Method Article
האדם המושרה בתאי גזע pluripotent (hiPSCs) נחשבים כלי רב עוצמה עבור סריקה וכימיים ההקרנה ופיתוח של מודלים חדשים במבחנה לבדיקת רעילות, כולל נוירוטוקסיטי. הנה, פרוטוקול מפורט עבור ההבחנה של hiPSCs לתוך נוירונים וגליה מתואר.
האדם בתאי גזע pluripotent יכול להבדיל סוגים שונים של תאים שניתן ליישם את האדם מבוסס מבחני רעילות מבחנה . אחד היתרונות העיקריים הוא שתכנות מחדש של תאים סומטיים לייצר תאי גזע פלוריפוטנטיים המושרשים על ידי האדם (hiPSCs) נמנעים מהנושאים האתיים והחקיקתיים הנוגעים לשימוש בתאי גזע עובריים אנושיים (hESC). HiPSCs ניתן להרחיב ו הבדיל ביעילות לסוגים שונים של תאים עצביים ותאי גלייה, המשמשים מערכות בדיקה לבדיקת רעילות, בפרט, לצורך הערכת מסלולים שונים המעורבים neurotoxicity. עבודה זו מתארת פרוטוקול ההבחנה של hiPSCs לתוך תרבויות מעורבות של תאים עצביים ותאי גלייה. מסלולי האיתות המווסתים ו / או מופעלים על ידי הבחנה נוירונים מוגדרים. מידע זה הוא קריטי ליישום המודל התא כדי פרדיגמה חדשה בדיקת רעילות, שבו כימיקלים מוערכים על בסיס יכולתם peRturb מסלולים ביולוגיים. כהוכחה לקונספט, rotenone, מעכב של מיטוכונדריה מורכבת I, שימש כדי להעריך את ההפעלה של נתיב איתות Nrf2, רגולטור מפתח של מנגנון נוגד חמצון תגובה אלמנט - (ARE) מונע מנגנון הגנה הסלולר נגד מתח חמצוני .
המועצה הלאומית למחקר של ארה"ב דו"ח 1 חזה חדש בדיקת רעילות פרדיגמה שבה בדיקות רעילות רגולטורית יועברו מתוך גישה להסתמך על שינויים פנוטיפי שנצפה בבעלי חיים לגישה המתמקדת מבחני מבחנה מכניסטית באמצעות תאים אנושיים. נגזרות של תאי גזע Pluripotent (PSC) עשויות לייצג חלופות למודלי תאים סרטניים, שכן התאים המתקבלים עשויים להיות דומים יותר לתנאים הפיזיולוגיים של רקמות האדם ולספק כלים רלוונטיים יותר לחקר השפעות שליליות הנגרמות על ידי כימי. שני סוגים עיקריים של תרבויות PSC כי הם המבטיחים ביותר לבדיקת רעילות הם תאי גזע עובריים אנושיים (hESCs) ו האדם המושרה בתאי גזע pluripotent (hiPSCs), אשר נמצאים בשימוש נרחב בתחומי מחקר בסיסי רפואה משובי 2 , 3 . מומחיות זו יכולה כעת להיות רתום לפיתוח של סוג חדש של toxicoloGical במבחנה בדיקות שמטרתן לזהות את המסלולים הפיזיולוגיים מוטרד מעורב עם התפתחות של תופעות לוואי in vivo . עם זאת, שיטות בדיקה עבור הערכות בטיחות רגולטורית המבוססת על hESCs יהיה סביר להתקבל על ידי כל המדינות החברות באיחוד האירופי ועל ידי מדינות ברחבי העולם בשל חששות אתיים אפשריים ומדיניות החקיקה הלאומית מגוונים המסדיר את השימוש בתאים הנגזרים העובר.
HiPSCs לשתף מאפיינים דומים hESCs 4 , 5 ו להחזיק פוטנציאל גדול לשיטות חוץ גופית , הן לזיהוי מטרות טיפוליות, כמו גם עבור הערכות בטיחות. בנוסף, הטכנולוגיה hiPSC מפחית את האילוצים של מאגר התורם מוגבל ואת החששות האתיים הקשורים תאים הנגזרות העובר. האתגר העיקרי עבור hiPSCs היא ההוכחה כי תאים אלה יכולים reproducibly ליצור מגוון משמעותי של נגזרות תאים הרלוונטיים מבחינה רעילה,עם מאפיינים ותגובות אופייניות לרקמות אנושיות. רמות מוגדרות מראש של סמנים נבחרים משמשים בדרך כלל לאפיון אוכלוסיות תאים לאחר תהליך ההבחנה ולספק תובנות לגבי היציבות של תהליך ההבחנה.
עבודות קודמות העריכו התאמה של hiPSCs ליצירת תרבויות מעורבות של תאים עצביים ותאי גלייה, ולהעריך את ההשפעות של רוטנון, מעכב של המורכבות הנשימתיות המיטוכונדריאליות I, בהפעלת נתיב Nrf2, וסת רגולציה של מנגנוני הגנה נוגדי חמצון סוגי תאים רבים 6 , 7 .
עבודה זו מתארת פרוטוקול המשמש להבחנה של hiPSCs לתוך תרבויות מעורבות נוירונים וגליאלי, מתן פרטים על מסלולי איתות (רמת גן וחלבון) המופעלים על בידול נוירוני / גליאלי. בנוסף, העבודה מראה נציג תוצאות המדגים כיצד זהHiPSC הנגזרות תאים תאיים נוירונים ותאי גלייה ניתן להשתמש כדי להעריך Nrf2 הפעלת איתות המושרה על ידי טיפול אקוטי (24 שעות) עם rotenone, המאפשר הערכה של אינדוקציה מתח חמצוני.
IMR90 fibroblasts היו מתוכנתים לתוך hiPSCs ב I-Stem (צרפת) על ידי התמרה ויראלי של 2 גורמי שעתוק (Oct4 ו Sox2) באמצעות וקטורים pMIG 6 . מודלים hiPSC אנלוגי יכול להיות מיושם גם. הפרוטוקולים המתוארים להלן מסכמים את כל השלבים של ההבחנה בין hiPSCs לתאי גזע עצביים (NSCs) ובין תרבויות מעורבות של נוירונים פוסט-מיטוטיים ותאי גלייה (שלבים 1 ו -2, ראו גם את האתר של EURL ECVAM DBALM לתיאור מפורט של הפרוטוקול) 8 .
פרוטוקול נוסף לבידוד, הרחבה, cryopreservation, והבחנה נוספת של NSCs לתוך נוירונים מעורבים ותאי גלייה מפורטת בשלבים 3 ו 4 (גם מתייחסים EURL ECVAM DBALM אנחנוBsite לתיאור מפורט של פרוטוקול זה) 9 . שלב 5 מתאר את הניתוחים שניתן לעשות כדי להעריך את הזהות פנוטיפי של התאים במהלך שלבים שונים של מחויבות בידול.
1. הרחבת תאי גזע פלוריפוטנטיים (hiPSC)
הערה: hiPSCs יכול להיות מתורבת על מצע תערובת חלבון מתאים בנוכחות mTeSR1 בינוני המכיל mTeSR1 5x ספקים (מוכן בעקבות הוראות היצרן, צלחת ~ 100 שברי מושבה / צלחת פטרי 60 מ"מ). כאשר מושבות hiPSC להגיע לגודל המתאים (ראה דוגמה המושבה באיור 2A ), להעביר את התאים כמתואר להלן (פעם בשבוע).
2. HiPSC DiffereNtiation לתוך נוירונים מעורב וגליה
הערה: ההליך אורך כ -28 יום, עם השלבים העיקריים המתוארים באיור 1 (החלק העליון).
איור 1: ייצוג סכמטי של פרוטוקול ההפרדה העצבית. (החלק העליון) IMR90-hiPSC מושבות ניתן לחתוך לשברים כדי ליצור גופים עובריים (EBS). לאחר 2 ימים במבחנה (DIV), EBS יכול להיות מצופה על laminin או סטנדרטי מטריצה מצופה מנות ותרבותית בנוכחות בינוני אינדוקציה neuroepithelial (NRI) כדי לייצר נגזרות neuroectodermal (רוזטות, כאן מוכתם עבור nestin (ירוק) ו β -אני טובולין (אדום)). Rosettes ניתן לנתק, שנאספו, הוחזרו על laminin או סטנדרטי מצופה מטריצה כלים, ועוד הבדיל לתוך נוירונים בוגרת (NF200, אדום) ו glial(GFAP, ירוק) תאים בנוכחות של דיפרנציאציה נוירונים (ND) בינוני. (חלק תחתון) NSCs רוזטה נגזרות (nestin, אדום) ניתן להרחיב בנוכחות אינדוקציה עצבית (NI) בינוני, cryopreserved, או עוד הבדיל בנוכחות בינוני ND לעצב מעורב נוירונים (NF200, ירוק) ו גליה ( GFAP, אדום) תרבויות. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של דמות זו.
3. HiPSC הנגזרות גזע גזע עצביים (NSC) הרחבת בידול לתוך נוירונים מעורב גליה
הערה: NSCs נגזר שברי רוזטה ניתן להרחיב ומתוחזק בעקבות הנוהל המתואר להלן ( איור 1 , חלק התחתון). זה מאפשר תוספת thמספר תאים לבדיקות ובדיקות כימיות.
4. HiPSC הנגזרות NSC Cryopreservation והפשרה
הערה: על passaging, NSCs ניתן להקפיא מחדש מופשר בעקבות הליך זה.
5. צ'ארהCterization של hiPSC הנגזרות תאים עצביים וגליאל
הערה: עם הבחנה, נגזרות עצביות וגליאל ניתן לאפיין באמצעות טכניקות שונות, כגון אלה המתוארים בסעיפים הבאים.
אפיון של hiPSCs לא מובחנים
כדי להעריך את הפנוטיפ של hiPSCs, ניתוח מורפולוגיה המושבה / התא, קביעת סמנים ספציפיים PSC, ובדיקה של ביטוי גנים ופעילות פוספט אלקליין צריך להתבצע. Uniferentiated hiPSCs צריך להיות עגול, עם גרעין גדול וללא ציטופלסמה בשפע. רוב המושבות צריך להיות מאופיין שטוח המורחב במורפולוגיה, המעיד על פנוטיפ בלתי מובחנת ( איור 2 א ו איור 2 ב ). בנוסף, יותר מ 80% של המושבות צריך להיות חיובי עבור פעילות phosphatase אלקליין פעילות ( איור 2 ג ).
כ 80% מהתאים צריך להיות חיובי עבור סמנים הקשורים קלאסי pluripotency, כגון Oct4, SSEA3, SSEA4 ו Tra1-60 ( איור 2D-H ), כפי שמוצג על ידי immunocytochemistry ו cytometry זרימה, בעוד אחוזי nestin + ו β-III-Tubulin + תאים צריך להיות נמוך באופן משמעותי (כ 8% ו -3%, בהתאמה, כפי שמוצג בתרשים 2H ). תוצאות אלה יש לשעתק על מעברים.
איור 2. אפיון של IMR90-hiPSCs לא מתוארים. (A ו- B) נציג שלב תמונות בניגוד (10X ו 20x הגדלות) של מושבות IMR90-hiPSC לא מובחנים. (ג) תמונות נציג של מושבות מוכות phosphatase אלקליין (הגדלה 4X). (DF) נציג תמונות immunocytochemical של (D) Oct4 (אדום), (E) SSEA3 (ירוק), ו (F) TrA1-60 (ירוק). (G) נציג נקודה של SSEA1 (CD15) ו SSEA4 מכתים, ניתח על ידי cytometry הזרימה. ( + ) ~ ~ 75% - 80%, + + + ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ), ו β-III-tubulin + (~ 3 - 7%) תאים, counterstained עם DAPI ו לכמת ידי HCI, עם ממוצע של 3 עד 5 משכפל ביולוגי ± SEM (גרף שונה מ הפניה 6). אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של דמות זו.
הערכה של pluripotency באמצעות היווצרות EB
HiPSCs הם pluripotent, כלומר הם מבטאים שלושה גנים הקשורים גידולים הקשורים בתנאים המתאימים. כדי להעריך hiPSC pluripotency, ניתן להחיל משותףגישה המבוססת על היווצרות EB ספונטנית, אשר גורם להיווצרות של שלוש שכבות נבט 14 . ניתוחי גנים ספציפיים של שכבת גידולים חייבים להצביע על עלייה תלויית זמן באאודודרם (α-fetoprotein (AFP) ו- Cytokeratin 18 (KRT18)), ectoderm (Nestin, SRY-box 1 (Sox1) ו 6 קופסה 6 (Pax6) ), ו mesoderm (nptriuretic פפטיד (NPPA) ו Brachyury-T) ביטוי גנטי הקשורות ( איור 3 א ו איור 3 ב ); ראה טבלה של חומרים.
איור 3. הערכה של pluripotency על ידי היווצרות EB. (A) נציג שלב שלב התמונה של EBS ביום 1. (ב) תרשים הבר מציג ניתוח QPCR של מזודרמל (NPPA ו brachyury), ectodermal (Pax6, Sox1, ו nestin), ואת האאודודרמה (AFP ו KRT18 ) גנים, מנורמל לגנים הפניה, אקטין β ו- GAPDH, וכיול לתאים לא מובחנים (יום 0). זוהי שיטת ΔΔCt, עם ממוצע של 5 ניתוחים עצמאיים ± S
אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של דמות זו.
אינדוקציה של בידול נוירוני וגליאלי
IMR90-iPSCs ניתן להבדיל תרבויות מעורבות של נוירונים פוסט מיטוטי ותאי גלייה בעקבות הצעדים המסוכמים באיור 1 ובקטעים פרוטוקול. 5-8 ימים לאחר ציפוי EBS על סטנדרטי מטריקס או laminin מצופים מנות בנוכחות של NRI בינוני, מבנים דמויי רוזטה צריך להתחיל להיות גלוי (= "Xfig"> איור 4 א). רוזטות מאופיינות בנוכחות תאי nestin + (מבשרי עצבים, ~ 90%), עם מעט תאים β-III-tubulin + (תאים נוירונים מחויב, ~ 5-10%), האחרון בדרך כלל מקומי בעיקר בפריפריה של ורדים ( איור 4 ב , שושנות ביום 12).
על דיסוציאציה עם רוזטה ולהחזיר על גבי laminin או סטנדרטי מצופה מטריצה צלחות או צלחות בנוכחות המדיום ND מלא, תאים מתחילים עוברים differiation לתוך תרבויות מעורבות של נוירונים וגליה, בהדרגה יוצרים אשכולות של גופים תא עצבי מחובר על ידי צרורות של neurites ( איור 4C ותרשים 4 ד ). תוצאות דומות יש להשיג בעת ניתוח אוכלוסיות נוירונים המתקבל על ידי הרחבת NSCs נגזר רוזטה ומבדיל אותם נוירונים וגליה. NSCs מורחבת משושלות צריך להיות nEstin + ( איור 4E , הבלעה מראה nestin + תאים).
לאחר 21 ימים של הבחנה, התאים צריכים להיות חיוביים ל- β-III-tubulin; NF200; טאו; ו MAP2, סמן מאוחר של הדנדריטים ( איור 4D , 4F, ואת איור 4H), עם לפחות 10-15% של תאים חיוביים עבור חלבון חומצה fibriillary fibriillary (GFAP), סמן astroglial ( איור 4 איור 4H) . יתר על כן, ~ 20 - 30% של התאים צריך לשמור על הביטוי של nestin לאחר בידול ( איור 4H ). חשוב לזכור כי אחוז של כל סוג תא ( כלומר, נוירון, astrocyte, nestin + תאים) עשויים להשתנות על פני מעברים, ואת השתנות תלויי המשתמש ניתן לצפות.
על ידי ניתוח subpopulations נוירונים ספציפיים, נוירונים GABAergic repreשנשלחו ~ 15 - 20% מכלל התאים, נוירונים דופאמינרגיים ~ 13 - 20%, נוירונים גלוטמטריים ~ 35 - 42%, כפי שמוצג על ידי immunostaining עבור gamma-aminobutyric חומצה (GABA), tyrosine hydroxylase (TH), גלוטמט שלפוחית טרנספורטר 1 (VGlut1), בהתאמה (ראה כימות נציג בתרשים 4H ). האינדיקציה של הבחנה יכולה גם להיות מוערכת על ידי ניתוח של סמנים הקשורים pluripotency ( למשל, Oct4, Tra1-60, ו SSEA3), אשר צריך להיות downregulated משמעותי בתאים מובחנים לעומת hiPSCs לא מובחנים (לא מוצג, ראה התייחסות 6). זה גם יכול להיות מאושר על ידי ניתוח של ביטוי גנים על ידי qPCR, אשר אמור להצביע על ירידה של Oct4 ו Nanog ו upregulation של גנים עצביים, כגון מולקולה הידבקות תא עצביים 1 (NCAM1) ו microtubule הקשורים חלבון 2 (MAP2); הגן presynaptic, synaptophysin (SYP); ואת הגן שלאחר הסינפטי, microtubule הקשורים חלבון טאו (MAPT), כפי שמוצג ב < Strong class = "xfig"> איור 4I. יתר על כן, דופאמינרגים (TH ו- NR4A1), נוירונרגים (PHOX2A ו- PHOX2B), גלוטמטרגים (NARG2, GRIA1 ו- GAP43), GABRAEGIC (GABRA1 ו- GABRA3), נוירונים מוטוריים (ISL1 ו- LHX3) וגנים הקשורים ב- cholinergic (SLC5A7 ו- SLC18A13) וכתוצאה מכך תאים עצביים upregulated לעומת תאים בלתי מובחנים ( איור 4J ).
ניתוח הפעילות החשמלית הספונטנית, באמצעות MEA, הוא readout יקר כדי להעריך את הפונקציונליות של הרשת העצבית hiPSCs מובחן. בתום תקופת ההבחנה, נגזרים נוירונים מאופיינים בדרך כלל בשיעור ירי ממוצע (MFR) של לפחות 60 קוצים / דקות (ראה את העלילה הסופית המייצגת בתרשים 4K ). עם זאת, התפרצויות לא נצפו.
55702fig4.jpg "/>
איור 4. דיפרנציאציה של IMR90-hiPSCs לתוך תרבויות מעורבות של נוירונים וגליה. (A ו- B) תמונות נציג של שושנות לאחר 7 DIV (A) ואחרי 12 DIV (B) , מוכתם עבור nestin (ירוק) ו- β III- טובולין (אדום)). (C ו- D) נציג תמונות של תאים מובחנים לאחר 22 DIV (C) ו 28 DIV (D) , מוכתמים β-III-tubulin (אדום) ו NF200 (ירוק)). (ה) תמונה נציג של NSCs הנגזרות דיסוציאציה ורדיאטיה (מראה הבלעדי nestin + תאים, אדום). (F ו- G) תמונות נציג של תאים עצביים ( F , מוכתם עבור NF200 (אדום) ו טאו (ירוק)) ותאי גלייה ( G , מוכתם עבור GFAP (אדום) נבדלים מ NSCs (לאחר 21 DIV). (H) כימות של nestin, MAP2, GFAP, gamma-aminobutyric חומצה (GABA), transulator גלוטמט vesicular 1 (VGlut1), ו tyrosine hydroxylase (TH) תאים חיוניים על ידי HCI, השוואת IMR90-hiPSC נגזרות תאים מובחנים IMR90-hiPSC הנגזרות NSCs (גרף שונה מ הפניה 7). (I ו - J) בר גרפים המראים ניתוחי QPCR של גנים מסוג pluripotency (Oct4 ו Nanog) וגנים נוירונים (NCAM1, MAP2, SYP ו- MAPT) (I) ושל דופאמינרגי (TH ו- NR4A1), נואדרנרגי (PHOX2A ו- PHOX2B) Glutamatergic (NARG2, GRIA1, ו- GAP43), GABAergic (GABRA1 ו GABRA3), נוירון המוטורי (ISL1 ו LHX3), ו cholinergic (SLC5A7 ו SLC18A13) גנים הקשורים (J) . כל הניתוחים מנורמל לגנים הפניה, אקטין β ו- GAPDH, וכיול לתאים לא מובחנים (מוטות ירוקים). זוהי שיטת ΔΔCt, עם ממוצע של 5 ניתוחים עצמאיים ± S
(K) נציג סריקה העלילה של IMR90-NSC נגזר neur(ההקלטות בוצעו עבור מינימום של 600 s, ברים אנכיים מייצגים קוצים יחיד). אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של דמות זו.
חתימה ספציפית של סמנים עצביים הוא upregulated ב IMR90-hiPSCs מובחן
בפרדיגמת בדיקת הרעילות החדשה, חיוני להגדיר את האירועים המולקולריים והסלולריים המתרחשים בתוך תא בעקבות החשיפה לרעיל נתון. לכן, חשוב לאפיין אילו מסלולי איתות מופעלים ו / או מבודדים בתוך המודל הסלולרי הנחקר.
מערכים זמינים מסחרית עבור ניתוחים של ביטוי חלבון קינאז חלבון ניתן להשתמש כדי להשוות hiPSCs לא מובחן לעומת תאים מובחנים. דיפרנס(IMPR), גידולים של נוירוטרופים (GDNF), חלבון מורפוגנטי (BMP) / TGF-Beta, מקדם גדילה נגזר (PDGF) קולטנים ( איור 5 א ו איור 5 ב ).
הניתוח של RPPA מראה את upregulation של חתימה עצבית ספציפית IMR90-hiPSCs מובחן. בפרט, ארק / CREB, Akt / PDK1 / mTOR, ואת נתיבי איתות Notch1 מופעלים על בידול ( איור 5 ג ).
איור 5. מובחנים תאים עצביים ו Glial הצג את הפעלת נתיבים הקשורים נוירון. (או B) גרפים בר לדווח על ניתוח qPCR של קינאזות נוירון הקשורים (א) וגנים אחרים הקשורים קינאז (B) . נתוני ביטוי גנים מנורמל הגנים התייחסות 18S ו GAPDH (מסופק במערך) מכויל לתאים מובחנים. עבור ניתוחים אלה, גן נחשב upregulated באופן משמעותי כאשר הביטוי שלה היה לפחות 2x גבוה יותר מאשר תאים מובחנים (2 -ΔΔCt ≥ 2); ממוצע של 3 ניתוחים עצמאיים ± SEM). (ג) תרשים הבר מציג את quantifications חלבון מוחלט באמצעות ניתוח RPPA, השוואת הבדיל (ברים אדומים) ותאים מובחנים (ברים ירוקים). החלבונים השייכים לאותם מסלולים של נתיבי איתות, מקובצים יחדיו כדלקמן: CREB / Erk / Akt, PDK1 / mTOR / Erk / Akt, Notch1, Shh ו- Wnt, SAPK / JNK ו- BMP / SMAD. ממוצע ± SEM של 4 ניתוחים עצמאיים. * P <0,05, ** p <0.01, *** p <0.001; גרף שונהRom Reference 6. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של דמות זו.
IMR90-hiPSC הנגזרות נוירונים / גליה תרבויות ניתן להשתמש כדי להעריך את ההשפעות של rotenone
Rotenone, מעכב של I מורכב של שרשרת הנשימה המיטוכונדריאלית, ידוע כגורם ללחץ חמצוני על ידי הפעלת ההפעלה של נתיב Nrf2. בתנאים של שקט, Nrf2 מעוגן בציטופלזמה על ידי Keap1 (Kelch כמו ECH הקשורים חלבון 1), מדכא Nrf2, אשר מקל על Nvf2 ubiquitination ו proteolysis 15 . עם אינדוקציה של מתח חמצוני, Nrf2 translocates לתוך הגרעין ומפעיל את הביטוי של Nrf2-ARE גנים היעד 16 .
IMR90-hiPSC הנגזרות נוירונים אD תאים גליה ניתן להשתמש כדי להעריך את ההשפעות של rotenone על הפעלת Nrf2 על ידי חשיפת התאים לריכוזים שונים של rotenone ( למשל, 1, 10, 100 ננומטר) במשך 24 שעות. ריכוזים אלה נקבעו על פי מחקרים קודמים 17 , 18 .
בריכוזים אלה וזמני החשיפה, rotenone לא לגרום cytotoxicity, כפי שמוצג על ידי כימות של גרעין DAPI + תא גרעין ( איור 6 א ). Rotenone המושרה Nrf2 טרנסלוקציה גרעינית, במיוחד לאחר חשיפת התאים 100 romone ננומטר ( איור 6 ב ו איור 6E ). בריכוז זהה, ירידה משמעותית ב- Keap1 הציטוטלסמה נצפתה ( איור 6 ג ' ), יחד עם עלייה של שני NAD (P) H quidone oxidoreductase 1 (NQO1) ו Sulfiredoxin 1 (SRXN1), שני Nrf2 היעדZymes 19 , 20 ( איור 6D ).
איור 6. ההשפעות של Rotenone על Nrf2 גרעיני טרנסלוקציה, Keap1, SRXN1, ו NQO1 רמות החלבון. (א) כימות של תאים DAPI חיים ( כלומר, גרעינים שאינם pyknotic) על טיפול 24 שעות עם 1, 10, 100 רוטנון ננומטר ו מנורמל לתאים מטופלים (Control, Ctr). (B) Nrf2 חלבון גרעיני טרנסלוקציה ( כלומר, יחסי גרעינית / cytoplasmic) לאחר 24 שעות של חשיפה rotenone, מוערך על ידי מדידות של עוצמת הקרינה באמצעות ניתוח HCI. (ג) כימות של רמות חלבון cytoplasmic Keap1 על הטיפול rotenone, להעריך על ידי ניתוח HCI. (D) כימות של NAD (P) H quidone oxidoreductase 1 (NQO1) ו SulfiRedoxin 1 (SRXN1) באמצעות immunofluorescence ו- HCI לאחר 24 שעות של טיפול עם rotenone. (ה) נציג תמונות של לוקליזציה חלבון Nrf2 (ירוק). כל הערכים מוצגים כמו הממוצע ± SEM של 3 משכפל ביולוגי. * P <0,05, ** p <0.01; דמות שונה מ הפניה 7. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של דמות זו.
בריכוז זה ובשעות הטיפול, הרוטנון העלה גם גידול תלויי ריכוז של אחוז התא באסטרוגליום ( איור 7 א ' ואיור 7 ב' ), מבלי להשפיע על הפרופורציות של NSC (nestin + ) ונוירונים (MAP2 + ) ( איור). 7 ב ). על ידי בחינת הפרופורציות של תת סוגי נוירונים ספציפיים, טיפול rotenone (10 ננומטר 100 ננומטר)הפחית משמעותית את מספר הנוירונים הדופאמינרגיים (TH + ) ( איור 7 ג ' ו- ד' ), בעוד שאחוזים של נוירונים GABAergic (GABA + ) ו glutamatergic (VGlut1 + ) לא השתנה ( איור 7 ד ). באופן אנלוגי, הקודם in vivo ובמחקרים חוץ גופית תיארו רוטנון תלוי סלקטיבי דופאמינרגי תא עצבי דופאמינרגי 21 , 22 , 23 .
איור 7. השפעות של רוטנון על תאים גליה ו נוירונים דופאמינרגיים. (א) תמונות נציג של GFAP + תאים (אדום), עם הגדלה 40X ב insets, מטופל או מטופל עם rotenone 100 ננומטר במשך 24 שעות. (ב) כימות של + nestin + , MAP2 + , ו GFAP + תאים, מנורמל לתאים מטופלים (שליטה, Ctr). (C) נציג תמונות של נוירונים דופאמין + דופאמין (ירוק), עם הגדלה 40X ב insets, מטופל או מטופל עם rotenone 100 ננומטר במשך 24 שעות. (D) כימות של GABA + , VGlut1 + , ו + תאים נוירונים, מנורמל תאים מטופלים (Ctr). כל הערכים מוצגים כמו הממוצע ± SEM של 3 משכפל ביולוגי. * P <0,05, ** p <0.01, *** p <0.001; דמות שונה מ הפניה 7. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של דמות זו.
משמעות סטטיסטית הוערכה על ידי ANOVA חד-כיווני עם מבחן השוואתי מרובה של דנט כבחנת פוסט (השוואת כל העמודות לעומת עמודת הבקרה)Xref "> 24 או על ידי מבחן זנב לא מזווג או מזווג דו-זנבי לפי סוג הניתוח כל הנתונים מייצגים את הממוצע של לפחות שלושה משכפלים ביולוגיים ± השגיאה הסטנדרטית של הממוצע (SEM). הבדל משמעותי עם קבוצת הביקורת. * P <0.05, p <0.01, p <0.001.
שולחן 1.
הערה על צפיפות ציפוי רוזטה ניתק: אם שברי רוזטה לא נראים מנותקים לחלוטין, כדי להגיע צפיפות ציפוי של כ 15.000 תאים / ס"מ 2 , ניתוק שושנות ניתוק הנובע כ 50 EBS / 1 x 60 מ"מ צלחת ניתן resuspended ב 50 מ"ל של המדיום NRI מלא מצופה כדלקמן (בהתאם לתבנית הצלחת):
לוחיות רב-תכליתי / MEA | אזור הגידול (ס"מ 2) / טוב) | נפח ההשעיה התא לצלחת לכל טוב (או שבב MEA) | המספר המרבי של צלחות שניתן מצופה (עם 50 מ"ל של השעיה תא) |
96 בארות | 0.3 | 100 ul | 5 |
48 בארות | 0.7 | 220 | 4 |
24 בארות | 2 | 625 ul | 3 |
12 בארות | 4 | 1.25 מ"ל | 3 |
6 בארות | 10 | 3.125 מ"ל | 2 |
שבב MEA יחיד | 3.5 | 1.1 מ"ל | 45 |
טבלה 2: קריטריונים לקבלה
סמן /נוֹגְדָן | אחוז (על DAPI + (תאים) תאים) לאחר 28 DIV |
B-III-tubulin (Tuj1) | 35-45% |
MAP2 | 50-60% |
NF200 | 45-55% |
GFAP | 10-25% |
Nestin | 15-25% |
עבודה זו מתארת פרוטוקול חזק ומהיר יחסית עבור בידול של IMR90-hiPSCs לתוך נוירונים פוסט מיטוטי ותאי גלייה. פורסמו בעבר פרוטוקולים בידול נוירונים המבוססים על hESCs ו hiPSCs בדרך כלל תשואה אחוזים גבוהים של מבשרי עצבים 25 , 26 ו מספר משמעותי של תאים היעד העצבית 27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 32 , 33 . באופן אנלוגי, פרוטוקול ההבחנה המתואר כאן מתאים ליצירת תרבויות הטרוגניות של תאים עצביים של GABAergic, glutamatergic ו- dopaminergic, יחד עם גליה ושיעור דיסקרטי של תאי Nestin + . נוכחות של תאים עצביים גלוטמטריים (~ 35-42%) ו GABAergic (~ 15-20%) עצביים עולה כילתרבות זו יש תכונות של המוח הקדמי, כמו קליפת המוח, ונוכחות של מספר דיסקרטי של נוירונים דופאמינרגיים (~ 13-20%) עשויה גם להצביע על סגוליות של המוח התיכון. בנוסף, הקביעות של אחוז קטן של תאים + nestin עשוי להוכיח מתאים לחקר neurogenesis ואת ההשפעות האפשריות של כימיקלים על NSCs, אשר מוגבלים בעיקר הן את ההיפוקמפוס ואת אזור subventricular (SVZ) של forebrain 34 . ניתוח נוסף immunocytochemical ו ביטוי גנים יעזור להגדיר טוב יותר את הספציפיות האזורית של נגזרות תא מובחן.
שני הצעדים הקריטיים ביותר בפרוטוקול ההבחנה המתואר במסמך זה הם: (i) חיתוך מושבות hiPSC לשברים הומוגניים (קריטיים לדור EBS עם גודל הומוגני) ו- (ii) חיתוך מבנים נוירו-אוקטרומלים (שושנות) ) עבור בידול NSC, הדורש מיומנות ידנית משמעותיתואת דיוק כדי למנוע איסוף mesodermal ו תאים endodermal שעלולים להפחית את הפרופורציות של נוירונים ותאי גלייה שהושגו על בידול.
זה חיוני כדי לאפיין את פנוטיפים של התאים במהלך ההתרחבות (כמו מושבות לא מובחנות או NSCs) ובמהלך כל הצעדים בידול. בפרט, הגן פרופילים ביטוי חלבון של נגזרות תא עצבי / גליה צריך להראות upregulation והפעלה של מסלולי איתות נוירון הקשורים, ואילו הביטוי של סמנים pluripotency צריך להיות מופחת.
הדור של EBS ונגיפים neuroectodermal (רוזטות) יכול להיות מאתגר באופן ידני נוטה השתנות. מסיבה זו, פיתחנו פרוטוקול להרחבת NSCs נגזר רוזטה והבחנה נוספת שלהם לתוך תאים עצביים / גליה.
המגבלות האפשריות של פרוטוקול זה בידול הם בעיקר (i) אחוז נמוך יחסית של דנגזרים גליליים שונים ו - (ii) היעדר פונקציות רשת נוירונים בוגרים (כפי שמוצג על ידי חוסר התפרצויות). יתר על כן, subpopulations ספציפיים של astrocytes יכול לתפקד כמו אבות ראשוניים או NSCs 35 . בעוד Nestin / GFAP תאים חיוביים פעמיים לא נצפו בתרבות תאים מובחנת זו (נתונים לא מוצג), הוא שיערו כי GFAP + תאים אלה תרבויות מעורבות הם אבות astrocytic ו astrocytes. סביר כי על ידי הארכת הזמן של בידול, מספר האסטרוציטים עשוי להגדיל, המורפולוגיה שלהם עשוי להיות יותר בוגרת, כפי שכבר צוין על ידי עבודות קודמות של הקבוצה של ג 'אנג 36 , 37 .
בפרדיגמת בדיקת הרעילות החדשה, הידע על הפרעות ביולוגיות של נתיבים ביולוגיים הוא בעל חשיבות עליונה בהערכת מצוקות כימיות. לכן, במבחנה מערכות הבדיקה צריכה להיות מסוגלתמתייחסים לתופעות שליליות להפרעות של מסלולי איתות, בהתאם למושג של מסלול התוצאה השלילית (AOP). כמו הוכחה של קונספט, rotenone ניתן להשתמש כדי להעריך את ההפעלה של נתיב Nrf2, אשר מעורב בהגנה הסלולרית נגד מתח חמצוני או electrophilic 38 , ואת הלחץ החמצוני הוא אירוע מפתח חשוב משותף ב- AOPs שונים הרלוונטיים נוירוטוקסיות התפתחותית ומבוגרת 39 .
Rotenone צריך לעורר את ההפעלה של נתיב Nrf2, אשר ניתן להוכיח על ידי Nrf2 חלבון טרנסלוקציה גרעינית ביטוי מוגבר של אנזימים היעד Nrf2, כולל NQO1 ו SRXN1. נמצא כי rotenone גורם לגידול תלוי מינון של רמות חלבון GFAP, המעיד על הפעלת אסטרוציטים 40 , 41 . Rotenone גם מקטין את מספר תאים dopaminergic (TH + ), אשר עולה בקנה אחד עם previOus במבחנה ובבדיקות vivo המציגות רוטנון תלוי במוות דופאמינרגי, שכן סוג זה של נוירון רגיש במיוחד למתח חמצוני 21 , 22 , 23 .
לסיכום, זה hiPSC הנגזרות נוירונים ותאי גלייה התרבות מודל הוא כלי רב ערך כדי להעריך את ההשפעות הנוירוטוקסיות של כימיקלים המעוררים מתח חמצוני וכתוצאה מכך הפעלה נתיב Nrf2. כמו פרוטוקול הבחנה זה מאפשר את הדור של תרבויות מעורבות של תאים עצביים (GABAergic, dopaminergic, ו נוירונים glutamatergic) ו astrocytes, זה עשוי להוכיח מתאים ללמוד את crosstalk בין נוירונים וגליה בתנאים פיזיולוגיים ופתולוגיים, כגון מחלות נוירודגנרטיבית ( למשל, מחלת פרקינסון). יתר על כן, הנוכחות של חלק משמעותי של NSCs עשוי לעזור להעריך את ההשפעות האפשריות של כימיקלים על פרווה עצביתEnitors, אשר ידוע להיות היעד העיקרי של מוטציות הנגרמות כימית או זיהומים ויראליים 42 .
למחברים אין מה לחשוף.
המחברים מבקשים להודות לד"ר מארק Peschanski (I-Stem, Évry, צרפת), על מתן IMR90-hiPSCs; ד"ר ג'ובאנה לזארי וד"ר סילביה קולוני (Avantea srl, קרמונה, איטליה); ד"ר סימון האפט (אוניברסיטת בון, גרמניה); ד"ר Tiziana Santini (המכון האיטלקי לטכנולוגיה, רומא), למתן ייעוץ על הערכת מכתים immunofluorescence; ד"ר בנדטה אקורדי, ד"ר אלנה רמפאצו וד"ר לוקה פרסאנו (אוניברסיטת פאדובה, איטליה), על תרומתם לניתוח ה- RPPA ולאימות הנוגדן. מימון: עבודה זו נתמכה על ידי האיחוד האירופי במימון פרויקט "SCR & Tox" (הסכם מענק מס '266753).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Complete hiPSC medium: | |||
mTeSR1 Basal Medium | Stem Cell Technologies | 05851 | (Step 1.2.6). Complete mTeSR1 is stable when stored at 2 - 8°C for up to 2 weeks. 5X Supplements can be dispensed into working aliquots and stored at -20°C. Use frozen aliquots within 3 months. |
mTeSR1 5X Supplements | Stem Cell Technologies | 05852 | |
Matrigel hESC-qualified Matrix | Corning | 354277 | 1:100 (Step 1.1). Thaw Matrigel on ice, prepare 200 ul aliquots and store them in -80°C. For coating, dilute 200ul aliquot in 20 ml of DMEM/F12 medium. |
CryoStem Freezing Medium | Stemgent | 01-0013-50 | Freeze ~ 100 fragments/250 ul/vial (Step 1.2.1) |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
hiPSC EB medium: | |||
Knockout DMEM | Thermo-Fisher | 10829-018 | (Step 2.1.7) |
Knockout Serum Replacement (KOSR) | Thermo-Fisher | 10828-028 | 20% final concentration (Step 2.1.7) |
Non-Essential Amino Acids | Thermo-Fisher | 11140-035 | (Step 2.1.7) |
Penicillin/Streptomycin | Thermo-Fisher | 15140-122 | 50 U/mL final concentration (Step 2.1.7) |
L-Glutamine 200 mM Solution | Thermo-Fisher | 25030-081 | 2 mM final concentration (Step 2.1.7) |
β-Mercaptoethanol | Thermo-Fisher | 31350-010 | 50 µM final concentration (Step 2.1.7) |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Complete neuroepithelial induction medium (NRI): | |||
DMEM/F12 | Thermo-Fisher | 3133-038 | (Step 2.3.1) |
Non-Essential Amino Acids | Thermo-Fisher | 11140-035 | (Step 2.3.1) |
N2 Supplement | Thermo-Fisher | 17502-048 | (Step 2.3.1) |
Penicillin/Streptomycin | Thermo-Fisher | 15140-122 | 50 U/mL final concentration (Step 2.3.1) |
Heparin Grade I-A, ≥180 USP units/mg | Sigma-Aldrich | H3149-100KU | 2 µg/ml final concentration (Step 2.3.1) |
bFGF | Thermo-Fisher | 13256-029 | 20 ng/ml final concentration added before use (Step 2.3.1) |
Matrigel Basement Membrane Matrix | Corning | 354234 | 1:100 (Step 2.2). Thaw Matrigel on ice, prepare 200 ul aliquots and store them in -80°C. For coating, dilute 200 ul aliquot in 20 ml of cold DMEM/F12 medium. |
Laminin | Sigma-Aldrich | L2020 | 1:100 (Step 2.2). Dilute in PBS 1X. |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Complete Neuronal Differentiation medium (ND): | |||
Neurobasal Medium | Thermo-Fisher | 21103049 | (Step 2.4.11) |
B-27 Supplements (50x) | Thermo-Fisher | 17504044 | (Step 2.4.11) |
N2 Supplement | Thermo-Fisher | 17502-048 | (Step 2.4.11) |
Penicillin/Streptomycin | Thermo-Fisher | 15140-122 | 50 U/mL final concentration (Step 2.4.11) |
GDNF | Thermo-Fisher | PHC7045 | 1 ng/ml final concentration. Added before use. (Step 2.4.11) |
BDNF | Thermo-Fisher | PHC7074 | 2.5 ng/ml final concentration. Added before use. (Step 2.4.11) |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Neural induction medium (NI): | |||
DMEM/F12 | Thermo-Fisher | 3133-038 | (Step 3.3) |
Non-Essential Amino Acids | Thermo-Fisher | 11140-035 | (Step 3.3) |
N2 Supplement | Thermo-Fisher | 17502-048 | (Step 3.3) |
Penicillin/Streptomycin | Thermo-Fisher | 15140-122 | 50 U/mL final concentration (Step 3.3) |
Heparin Grade I-A, ≥180 USP units/mg | Sigma-Aldrich | H3149-100KU | 2 µg/ml final concentration (Step 3.3) |
B-27 Supplement (50X), minus vitamin A | Thermo-Fisher | 12587010 | (Step 3.3) |
L-Glutamine 200 mM Solution | Thermo-Fisher | 25030-081 | 2 mM final concentration (Step 3.3) |
bFGF | Thermo-Fisher | 13256-029 | 10 ng/ml final concentration. Added before use (Step 3.3) |
EGF | Thermo-Fisher | PHG6045 | 10 ng/ml final concentration. Added before use (Step 3.3) |
BDNF | Thermo-Fisher | PHC7074 | 2.5 ng/ml final concentration. Added before use (Step 3.3) |
Defined Trypsin Inhibitor (DTI) | Thermo-Fisher | R007-100 | Pre-warm at 37°C. Add an equal amount of DTI to Trypsin-EDTA (Step 3.10) |
Trypsin-EDTA (0.5%), no phenol red | Thermo-Fisher | 15400054 | 1:10. Dilute Trypsin-EDTA in PBS 1x (without calcium and magnesium), pre-warm the solution at 37°C (Step 3.8) |
CryoStor cell cryopreservation medium | Sigma-Aldrich | C2874-100ML | (Step 4.2) |
Trypan Blue (0.4%) | Sigma-Aldrich | T8154-100ML | multiple manufacturers/suppliers |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
TaqMan Probesets and reagents for gene expression analysis: | |||
RNAqueous-Micro kit | Thermo-Fisher | AM1931 | (Step 5.1.6) |
High Capacity cDNA Reverse Transcription Kits | Thermo-Fisher | 4368814 | |
TaqMan Gene Expression Master Mix | Thermo-Fisher | 4369016 | |
GFAP | Thermo-Fisher | Hs00909233_m1 | |
MAP2 | Thermo-Fisher | Hs00258900_m1 | |
NQO1 | Thermo-Fisher | Hs02512143_s1 | |
SRXN1 | Thermo-Fisher | Hs00607800_m1 | |
HMOX1 | Thermo-Fisher | Hs01110250_m1 | |
GSR | Thermo-Fisher | Hs00167317_m1 | |
PAX6 | Thermo-Fisher | Hs01088112_m1 | |
NES | Thermo-Fisher | Hs00707120_s1 | |
GRIA1 | Thermo-Fisher | Hs00181348_m1 | |
GAP43 | Thermo-Fisher | Hs00967138_m1 | |
GABRA3 | Thermo-Fisher | Hs00968132_m1 | |
GABRA1 | Thermo-Fisher | Hs00168058_m1 | |
NR4A2 | Thermo-Fisher | Hs00428691_m1 | |
TH | Thermo-Fisher | Hs00165941_m1 | |
GAPDH | Thermo-Fisher | Hs02758991_g1 | |
ACTB | Thermo-Fisher | Hs99999903_m1 | |
MAPT | Thermo-Fisher | Hs00902194_m1 | |
SYP | Thermo-Fisher | Hs00300531_m1 | |
NANOG | Thermo-Fisher | Hs04260366_g1 | |
POU5F1 (OCT4) | Thermo-Fisher | Hs04195369_s1 | |
SOX1 | Thermo-Fisher | Hs01057642_s1 | |
AFP | Thermo-Fisher | Hs00173490_m1 | |
KRT18 | Thermo-Fisher | Hs01941416_g1 | |
NPPA | Thermo-Fisher | Hs00383230_g1 | |
T | Thermo-Fisher | Hs00610080_m1 | |
NCAM1 | Thermo-Fisher | Hs00941821_m1 | |
NR4A1 | Thermo-Fisher | Hs00374226_m1 | |
PHOX2A | Thermo-Fisher | Hs00605931_mH | |
PHOX2B | Thermo-Fisher | Hs00243679_m1 | |
NARG2 | Thermo-Fisher | Hs00973298_g1 | |
SLC18A3 | Thermo-Fisher | Hs00268179_s1 | |
SLC5A7 | Thermo-Fisher | Hs00222367_m1 | |
ISL1 | Thermo-Fisher | Hs00158126_m1 | |
LHX3 | Thermo-Fisher | Hs01033412_m1 | |
TaqMan Human Protein Kinase Array | Thermo-Fisher | 4418721 | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Antibodies and reagents for immunostaining: | |||
B-III-tubulin (Tuj1) | Covance | MMS-435P | 1:500 (Step 5.2.5). Other antibodies may also be used. |
MAP2 | Sigma Aldrich | M4403 | 1:500 |
NF200 | Sigma Aldrich | N4142 | 1:1000 |
GFAP | Acris Antibodies GmbH | AP02002SU-N | 1:500 |
Nestin | Sigma-Aldrich | N5413 | 1:200 |
synaptophysin (SYN) | Abcam | AB14692 | 1:200 |
Tau | Thermo-Fisher | MA5-12808 | 1:100 |
Nrf2 | Abcam | AB62352 | 1:200 |
Keap1 | Abcam | AB66620 | 1:200 |
sulfiredoxin1 (SRXN1) | Abcam | AB92298 | 1:200 |
NAD(P)H quinone oxidoreductase 1 (NQO1) | Abcam | AB2346 | 1:200 |
OCT4 | Millipore | MAB4401 | 1:100 |
SSEA3 | Millipore | MAB4303 | 1:100 |
Tra1-60 | Millipore | MAB4360 | 1:250 |
Tyrosine hydroxylase (TH) | Millipore | AB152 | 1:200 |
Gamma-aminobutyric acid (GABA) | Sigma-Aldrich | A0310 | 1:100 |
Vesicular glutamate transporter 1 (VGlut1) | Abcam | AB72311 | 1:500 |
Paraformaldehyde | Sigma-Aldrich | P6148-500G | 4% (4% formaldehyde can also be used) |
DPBS, no calcium, no magnesium | Thermo-Fisher | 14190144 | |
Triton-X-100 Solution | Sigma-Aldrich | 93443-100ML | 0.1% |
BSA 35% | Sigma-Aldrich | A7979-50ML | 3.5% |
Donkey anti-Rabbit IgG (H+L) Cross Adsorbed Secondary Antibody, DyLight 594 conjugate | Thermo-Fisher | SA5-10040 | 1:500. (Step 5.2.7) Other fluorochrome-conjugated secondary antibodies may also be used. In this case, appropriate dilutions should be tested by the enduser. |
Donkey anti-Mouse IgG (H+L) Cross Adsorbed Secondary Antibody, DyLight 488 conjugate | Thermo-Fisher | SA5-10166 | 1:500 |
Donkey anti-Goat IgG (H+L) Cross Adsorbed Secondary Antibody, DyLight 488 conjugate | Thermo-Fisher | SA5-10086 | 1:500 |
DAPI Solution (1 mg/ml) | Thermo-Fisher | 62248 | 1:1000 (Step 5.2.7) |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Antibodies for Reverse Phase Protein Array (RPPA): | |||
4E-BP1 (S65) | Abcam | AB81297 | 1:250 (Note after step 5.2.8) |
Akt (T308) | Cell Signaling | 9275 | 1:100 |
Akt (S473) | Cell Signaling | 9271 | 1:100 |
AMPKalpha (T172) | Cell Signaling | 2531 | 1:100 |
AMPKbeta1 (S108) | Cell Signaling | 4181 | 1:100 |
ATF-2 (T71) | Cell Signaling | 9221 | 1:100 |
c-Jun (S63) | Cell Signaling | 9261 | 1:200 |
c-Jun (S73) | Cell Signaling | 9164 | 1:200 |
c-Kit (Y719) | Cell Signaling | 3391 | 1:250 |
CREB (S133) | Cell Signaling | 9191 | 1:100 |
EGFR (Y1068) | Cell Signaling | 2234 | 1:50 |
ErbB2/HER2 (Y1248) | Cell Signaling | 2247 | 1:100 |
ERK 1/2, p44/42 (T202/Y204) | Cell Signaling | 9101 | 1:2000 |
GSK-3alpha (S21) | Cell Signaling | 9337 | 1:50 |
Jak1 (Y1022/1023) | Cell Signaling | 3331 | 1:100 |
Lck (Y505) | Cell Signaling | 2751 | 1:500 |
LKB1 (S428) | Cell Signaling | 3051 | 1:100 |
mTOR (S2448) | Cell Signaling | 5536 | 1:100 |
NFkB p65 (S536) | Cell Signaling | 3031 | 1:50 |
p70 S6 Kinase (T389) | Cell Signaling | 9205 | 1:200 |
PDK1 (S241) | Cell Signaling | 3061 | 1:100 |
PKA C (T197) | Cell Signaling | 4781 | 1:250 |
PRAS40 (T246) | BioSource | 44-1100 | 1:2000 |
PTEN (S380) | Cell Signaling | 9551 | 1:500 |
Smad1 (S463/465), Smad5 (S463/465), Smad8 (S426/428) | Cell Signaling | 9511 | 1:500 |
Src (Y527) | Cell Signaling | 2105 | 1:500 |
Src Family (Y416) | Cell Signaling | 2101 | 1:200 |
Stat1 (Y701) | Cell Signaling | 9171 | 1:200 |
Stat3 (S727) | Cell Signaling | 9134 | 1:200 |
Zap-70 (Y319) | Enogene | E011159 | 1:100 |
βCatenin (S33/37/T41) | Cell Signaling | 9561 | 1:250 |
CREB | Upstate Biotechnologies | 06-863 | 1:100 |
Fos B | Cell Signaling | 2251 | 1:200 |
GRB2 | Cell Signaling | 3972 | 1:2000 |
HSP70 | Stressgen | SPA-810 | 1:100 |
c-Jun | Cell Signaling | 9165 | 1:100 |
Kip1/p27 | BD | 610241 | 1:100 |
Lck | Cell Signaling | 2984 | 1:250 |
Mcl-1 | Cell Signaling | 4572 | 1:80 |
Musashi | Cell Signaling | 2154 | 1:100 |
NOTCH1 | Cell Signaling | 3439 | 1:100 |
PTEN | Cell Signaling | 9552 | 1:500 |
SGK1 | Abnova | PAB4590 | 1:250 |
Zap-70 | Cell Signaling | 2705 | 1:250 |
β-Catenin | Abcam | AB32572 | 1:1000 |
Dll4 | Abcam | AB7280 | 1:500 |
Shh | Abcam | AB53281 | 1:250 |
HIF-1α | BD | 610958 | 1:50 |
NUMB PAN-ISO | Upstate Biotechnologies | 07-207 | 1:400 |
NUMB-L | Chemicon | AB15145 | 1:750 |
Cyclin B | BD | 610220 | 1:75 |
c-Myc | Calbiochem | OP-10 | 1:100 |
BCIP/NBT Kit | Thermo-Fisher | 002209 | (Note after step 5.2.8). Kit used to measure alkaline phosphatase activity, similar kits can be used. |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Antibodies for Flow Cytometry: | |||
SSEA1 Antibody, Pacific Blue conjugate | Thermo-Fisher | MHCD1528 | 1:100 (Note after step 5.2.8) |
SSEA4 Antibody (MC813-70), Alexa Fluor 647 | Thermo-Fisher | SSEA421 | 1:100 |
Name | Company | Catalog number | Comments |
Specific instruments, tools and softwares: | |||
Countess Automated Cell Counter | Thermo-Fisher | C10227 | Neubauer chamber or other suitable glass hemocytometer can be used. |
MEA1060-Inv-BC | Multichannel Systems | MEA1060-Inv-BC | (Step 5.3) |
MEA1060-BC control software | Multichannel Systems | MEA1060-BC | (Step 5.3) |
NeuroExplorer | Multichannel Systems | NeuroExplorer (NE) | (Step 5.3) For post-processing of MEA data |
Multielectrode arrays (MEA) | Multichannel Systems | 60MEA100/10iR-Ti-gr | (Step 5.3) Single-well MEA chip |
ArrayScan XTI High Content Platform | Thermo-Fisher | ASN00002P | (Step 5.2.8) Mean fluorescence can be quantified by using specific ArrayScan algorithms (e.g., Cytotoxicity V.4 and NucTrans V.4 bioapplications). It is recommended to take minimum 20 pictures/well, and have 7-8 internal replicates per condition |
7900HT Fast Real-Time PCR System | Thermo-Fisher | 4351405 | (Step 5.1.6) |
BD ULTRA-FINE Needle Insulin Syringe (with 30G needle) | BD | 328280 | (Steps 1.3.1, 2.1.2, and 2.4.1) |
StemPro EZPassage Disposable Stem Cell Passaging Tool | ThermoFisher | 23181010 | This colony cutting tool can be used as an alternative to the use of 30G needle 1 mL syringes (Step 1.3.1) |
Ultra-Low attachment Petri dish (60 mm) | Corning | 10010582 | (Step 2.1.8) Also other brands can be used. |
Mr. Frosty Freezing container | Sigma-Aldrich | C1562-1EA |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved