Sign In

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

In This Article

  • Summary
  • Abstract
  • Introduction
  • Protocol
  • תוצאות
  • Discussion
  • Disclosures
  • Acknowledgements
  • Materials
  • References
  • Reprints and Permissions

Summary

פרוטוקול זה מתאר שיטה להשגת הקלטות של נוירון יחיד בצפיפות גבוהה מגזע המוח של עכברים בעלי ראש קבוע. גישה זו מיושמת כדי למדוד את פוטנציאל הפעולה של ירי נוירונים באפור פריאקוודוקטלי וונטרולטרלי - אזור בגזע המוח שאינו פעיל במהלך שנת REM (Rapid Eye Movement) - לפני ובמהלך הרדמה כללית.

Abstract

הקלטות מבוססות סיליקון רב-אלקטרודות פופולריות יותר ויותר לחקר פעילות עצבית ברזולוציה הטמפורלית של פוטנציאלי פעולה באזורים רבים במוח. עם זאת, רישום פעילות עצבית ממבנים קאודליים עמוקים כמו גזע המוח באמצעות בדיקות רב-ערוציות נותר מאתגר. חשש משמעותי הוא מציאת מסלול החדרת בדיקה שימנע כלי דם גדולים, כגון הסינוס הוורידי העליון והסינוס הורידי הרוחבי. פגיעה בוורידים הגדולים הללו עלולה לגרום לדימום נרחב, נזק לרקמת המוח הבסיסית ואולי אף למוות. גישה זו מתארת מיקוד מבנים בגזע המוח על ידי צימוד קואורדינטות קדמיות עם גישה זוויתית, המאפשרת לגשושית ההקלטה לחדור למוח מתחת למבני כלי דם בסיכון גבוה. בהשוואה לגישה אנכית לחלוטין, הגישה הזוויתית ממקסמת את מספר אזורי המוח שניתן לכוון. באמצעות אסטרטגיה זו, ניתן לגשת לאפור פריאקוודוקטלי וונטרולטרלי (vlPAG), אזור בגזע המוח הקשור לשנת REM, באופן משוחזר ואמין כדי להשיג הקלטות מרובות אלקטרודות ביחידה אחת בעכברים קבועי ראש לפני ובמהלך הרדמה סבופלורנית. היכולת לרשום פעילות עצבית ב-vlPAG ובגרעינים הסובבים אותו ברזולוציה טמפורלית גבוהה היא צעד קדימה בקידום הבנת הקשר בין שנת REM להרדמה.

Introduction

הקלטות מבוססות סיליקון מבוססות אלקטרודות הופכות פופולריות יותר ויותר למדידת פעילות עצבית באזורים רבים במוח עם רזולוציה פוטנציאלית של פעולה יחידה 1,2,3,4. במהלך העשור האחרון, טכנולוגיית הקלטה בצפיפות גבוהה גדלה במידה ניכרת. אלקטרודות הקלטה מבוססות סיליקון נוכחיות יכולות להכיל ספירות ערוצים גבוהות, סיבים אופטיים והתקני הקלטה אלקטרוקורטיקוגרפיה (ECoG) 5,6. יתר על כן, השתלה כרונית של אלקטרודות אלה מאפשרת הקלטות ארוכות טווח 7,8.

למרות ההתקדמות הטכנולוגית האחרונה, התמקדות במבנים קאודליים עמוקים כמו גזע המוח באמצעות גשושיות רב-ערוציות נותרה מאתגרת. כאשר מתמקדים במבנים בגזע המוח כגון האפור הפריאקוודוקטלי הוונטרולטרלי (vlPAG), מכשול משמעותי אחד הוא זיהוי מסלול בדיקה הנמנע מכלי דם מרכזיים, למשל, הסינוס הוורידי העליון והסינוס הורידי הרוחבי. פגיעה בוורידים גדולים אלה עלולה לגרום לדימום נרחב, נזק לרקמת המוח הבסיסית ואפילו למוות 9,10. אנו מציעים לכוון מבנים של גזע המוח מקואורדינטות קדמיות בזווית, מה שיאפשר לגשושית ההקלטה לחדור למוח מתחת למבנים וסקולריים בסיכון גבוה כאלה (ראו איור 1). גישה זוויתית זוויתית, בהשוואה לגישה אנכית, ממקסמת את מספר אזורי המוח הנגישים להקלטה. בנוסף, בנסיבות ניסיוניות שבהן יש צורך בהקלטות ECoG, הגישה הקדמית הזוויתית מאפשרת יותר משטח גולגולת זמין להשתלת אוזניות ECoG, מכיוון שחלון הקרניוטומיה להחדרת בדיקה ממוקם קדמית יותר10,11.

זיהוי קבוצות התאים והמעגלים הספציפיים האחראים לשינויים בשנת REM הנגרמים על ידי הרדמה נותר מטרה עיקרית של מחקר הרדמה. לפיכך, המטרה כאן הייתה לגשת באופן משוחזר ואמין ל-vlPAG - אזור בגזע המוח הקשור לשנת REM - כדי להשיג רישומים חד-יחידתיים, מרובי אלקטרודות בעכברים קבועי ראש לפני ובמהלך הרדמה סבופלורנית12,13. מחקרים קודמים השתמשו במדידות אלקטרופיזיולוגיות של פוטנציאל שדה מקומי (LFP) של vlPAG בעכברים ערים כדי לזהות שינויים במצב העצבי הקשורים להרדמה14,15. עם זאת, מדידות LFP רגישות בעיקר לפעילות סינפטית, ולא לפוטנציאלי פעולה, בתוך האזור המתועד16. כתוצאה מכך, נותרה הבנה מוגבלת של האופן שבו חומרי הרדמה משפיעים ישירות על דפוסי הפעילות העצבית המיוצרים על-ידי נוירוני vlPAG. כאן, מתוארת שיטה להשגת הקלטות נוירון יחיד בצפיפות גבוהה מגזע המוח של עכברים קבועי ראש. שיטה זו יכולה גם להיות מותאמת לרישום פעילות נוירון יחיד ממבנים שונים אחרים בגזע המוח העמוק והאחורי.

Protocol

כל המחקרים אושרו על ידי הוועדה המוסדית לטיפול ושימוש בבעלי חיים באוניברסיטת וירג'יניה (שרלוטסוויל, וירג'יניה). נעשה שימוש בחמישה עכברי C57BL/6J זכרים בגילאי 3-7 חודשים, במשקל 25-30 גרם. פרטי הריאגנטים והציוד המשמש כאן מפורטים בטבלת החומרים.

1. השתלת לוחית ראש ואוזניות

  1. צרו אוזניות ECoG על-ידי הלחמת חוט נירוסטה מצופה פרפלואורואלקוקסי (PFA) לראש מחבר של 3 פינים (איור 2A).
  2. זהה את קואורדינטות ההכנסה בהתבסס על אטלס סטריאוטקסי של עכבר17. שימוש במשפט פיתגורס כדי לחשב את הזווית והעומק של החדרת הגשושית – במיוחד כאשר יש מעט מידע בספרות – הוא נקודת התחלה סבירה (איור 1)18.
    הערה: בסופו של דבר, הקואורדינטות יותאמו באמצעות ניסוי וטעייה. כדי להתמקד ב-vlPAG השתמשו בקואורדינטות הבאות בעכברים בוגרים: אנטרופוסטריור (AP) -3.6 מ"מ, בינוני (ML) +0.5 מ"מ, דורסו-ונטרלי (DV) -4 מ"מ. הגשושית הוכנסה בזווית של 20° (AP).
  3. יש לגרום להרדמה כללית על ידי הנחת העכבר בתא האינדוקציה (1.5%-3% איזופלורן בחמצן). לאחר הרדמה, מקם את העכבר במסגרת הסטריאוטקסית, הניח את אפו של בעל החיים בחרוט האף וייצב את הראש עם מוטות הראש.
  4. החל משחה אופתלמית על העיניים כדי למנוע נזק הקרנית. השתמש במערכת בקרת טמפרטורה כדי לשמור על טמפרטורת הגוף ב 37 ° C.
  5. יש למרוח קרם להסרת שיער או לגלח פרווה על הקרקפת, ולאחר מכן לחטא עם יוד פובידון ואלכוהול 70%. השתמש בטכניקה אספטית 'טיפים בלבד' כדי לשמור על שדה כירורגי סטרילי.
  6. בצע בדיקת צביטת בוהן כדי לבדוק את עומק ההרדמה.
  7. מתן שיכוך כאבים: קרפרופן 2.5 מ"ג/ק"ג, ניתן תת עורית בגב.
  8. בצע חתך קרקפת 5 מ"מ כדי להסיר כתם עגול של העור מעל עצמות הקודקוד והעורף. הסר בעדינות את קרומי המוח על ידי גירודם עם להב האזמל.
  9. השתמש בלהב האזמל כדי לחתוך חיבורי שרירים ולחשוף את עצמות הקודקוד והעורף19. יש למרוח מי חמצן לפי הצורך כדי לשלוט בדימום ולייבש את פני הגולגולת. חיוני למרוח מלט דנטלי ושרף על גולגולת יבשה כדי להשיג קשר חזק.
  10. ראשית, זהה את ציוני הדרך ברגמה ולמבדה על הגולגולת20. לאחר מכן, התאימו את מיקום חרוט האף כדי ליישר את המיקום הקדמי-אחורי של הגולגולת, וודאו שלא קיים הפרש גובה של יותר מ-100 מיקרומטר בין שני ציוני הדרך.
  11. כדי ליישר את המיקום המדיאלי-לטרלי של הגולגולת, בחר שתי נקודות מנוגדות בין ברגמה ללמדא, כל אחת 1 מ"מ מתפר הקשת ובדוק את רמתן. אם יש הפרש גובה של יותר מ-100 מיקרומטר ביניהם, התאימו את המיקום האמצעי-לטרלי של הגולגולת על ידי מניפולציה של מוטות הראש.
  12. מדדו את המרחק בין ברגמה ללמדא והשוו אותו למרחק שדווח באטלס הסטריאוטקסי של פרנקלין-פקסינוס (בדרך כלל 4.2 מ"מ)17. השתמש בהפרש בין המרחק הנמדד למרחק המדווח כדי לשנות את קנה המידה של נקודת הגישה באופן פרופורציונלי. סמן קואורדינטות קרניוטומיה על הגולגולת עם עיפרון מעוקר.
    הערה: אם המרחק הנמדד bregma-lambda שונה מ 4.2 מ"מ, אז הקואורדינטות צריכות להיות בקנה מידה פרופורציונלי. כל קואורדינטות AP המדווחות באטלס סטריאוטקסי תואמות למרחק ברגמה-למדא סטנדרטי. מכיוון שגודל גולגולת העכבר משתנה, חשוב להתאים את הקואורדינטות בהתאם.
  13. באמצעות מיקרומניפולטור סטריאוטקסי, מקמו את לוחית הראש ישירות על גבי תפר הלמדא, והדקו אותה לגולגולת על-ידי מריחת מלט דנטלי על לוחית הראש ומסביבה (איור 3A,B). יש להמתין לפחות 10 דקות לייבוש המלט.
  14. קדח חורים (בקוטר 0.5 מ"מ) עבור שתי אלקטרודות קליפת המוח (קליפת המוח הקדמית והקודקודית) ועבור אחת שתשמש כאלקטרודת ייחוס (המוח הקטן). הניחו את הקצוות המופשטים (0.5 מ"מ) של אלקטרודות חוטי כסף מצופות בתוך חורי הבור והדקו באמצעות שרף המופעל על ידי אור אולטרה סגול.
  15. כסו לחלוטין את חוטי הנירוסטה המצופים במלט דנטלי כך שאף חוט לא ייחשף. כסו את החלק התחתון והצדדים של האוזנייה במלט דנטלי כך שהוא יהיה יציב במקומו. ודאו שתפרי ברגמה ולמבדה נשארים גלויים ברגע שהאוזנייה מאובטחת במקומה (איור 2B).
  16. תן לעכבר להתאושש במשך מינימום של 7 ימים, לבחון את החיה ואת האתר כירורגי מדי יום עבור כל חריגות. מתן משככי כאבים (קרפרופן 2.5 מ"ג/ק"ג, SC) לפי הצורך.

2. מיקום והקלטה של גשושית סיליקון

  1. הרגילו את העכבר למתקן ההקלטה ולקיבוע הראש (לפחות שעה וחצי בשני ימים נפרדים) (איור 2D).
  2. ביום ההקלטה יש להכניס את העכבר לתא ההרדמה (איזופלורן 1.5%-3% בחמצן).
  3. מקם את העכבר במסגרת סטריאוטקסית, התאם את חרוט האף ואת מוטות הראש כמתואר ב- 1.3. לשמור על הרדמה (איזופלורן 1.5%-3% בחמצן) לאורך כל הניתוח הסטריאוטקסי. בצע בדיקת צביטת בוהן כדי לבדוק את עומק ההרדמה.
  4. החל משחה אופתלמית על העיניים ולשמור על טמפרטורת הגוף נאותה.
  5. זהה ברגמה ולמבדה, וודא שלא קיים הפרש גובה של יותר מ -100 מיקרומטר בין שני ציוני הדרך האנטומיים.
  6. מצא וסמן את הקואורדינטות המחושבות על הגולגולת בעיפרון סטרילי, ולאחר מכן צור מתאר של חלון קרניוטומיה בגודל 2 מ"מ x 2 מ"מ סביב הקואורדינטות.
  7. בצע בדיקת צביטת בוהן כדי לבדוק את עומק ההרדמה.
  8. השתמש במקדחה במהירות גבוהה כדי ליצור חלון קרניוטומיה בגודל 2 מ"מ x 2 מ"מ. יש למרוח 0.5-1 מ"ל של מי מלח רגילים כדי למנוע התייבשות של פני המוח. מוציאים את הדורה בעזרת מחט מזרק ומלקחיים עדינים.
    הערה: שימו לב לכלי דם עיקריים (סינוס סגיטלי עליון, סינוס רוחבי) כדי למנוע דימום יתר (איור 3).
  9. השתמש במקדחה במהירות גבוהה כדי ליצור חור בור נפרד לאלקטרודת הייחוס של גשושית הסיליקון, בדרך כלל ~ 1-2 מ"מ מחלון הגולגולת.
  10. החל 0.2 מ"ל רעילות נמוכה דבק סיליקון על הגולגולת כדי לאטום לחלוטין את craniotomy, באמצעות המוליך המצורף.
  11. תן לעכבר להתאושש במשך כשעה אחת.
  12. הצמידו את ראש העכבר למתקן ההקלטה האלקטרופיזיולוגי באמצעות לוחית הראש והברגים (איור 2D).
  13. צפו את שוק החללית סיליקון בצבע הפלואורסצנטי DiI (1:4 DiI:Ethanol) כך שניתן יהיה לשחזר את מסלול הגשושית לאחר הניסוי.
  14. הרכיבו את הגשושית על המניפולטור וקבעו את הזווית הרצויה. כדי לכוון את vlPAG, הוחלה זווית AP של 15-20°.
  15. הורידו את גשושית ההקלטה לפני השטח של המוח במרכז חלון הגולגולת. ראשית, הכנס ידנית את הגשושית לעומק של ~300 מיקרומטר. לאחר החדרתה לעומק הזה, הורידו את הגשושית באופן אוטומטי (למשל, 200 מיקרומטר/דקה) לעומק הממוקד כדי למזער את הנזק לרקמה21 (איור 2C).
    הערה: בתחילה מומלצת הכנסה ידנית של הבדיקה. החדרת בדיקה ידנית מבטיחה את היכולת לעצור ולמשוך את הגשושית אם היא מתכופפת עם הכנסתה הראשונית. ברגע שהגשושית חודרת במלואה לרקמה, בדרך כלל בטוח להמשיך לרדת בבדיקה במצב אוטומטי.
  16. יש למרוח שמן מינרלי על משטח המוח בתוך חלון הקרניוטומיה כדי למנוע התייבשות.
  17. הניחו לבדיקת ההקלטה להסתפק ב-10 דקות לאחר ההכנסה.
  18. הקלט נתונים מגשושית הסיליקון ומ- ECoG במהירות של 30kHz באמצעות בקר הקלטה Intan.
  19. 1-2 שעות לאחר ההקלטה, השתמש בטכניקת זילוח הלב כדי לתקן את המוח ב 4% paraformaldehyde22.
    הערה: בגלל המלט, ייתכן שיהיה קשה להסיר את החלק הרוסטרלי של הגולגולת. לכן עדיף להוציא את המוח על ידי הסרת החלקים הגביים של הגולגולת.
  20. ערפו את ראשו של העכבר, חתכו את העור בעקבות קו האמצע בצד הגבי, מהצוואר ועד הלסת התחתונה. הסר שרירים ורקמות המחוברים לגולגולת, חתוך את הלסת התחתונה לגישה קלה יותר למוח.
  21. אם הזלוף נעשה כראוי המוח צריך להתכווץ קצת, משאיר מספיק מקום כדי להכניס מספריים עדינים בחלק הגבי של מגנום foramen. בצע חתך מדיאלי אחד, אחד לרוחב ואחד קונטרלטרלי, בגודל של כ -1 מ"מ, בעצם העורפית.
  22. בזהירות להסיר את החלק הגבי של הגולגולת באמצעות מלקחיים אופתלמיים. התחל בעצם העורפית, הסר את כל שברי הגולגולת עד שכל החלק הגבי של המוח נחשף.
  23. החליקו מרית מיקרו מתחת למוח, התחילו בנורות הריח כדי להוציא את המוח החוצה.
  24. לאחר ניקוב והסרה, המוח יכול להיות מאוחסן 4% paraformaldehyde ב 4 ° C במשך 24-48 שעות.

3. היסטולוגיה לשחזור מסלול בדיקה

  1. חלק את המוח למקטעים קורונליים של 70 מיקרומטר באמצעות ויברטום.
  2. הרכבה של המקטעים בשקופיות באמצעות אמצעי הרכבה DAPI שמכתים גרעיני תאים. מכסים ואוטמים את המגלשות בלק שקוף.
  3. דמיינו את השקופיות במיקרוסקופ פלואורסצנטי. כוונן את הניגודיות/בהירות כך שרצועות הבדיקה יהיו גלויות בבירור. ודאו שגודל קובץ תמונת tiff המתקבל קטן מ- 10MB, כך שקודי MATLAB יפעלו בצורה חלקה. שחזר את רצועות הגשושית באמצעות קוד MATLAB23.

4. ניתוח נתונים אלקטרופיזיולוגיים

  1. נתח אותות עצביים מוקלטים מגשושית הסיליקון באמצעות תוכנת זיהוי ומיון אוטומטי (Kilosort)24.
  2. סווג ידנית אשכולות שזוהו עם Phy כיחידות מרובות או בודדות25. לסווג אשכולות כיחידות בודדות כאשר יש להם צורת גל ספייק פיזיולוגית, להראות תקופה עקשנית בקורלוגרמה הצולבת, והתפלגות נורמלית של תצוגת משרעת.
  3. ייבאו נתוני יחידה בודדת ל-MATLAB ונתחו23.

תוצאות

חמישה גברים C57BL/6J הושתלו עם אוזניות ECoG ולוחית ראש (איור 4A). לאחר ההתאוששות, עכברים הורגלו לקיבוע ראש ולמתקן ההקלטה האלקטרופיזיולוגי במהלך שני מפגשים של שעה וחצי בימים נפרדים (איור 4B). לאחר מכן, נוצר חלון קרניוטומיה בגודל 2 מ"מ על 2 מ"מ (

Discussion

גרעיני גזע המוח מתווכים תפקודים בסיסיים כגון נשימה, תודעה ושינה 26,27,28. מיקומו של גזע המוח (עמוק ואחורי) מהווה אתגר בחקר פעילותו העצבית in vivo באמצעות טכניקות סטנדרטיות. כאן מוצגת גישה קדמית זוויתית המאפשרת הקלטה של יח?...

Disclosures

למחברים אין אינטרסים כלכליים מתחרים או ניגודי עניינים אחרים בעקבות עבודה זו.

Acknowledgements

איור 1, איור 3, איור 4, איור 8 ואיור 9 נוצרו עם BioRender.com. ברצוננו להודות לסקוט קיליאנסקי על העזרה עם קוד MATLAB ושיתוף הסקריפטים שלו. אנו מודים לאנה גרייס קרנס על עזרתה בשחזור מסלול הגשושית.

Materials

NameCompanyCatalog NumberComments
1024 channel RHD Recording ControllerIntan Technologies, Los Angeles, California, USAC3008Silicon probe recording; recording hardware and software
24 mm x 50 mm No. 1.5 VWR coverslipVWR, Radnor, Pennsylvania, USA48393-081Histology
4% PFA in PBSThermoFisher Scientific, Waltham, Massachusetts, USAJ61899.AKHistology; perfusion solution
C&B metabondPatterson Dental, Richmond, Virginia, USApowder: 5533559, quick base: 5533492, catalyst: 55335007Headplate &Headset Implantation
C57/6J mice 4-6 weeks, malesThe Jackson Laboratory, Bar Harbor, Maine, USA000664
Capnomac UltimaDatex, Helsinki, Finland ULT-SVi-27-07Gas Analyzer; discontinued; alternative gas analyzer can be purchased from Bionet America 
CM-DiIThermoFisher Scientific, Waltham, Massachusetts, USAV22888Red fluorescent dye for coating of the silicon probe
Connector HeaderDigiKey, Thief River Falls, Minnesota, USA1212-1788-NDECoG Headset
DAPI Fluoromount-GSouthernBiotech, Birmingham, Alabama, USA0100-20Histology
iBOND UniversalPatterson Dental, Richmond, Virginia, USA044-1113Headplate &Headset Implantation; for  securing stainless steel wires to the skull
Low toxicity silicon adhesiveWorld Precision Instruments, Sarasota, Florida, USAKWIK-SILHeadplate
Micro-Manipulator SystemNew Scale Technologies, Victor, New York, USAMulti-Probe Manipulator: XYZ Stage Assembly: 06464-0000, MPM System Kit: 06267-3-0001, MPM-Platform-360, MPM ring for MPM Manual Arms, MPM_Ring-72 DEG: 06262-3-0000Silicon probe recording; inserting the probe into the brain
MicroprobesUCLA, Los Angeles, California, USA256 ANS, 64MDiscontinued; alternative silicon probes can be purchased from Neuropixels
Mineral OilSigma Aldrich, Saint Luis, Missouri, USAM8410-100MLSilicon probe recording; preventing the tissue from drying during the recording
Normal salineThermoFisher Scientific, Waltham, Massachusetts, USAZ1376Headplate &Headset Implantation; preventing the brain from drying during the surgery
PFA-Coated Stainless Steel Wire-Diameter 0.008 in. coated with striped endsA-M systems, Sequim, Washington, USA791400ECoG Headset & reference electrode for ECoG 
Platinum wire 24AWG World Precision Instruments, Sarasota, Florida, USAPTP201Reference electrode for the silicon probe recording 
Shandon Colorfrost Plus microscope slidesThermoFisher Scientific, Waltham, Massachusetts, USA99-910-01Histology
Stainless steel HeadplateStar Rapid, Chinacustom made partHeadplate &Headset Implantation; design available upon request
Stereotaxic apparatusKOPF, Tujunga, California, USAModel 940 Small Animal Stereotaxic Instrument with Digital Display ConsoleHeadplate &Headset Implantation

References

  1. Wu, F., et al. Monolithically integrated µLEDs on silicon neural probes for high-resolution optogenetic studies in behaving animals. Neuron. 88 (6), 1136-1148 (2015).
  2. Hong, G., Lieber, C. M. Novel electrode technologies for neural recordings. Nat Rev Neurosci. 20 (6), 330-345 (2019).
  3. Li, N., Daie, K., Svoboda, K., Druckmann, S. Robust neuronal dynamics in premotor cortex during motor planning. Nature. 532 (7600), 459-464 (2016).
  4. Kipke, D. R., et al. Advanced neurotechnologies for chronic neural interfaces: New horizons and clinical opportunities. J Neurosci. 28 (46), 11830-11838 (2008).
  5. Steinmetz, N. A., Koch, C., Harris, K. D., Carandini, M. Challenges and opportunities for large-scale electrophysiology with Neuropixels probes. Curr Opinion Neurobiol. 50, 92-100 (2018).
  6. Nunez-Elizalde, A. O., et al. Neural correlates of blood flow measured by ultrasound. Neuron. 110 (10), 1631-1640.e4 (2022).
  7. Yang, L., Lee, K., Villagracia, J., Masmanidis, S. C. Open source silicon microprobes for high throughput neural recording. J Neural Eng. 17 (1), 016036 (2020).
  8. Jun, J. J., et al. Fully integrated silicon probes for high-density recording of neural activity. Nature. 551 (7679), 232-236 (2017).
  9. Augustinaite, S., Kuhn, B. Chronic cranial window for imaging cortical activity in head-fixed mice. STAR Protoc. 1 (3), 100194 (2020).
  10. Dias, M., et al. Transection of the superior sagittal sinus enables bilateral access to the rodent midline brain structures. eNeuro. 8 (4), (2021).
  11. Gao, Z. R., et al. Tac1-expressing neurons in the periaqueductal gray facilitate the itch-scratching cycle via descending regulation. Neuron. 101 (1), 45-59.e9 (2019).
  12. Atluri, N., et al. Anatomical substrates of rapid eye movement sleep rebound in a rodent model of post-sevoflurane sleep disruption. Anesthesiology. 140 (4), 729-741 (2023).
  13. Weber, F., Dan, Y. Circuit-based interrogation of sleep control. Nature. 538 (7623), 51-59 (2016).
  14. Frontera, J., et al. Bidirectional control of fear memories by cerebellar neurons projecting to the ventrolateral periaqueductal grey. Nat Commun. 11 (1234567890), (2020).
  15. Weber, F., et al. Regulation of REM and Non-REM sleep by periaqueductal GABAergic neurons. Nat Commun. 9 (1), 354 (2018).
  16. Buzsáki, G., Anastassiou, C. A., Koch, C. The origin of extracellular fields and currents--EEG, ECoG, LFP and spikes. Nat Rev Neurosci. 13 (6), 407-420 (2012).
  17. Franklin, K. B. J., Paxinos, G. . The mouse brain in stereotaxic coordinates. , (2008).
  18. . Pythagorean theorem Available from: https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Pythagorean_theorem&oldid=1222259845 (2024)
  19. . The Anatomy of the Laboratory Mouse Available from: https://www.informatics.jax.org/cookbook/chapters/skeleton.shtml (2024)
  20. Cecyn, M. N., Abrahao, K. P. Where do you measure the Bregma for rodent stereotaxic surgery. IBRO Neurosci Rep. 15, 143-148 (2023).
  21. Fiáth, R., et al. Slow insertion of silicon probes improves the quality of acute neuronal recordings. Sci Rep. 9, 111 (2019).
  22. Wu, J., et al. Transcardiac perfusion of the mouse for brain tissue dissection and fixation. Bio-protocol. 11 (5), e3988 (2021).
  23. Peters, A. . petersaj/AP_histology. , (2024).
  24. Pachitariu, M., Sridhar, S., Stringer, C. . Solving the spike sorting problem with Kilosort. , (2023).
  25. Akam, T., Walton, M. E. pyPhotometry: Open source Python based hardware and software for fiber photometry data acquisition. Sci Rep. 9 (1), 3521 (2019).
  26. Leiras, R., Cregg, J. M., Kiehn, O. Brainstem circuits for locomotion. Ann Rev Neurosci. 45 (2022), 63-85 (2022).
  27. Benarroch, E. E. Brainstem integration of arousal, sleep, cardiovascular, and respiratory control. Neurology. 91 (21), 958-966 (2018).
  28. Guyenet, P. G., Bayliss, D. A. Neural control of breathing and CO2 homeostasis. Neuron. 87 (5), 946-961 (2015).
  29. Potter, K. A., Buck, A. C., Self, W. K., Capadona, J. R. Stab injury and device implantation within the brain results in inversely multiphasic neuroinflammatory and neurodegenerative responses. J Neural Eng. 9 (4), 046020 (2012).

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Explore More Articles

vlPAGREM

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved