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Method Article
寄生性線虫 Strongyloides stercoralis および Strongyloides ratti のための機能的ゲノムツールキットには、トランスジェネシス、CRISPR/Cas9媒介突然変異誘発、およびRNAiが含まれる。このプロトコルは、生殖腺内マイクロインジェクションを使用して、導入遺伝子およびCRISPR成分を S. stercoralis および S. rattiに導入する方法を実証する。
ストロンギロイデス属は、ストロンギロイデス・ステロイドおよびストロンギロイデス・ラティを含む、異なる宿主範囲を有する皮膚貫通線虫の複数種からなる。S. stercoralisは、約6億1000万人に感染するヒト寄生性の皮膚透過性線虫であり、ラット寄生虫S. rattiはS. stercoralisと密接に関連しており、S. stercoralisの実験室モデルとしてしばしば使用されている。 S. stercoralisとS. rattiの両方は、生殖腺内マイクロインジェクションの外因性核酸送達技術によるトランスジェニックおよびノックアウトの生成に容易に順応性であり、したがって、この技術にまだ順応していない他の寄生性蠕虫のモデルシステムとして浮上している。
寄生性 ストロンギロイデス 成虫は宿主の小腸に生息し、糞便を介して子孫を環境に放出する。環境に入ると、幼虫は糞便に住み、新しい宿主を見つけて侵入しなければならない子孫を産む自由生活の成虫に発達する。この環境生成は ストロンギロイデス 種に特有のものであり、モデルの自由生活線虫 Caenorhabditis elegansに形態が十分に類似しており、 C. elegans のために開発された技術は、性腺内マイクロインジェクションを含むこれらの寄生性線虫での使用に適合させることができる。生殖腺内マイクロインジェクションを用いて、多種多様な導入遺伝子を ストロンギロイデスに導入することができる。CRISPR/Cas9成分をマイクロインジェクションして、変異型 ストロンギロイデス 幼虫を作成することもできる。ここでは、自由生存成人の調製、注射手順、およびトランスジェニック子孫の選択を含む、 ストロンギロイデス への性腺内マイクロインジェクションの技術について説明する。CRISPR/Cas9突然変異誘発を用いて作製されたトランスジェニックスト ロンギロイデス 幼虫の画像が含まれる。この論文の目的は、他の研究者がマイクロインジェクションを使用してトランスジェニックおよび変異型の ストロンギロイデスを作成できるようにすることです。
ストロンギロイデス・ステコラリスは、より広く認識されている鉤虫や回虫のアスカリス・ルンブリコイデス1と比較して、重要なヒト病原体として長い間見過ごされてきた。ワームの負担に関する以前の研究では、S.スターコラリス2の一般的な診断方法の感度が低いため、S.スターコラリスの有病率をしばしばひどく過小評価していました。近年、改良された診断ツールに基づく疫学的研究は、S.ステルコラリス感染症の真の有病率は、以前に報告されたよりもはるかに高く、世界中で約6億1000万人と推定されている2。
S. stercoralisと他のストロンギロイデス種(近縁のラット寄生虫および共通ラボモデルS. rattiを含む)は、寄生世代と自由生活(環境)世代の両方からなるため、実験的ゲノム研究に有利な異常なライフサイクルを持っています3(図1)。具体的には、S. stercoralisとS. rattiの両方が単一の自由生活世代を循環させることができます。自由生活世代は、自由生活の成人男性と女性に発達する寄生後の幼虫からなる。自由生活の成虫のすべての子孫は感染性の幼虫に発達し、ライフサイクルを継続するために宿主に感染しなければならない。さらに、この環境世代または自由生活世代は、実験室で実験的に操作することができる。自由生活のストロンギロイデス成虫とC.エレガンス成虫は類似の形態を共有しているため、もともとC.エレガンスのために開発された性腺内マイクロインジェクションなどの技術は、自由生活の成体ストロンギロイデス4,5での使用に適合させることができる。DNAは一般に自由生活の成人女性に導入されるが、ストロンギロイデスの男性と女性の両方にマイクロインジェクションすることができる6。したがって、機能的ゲノムツールは、ストロンギロイデスの生物学の多くの側面を調査するために利用可能である。他の寄生性線虫は自由生活世代を欠いており、その結果、機能的ゲノム技術に容易に順応していない3。
図1:ストロンギロイデス・ステロイドのライフサイクル S.ステルコラリス寄生雌は、哺乳類宿主(ヒト、非ヒト霊長類、イヌ)の小腸に生息する。寄生雌は単為生殖によって繁殖し、小腸内で卵を産む。卵は宿主の内部に留まっている間に孵化し、寄生後幼虫に孵化し、糞便とともに環境に渡される。寄生後の幼虫が雄である場合、それらは自由生活の成人男性に発達する。寄生後幼虫が雌である場合、それらは自由生活の成体雌(間接発達)または第3段階の感染性幼虫(iL3s;直接発達)のいずれかに発達することができる。自由生活の男性と女性は、iL3になるように制約されている子孫を作り出すために性的に繁殖します。特定の条件下では、S. stercoralisはまた、寄生後幼虫の一部が糞便中の環境に入るのではなく宿主腸内に留まる自己感染を受ける可能性がある。これらの幼虫は、宿主内で自己感染性幼虫(L3a)に発達し、腸壁を貫通し、体内を移動し、最終的に腸に戻って生殖成虫になることができる。S. rattiの生活環は、S. rattiがラットに感染し、自己感染サイクルを持たないことを除いて、類似している。環境生成は、遺伝学的研究にストロンギロイデス種を使用するための鍵です。自由生活の成人女性(P0)にはマイクロインジェクションすることができます。それらの子孫は、すべてiL3sになり、潜在的なF1遺伝子導入薬である。この図はカステルレットらから修正されたものである。3. この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
S. stercoralisは 、宿主の侵入や宿主の免疫調節を含む他の胃腸ヒト寄生性線虫と生物学の多くの側面を共有しています。例えば、 Necator 属および Ancylostoma 属のヒト寄生性鉤虫も皮膚浸透によって感染し、同様に体内をナビゲートし、そして最終的には小腸に寄生成体として存在する7。したがって、多くの胃腸線虫は、一般的な感覚行動および免疫回避技術を使用する可能性が高い。その結果、 ストロンギロイデス から集められた知識は、他の遺伝的に扱いにくい線虫の発見を補完し、これらの複雑で重要な寄生虫のより完全な理解につながるでしょう。
このマイクロインジェクションプロトコルは、トランスジェニックおよび突然変異体の子孫を作るために 、ストロンギロイデス の自由生活の成人女性にDNAを導入する方法を概説しています。マイクロインジェクションのための成虫の発生時期およびトランスジェニック子孫の収集を含む、株維持要件が記載されている。プロトコルと完全なマイクロインジェクション技術のデモンストレーション、トランスジェニック子孫の培養とスクリーニングのためのプロトコルが、必要なすべての機器と消耗品のリストとともに含まれています。
注:スナネズミはS. ステルコラリスの継代に使用され、ラットは S.ラッティの継代に使用された。すべての手順は、AAALAC規格および実験動物のケアと使用のためのガイドに準拠しているUCLA動物研究監督局(議定書番号2011-060-21A)によって承認されました。以下のタスクは、マイクロインジェクションの少なくとも1日前に完了しなければならない:ワームの培養、マイクロインジェクションパッドの調製、マイクロインジェクションミックス用の構築物の作成、および細菌(大腸菌 HB101)を6cm線虫増殖培地(NGM)プレート上に広げる8。自由生活の女性は、マイクロインジェクションを受ける前に若年成人に発達するために、25°Cで最低24時間の糞便収集を必要とします。マイクロインジェクションパッドは完全に乾燥している必要があります。バクテリアプレートは乾燥して小さな芝生を確立しなければなりません。
1.マイクロインジェクションスライドの調製:注射の少なくとも1日前
注:ワームは、注射用の乾燥寒天パッドを備えたマイクロインジェクションカバースリップに取り付けられています。
2.マイクロインジェクション用のワームを得るための ストロンギロイデス の培養:注射の1〜2日前
注:株維持プロトコルは、スナネズミやラットに線虫を感染させ、感染した動物の糞便から線虫を収穫する方法の詳細な説明を含む 補足資料に記載されています。
3.マイクロインジェクションミックスを作る:注射の前または当日
注:マイクロインジェクションミックスは、ワーム緩衝生理食塩水(BU)中で所望の濃度に希釈された目的のプラスミド(50mM Na2HPO4、22mMKH2PO4、70mM NaCl)11からなる。
マイクロインジェクションミックス:レポーターコンストラクト | |||
コンポーネント | 在庫濃度 | 量 | 最終濃度 |
pMLC30 GPA-3::gfp | 300 ng/μL | 1.7 μL | 50 ng/μL |
ティッカー | ナ | 8.3 μL | ナ |
トータル | 10 μL | 50 ng/μL | |
マイクロインジェクションミックス:CRISPR/Cas9突然変異誘発 | |||
コンポーネント | 在庫濃度 | 量 | 最終濃度 |
pMLC47 tax-4 sgRNA | 300 ng/μL | 2.7 μL | 80 ng/μL |
pEY11 Ss-tax-4 HDRプラスミド | 400 ng/μL | 2.0 μL | 80 ng/μL |
pPV540 strCas9プラス ミド | 350 ng/μL | 1.1 μL | 40 ng/μL |
ティッカー | ナ | 4.2 ミリリットル | ナ |
トータル | 10 μL | 200 ng/μL | |
マイクロインジェクションミックス:ピギーバック統合 | |||
コンポーネント | 在庫濃度 | 量 | 最終濃度 |
pMLC30 gpa3::gfp | 300 ng/μL | 2.0 μL | 60 ng/μL |
pPV402トランスポザーゼプラスミド | 450 ng/μL | 0.9 μL | 40 ng/μL |
ティッカー | ナ | 7.1 μL | ナ |
トータル | 10 μL | 100 ng/μL |
表1:マイクロインジェクションミックスの例3つの例えばマイクロインジェクションのためのプラスミドおよび濃度は、gpa−3::GFPレポーター構築物10のための1つ、Ss−tax−4遺伝子座14,15のCRISPR/Cas9媒介性破壊のための1つ、およびSs−gpa−3::GFP構築物13、17、18のpiggyBac媒介性統合のための1つを混合する。strCas9は、ストロンギロイデスコドン最適化Cas9遺伝子を示す。記載されている最終濃度は、ストロンギロイデスマイクロインジェクションミックスで一般的に使用されます。
4.マイクロインジェクションのためにヤング アダルトストロンギロイデス を集める:注射日の朝
図2:培養物10から寄生虫を採取するために使用したBaermann装置。 糞便 - 木炭プレートの内容物は、温水の柱の上部に配置される。ワームは水に移動し、漏斗の底に集まります。(A)Baermann装置を設置するには、Baermann漏斗用のスタンドをCクランプでベンチにクランプします。漏斗の端に取り付けられたゴムチューブをピンチクランプで閉じ、チューブの下にキャッチバケツを置いて滴り止めます。温水をガラス漏斗に加える。(B)糞便 - 木炭混合物用のプラスチックリングホルダーに、3枚の実験室組織(左)を裏打ちする。木製の棒または舌圧迫器(中央)を使用して、糞便炭プレート(右)の内容物をプラスチックリングホルダーに移します。(C)糞便-木炭ミックス用のプラスチックリングホルダーの底部のクローズアップで、ホルダーの底部にナイロンチュールの二重層を示す。(D)次いで、糞便炭ホルダーをガラス漏斗の上部に置く。(E)実験室組織を水で湿らせ、糞便 - 木炭混合物上で閉じる。より多くの温水が加えられ、主に糞便 - 木炭を沈める。(F) 糞便-木炭培養物を温水に沈めた完全なベアマン・セットアップ。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
5.マイクロ注射針の引っ張りと装填:注射直前
図3:マイクロインジェクション針と、マイクロインジェクションに最適な部位が特定されたストロンギロイデス・ステロイド・アダルト・メス。(A-B)マイクロインジェクション用に正しい形状の針のシャフトテーパ(A)および先端(B)。先端はキューティクルを突き刺すほど鋭く、過度の損傷を引き起こさないほど狭い。(C-D)マイクロインジェクション用形状が間違っているマイクロインジェクション針のシャフトテーパ(C)および先端(D)。先端は鈍くて広く、ワームに過度の損傷を与えます。(E-F)針のシャフトテーパ(E)と先端(F)は、マイクロインジェクションに作用するには長すぎて細い可能性があります。F の先端は D の先端と非常によく似ています。しかし、シャフトはより狭く、柔軟性がありすぎてキューティクルを効果的に突き刺すことができません。また、非常に細い針が詰まりやすい。(G) マイクロインジェクションのために正しく配置されたワーム全体の画像で、針が右から入ってくると仮定して。前部は下向きで左側にあります。外陰部は矢印で示されます。生殖腺は女性の右側に沿って見えます。この女性は子宮内に卵子を1つだけ持っています(アスタリスクで示されます)。(H、I)マイクロインジェクション部位の拡大図。矢印の角度は注射針の角度に近似している。外陰部はランドマークとして使用することができます。それは生殖腺の腕からワームの反対側にあります。生殖腺の腕は腸の周りを湾曲し、分裂核の端は外陰部の反対側にあります。(H) 生殖腺の後腕;(i)前腕。一方または両方の腕を注入することができる。H、Iの場合、規約はGと同様である。スケールバー = 50 μm (B, D, F, H, I);100 μm (A, C, E, G).この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
6. 顕微鏡の準備と針の折れ
注:マイクロインジェクションは、針の動きを制御するためにマイクロインジェクタセットアップを備えた5xおよび40x対物レンズを備えた倒立顕微鏡を使用します。倒立顕微鏡は、振動騒音を低減するために、重いテーブルまたは防振エアテーブルに置く必要があります。マイクロインジェクターニードルホルダーは、マイクロインジェクションミックスを送達するために必要な圧力を加える窒素ガスに接続されています。近くの小さな解剖顕微鏡がワームを移すために使用されます。
7. ストロンギロイデスのマイクロインジェクション
8. 注射されたストロンギロイデスの回収と培養
9. トランスジェニック/ノックアウトを回収するための F1 幼虫の収集とスクリーニング
実験が成功した場合、F1幼虫は目的の導入遺伝子および/または変異表現型を発現する(図4)。しかし、形質転換率は非常に変動し、構築物、ワームの健康状態、注射後の培養条件、および実験者のスキルに依存する。一般に、実験が成功すると、注射された雌あたり>15F1幼虫が得られ、蛍光マーカーの形質転換率は>3%となる。生きている子孫の総数が平均?...
このマイクロインジェクションプロトコルは、トランスジェネシスおよびCRISPR/Cas9媒介突然変異誘発のための構築物を S. stercoralis および S. ratti に導入するための方法を詳述する。S. stercoralis と S. rattiの両方について、注射後の生存率およびトランスジェネシスまたは突然変異誘発の速度は、微調整可能ないくつかの変数の影響を受けます。
ト?...
著者らは利益相反がないと宣言しています。
pPV540とpPV402は、ペンシルベニア大学のジェームズ・ロック博士からの親切な贈り物でした。原稿に関する有益なコメントをくれたAstra Bryantに感謝します。この研究は、バローズ・ウェルカム基金の研究者から、疾患の病因賞、ハワード・ヒューズ医学研究所教員奨学生賞、国立衛生研究所R01 DC017959(E.A.H.)から資金提供を受けました。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
(−)-Nicotine, ≥99% (GC), liquid | Sigma-Aldrich | N3876-5ML | nicotine for paralyzing worms |
3" iron C-clamp, 3" x 2" (capacity x depth) | VWR | 470121-790 | C-clamp to secure setup to bench top |
Agarose LE | Phenix | RBA-500 | agarose for slides |
Bone char, 4 lb pail, 10 x 28 mesh | Ebonex | n/a | charcoal for fecal-charcoal cultures |
Bone char, granules, 10 x 28 mesh | Reade | bonechar10x28 | charcoal for fecal-cultures (alternative to the above) |
Coarse micromanipulator | Narishige | MMN-1 | coarse micromanipulator |
Corning Costar Spin-X centrifuge tube filters | Fisher | 07-200-385 | microfilter column |
Cover glass, 48 x 60 mm, No. 1 thickness | Brain Research Lab | 4860-1 | coverslips (48 x 60 mm) |
Deep Petri dishes, heavy version with 6 vents, 100 mm diameter | VWR | 82050-918 | 10 cm Petri dishes (for fecal-charcoal cultures) |
Eisco retort base w/ rod | Fisher | 12-000-101 | stand for Baermann apparatus |
Eppendorf FemtoJet microinjector microloader tips | VWR | 89009-310 | for filling microinjection needles |
Fisherbrand absorbent underpads | Fisher | 14-206-62 | bench paper (for prepping) |
Fisherbrand Cast-Iron Rings | Fisher | 14-050CQ | Baermann o-ring |
Fisherbrand tri-cornered polypropylene beakers | Fisher | 14-955-111F | Plastic beaker (for mixing) |
Fisherbrand tri-cornered polypropylene beakers | Fisher | 14-955-111F | Plastic beaker (for catch bucket/water bucket) |
Fisherbrand tri-cornered polypropylene beakers | Fisher | 14-955-111F | Plastic beaker (x2) (to make holder) |
Gorilla epoxie in syringe | McMaster-Carr | 7541A51 | glue (to attach tubing) |
Halocarbon oil 700 | Sigma-Aldrich | H8898-50ML | halocarbon oil |
High-temperature silicone rubber tubing for food and beverage, 1/2" ID, 5/8" OD | McMaster-Carr | 3038K24 | tubing (for funnel) |
KIMAX funnels, long stem, 60° Angle, Kimble Chase | VWR | 89001-414 | Baermann funnel |
Kimberly-Clark Professional Kimtech Science benchtop protectors | Fisher | 15-235-101 | bench paper (for prepping) |
Leica stereomicroscope with fluorescence | Leica | M165 FC | GFP stereomicroscope for identifying and sorting transgenic worms |
microINJECTOR brass straight arm needle-holder | Tritech | MINJ-4 | microinjection needle holder |
microINJECTOR system | Tritech | MINJ-1 | microinjection system |
Mongolian Gerbils | Charles River Laboratories | 213-Mongolian Gerbil | gerbils for maintenance of S. stercoralis, male 4-6 weeks |
Nasco Whirl-Pak easy-to-close bags, 18 oz | VWR | 11216-776 | Whirl-Pak sample bags |
Nylon tulle (mesh) | Jo-Ann Fabrics | zprd_14061949a | nylon mesh for Baermann holder |
Platinum wire, 36 Gauge, per inch | Thomas Scientific | 1233S72 | platinum/iridium wire for worm picks |
Puritan tongue depressors, 152 mm (L) x 17.5 mm (W) | VWR | 62505-007 | wood sticks (for mixing samples) |
QIAprep Spin Miniprep Kit (250) | QIAGEN | 27106 | QIAGEN miniprep kit |
Rats-Long Evans | Envigo | 140 HsdBlu:LE Long Evans | rats for maintenance of S. ratti, female 4-6 weeks |
Rats-Sprague Dawley | Envigo | 002 Hsd:Sprague Dawley SD | rats for maintenance of S. ratti, female 4-6 weeks |
Really Useful Boxes translucent storage boxes with lids, 1.6 L capacity, 7-5/8" x 5-5/16" x 4-5/16" | Office Depot | 452369 | plastic boxes for humidified chamber |
Shepherd techboard, 8 x 16.5 inches | Newco | 999589 | techboard |
Stainless steel raised wire floor | Ancare | R20SSRWF | wire cage bottoms |
StalkMarket compostable cutlery spoons, 6", white, pack of 1,000 | Office Depot | 9587303 | spoons |
Stender dish, stacking type, 37 x 25 mm | Carolina (Science) | 741012 | watch glasses (small, round) |
Stereomicroscope | Motic | K-400 LED | dissecting prep scope |
Storage tote, color clear/white, outside height 4-7/8 in, outside length 13-5/8 in, Sterilite | Grainger | 53GN16 | plastic boxes for humidified chamber |
Sutter P-30 micropipette puller | Sutter | P-30/P | needle puller with platinum/iridium filament |
Syracuse watch glasses | Fisher | S34826 | watch glasses (large, round) |
Thermo Scientific Castaloy fixed-angle clamps | Fisher | 05-769-2Q | funnel clamps (2x) |
Three-axis hanging joystick oil hydrolic micromanipulator | Narishige | MM0-4 | fine micromanipulator |
United Mohr pinchcock clamps | Fisher | S99422 | Pinch clamps (2x) |
Vented, sharp-edge Petri dishes (60 mm diameter) | Tritech Research | T3308P | 6 cm Petri dishes (for small-scale fecal-charcoal cultures) |
VWR light-duty tissue wipers | VWR | 82003-820 | lining for Baermann holder |
watch glass, square, 1-5/8 in | Carolina (Science) | 742300 | watch glasses (small, square) |
Whatman qualitative grade plain circles, grade 1, 5.5 cm diameter | Fisher | 09-805B | filter paper (for 6 cm Petri dishes) |
Whatman qualitative grade plain circles, grade 1, 9 cm diameter | Fisher | 09-805D | filter paper (for 10 cm Petri dishes) |
World Precision Instrument borosilicate glass capillary, 1.2 mm x 4 in | Fisher | 50-821-813 | glass capillaries for microinjection needles |
X-Acto Knives, No. 1 Knife With No. 11 Blade | Office Depot | 238816 | X-Acto knives without blades to hold worm picks |
Zeiss AxioObserver A1 | Zeiss | n/a | inverted microscope |
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