Metabolomica mirata su cellule primarie rare

L'obiettivo principale del mio laboratorio è quello di mantenere un sano pull up delle cellule staminali ematopoietiche durante l'invecchiamento per evitare neoplasie ematologiche, e lo facciamo eseguendo interventi dietetici. Quindi, in particolare, siamo interessati a capire come i metaboliti derivati dalla dieta regolano la staminalità e anche i metaboliti intracellulari come regolano il destino delle cellule staminali. Le cellule staminali ematopoietiche sono una popolazione molto rara, il che significa che affrontiamo sempre la sfida di non avere abbastanza materiale per eseguire i nostri esperimenti.

Ma ora, con l'istituzione di metodi a singola cellula, e anche con metodi a basso input, abbiamo raggiunto una nuova conoscenza su come queste cellule staminali sono regolate. Le cellule staminali ematopoietiche sono una popolazione molto rara e, soprattutto, sono molto piccole. Ora, con i metodi che abbiamo sviluppato, ad esempio la metabolomica a basso input basata sulla spettrometria di massa, ora possiamo rilevare con un numero molto basso di cellule, centinaia di metaboliti, questo ci ha permesso di capire qual è il ruolo di alcuni metaboliti per la regolazione delle cellule staminali.

In passato, l'analisi metabolomica di cellule primarie rare richiedeva molti topi e giorni di lavoro e preparazione del campione. Con il nostro nuovo protocollo, abbiamo bisogno di meno topi e meno tempo. Inoltre, abbiamo ridotto il numero di passaggi manuali, in modo che l'intero protocollo diventi più robusto.

Per il futuro, abbiamo pianificato di adattare il nostro protocollo a basso input per consentire ulteriori analisi e cellule primarie rare. Ad esempio, metabolomica e lipidomica non mirate.