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인간 유도 다 능성 줄기 세포 (hiPSCs)는 약물 및 화학 스크리닝 및 신경 독성을 포함한 독성 시험을위한 새로운 시험 관내 모델 개발을위한 강력한 도구로 간주됩니다. 여기, hiPSCs의 뉴런과 glia 로의 차별화에 대한 자세한 프로토콜이 설명되어 있습니다.
인간의 다 능성 줄기 세포는 인체 시험관 독성 시험 에 적용 할 수있는 다양한 세포 유형으로 분화 할 수 있습니다. 인간의 배아 줄기 세포 (hESCs)의 사용과 관련된 윤리적 및 입법상의 문제를 피하기 위해 인간 유도 다 능성 줄기 세포 (hiPSCs)를 생산하기위한 체세포의 재 프로그램화가 가장 큰 장점이다. HiPSCs는 확대 될 수 있으며 독성 테스트를위한 테스트 시스템으로, 특히 신경 독성과 관련된 다양한 경로의 평가를 위해 여러 유형의 신경 및 신경 교세포로 효율적으로 분화 될 수 있습니다. 이 작품은 연결 및 glial 세포의 혼합 문화에 hiPSCs의 차별을위한 프로토콜을 설명합니다. 신경 세포 분화 (neuronal differentiation)에 의해 조절 및 / 또는 활성화되는 신호 전달 경로가 정의된다. 이 정보는 새로운 독성 테스트 패러다임에 대한 세포 모델의 적용에 중요합니다.이 패러다임에서는 화학 물질이 자신의 능력에 따라 평가됩니다rturb 생물학적 경로. 개념 증명으로 미토콘드리아 호흡 복합체 I의 억제제 인 로테 논 (rotenone)을 사용하여 산화 스트레스에 대한 항산화 - 반응 요소 - (ARE) - 유도 세포 방어 기작의 핵심 조절자인 Nrf2 신호 전달 경로의 활성화를 평가했다 .
미국 국립 연구위원회 보고서 1 은 규제 독성 시험이 동물에서 관찰 된 표현형 변화에 의존하는 접근법 에서 인간 세포를 이용한 역학 시험 법에 초점을 맞춘 접근법으로 바뀌는 새로운 독성 시험 패러다임을 구상했습니다. 다 능성 줄기 세포 (PSC) 유도체는 얻은 세포가 인간 조직의 생리 조건과 더 유사 할 수 있고 화학 유발 유해 영향을 연구하기 위해보다 관련성이 높은 도구를 제공하기 때문에 암 세포 모델의 대안이 될 수 있습니다. 독성 시험에 가장 유망한 두 가지 유형의 PSC 배양은 인간 배아 줄기 세포 (human embryonic stem cell, hESCs)와 인간 유도 다 능성 줄기 세포 (human induced pluripotent stem cell, hiPSCs)로 현재 기초 연구 및 재생 의학 분야에서 널리 사용되고있다. 이 전문 지식은 이제 새로운 종류의 toxicolo 개발에 활용 될 수 있습니다.생체 내 부작용의 발병과 관련된 섭동 한 생리 학적 경로를 확인하기위한 생체 외 시험. 그러나 hESC에 기초한 규제 안전성 평가 시험 방법은 가능한 모든 윤리적 문제와 배아 유래 세포의 사용을 규제하는 다양한 국가 입법 정책으로 인해 모든 EU 회원국과 전 세계 국가에서 받아 들여지지 않을 것입니다.
hiPSCs는 hESCs 4 , 5 와 유사한 특성을 공유하며, 안전성 평가뿐만 아니라 치료 표적 을 확인 하기위한 시험관 내 방법에 대한 큰 가능성을 가지고 있습니다. 또한, hiPSC 기술은 제한된 기증자 집단의 제약과 배아 유래 세포와 관련된 윤리적 우려를 완화합니다. hiPSC에 대한 주요 도전 과제는 이러한 세포가 독성 학적으로 관련된 세포 유도체의 상당 부분을 재현 가능하게 만들 수 있다는 데모이다.인간의 조직에 전형적으로 나타나는 특성과 반응을 보입니다. 선택된 마커의 미리 정의 된 수준은 일반적으로 차별화 프로세스 이후 세포 집단을 특성화하고 차별화 프로세스의 안정성에 대한 통찰력을 제공하는 데 사용됩니다.
이전의 연구는 hiPSC가 신경 및 신경 교세포의 혼합 배양 물을 생성하고 미토콘드리아 호흡 복합체 I의 억제제 인 로테 논이 항산화 제 방어 기전의 핵심 조절 인자 인 Nrf2 경로의 활성화에 미치는 영향을 평가했다. 많은 세포 유형 6 , 7 .
이 작품은 연결 / glial 차별화시 활성화 신호 경로 (유전자 및 단백질 수준)에 대한 자세한 내용을 제공, 혼합 신경 및 glial 문화로 hiPSCs의 차별을 위해 사용되는 프로토콜을 설명합니다. 또한,이 작업을 통해hiPSC에서 유래 한 신경 세포 및 신경 교세포 모델은 로테 논으로 급성 (24 시간) 치료에 의해 유발 된 Nrf2 신호 전달 활성화를 평가하는 데 사용할 수있어 산화 스트레스 유도 평가가 가능합니다.
IMR90 섬유 아세포는 pMIG 벡터를 사용하여 2 개의 전사 인자 (Oct4 및 Sox2)의 바이러스 성 전달에 의해 I-Stem (프랑스)에서 hiPSCs로 재 프로그램되었다. 유사한 hiPSC 모델도 적용 할 수 있습니다. 아래에 설명 된 프로토콜은 신경 줄기 세포 (NSCs)로 hiPSCs의 차별화의 모든 단계를 요약하고 사후 mitotic 뉴런과 glial 세포의 혼합 문화 (단계 1과 2, 또한 자세한 내용은 EURL ECVAM DBALM 웹 사이트를 참조하십시오 프로토콜) 8 .
NSC의 혼합 뉴런 및 신경 교세포로의 분리, 확장, 저온 보존 및 추가 분화에 대한 추가 프로토콜은 단계 3 및 4에서 상세히 설명된다 (EURL ECVAM DBALM이 프로토콜에 대한 자세한 설명은 bsite를 참조 하십시오.) 9 . 5 단계는 헌신과 분화의 여러 단계 동안 세포의 표현형 정체성을 평가하기 위해 수행 할 수있는 분석을 설명합니다.
1. 인간 유도 된 다 능성 줄기 세포 (hiPSC) 확장
참고 : hiPSCs는 mTeSR1 5x 보충제 (제조사의 지침에 따라 준비, 플레이트 ~ 100 식민지 조각 / 60mm 페트리 접시)가 포함 된 mTeSR1 매체의 존재하에 적절한 단백질 혼합 기판에서 배양 할 수 있습니다. hiPSC 콜로니가 적절한 크기에 도달하면 ( 그림 2A 의 식민지 예 참조), 아래에 설명 된대로 (일주일에 한 번) 세포를 통과시킵니다.
2. HiPSC Differe혼합 뉴런과 글 리아로의 통합
참고 : 절차는 그림 1 (상단)에 요약 된 주요 단계를 완료하는 데 약 28 일이 소요됩니다.
그림 1 : 연결의 분화 프로토콜의 도식 표현. (상단 부분) IMR90-hiPSC 콜로니는 조각으로 절단되어 배아 체 (EB)를 형성 할 수 있습니다. 시험관 내 (DIV) 에서 2 일 후, EBs는 laminin 또는 표준 매트릭스 코팅 요리에 도금 수 neurepectial 유도 (NRI) 매체의 존재에서 neuroectodermal 유도체 (rosettes, 여기에 nestin (녹색) 및 β -III- 튜 불린 (적색)). 로제트는 분리되거나 수집되어 라미네이트 또는 표준 매트릭스 코팅 접시에 재현 될 수 있으며 성숙한 신경 세포 (NF200, 적색) 및 신경아 교세포(GFAP, 녹색) 뉴런 분화 (ND) 매체의 면전에서 세포. (Nestin, red)은 신경 유도 (Neural induction, NI) 배지의 존재하에 확장되거나, 동결 보존되거나, 또는 ND 배지의 존재 하에서 추가로 분화되어 혼합 된 신경 세포 (NF200, 녹색) 및 신경교 (glial)를 형성 할 수있다 GFAP, red) 문화. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
3. HiPSC 유래 신경 줄기 세포 (NSC) 혼합 뉴런과 Glia 로의 분화
참고 : 로제트 조각에서 추출한 NSC는 아래에 설명 된 절차 ( 그림 1 , 하단 부분)에 따라 확장 및 유지 관리 할 수 있습니다. 이렇게하면 th를 증가시킬 수 있습니다.분화 및 화학 시험을위한 세포 수.
4. HiPSC 유래 NSC 저온 보존 및 해동
참고 : passaging, NSCs는 동결 수 있으며이 절차를 다시 해동.
5. 채라hiPSC 유래 신경 세포 및 신경 교세포의 체화
참고 : 차별화, 신경 및 glial 파생 상품은 다음 섹션에서 설명하는 것과 같은 다른 기술을 사용하여 특성 수 있습니다.
미분화 hiPSCs의 특성
hiPSCs의 표현형을 평가하기 위해 식민지 / 세포 형태의 분석, PSC- 특이 적 마커의 결정, 유전자 발현 및 알칼리성 인산염 활성의 검사가 수행되어야한다. 미분화 된 hiPSC는 둥글고 커다란 핵 리성과 풍부한 세포질이 없어야한다. 대부분의 콜로니는 미분화 된 표현형을 나타내는 평평하고 단단히 채워진 형태로 특징 지어 져야한다 ( 그림 2A 와 그림 2B ). 또한 콜로니의 80 % 이상이 alkaline phosphatase 활성 염색에 양성이어야한다 ( 그림 2C ).
세포의 약 80 %가 Oct4, S와 같은 고전 다 분화능 관련 마커에 양성이어야한다.SEA3, SSEA4, 및 Tra1-60 ( 도 2D-H )은 면역 세포 화학 및 유동 세포 계측법에 의해 나타내지 만, nestin + 및 β-III-Tubulin + 세포의 백분율은 상당히 낮아야한다 (각각 약 8 % 및 3 % 그림 2H 참조). 이러한 결과는 구절을 통해 재현 가능해야합니다.
그림 2. 미분화 IMR90 - hiPSCs의 특성. (A 및 B) 미분화 된 IMR90-hiPSC 콜로니의 대표적인 위상 - 대조 이미지 (10X 및 20X 배율). (C) 알칼라인 포스파타제로 염색 된 콜로니 (4X 배율)의 대표 이미지. (DF) (D) Oct4 (적색), (E) SSEA3 (녹색) 및 (F) Tr의 대표적인 면역 세포 화학 이미지a1-60 (녹색). (G) 유동 세포 계측법으로 분석 한 SSEA1 (CD15) 및 SSEA4 염색의 대표적인 도트 플롯. (H) 막대 그래프는 Oct4 + (~ 75-80 %), Tra1-60 + (~ 75-80 %), SSEA3 + (~ 75-80 %), nestin + (~ 10-15 % ), DAPI로 대조 염색하고 HCI로 정량화 한 β-III- 튜 불린 + (~ 3 - 7 %) 세포를 SEM (참조 6에서 수정 된 그래프)으로 3 ~ 5 회의 생물학적으로 복제 하였다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
EB 형성을 통한 pluripotency의 평가
HiPSCs는 다 능성이며 적절한 조건에서 3 개의 세균층 관련 유전자를 발현한다는 의미입니다. hiPSC의 다 분화능을 평가하기 위해 공통점접근은 자발적인 EB 형성에 기반을 두어 3 개의 세균층 형성을 유도한다. 세 포층 특이적인 유전자의 분석은 내배엽 (α-fetoprotein (AFP) 및 Cytokeratin 18 (KRT18)), 외배엽 (Nestin, SRY- 상자 1 (Sox1) 및 쌍 상자 6 (Pax6) ) 및 중배엽 (나트륨 이뇨 펩타이드 A (NPPA) 및 브라 키유리 -T) - 관련 유전자 발현 ( 도 3A 및 도 3B ); 재료 표를 참조하십시오 .
그림 3. EB 형성에 의한 다 능성의 평가. ( B) 막대 그래프는 중배엽 (NPPA 및 brachyury), 외배엽 (Pax6, Sox1 및 nestin) 및 내배엽 (AFP 및 KRT18)의 qPCR 분석을 보여줍니다. ) 유전자를 참조 유전자, β- 액틴 및 GAPDH로 정규화하고, 미분화 세포로 보정 하였다 (0 일째). 이것은 ΔΔCt 방법이며 평균 5 개의 독립적 인 분석 ± SEM * p <0.05, ** p <0.01, *** p <0.001; 그래프는 참고 자료 6에서 수정되었습니다 .이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
신경 및 신경 교세포 분화의 유도
IMR90-iPSCs는 그림 1 과 프로토콜 섹션에 요약 된 단계에 따라 사후 유사 분열 뉴런과 신경 교세포의 혼합 배양으로 분화 될 수 있습니다. 완전한 NRI 배지의 존재하에 표준 매트릭스 또는 라미닌 코팅 된 접시 위에 EB를 도금 한 후 5-8 일 후에, 로제 같은 형태의 구조물이 가시화되기 시작해야한다 (= "xfig"> 그림 4A). Rosettes은 거의 β-III- 튜 불린 + 세포 (신경 세포가 약 5 ~ 10 %)가 거의없는 nestin + 세포 (신경 전구체, ~ 90 %)의 존재를 특징으로하며, 후자는 일반적으로 주로 rosettes ( 그림 4B , 12 일째 장미).
로제리 해리 및 완전한 ND 배지의 존재하에 라미닌 - 또는 표준 매트릭스 - 코팅 된 접시 또는 플레이트 상에 재현시, 세포는 뉴런 및 번리아의 혼합 배양으로 분화를 시작하여 신경 돌기의 번들에 의해 연결된 신경 세포 몸체의 클러스터를 점차적으로 형성한다 ( 도 4C 및 4D ). 유사한 결과는 로제트 유래 NSC를 확대하여 뉴런과 신경아 교세포로 분화하여 얻은 연결 인구를 분석 할 때 얻어야한다. 로제트에서 확장 된 NSC는 n이어야합니다.estin + ( 도 4e , 네 스틴 + 세포를 나타낸 삽화).
분화 21 일 후에 세포는 β-III-tubulin에 양성이어야한다. NF200; 타우; (GFAP), 성상 세포 마커 ( 도 4G 및도 4H)에 대해 양성인 세포의 적어도 10-15 %를 갖는 수상 돌기의 후기 마커 인 MAP2 ( 도 4D , 4F 및도 4H) . 더욱이, 세포의 ~ 20-30 %는 분화 후에 네 스틴의 발현을 유지해야한다 ( 그림 4H ). 각 세포 유형 ( 즉, 뉴런, 성상 세포, 네 스틴 + 세포)의 비율이 계대를 통해 달라질 수 있으며 사용자에 따라 가변성이 관찰 될 수 있다는 점을 고려하는 것이 중요합니다.
특정 신경 subpopulations을 분석하여, GABAergic 뉴런 repre감마 - 아미노 부티르산 (GABA), 티로신 히드 록 실라 제 (TH), 및 소포 성 글루타메이트에 대한 면역 염색으로 볼 때 총 세포의 15-20 %, 도파민 성 뉴론 13-20 %, 글루탐산 작용 성 뉴런 35-42 % 트랜스포터 1 (VGlut1)을 각각 검출 하였다 ( 도 4H 의 대표적인 정량화 참조). 분화 유도는 미 분화 hiPSC 대 미 분화 세포에서 유의하게 하향 조절되어야하는 다 분화능 관련 마커 ( 예 : Oct4, Tra1-60 및 SSEA3)의 분석으로 평가할 수 있습니다 (참고 자료 6 참조). 이것은 OctPC와 Nanog의 감소와 신경 세포 접착 분자 1 (NCAM1)과 미세 소관 연합 단백질 2 (MAP2)와 같은 신경 유전자의 상향 조절을 나타내는 qPCR에 의한 유전자 발현의 분석을 통해서도 확인 될 수있다. presynaptic 유전자, synaptophysin (SYP); 및 시냅스 후 (post-synaptic) 유전자 인 미세 소관 연합 단백질 타우 (microtubule-associated protein tau, MAPT) strong class = "xfig"> 그림 4I. 또한, 도파민 성 (TH 및 NR4A1), 노르 아드레날린 성 (PHOX2A 및 PHOX2B), 글루탐산 작용 성 (NARG2, GRIA1 및 GAP43), GABA 성 (GABRA1 및 GABRA3), 모터 뉴런 (ISL1 및 LHX3) 및 콜린성 (SLC5A7 및 SLC18A13) 미분화 세포와 비교하여 상향 조절 된 신경 세포를 생성한다 ( 도 4J ).
MEA를 통한 자발적인 전기 활동 분석은 분화 된 hiPSC에서 신경 네트워크의 기능을 평가하는 데 중요한 가치가 있습니다. 분화 기간의 끝에서, 신경 유래 물은 일반적으로 최소 발화 속도 (MFR)가 적어도 60 스파이크 / 분인 것을 특징으로합니다 ( 그림 4K 의 대표 래스터 도표 참조). 그러나 파열은 관찰되지 않습니다.
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그림 4. 뉴런과 Glia의 혼합 문화로 IMR90 - hiPSCs의 분화. (A 및 B) 네 스틴 (녹색) 및 β-III- 튜 불린 (적색)에 대해 염색 된 7 DIV (A) 및 12 DIV (B) 후 로제트의 대표 이미지. (C 및 D) β-III- 튜 불린 (적색) 및 NF200 (녹색)에 대해 염색 된 22 DIV (C) 및 28 DIV (D) 후 분화 된 세포의 대표적인 이미지. (E) 로제트 해리 및 팽창으로부터 유래 된 NSC의 대표적인 이미지 (삽관은 네 스틴 + 세포, 적색을 나타낸다). (F 및 G) 신경 세포 ( F , NF200 (적색) 및 타우 (녹색)에 대해 염색) 및 신경교 세포 ( G , GFAP (적색)에 대해 염색 됨)의 대표적인 이미지는 NSC로부터 분화되었다 (21 DIV 이후). (H) Nestin, MAP2, GFAP, 감마 - 아미노 부티르산 (GABA), 소포 글루타메이트 운반체 1 (VGlutIMR90-hiPSC 유도체와 IMR90-hiPSC 유래 NSC로부터 분화 된 세포를 비교하여 HCl에 의한 티로신 히드 록 실기 (TH) - 양성 세포 (참조 7로부터 변형 된 그래프)를 얻었다. ( Oct4 및 Nanog) 및 신경 세포 (NCAM1, MAP2, SYP 및 MAPT) (I) 및 도파민 성 물질 (TH 및 NR4A1), 노르 아드레날린 성 물질 (PHOX2A 및 PHOX2B)의 qPCR 분석을 보여주는 막대 그래프. (NARG2, GRIA1 및 GAP43), GABA (GABRA1 및 GABRA3), 운동 신경 세포 (ISL1 및 LHX3) 및 콜린성 (SLC5A7 및 SLC18A13) 관련 유전자 (J) 모든 분석은 참조 유전자, β-actin 및 GAPDH에 대해 표준화되었고 미분화 세포 (녹색 막대)로 보정되었습니다. 이것은 ΔΔCt 방법이며 평균 5 개의 독립적 인 분석 ± SEM * p <0.05, ** p <0.01, *** p <0.001이다. I 및 J의 그래프는 참고 문헌 6에서 수정되었다. (K) IMR90-NSC 유래 신경의 대표 래스터 플롯(녹음은 최소 600 초 동안 수행되었으며, 수직 막대는 단일 스파이크를 나타냄). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
신경 마커의 특이 적 시그니처는 분화 된 IMR90-hiPSCs에서 상향 조절됩니다
새로운 독성 시험 패러다임에서 주어진 독성 물질에 노출 된 후 세포 내에서 일어나는 분자 및 세포 사건을 정의하는 것이 필수적이다. 따라서 연구중인 세포 모델 내에서 어떤 신호 전달 경로가 활성화 및 / 또는 상향 조절되는지를 특성화하는 것이 적절하다.
단백질 키나아제 유전자 발현 분석을 위해 상업적으로 이용 가능한 어레이는 분화되지 않은 세포에 비해 미분화 된 hiPSCs를 비교하는데 사용될 수있다. 차이(GDNF) 수용체, 골 형성 단백질 (BMP) / TGF-β 경로 및 혈소판 응집 조절 인자와 같은 신경 모세포 수용체의 조절에 관여하는 유전자의 상향 조절을 받는다. 파생 성장 인자 (PDGF) 수용체 ( 그림 5A 및 그림 5B ).
RPPA의 분석은 분화 된 IMR90-hiPSCs에서 특정 신경 신호의 상향 조절을 보여줍니다. 특히, Erk / CREB, Akt / PDK1 / mTOR 및 Notch1 신호 경로는 분화시 활성화됩니다 ( 그림 5C ).
그림 5. 분화 된 신경 및 신경 세포는 뉴런 관련 경로의 활성화를 보여줍니다. (에이B) 막대 그래프는 뉴런 관련 키나아제 (A) 및 기타 키나아제 관련 유전자 (B) 의 qPCR 분석을보고합니다. 유전자 발현 데이터를 참조 유전자 18S 및 GAPDH (어레이에 제공)로 정규화하고 미분화 세포로 보정 하였다. 이러한 분석에서 유전자는 발현이 미분화 세포 (2- ΔΔCt ≥ 2)보다 적어도 2 배 이상 높았을 때 유의하게 상향 조절 된 것으로 간주되었다. 평균 3 개의 독립적 인 분석 ± SEM). (C) 막대 그래프는 RPPA 분석을 통해 분화 된 (빨간색 막대) 및 미분화 세포 (녹색 막대)를 비교하여 절대 단백질 양을 표시합니다. CREB / Erk / Akt, PDK1 / mTOR / Erk / Akt, Notch1, Shh 및 Wnt, SAPK / JNK, 및 BMP / SMAD와 같은 신호 경로 캐스케이드에 속하는 단백질은 함께 클러스터링된다. 4 개의 독립적 인 분석의 평균 ± SEM. * p <0.05, ** p <0.01, *** p <0.001; 그래프 수정 된 from 참고 자료 6. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
IMR90-hiPSC 유래 신경 세포 / 신경 교세포는로 테톤의 효과를 평가하는 데 사용할 수 있습니다
미토콘드리아 호흡 쇄의 복합체 I 억제제 인 로테 논 (Rotenone)은 Nrf2 경로의 활성화를 촉발시켜 산화 스트레스를 일으키는 것으로 알려져있다. 정지 상태에서, Nrf2는 Nrf2 유비퀴틴 화 및 단백질 분해 15를 촉진하는 Keap1 (Kelch-like ECH 관련 단백질 1)에 의해 세포질에 고정되어있다. 산화 스트레스의 유도시, Nrf2는 핵으로 전위되어 Nrf2-ARE 표적 유전자의 발현을 활성화시킨다.
IMR90-hiPSC 유래 뉴런d glial 세포는 24 시간 동안 여러 농도의 rotenone ( 예 : 1, 10 및 100 nM)에 세포를 노출시킴으로써 Nrf2 활성화에 대한 rotenone의 효과를 평가하는 데 사용할 수 있습니다. 이러한 농도는 이전의 연구 17 , 18 에 따라 확립되었다.
이러한 농도와 시간의 노출에서, 로테 논은 생 DAPI + 세포 핵의 정량화에 의해 보여지는 것처럼 세포 독성을 나타내지 않았다 ( 그림 6A ). Rotenone은 Nrf2 nuclear translocation을 유도하였으며, 특히 100nM의 rotenone에 세포를 노출시킨 후 ( 그림 6B 및 그림 6E ). 동일한 농도에서 NAD (P) H 퀴논 산화 환원 효소 1 (NQO1)과 Sulfiredoxin 1 (SRXN1)의 두 가지 Nrf2- 표적 en과 함께 세포질 Keap1의 유의 한 감소가 관찰되었다 ( 도 6C )zymes 19 , 20 ( 도 6D ).
그림 6. Nrf2 핵 이식, Keap1, SRXN1 및 NQO1 단백질 수준에 대한 Rotenone의 효과. (A) 1, 10, 100 nM 로테 논으로 24 시간 처리 한 후 생존 한 DAPI + 세포 (비핵 핵)를 정량화하고 미처리 된 세포로 정상화 (대조군, Ctr). (B) 로테 논 노출 24 시간 후 Nrf2 단백질 핵 전좌 ( 즉, 핵 / 세포질 비율)를 HCI 분석을 사용하여 형광 강도를 측정하여 평가. (C) HCI 분석에 의해 평가 된 로테 논 처리시의 세포질 Keap1 단백질 수준의 정량화. (D) NAD (P) H 퀴논 산화 환원 효소 1 (NQO1)과 Sulfi(redoxin) 1 (SRXN1)을 면역 형광 및 HCI를 이용하여 24 시간 동안 투여 하였다. (E) Nrf2 단백질 지방화 (녹색)의 대표 이미지. 모든 값은 3 번의 생물학적 복제의 평균 ± SEM으로 표시됩니다. * p <0.05, ** p <0.01; 참조 번호 7에서 수정 된 그림입니다.이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
이러한 농도와 치료 시간에서,로 넥은 또한 NSCs (nestin + )와 뉴런 (MAP2 + )의 비율에 영향을 미치지 않고 농도 의존적으로 성상 세포 (GFAP + ) 세포 백분율을 증가시켰다 ( 그림 7A 및 그림 7B ) 7B ). 특정 신경 아형의 비율을 살펴보면, 로테 논 치료 (10 nM 및 100 nM)GABA (GABA + ) 및 글루탐산 작용 (VGlut1 + ) 뉴런의 비율은 변화하지 않는 반면 ( 도 7C 및 D ) 도파민 성 뉴런 (TH + )의 수를 현저히 감소시켰다 ( 도 7C 및 D ). 유사하게, 이전 의 생체 내 및 시험 관내 연구는 로테 논 의존성 및 선택적 도파민 성 신경 세포 죽음 21 , 22 , 23을 기술 하였다.
그림 7. Glial 세포와 Dopaminergic 뉴런에 대한 Rotenone의 효과. (A) 인 세트에서 40X 배율의 GFAP + 세포 (적색)의 대표 사진, 치료되지 않거나 24 시간 동안 100nM의 로톤 처리. (B) 정량화 처리되지 않은 세포로 정상화 된 nestin + , MAP2 + 및 GFAP + 세포 (대조군, Ctr) (C) 인 세트에서 40X 배율의 도파민 성 TH + 뉴런 (녹색)의 대표 사진, 치료되지 않거나 24 시간 동안 100nM의로 테톤으로 치료됨. (D) GABA + , VGlut1 + 및 TH + 신경 세포의 정량, 치료받지 않은 세포 (Ctr)로 표준화. 모든 값은 3 번의 생물학적 복제의 평균 ± SEM으로 표시됩니다. * p <0.05, ** p <0.01, *** p <0.001; 참조 번호 7에서 수정 된 그림입니다.이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
통계적 유의성은 Dunnett의 Multiple Comparison Test를 사용하여 일원 분산 분석 (one-way ANOVA)으로 사후 테스트로 평가되었습니다 (모든 컬럼과 대조 컬럼 비교)xref "> 24 또는 분석 유형에 따라 양측의 쌍을 이룰 수없는 쌍 또는 쌍으로 된 t- 검정으로 나타낼 수 있습니다. 모든 데이터는 적어도 세 번의 생물학적 복제의 평균 ± 표준 오차 (SEM)를 나타냅니다. 막대 위에 별표가 표시되어 있으면 * p <0.05, ** p <0.01, *** p <0.001.
1 번 테이블.
해리 된 로제트 도금 밀도에 대한 참고 사항 : 로제트 단편이 완전히 해리 된 것처럼 보이지 않는 경우, 약 15.000 세포 / cm2의 세포 도금 밀도에 도달하기 위해, 약 50 EB / 1 x 60mm- 접시에서 유래하는 분리 된 로제트 단편을 50 mL의 완전한 NRI 배지에 넣고 다음과 같이 도금한다 (플레이트 형식에 따라 다름).
멀티 웰 플레이트 / MEA | 성장 면적 (cm2 / 우물) | 웰당 플레이트 현탁액의 부피 (또는 MEA 칩) | 도금 할 수있는 최대 플레이트 수 (세포 현탁액 50 ml 포함) |
96 개 우물 | 0.3 | 100 ul | 5 |
48 개의 우물 | 0.7 | 220 ul | 4 |
24 개 우물 | 2 | 625 ul | 삼 |
12 개 우물 | 4 | 1.25 ml | 삼 |
6 개의 우물 | 10 | 3.125 ml | 2 |
싱글 웰 MEA 칩 | 3.5 | 1.1 ml | 45 |
도표 2 : 합격 기준
마커 /항독소 | 28 DIV 후 백분율 (DAPI + (live) 세포에서) |
B-III- 튜 불린 (Tuj1) | 35-45 % |
MAP2 | 50-60 % |
NF200 | 45-55 % |
GFAP | 10-25 % |
네스틴 | 15-25 % |
이 연구는 IMR90-hiPSC를 사후 유사 분열 뉴런 및 신경 교세포로 분화시키기위한 견고하고 비교적 빠른 프로토콜을 기술한다. hESCs와 hiPSCs를 기반으로 이전에 발표 된 신경 세포 분화 프로토콜은 일반적으로 높은 비율의 신경 전구체 25 , 26 과 상당한 숫자의 연결 대상 세포 27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 32 , 33을 생산 합니다. 유사하게, 여기에 설명 된 분화 프로토콜은 glia와 nestin + 세포의 이산 비율과 함께 GABA 성, glutamatergic 및 dopaminergic 신경 세포의 이종 배양을 생성하는 데 적합합니다. glutamatergic (~ 35-42 %) 및 GABA (~ 15-20 %) 신경 세포의 존재는이 문화는 forebrain, 피질과 같은 기능을 보유하고 dopaminergic 뉴런 (~ 13-20 %)의 이산 번호의 존재는 또한 midbrain 특이성을 나타낼 수 있습니다. 또한, neestrogen + 세포의 겸손한 비율의 영속성은 neurogenesis의 연구와 NSC에 대한 화학 물질의 가능한 영향을 입증 할 수 있으며, NSC는 주로 해마와 뇌의 뇌실 영역 (SVZ) 모두에 국한되어있다. 추가 면역 세포 화학 및 유전자 발현 분석은 분화 된 세포 유도체의 지역 특이성을보다 잘 정의하는 데 도움이됩니다.
이 문서에서 설명하는 분화 프로토콜의 가장 중요한 두 단계는 다음과 같습니다 : (i) 균질 한 조각으로 hiPSC 콜로니를 절단하는 것 (균일 한 크기의 EB 생성에 중요합니다) 및 (ii) 신경 외배엽 구조 절단 ) NSC 차별화에는 상당한 수작업 기술이 필요합니다.분화시 얻은 뉴런 및 신경 교세포의 비율을 감소시킬 수있는 중배엽 및 내배엽 세포를 수집하는 것을 피하기위한 정밀성을 제공한다.
팽창하는 동안 (미분화 된 식민지 또는 NSCs와 같은) 모든 분화 단계에서 세포의 표현형을 특성화하는 것이 중요합니다. 특히, 신경 세포 / 신경 교세포 유도체의 유전자 및 단백질 발현 프로파일은 뉴런 관련 신호 경로의 상향 조절 및 활성화를 보여야하지만, 다 능성 마커의 발현은 감소되어야한다.
EBs와 neuroectodermal 유도체 (rosettes)의 생성은 수동으로 도전하고 가변성이 있습니다. 이러한 이유로 우리는 로제트 유도 NSC의 확장 및 신경 세포 / 신경 교세포로의 추가 분화를위한 프로토콜을 개발했습니다.
이 분화 프로토콜의 가능한 한계는 주로 (i) 상대적으로 낮은 비율의 d(ii) 성숙한 신경 네트워크 기능의 결핍 (파열의 부족으로 나타남)과 관련이있다. 또한, 성상 세포의 특정 subpopulations은 기본 progenitors 또는 NSCs 35 로 기능 할 수 있습니다. 이 분화 된 세포 배양에서 nestin / GFAP 이중 양성 세포가 관찰되지 않았지만 (데이터는 표시되지 않음), 이러한 혼합 배양 물에서 GFAP + 세포는 성상 세포 전구 세포 및 성상 세포 인 것으로 가정합니다. 분화 시간을 연장함으로써 성 장군의 숫자가 증가하고 그 형태가보다 성숙해질 가능성이있다 (Zhang의 36 , 37) .
새로운 독성 시험 패러다임에서는 화학적 역경을 평가할 때 생물학적 경로의 화학적 섭동에 대한 지식이 가장 중요합니다. 따라서 체외 시험 시스템은불리한 결과 경로 (AOP)의 개념에 따라 신호 경로의 교란에 부작용을 연관시킨다. 개념 증명으로 로테 논은 Nrf2 경로의 활성화를 평가하는 데 사용할 수 있습니다.이 경로는 산화성 또는 친 전자 성 스트레스에 대한 세포 방어에 관여합니다. 38 산화 스트레스는 다음과 관련된 다양한 AOP에서 중요하고 공통적 인 핵심 이벤트입니다. 발달 및 성충 신경 독성 39 .
로 테논은 Nrf2 단백질의 핵 전좌와 NQO1과 SRXN1을 포함한 Nrf2 표적 효소의 발현 증가에 의해 증명 될 수있는 Nrf2 경로의 활성화를 이끌어 내야한다. 로테 논은 성상 세포 활성화 40 , 41 을 나타내는 GFAP 단백질 수준의 용량 의존적 인 증가를 유도한다는 것이 밝혀졌습니다. Rotenone은 또한 dopaminergic (TH + ) 세포의 수를 감소 시키며, 이는 previ와 일치한다이 유형의 뉴런은 특히 산화 적 스트레스에 민감하기 때문에, 로테 논 의존성 도파민 성 세포 사멸을 보여주는 시험관 내 및 생체 내 연구 21 , 22 , 23 .
결론적으로이 hiPSC 유래 신경 세포 및 신경교 세포 배양 모델은 Nrf2 경로 활성화를 초래하는 산화 스트레스를 유발하는 화학 물질의 신경 독성 효과를 평가하는 데 유용한 도구입니다. 이 분화 프로토콜은 신경 세포 (GABA 성, 도파민 성 및 글루탐산 작용 성 뉴런) 및 성상 교세포의 혼합 배양 물의 생성을 허용하기 때문에 신경 퇴행성 질환과 같은 생리적 및 병리학 적 조건에서 뉴런과 글 리아 사이의 크로스 토크를 연구하는 데 적합 할 수 있습니다 예 : 파킨슨 병). 또한 상당량의 NSC가 존재하면 신경계에 화학 물질이 미치는 영향을 평가하는 데 도움이 될 수 있습니다화학적으로 유도 된 돌연변이 또는 바이러스 감염의 주요 표적이 될 수있는 것으로 알려져있다.
저자는 공개 할 것이 없습니다.
저자는 IMR90-hiPSC를 제공 한 Dr. Marc Peschanski (I-Stem, 프랑스, 에리)에게 감사 드리고 싶습니다. Dr. Giovanna Lazzari와 Dr. Silvia Colleoni (Avantea srl, Cremona, Italy); Dr. Simone Haupt (독일 본 (Bonn) 대학교); Tiziana Santini 박사 (이탈리아 기술 연구소, 로마), 면역 형광 염색 평가에 대한 조언 제공. RPPA 분석 및 항체 검증에 대한 공헌으로 Benedetta Accordi 박사, Elena Rampazzo 박사 및 Luca Persano 박사 (University of Padua, 이탈리아) 자금 조달 :이 작업은 EU가 지원하는 "SCR & Tox"프로젝트 (보조금 협약 N ° 266753)에 의해 지원되었습니다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Complete hiPSC medium: | |||
mTeSR1 Basal Medium | Stem Cell Technologies | 05851 | (Step 1.2.6). Complete mTeSR1 is stable when stored at 2 - 8°C for up to 2 weeks. 5X Supplements can be dispensed into working aliquots and stored at -20°C. Use frozen aliquots within 3 months. |
mTeSR1 5X Supplements | Stem Cell Technologies | 05852 | |
Matrigel hESC-qualified Matrix | Corning | 354277 | 1:100 (Step 1.1). Thaw Matrigel on ice, prepare 200 ul aliquots and store them in -80°C. For coating, dilute 200ul aliquot in 20 ml of DMEM/F12 medium. |
CryoStem Freezing Medium | Stemgent | 01-0013-50 | Freeze ~ 100 fragments/250 ul/vial (Step 1.2.1) |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
hiPSC EB medium: | |||
Knockout DMEM | Thermo-Fisher | 10829-018 | (Step 2.1.7) |
Knockout Serum Replacement (KOSR) | Thermo-Fisher | 10828-028 | 20% final concentration (Step 2.1.7) |
Non-Essential Amino Acids | Thermo-Fisher | 11140-035 | (Step 2.1.7) |
Penicillin/Streptomycin | Thermo-Fisher | 15140-122 | 50 U/mL final concentration (Step 2.1.7) |
L-Glutamine 200 mM Solution | Thermo-Fisher | 25030-081 | 2 mM final concentration (Step 2.1.7) |
β-Mercaptoethanol | Thermo-Fisher | 31350-010 | 50 µM final concentration (Step 2.1.7) |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Complete neuroepithelial induction medium (NRI): | |||
DMEM/F12 | Thermo-Fisher | 3133-038 | (Step 2.3.1) |
Non-Essential Amino Acids | Thermo-Fisher | 11140-035 | (Step 2.3.1) |
N2 Supplement | Thermo-Fisher | 17502-048 | (Step 2.3.1) |
Penicillin/Streptomycin | Thermo-Fisher | 15140-122 | 50 U/mL final concentration (Step 2.3.1) |
Heparin Grade I-A, ≥180 USP units/mg | Sigma-Aldrich | H3149-100KU | 2 µg/ml final concentration (Step 2.3.1) |
bFGF | Thermo-Fisher | 13256-029 | 20 ng/ml final concentration added before use (Step 2.3.1) |
Matrigel Basement Membrane Matrix | Corning | 354234 | 1:100 (Step 2.2). Thaw Matrigel on ice, prepare 200 ul aliquots and store them in -80°C. For coating, dilute 200 ul aliquot in 20 ml of cold DMEM/F12 medium. |
Laminin | Sigma-Aldrich | L2020 | 1:100 (Step 2.2). Dilute in PBS 1X. |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Complete Neuronal Differentiation medium (ND): | |||
Neurobasal Medium | Thermo-Fisher | 21103049 | (Step 2.4.11) |
B-27 Supplements (50x) | Thermo-Fisher | 17504044 | (Step 2.4.11) |
N2 Supplement | Thermo-Fisher | 17502-048 | (Step 2.4.11) |
Penicillin/Streptomycin | Thermo-Fisher | 15140-122 | 50 U/mL final concentration (Step 2.4.11) |
GDNF | Thermo-Fisher | PHC7045 | 1 ng/ml final concentration. Added before use. (Step 2.4.11) |
BDNF | Thermo-Fisher | PHC7074 | 2.5 ng/ml final concentration. Added before use. (Step 2.4.11) |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Neural induction medium (NI): | |||
DMEM/F12 | Thermo-Fisher | 3133-038 | (Step 3.3) |
Non-Essential Amino Acids | Thermo-Fisher | 11140-035 | (Step 3.3) |
N2 Supplement | Thermo-Fisher | 17502-048 | (Step 3.3) |
Penicillin/Streptomycin | Thermo-Fisher | 15140-122 | 50 U/mL final concentration (Step 3.3) |
Heparin Grade I-A, ≥180 USP units/mg | Sigma-Aldrich | H3149-100KU | 2 µg/ml final concentration (Step 3.3) |
B-27 Supplement (50X), minus vitamin A | Thermo-Fisher | 12587010 | (Step 3.3) |
L-Glutamine 200 mM Solution | Thermo-Fisher | 25030-081 | 2 mM final concentration (Step 3.3) |
bFGF | Thermo-Fisher | 13256-029 | 10 ng/ml final concentration. Added before use (Step 3.3) |
EGF | Thermo-Fisher | PHG6045 | 10 ng/ml final concentration. Added before use (Step 3.3) |
BDNF | Thermo-Fisher | PHC7074 | 2.5 ng/ml final concentration. Added before use (Step 3.3) |
Defined Trypsin Inhibitor (DTI) | Thermo-Fisher | R007-100 | Pre-warm at 37°C. Add an equal amount of DTI to Trypsin-EDTA (Step 3.10) |
Trypsin-EDTA (0.5%), no phenol red | Thermo-Fisher | 15400054 | 1:10. Dilute Trypsin-EDTA in PBS 1x (without calcium and magnesium), pre-warm the solution at 37°C (Step 3.8) |
CryoStor cell cryopreservation medium | Sigma-Aldrich | C2874-100ML | (Step 4.2) |
Trypan Blue (0.4%) | Sigma-Aldrich | T8154-100ML | multiple manufacturers/suppliers |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
TaqMan Probesets and reagents for gene expression analysis: | |||
RNAqueous-Micro kit | Thermo-Fisher | AM1931 | (Step 5.1.6) |
High Capacity cDNA Reverse Transcription Kits | Thermo-Fisher | 4368814 | |
TaqMan Gene Expression Master Mix | Thermo-Fisher | 4369016 | |
GFAP | Thermo-Fisher | Hs00909233_m1 | |
MAP2 | Thermo-Fisher | Hs00258900_m1 | |
NQO1 | Thermo-Fisher | Hs02512143_s1 | |
SRXN1 | Thermo-Fisher | Hs00607800_m1 | |
HMOX1 | Thermo-Fisher | Hs01110250_m1 | |
GSR | Thermo-Fisher | Hs00167317_m1 | |
PAX6 | Thermo-Fisher | Hs01088112_m1 | |
NES | Thermo-Fisher | Hs00707120_s1 | |
GRIA1 | Thermo-Fisher | Hs00181348_m1 | |
GAP43 | Thermo-Fisher | Hs00967138_m1 | |
GABRA3 | Thermo-Fisher | Hs00968132_m1 | |
GABRA1 | Thermo-Fisher | Hs00168058_m1 | |
NR4A2 | Thermo-Fisher | Hs00428691_m1 | |
TH | Thermo-Fisher | Hs00165941_m1 | |
GAPDH | Thermo-Fisher | Hs02758991_g1 | |
ACTB | Thermo-Fisher | Hs99999903_m1 | |
MAPT | Thermo-Fisher | Hs00902194_m1 | |
SYP | Thermo-Fisher | Hs00300531_m1 | |
NANOG | Thermo-Fisher | Hs04260366_g1 | |
POU5F1 (OCT4) | Thermo-Fisher | Hs04195369_s1 | |
SOX1 | Thermo-Fisher | Hs01057642_s1 | |
AFP | Thermo-Fisher | Hs00173490_m1 | |
KRT18 | Thermo-Fisher | Hs01941416_g1 | |
NPPA | Thermo-Fisher | Hs00383230_g1 | |
T | Thermo-Fisher | Hs00610080_m1 | |
NCAM1 | Thermo-Fisher | Hs00941821_m1 | |
NR4A1 | Thermo-Fisher | Hs00374226_m1 | |
PHOX2A | Thermo-Fisher | Hs00605931_mH | |
PHOX2B | Thermo-Fisher | Hs00243679_m1 | |
NARG2 | Thermo-Fisher | Hs00973298_g1 | |
SLC18A3 | Thermo-Fisher | Hs00268179_s1 | |
SLC5A7 | Thermo-Fisher | Hs00222367_m1 | |
ISL1 | Thermo-Fisher | Hs00158126_m1 | |
LHX3 | Thermo-Fisher | Hs01033412_m1 | |
TaqMan Human Protein Kinase Array | Thermo-Fisher | 4418721 | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Antibodies and reagents for immunostaining: | |||
B-III-tubulin (Tuj1) | Covance | MMS-435P | 1:500 (Step 5.2.5). Other antibodies may also be used. |
MAP2 | Sigma Aldrich | M4403 | 1:500 |
NF200 | Sigma Aldrich | N4142 | 1:1000 |
GFAP | Acris Antibodies GmbH | AP02002SU-N | 1:500 |
Nestin | Sigma-Aldrich | N5413 | 1:200 |
synaptophysin (SYN) | Abcam | AB14692 | 1:200 |
Tau | Thermo-Fisher | MA5-12808 | 1:100 |
Nrf2 | Abcam | AB62352 | 1:200 |
Keap1 | Abcam | AB66620 | 1:200 |
sulfiredoxin1 (SRXN1) | Abcam | AB92298 | 1:200 |
NAD(P)H quinone oxidoreductase 1 (NQO1) | Abcam | AB2346 | 1:200 |
OCT4 | Millipore | MAB4401 | 1:100 |
SSEA3 | Millipore | MAB4303 | 1:100 |
Tra1-60 | Millipore | MAB4360 | 1:250 |
Tyrosine hydroxylase (TH) | Millipore | AB152 | 1:200 |
Gamma-aminobutyric acid (GABA) | Sigma-Aldrich | A0310 | 1:100 |
Vesicular glutamate transporter 1 (VGlut1) | Abcam | AB72311 | 1:500 |
Paraformaldehyde | Sigma-Aldrich | P6148-500G | 4% (4% formaldehyde can also be used) |
DPBS, no calcium, no magnesium | Thermo-Fisher | 14190144 | |
Triton-X-100 Solution | Sigma-Aldrich | 93443-100ML | 0.1% |
BSA 35% | Sigma-Aldrich | A7979-50ML | 3.5% |
Donkey anti-Rabbit IgG (H+L) Cross Adsorbed Secondary Antibody, DyLight 594 conjugate | Thermo-Fisher | SA5-10040 | 1:500. (Step 5.2.7) Other fluorochrome-conjugated secondary antibodies may also be used. In this case, appropriate dilutions should be tested by the enduser. |
Donkey anti-Mouse IgG (H+L) Cross Adsorbed Secondary Antibody, DyLight 488 conjugate | Thermo-Fisher | SA5-10166 | 1:500 |
Donkey anti-Goat IgG (H+L) Cross Adsorbed Secondary Antibody, DyLight 488 conjugate | Thermo-Fisher | SA5-10086 | 1:500 |
DAPI Solution (1 mg/ml) | Thermo-Fisher | 62248 | 1:1000 (Step 5.2.7) |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Antibodies for Reverse Phase Protein Array (RPPA): | |||
4E-BP1 (S65) | Abcam | AB81297 | 1:250 (Note after step 5.2.8) |
Akt (T308) | Cell Signaling | 9275 | 1:100 |
Akt (S473) | Cell Signaling | 9271 | 1:100 |
AMPKalpha (T172) | Cell Signaling | 2531 | 1:100 |
AMPKbeta1 (S108) | Cell Signaling | 4181 | 1:100 |
ATF-2 (T71) | Cell Signaling | 9221 | 1:100 |
c-Jun (S63) | Cell Signaling | 9261 | 1:200 |
c-Jun (S73) | Cell Signaling | 9164 | 1:200 |
c-Kit (Y719) | Cell Signaling | 3391 | 1:250 |
CREB (S133) | Cell Signaling | 9191 | 1:100 |
EGFR (Y1068) | Cell Signaling | 2234 | 1:50 |
ErbB2/HER2 (Y1248) | Cell Signaling | 2247 | 1:100 |
ERK 1/2, p44/42 (T202/Y204) | Cell Signaling | 9101 | 1:2000 |
GSK-3alpha (S21) | Cell Signaling | 9337 | 1:50 |
Jak1 (Y1022/1023) | Cell Signaling | 3331 | 1:100 |
Lck (Y505) | Cell Signaling | 2751 | 1:500 |
LKB1 (S428) | Cell Signaling | 3051 | 1:100 |
mTOR (S2448) | Cell Signaling | 5536 | 1:100 |
NFkB p65 (S536) | Cell Signaling | 3031 | 1:50 |
p70 S6 Kinase (T389) | Cell Signaling | 9205 | 1:200 |
PDK1 (S241) | Cell Signaling | 3061 | 1:100 |
PKA C (T197) | Cell Signaling | 4781 | 1:250 |
PRAS40 (T246) | BioSource | 44-1100 | 1:2000 |
PTEN (S380) | Cell Signaling | 9551 | 1:500 |
Smad1 (S463/465), Smad5 (S463/465), Smad8 (S426/428) | Cell Signaling | 9511 | 1:500 |
Src (Y527) | Cell Signaling | 2105 | 1:500 |
Src Family (Y416) | Cell Signaling | 2101 | 1:200 |
Stat1 (Y701) | Cell Signaling | 9171 | 1:200 |
Stat3 (S727) | Cell Signaling | 9134 | 1:200 |
Zap-70 (Y319) | Enogene | E011159 | 1:100 |
βCatenin (S33/37/T41) | Cell Signaling | 9561 | 1:250 |
CREB | Upstate Biotechnologies | 06-863 | 1:100 |
Fos B | Cell Signaling | 2251 | 1:200 |
GRB2 | Cell Signaling | 3972 | 1:2000 |
HSP70 | Stressgen | SPA-810 | 1:100 |
c-Jun | Cell Signaling | 9165 | 1:100 |
Kip1/p27 | BD | 610241 | 1:100 |
Lck | Cell Signaling | 2984 | 1:250 |
Mcl-1 | Cell Signaling | 4572 | 1:80 |
Musashi | Cell Signaling | 2154 | 1:100 |
NOTCH1 | Cell Signaling | 3439 | 1:100 |
PTEN | Cell Signaling | 9552 | 1:500 |
SGK1 | Abnova | PAB4590 | 1:250 |
Zap-70 | Cell Signaling | 2705 | 1:250 |
β-Catenin | Abcam | AB32572 | 1:1000 |
Dll4 | Abcam | AB7280 | 1:500 |
Shh | Abcam | AB53281 | 1:250 |
HIF-1α | BD | 610958 | 1:50 |
NUMB PAN-ISO | Upstate Biotechnologies | 07-207 | 1:400 |
NUMB-L | Chemicon | AB15145 | 1:750 |
Cyclin B | BD | 610220 | 1:75 |
c-Myc | Calbiochem | OP-10 | 1:100 |
BCIP/NBT Kit | Thermo-Fisher | 002209 | (Note after step 5.2.8). Kit used to measure alkaline phosphatase activity, similar kits can be used. |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Antibodies for Flow Cytometry: | |||
SSEA1 Antibody, Pacific Blue conjugate | Thermo-Fisher | MHCD1528 | 1:100 (Note after step 5.2.8) |
SSEA4 Antibody (MC813-70), Alexa Fluor 647 | Thermo-Fisher | SSEA421 | 1:100 |
Name | Company | Catalog number | Comments |
Specific instruments, tools and softwares: | |||
Countess Automated Cell Counter | Thermo-Fisher | C10227 | Neubauer chamber or other suitable glass hemocytometer can be used. |
MEA1060-Inv-BC | Multichannel Systems | MEA1060-Inv-BC | (Step 5.3) |
MEA1060-BC control software | Multichannel Systems | MEA1060-BC | (Step 5.3) |
NeuroExplorer | Multichannel Systems | NeuroExplorer (NE) | (Step 5.3) For post-processing of MEA data |
Multielectrode arrays (MEA) | Multichannel Systems | 60MEA100/10iR-Ti-gr | (Step 5.3) Single-well MEA chip |
ArrayScan XTI High Content Platform | Thermo-Fisher | ASN00002P | (Step 5.2.8) Mean fluorescence can be quantified by using specific ArrayScan algorithms (e.g., Cytotoxicity V.4 and NucTrans V.4 bioapplications). It is recommended to take minimum 20 pictures/well, and have 7-8 internal replicates per condition |
7900HT Fast Real-Time PCR System | Thermo-Fisher | 4351405 | (Step 5.1.6) |
BD ULTRA-FINE Needle Insulin Syringe (with 30G needle) | BD | 328280 | (Steps 1.3.1, 2.1.2, and 2.4.1) |
StemPro EZPassage Disposable Stem Cell Passaging Tool | ThermoFisher | 23181010 | This colony cutting tool can be used as an alternative to the use of 30G needle 1 mL syringes (Step 1.3.1) |
Ultra-Low attachment Petri dish (60 mm) | Corning | 10010582 | (Step 2.1.8) Also other brands can be used. |
Mr. Frosty Freezing container | Sigma-Aldrich | C1562-1EA |
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