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Method Article
Vengono descritti metodi per la generazione di grandi quantità di adenovirus ricombinanti, che possono quindi essere utilizzati per trasdurre l'urotelio nativo dei roditori consentendo l'espressione di transgeni o la downregulation di prodotti genici endogeni.
Oltre a formare una barriera ad alta resistenza, si ipotizza che l'urotelio che riveste la pelvi renale, gli ureteri, la vescica e l'uretra prossimale percepisca e trasmetta informazioni sul suo ambiente ai tessuti sottostanti, promuovendo la funzione e il comportamento minzionale. La rottura della barriera uroteliale, o della sua funzione sensoriale / trasduttore, può portare a malattie. Lo studio di questi eventi complessi è ostacolato dalla mancanza di strategie semplici per alterare l'espressione genica e proteica nell'urotelio. Qui sono descritti metodi che consentono ai ricercatori di generare grandi quantità di adenovirus ad alto titolo, che può quindi essere utilizzato per trasdurre l'urotelio dei roditori con alta efficienza e in modo relativamente semplice. Sia i cDNA che i piccoli RNA interferenti possono essere espressi utilizzando la trasduzione adenovirale e l'impatto dell'espressione del transgene sulla funzione uroteliale può essere valutato da 12 ore a diversi giorni dopo. Questi metodi hanno un'ampia applicabilità agli studi di biologia uroteliale normale e anormale utilizzando modelli animali murini o ratti.
L'urotelio è l'epitelio specializzato che riveste la pelvi renale, gli ureteri, la vescica e l'uretra prossimale1. Comprende tre strati: uno strato di cellule ombrello altamente differenziate e polarizzate spesso bi-nucleate, le cui superfici apicali sono immerse nelle urine; uno strato cellulare intermedio con una popolazione di cellule binucleate che amplificano il transito che possono dare origine a cellule ombrello superficiali in risposta alla loro perdita acuta; e un singolo strato di cellule basali, un sottoinsieme delle quali funziona come cellule staminali in grado di rigenerare l'intero urotelio in risposta a lesioni croniche. Le cellule ombrello sono principalmente responsabili della formazione della barriera uroteliale ad alta resistenza, i cui componenti includono una membrana apicale (ricca di colesterolo e cerebrosidi) con bassa permeabilità all'acqua e ai soluti e un complesso giunzionale apicale ad alta resistenza (composto da giunzioni strette, giunzioni aderenti, desmosomi e un anello di actomiosina associato)1 . Sia la superficie apicale della cellula ombrello che il suo anello giunzionale si espandono durante il riempimento della vescica e ritornano rapidamente al loro stato pre-riempito dopo aver annullato 1,2,3,4,5. Oltre al suo ruolo nella funzione di barriera, si ipotizza che l'urotelio abbia anche funzioni sensoriali e trasduttrici che gli consentono di percepire i cambiamenti nell'ambiente extracellulare (ad esempio, allungare) e trasmettere queste informazioni attraverso il rilascio di mediatori (tra cui ATP, adenosina e acetilcolina) ai tessuti sottostanti, compresi i processi nervosi afferenti suburoteliali 6,7,8 . Recenti prove di questo ruolo si trovano in topi privi di espressione uroteliale sia di Piezo1 che di Piezo2, che si traduce in un'alterata funzione minzionale9. Inoltre, i ratti che sovraesprimono la proteina CLDN2 che forma i pori stretti nello strato cellulare dell'ombrello sviluppano infiammazione e dolore analoghi a quelli osservati nei pazienti con cistite interstiziale10. Si ipotizza che l'interruzione della funzione sensoriale/trasduttore uroteliale o della barriera possa contribuire a diversi disturbi della vescica 6,11.
Una migliore comprensione della biologia dell'urotelio negli stati normali e patologici dipende dalla disponibilità di strumenti che consentiranno ai ricercatori di sottoregolare prontamente l'espressione genica endogena o consentire l'espressione di transgeni nel tessuto nativo. Mentre un approccio per sottoregolare l'espressione genica è quello di generare topi knockout uroteliali condizionali, questo approccio dipende dalla disponibilità di topi con alleli floxati, è laborioso e può richiedere mesi o anni per completarne12. Non sorprende quindi che i ricercatori abbiano sviluppato tecniche per trasfettare o trasdurre l'urotelio, che possono portare a risultati su una scala temporale più breve. I metodi pubblicati per la trasfezione includono l'uso di lipidi cationici13, oligodeossinucleotidi fosforotioati antisenso14 o acidi nucleici antisenso legati alla proteina TAT dell'HIV che penetra il peptide 11-mer15. Tuttavia, il focus di questo protocollo è sull'uso della trasduzione adenovirale-mediata, una metodologia ben studiata che è efficiente nella consegna genica a una vasta gamma di cellule, è stata testata in numerosi studi clinici e più recentemente è stata utilizzata per fornire il cDNA che codifica la proteina del capside COVID-19 ai destinatari di una variante del vaccino COVID-1916, 17. Per una descrizione più approfondita del ciclo di vita dell'adenovirus, dei vettori adenovirali e delle applicazioni cliniche degli adenovirus, il lettore è indirizzato al riferimento17.
Un'importante pietra miliare nell'uso di adenovirus per trasdurre l'urotelio, è stato un rapporto di Ramesh et al. che ha mostrato brevi pretrattamenti con detergenti, tra cui N-dodecil-β-D-maltoside (DDM) drammaticamente aumentato la trasduzione dell'urotelio da parte di un adenovirus che codifica β-galattosidasi18. Utilizzando questo studio proof-of-principle come guida, la trasduzione adenovirale-mediata dell'urotelio è stata ora utilizzata per esprimere una varietà di proteine, tra cui GTPasi della famiglia Rab, fattori di scambio guanina-nucleotide, frammenti motori di miosina, claudine associate alla giunzione stretta che formano pori e ADAM17 10,19,20,21,22 . Lo stesso approccio è stato adattato per esprimere piccoli RNA interferenti (siRNA), i cui effetti sono stati salvati da varianti co-esprimenti resistenti ai siRNA del transgene22. Il protocollo qui descritto include metodi generali per generare grandi quantità di adenovirus altamente concentrato, un requisito per queste tecniche, nonché adattamenti dei metodi di Ramesh et al.18 per esprimere transgeni nell'urotelio con alta efficienza.
Gli esperimenti che coinvolgono la generazione di adenovirus, che richiede la certificazione BSL2, sono stati eseguiti sotto l'approvazione degli uffici di salute e sicurezza ambientale dell'Università di Pittsburgh e del Comitato istituzionale per la biosicurezza. Tutti gli esperimenti sugli animali eseguiti, compresa la trasduzione adenovirale (che richiede la certificazione ABSL2), sono stati condotti in conformità con le linee guida / regolamenti pertinenti della politica del servizio sanitario pubblico sulla cura umana e l'uso degli animali da laboratorio e della legge sul benessere degli animali e sotto l'approvazione del Comitato istituzionale per la cura e l'uso degli animali dell'Università di Pittsburgh. Guanti, protezione per gli occhi e abbigliamento appropriato sono indossati per tutte le procedure che coinvolgono virus ricombinanti. Tutti i rifiuti liquidi o solidi devono essere smaltiti come descritto di seguito. La lettiera degli animali dopo la trasduzione e le carcasse di animali risultanti devono essere trattate come materiali biopericolosi e smaltite secondo le politiche istituzionali.
1. Preparazione di stock di adenovirus ad alto titolo
NOTA: L'efficace trasduzione delle vesciche dei roditori dipende dall'uso di scorte virali purificate e concentrate, tipicamente da 1 x 107 a 1 x 108 particelle virali infettive (IVP) per μL. Questa parte del protocollo è focalizzata sulla generazione di stock di adenovirus ad alto titolo da preparazioni di virus esistenti. Tutti i passaggi devono essere eseguiti in una cappa di coltura cellulare utilizzando reagenti e strumenti sterili. Mentre i ceppi disponibili di adenovirus utilizzati oggi sono difettosi di replicazione, la maggior parte delle istituzioni richiede l'approvazione per utilizzare adenovirus e DNA ricombinante. Ciò include spesso la designazione di una sala di coltura cellulare come struttura approvata BSL2 per produrre e amplificare adenovirus. Alcune considerazioni generali includono l'uso di maschere, protezione per gli occhi, guanti e abbigliamento appropriato in tutte le fasi della produzione e della purificazione del virus. Quando si esegue la centrifugazione, si raccomandano tappi di sicurezza se i tubi della centrifuga non hanno tappi aderenti. Tutti i materiali non usa e getta, compresi i tappi di sicurezza delle centrifughe potenzialmente contaminati, le bottiglie e i rotori vengono trattati con una soluzione antivirale (vedere la tabella dei materiali) e quindi risciacquati con acqua o etanolo al 70%. I rifiuti liquidi vengono trattati aggiungendo candeggina ad una concentrazione finale del 10% (v/v). Lo smaltimento di questi rifiuti liquidi dipenderà dalle politiche istituzionali. I rifiuti solidi vengono generalmente smaltiti in rifiuti biopericolosi.
2. Trasduzione della vescica dei roditori
NOTA: Se non si ha familiarità con questa tecnica, si raccomanda di limitare a 2-4 il numero di animali trasdotti contemporaneamente. Ciò può essere ottenuto scaglionando gli orari di inizio per ciascun animale, in particolare durante il trattamento detergente nella fase 2.2, e quindi l'incubazione del virus nella fase 2.3. I ricercatori esperti possono trasdurre fino a sei animali alla volta.
Preparazione del virus
Un esempio di purificazione del virus mediante centrifugazione a gradiente di densità è mostrato nella Figura 1A. La banda rosa chiaro, che si trova all'interfaccia tra il materiale cellulare caricato e lo strato di CsCl da 1,25 g/ml, è composta principalmente da cellule disgregate e dai loro detriti (vedi freccia magenta in Figura 1A). Deriva il suo colore rosato dalla piccola quantità di terreno di coltura che vie...
Mentre Ramesh et al. si sono concentrati sullo sviluppo di strategie per utilizzare la trasduzione adenovirale nel trattamento del cancro della vescica 18, rapporti più recenti hanno dimostrato l'utilità di queste tecniche nello studio della normale biologia uroteliale / fisiologia e fisiopatologia 10,18,19,20,21 . Le caratteristiche ...
Gli autori non hanno nulla da rivelare.
Questo lavoro è stato supportato da un progetto pilota attraverso P30DK079307 (a M.G.D.), NIH grant R01DK119183 (a G.A. e MDC), NIH grant R01DK129473 (a G.A.), un premio per lo sviluppo della carriera dell'American Urology Association e una sovvenzione della Winters Foundation (a NM), dal Cell Physiology and Model Organisms Kidney Imaging Cores del Pittsburgh Center for Kidney Research (P30DK079307), e da S10OD028596 (a G.A.), che ha finanziato l'acquisto del sistema confocale utilizzato per catturare alcune delle immagini presentate in questo manoscritto.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
10 mL pipette | Corning Costar (Millipore Sigma) | CLS4488 | sterile, serological pipette, individually wrapped |
12 mL ultracentrifuge tube | ThermoFisher | 06-752 | PET thinwall ultracentrifuge tube |
15 mL conical centrifuge tube | Falcon (Corning) | 352097 | sterile |
18 G needle | BD | 305196 | 18 G x 1.5 in needle |
20 mL pipette | Corning Costar (Millipore Sigma) | CLS4489 | sterile, serological pipette, individually wrapped |
50 mL conical centrifuge tube | Falcon (Corning) | 352098 | sterile |
5 mL pipette | Corning Costar (Millipore Sigma) | CLS4487 | sterile, serological pipette, individually wrapped |
Cavicide | Henry Schein | 6400012 | Anti-viral solution |
Cell culture dish - 15 cm | Falcon (Corning) | 353025 | sterile, tissue-culture treated (150 mm x 25 mm dish) |
Cell scraper | Sarstedt | 893.1832 | handle length 24 cm, blade length 1.7 cm |
CsCl | Millipore Sigma | C-4306 | Molecular Biology grade ≥ 98% |
DMEM culture medium (high glucose) | Gibco (ThermoFisher) | 11965092 | with 4.5 g/L glucose + L-glutamine + phenol red |
EDTA | Millipore Sigma | EDS | Bioiultra grade ≥ 99% |
Fetal bovine serum | Hyclone (Cytiva) | SH30070.03 | defined serum |
Glass pipette | Fisher Scientific | 13-678-20A | 5.75 in glass pipette, autoclaved |
Glycerol | Millipore Sigma | G-5516 | Molecular Biology grade ≥ 99% |
HEK293 cells | ATCC | CRL-3216 | HEK293T cells are a variant of HEK293 cells that express the SV40 large T-antigen |
Isoflurane | Covetrus | 29405 | |
IV catheter - mouse | Smith Medical Jelco | 3063 | 24 G x 3/4 in Safety IV catheter radiopaque |
IV catheter - rat | Smith Medical Jelco | 3060 | 22 G x 1 in Safety IV catheter radiopaque |
KCl | Millipore Sigma | P-9541 | Molecular Biology grade ≥ 99% |
KH2PO4 | Millipore Sigma | P5655 | Cell culture grade ≥ 99% |
Na2HPO4•7 H2O | Millipore Sigma | 431478 | ≥ 99.99% |
NaCl | Millipore Sigma | S3014 | Molecular Biology grade ≥ 99% |
N-dodecyl-β-D-maltoside | Millipore Sigma | D4641 | ≥ 98% |
Nose cone for multiple animals | custom designed | commercial options include one from Parkland Scientific (RES3200) | |
PD-10 column | GE Healthcare | 17-085-01 | Prepacked columns filled ith Sephadex G-25M |
Penicillin/streptomycin antibiotic (100x) | Gibco (ThermoFisher) | 15070063 | 100x concentrated solution |
Spectrophotometer | Eppendorf | BioPhotometer | |
Stand and clamp | Fisher Scientific | 14-679Q and 05-769-8FQ | available from numerous suppliers |
Sterile filter unit | Fisher Scientific (Nalgene) | 09-740-65B | 0.2 µm rapid-flow filter unit (150 mL) |
Sterile filter unit 0.2 µm (syringe) | Fisher Scientific | SLGV004SL | Millipore Sigma Milex 0.22 µm filter unit that attaches to syringe |
Super speed centrifuge | Eppendorf | 5810R | with Eppendorf F34-6-38 fixed angle rotor (12,000 rpm) |
Syringe (1 mL) | BD | 309628 | 1-mL syringe Luer-lok tip - sterile |
Syringe (3 mL) | BD | 309656 | 3-mL syringe slip tip - sterile |
Table-top centrifuge (low speed) | Eppendorf | 5702 | with swinging bucket rotor |
Transfer pipettes | Fisher Scientific | 13-711-9AM | polyethylene 3.4 mL transfer pipette |
Tris-base | Millipore Sigma | 648310-M | Molecular Biology grade |
TrypLE select protease solution | Gibco (ThermoFisher) | 12604013 | TrypLE express enzyme (1x), no phenol red |
Ultracentrifuge | Beckman Coulter | Optima L-80 XP | with Beckman SW41 rotor (41,000 rpm) |
Vaporizer | General Anesthetic Services, Inc. | Tec 3 | Isoflurane vaporizer |
Vortex Mixer | VWR | 10153-838 | analog vortex mixer |
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