Isolamento intestinale da larve di pesce zebra per il sequenziamento dell'RNA a singola cellula

La nostra ricerca mira a indagare i cambiamenti trascrittomici che si verificano durante lo sviluppo e la disfunzione gastrointestinale nelle larve di zebrafish. Qui, forniamo un nuovo protocollo che consente l'isolamento di diversi tipi di cellule all'interno dell'intestino del pesce zebra, che ha potenziali applicazioni nella comprensione della salute e delle malattie gastrointestinali. Negli ultimi anni, c'è stato un crescente interesse nell'esplorare l'interazione tra il sistema nervoso enterico e altri tipi di cellule intestinali durante lo sviluppo e la malattia.

La comprensione di queste dinamiche complesse utilizzando tecniche avanzate come il sequenziamento dell'RNA a singola cellula ha il potenziale per rivelare informazioni critiche sulle neuromiopatie enteriche, portando a diagnosi e trattamenti più precisi. Utilizzando questo protocollo, abbiamo identificato con successo vari tipi di cellule intestinali, tra cui epiteliali, stromali, del sangue, dei muscoli, delle cellule immunitarie e persino dei neuroni enterici e della glia, che non sono mai stati catturati prima a questa quantità utilizzando approcci simili. Pertanto, forniamo una tecnica affidabile per studiare la composizione gastrointestinale durante lo sviluppo e la disfunzione.