ce protocole détaille une méthode cruciale pour caractériser et purifier avec précision les cellules souches mésenchymateuses humaines sur une seule plateforme, permettant des applications efficaces en aval comme la transplantation de cellules souches. Il est particulièrement important pour les laboratoires cliniques qui améliorent les tests moléculaires et cytogénétiques grâce à un tri précis des cellules souches génétiques ou naturelles. Les méthodes couramment utilisées pour isoler les populations de cellules souches purifiées font référence à des techniques telles que la séparation immunomagnétique, le gradient de densité ou le tri cellulaire microfluidique.
Une technique comme le tri par index permet de le relier au profilage de l’ARN d’une cellule unique qui permet d’extraire l’information transcriptomique de chaque cellule triée. Les principaux défis consistent à maintenir la qualité des échantillons, à optimiser les conditions de culture cellulaire, y compris la densité et la viabilité des cellules pendant et après le tri. De plus, il serait également envisagé de choisir des tailles de buses appropriées pour l’instrument et d’assurer un accès rapide aux trieurs.
Ce protocole illustre un panel de coloration précis pour l’immunophénotypage et le tri de la population cellulaire souhaitée. Il garantit une qualité d’échantillon standardisée, une viabilité cellulaire optimale, une densité pour le tri des populations cellulaires et définit les paramètres expérimentaux de tri sur le logiciel FACSDiva. Cette méthode permet une sélection et un immunophénotypage simples d’une population de cellules souches exprimant des biomarqueurs spécifiques.
Cette plate-forme simple permet un tri efficace en fonction de la population cible, ce qui facilite et permet d’obtenir des échantillons purifiés pour des applications ultérieures en aval.