פרוטוקול זה מדגים בנייה של וקטור ביטוי גנים ארוך ומורכב. כאשר לא ניתן להשיג מקטע DNA באורך מלא על ידי PCR יחיד מ- cDNA, או שלא ניתן להשיג את וקטור ביטוי הגנים באורך מלא על ידי רקומבינציה הומולוגית מרובת כניסות במבחנה, שיטה זו ישימה. כיום, שיבוט קשירה מרובת כניסות משמש להשגת מקטע DNA באורך מלא לשיבוט לווקטור מתאים.
שיטה זו יכולה להשיג מחיקה או מוטציה של גני מטרה ולצרף ביעילות מספר רב של מקטעי DNA לווקטור הביטוי.