この研究は、スペインの経済経済大臣(RTC-2014-2626-1からJE)およびサルドカルロスIII研究所(PI15/01458からJE)からの助成金によってサポートされています。ECは、Atracción de Talento Investigador grant 2017-T2/BMD-5766(Comunidad de Madrid and UAM)の支援を受けています。

すべてのマウス飼育および実験手順は、動物実験に関する地域、国内、国際的な法律およびガイドラインに準拠して実施する必要があります。
1.発毛の誘導、熱傷の誘発、および尾部皮膚上皮全体における長期BrdU LRCの同定
注:以下に説明する実験計画には、10日齢または7週齢のC57BL / 6マウス、できれば同腹仔を使用してください。すべての実験手順において、動物は3%イソフルラン吸入によって麻酔されるか、示されているように頸部脱臼によって安楽死させられます。
<ol><li>第2休止期(生後約50日目)におけるマウスの背部皮膚における発毛の誘導<ol><li>3%イソフルランを吸入してマウスに麻酔をかける。ペダル反射の欠如(しっかりとしたつま先をつまむ)によって完全な深部麻酔を確認します。バリカンと脱毛クリームを使用して、各マウスの背中の皮膚の2つの独立した横並びの領域を剃ります(材料表)。左側をコントロールに、右側を治療に使用します。 注:剃毛後、このマウス系統のメラニン形成と成長期(成長)期への参入の指標である灰色/黒ではなく、鉃毛後の背中の皮膚がピンクがかっていることを確認してください。</li>
		<li>PBSで完全に洗浄して、すべてのクリームの残りを取り除き、セクション2.1で説明されているように、非致死性ROSレベルの一過性のin situ産生の誘導に進みます。.</li>
		<li>各動物の対照および治療された背中の皮膚領域の高解像度画像を毎日取得することにより、毛包の成長を記録します(たとえば、5〜20倍の双眼レンズに結合されたHDカメラを使用)。</li>
	</ol></li>
	<li>第2休止期(休止期)におけるマウスの背部皮膚における2度 熱傷病変の誘導(生後約50日目)<ol><li>マウスに麻酔をかける。バリカンと脱毛クリームを使用して各マウスの背中の皮膚領域全体を剃り、PBSで完全に洗浄して、すべてのクリームの残りを取り除きます。 注:燃焼手順の直前に、滅菌生理食塩水中のリドカイン0.5%(2 mg / ml)の皮下注射を7 mg / mlを超えない状態で投与します。.</li>
		<li>真ちゅう製の棒(断面1 cm)を沸騰水に浸して95°Cに予熱し、各マウスの背側後皮表面の中央領域に5秒間塗布します。</li>
		<li>熱傷発生直後に、脱水症を防ぐために、電気毛布に1 mLの生理溶液(0.9%NaCl)を腹腔内注射します。動物を24時間回復させ、セクション2.3で説明されているように、非致死性ROSレベルの一過性のin situ産生の誘導に進みます。</li>
		<li>各動物の対照および治療された背中の皮膚領域の高解像度画像を毎日取得することにより、火傷の進行を記録します(たとえば、5〜20倍の双眼レンズに結合されたHDカメラを使用)。</li>
	</ol></li>
	<li>尾部皮膚上皮における長期BrdU LRCの生成と同定<ol><li>10/14日齢の同腹仔に腹腔内注射(麻酔なし)1日1回、4日間連続して、50 mg / kg体重のBrdUをPBSに溶解します。.標識段階の後、治療の前にマウスを50〜60日間成長させます。 注意: 注射ごとに新しい針を使用してください。</li>
		<li>組織ホールマウントの調製前のさまざまな時点での尾部皮膚における一過性のin situ非致死性ROS産生の誘導については、セクション2.3で説明されているように進めます。.</li>
		<li>尾表皮のホールマウントを準備するには、頸部脱臼によってマウスを安楽死させ、外科用ハサミで尾を切り取ります。<ol><li>メスを使って尾に沿って縦方向にまっすぐに切開し、背骨から皮膚全体を一枚として剥がします。皮をむいた皮膚を5 mLチューブ中のPBS中の5 mM EDTAで37°Cで4時間インキュベートし、鉗子を使用して無傷の表皮シートを真皮から慎重に分離します。</li>
			<li>組織をPBS中の4%ホルムアルデヒド中で室温(RT)で少なくとも72時間固定し、適切な抗体を使用してBrdU検出に進みます。</li>
			<li>蛍光/共焦点顕微鏡を使用して、組織ホールマウントの調製前の異なる時間における光制御および光線力学処理を含む、各実験条件におけるLRCを同定および定量します(前述の詳細19,20)。 注意: 固定された表皮シートは、0.02%アジ化ナトリウムを含むPBSで4°Cで最大3か月間保存できます。固定表皮シートは、標準的な組織学的切片手順に従って、必要なタンパク質の免疫局在化に使用できます。</li>
		</ol></li>
	</ol></li>
</ol>2. マウス皮膚における非致死性ROSレベルの一過性産生の誘導
注:マウスの皮膚で非致死的なROSレベルの一時的な生成を誘発するために、内因性光増感剤PpIXの前駆体を使用した光線力学的治療、この場合はメチルアミノレブリン酸(mALA)、および赤色光が使用されます。
<ol><li>背中の皮膚の発毛を誘導するための一時的なROS産生をオンにするには、セクション1.1に示すように動物を準備します。<ol><li>右部に~25mgのmALAを局所クリーム(材料表)の形で塗布し、左側を個人差のない内部統制として保ちます。暗所で2.5時間インキュベートし、余分なクリームをPBSで完全に洗い流します。麻酔の深さを確認するには、完全に回復するまで10分ごとに動物を監視します。 注:背中の皮膚でのPpIXの生成は、青色光(407 nm)励起下での赤色蛍光によってその場でテストする必要があります。</li>
		<li>動物に麻酔をかけます。</li>
		<li>背中の皮膚全体に適切な赤色光源(材料表)を照射し、総線量は2.5〜4 J / cm2です。完全に回復するまでマウスを電気毛布の上に置き、手順1.1.3の説明に従って続行します。 注意: 放射照度は、光源と組織の間の距離を操作して調整し、電力エネルギーメーター(材料表)を使用して測定する必要があります。実験は、各動物の独立した剃毛領域のいずれかで完全な発毛が観察されたときに終了したと見なされます。全体の手順はたった1回の写真治療を含みます。</li>
	</ol></li>
	<li>2度の 熱傷病変の治癒改善のために一時的なROS産生をオンにするには、セクション1.2に示すように動物を準備します。<ol><li>~25 mgのmALAを局所クリームの形で、約4 mmの隣接組織を含む火傷した表面に沿って塗布します。暗所で2.5時間インキュベートし、余分なクリームをPBSで完全に洗い流します。麻酔の深さを確認するには、完全に回復するまで10分ごとに動物を監視します。</li>
		<li>動物に麻酔をかけます。</li>
		<li>背中の皮膚全体に適切な赤色光源を照射し、総線量は2.5〜4 J / cm2です。完全に回復するまでマウスを電気毛布の上に置き、手順1.2.4の説明に従って続行します。 注:各動物の実験手順は、完全な火傷の治癒が観察されたときに終了したと見なされます。全体の手順はたった1回の写真治療を含みます。</li>
	</ol></li>
	<li>尾部皮膚における一過性のROS産生をオンにするには、セクション1.3に示すようにマウスを準備し、背部組織領域全体に局所クリームの形で~25 mgのmALAを塗布し、背中の皮膚についてはセクション2.1の説明に従って進めます。動物の安楽死の24時間、48時間、または72時間前に写真処理と対応する光制御を実行し、尾の皮膚全体のマウントをさらに抽出します。 注:すべての実験デザインにおいて、抗酸化性ROSスカベンジャーを使用してプロセスのROS依存性をアッセイします(例:.、mALA治療の5日前からPBS、pH 7.2の20 mg / mL溶液の腹腔内注射による100 mg / kg体重のN-アセチルシステインの毎日の接種、または、代わりに、50%エタノール中の100 mg / mLアスコルビン酸の2回の投与、 30分間間隔をあけて、mALA処置と赤色光照射との間の時間間隔で皮膚に局所適用した)。</li>
</ol>3.皮膚のROS検出
<ol><li>ヒドロエチジンを用いた光線力学処理後の尾部皮膚におけるROS産生のEx-vivo評価 注:ヒドロエチジンは、ROSと特異的に反応して蛍光色素2-ヒドロキシエチジウム(hET)を生成する非蛍光分子です。<ol><li>セクション1.3.3に記載されているように得られた尾の皮全体を、PBS溶液(対照サンプル)またはさらに2 mM mALA(光線力学的処理サンプル)を含む5 mM EDTA中で37°Cで3時間インキュベートします。</li>
		<li>いずれの場合も、ジメチルスルホキシド(DMSO)中の25 mg/mLストックからヒドロエチジンを最終濃度3.2 μMまで添加し、室温で暗所で1時間インキュベートします。</li>
		<li>尾部皮膚サンプルを指先でガラス表面上に伸ばし、10 J/cm2 フルエンスで636 nmの赤色光を照射します。</li>
		<li>すぐに表皮を真皮から分離し、セクション1.3.3で説明されているように表皮シートを固定します。</li>
		<li>緑色の励起光を用いて蛍光/共焦点顕微鏡でhETの赤色発光を評価し、高品質の画像を撮影して、さらなる分析を進めます。 注:hET自動酸化のネガティブコントロールとして、光線力学的治療がない場合の組織サンプルのhET染色を使用してください。</li>
	</ol></li>
	<li>発毛誘導と熱傷治癒と光線力学治療後の背部皮膚におけるROS産生のin vivo検出 注:このステップは、細胞内エステラーゼ酵素による切断後、ROSと特異的に反応して2',7'-ジクロロフルオレセイン(DCF)蛍光色素を与える細胞透過性非蛍光化合物である2',7'-ジクロロジヒドロフルオレセインジアセテート(DHF-DA)を使用して実行されます。<ol><li>発毛の誘導(セクション1.1)または火傷の治癒(セクション1.2)のために準備された動物を使用してください。局所mALAクリーム治療(セクション2.1および2.2を参照)の直前に、すべてのターゲットコントロール/治療された皮膚領域にDHF-DAの50%エタノール中の1 mg / mLの100 μLを局所的に分注し、皮膚に材料を完全に吸収させ、局所mALAクリームの塗布を進めます。</li>
		<li>処理した動物を暗所で4時間インキュベートし、局所mALAクリームをPBSで皮膚から完全に洗い流し、100μLのDHF-DA溶液の2回目の用量を皮膚に分注します。麻酔の深さを確認するには、完全に回復するまで10分ごとに動物を監視します。</li>
		<li>処理した動物を暗所で50分間インキュベートし、麻酔をかけ、LEDランプを使用して636nmの赤色光の2.5〜4 J / cm2 の範囲のフルエンスを背中の皮膚全体に照射します。</li>
		<li>照射直後、in vivoイメージングシステムを用いて皮膚に発生したROSレベルを評価します(材料表)。フィルターボックスを445-490 nm励起と515-575 nm発光に設定し、高品質の画像をキャプチャして、さらなる分析に進みます。 注:DHF-DA自動酸化のネガティブコントロールとして、光線力学的治療がない場合の組織サンプルのDHF-DA染色を使用してください。</li>
	</ol></li>
</ol>

<ol>
	<li>Bl&#225;zquez-Castro, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Direct+1O2+optical+excitation:+A+tool+for+redox+biology.">Direct 1O2 optical excitation: A tool for redox biology.</a> Redox Biology. 13, 39-59 (2017).</li><li>Valko, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Free+radicals+and+antioxidants+in+normal+physiological+functions+and+human+disease.">Free radicals and antioxidants in normal physiological functions and human disease.</a> The International Journal of Biochemistry &amp; Cell Biology. 39 (1), 44-84 (2007).</li><li>Sena, L. A., Chandel, N. 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この作業で説明されている手順のすべての商用アプリケーションは、EC、MIC、およびJEによって作成され、商業的利用のためにDerma Innovate SLにライセンス供与されたCSIC-UAM特許(EP2932967A1)によって保護されています。JEとJJMは、Derma Innovate SLのアドバイザリーポジションを持っています。

ここでは、マウス皮膚における生体内の内因性ROS産生を一過性に活性化させ、生理的効果を発揮する方法論を提示する。この方法論は、内因性光増感剤PpIXの制御された局所刺激を誘導するための光力学的手順に基づいている(図1B)。この実験的アプローチは、in vivo実験システムでROS生物学を研究するための興味深いツールであり、外部ROS源(通常は過酸化水素)を使用し?...

活性酸素種(ROS)は、分子状酸素を化学的に還元して水を形成した結果であり、一重項酸素、スーパーオキシドアニオン、過酸化水素、およびヒドロキシルラジカル1,2,3が含まれます。ROSは、その非常に化学的反応性のために非常に短い寿命を有する。好気性生物では、ミトコンドリアの好気性呼吸(電子伝達系)の主要な漏出性副産物として、ROSが細胞内に偶然形成されます。細胞内の高レベルのROSの一時的な蓄積は、タンパク質、脂質および糖の不可逆的な不活性化およびDNA分子における突然変異の導入を引き起こす可能性のある酸化ストレス状態をもたらす2,3,4,5。細胞、組織、および生物全体における酸化的損傷の漸進的な蓄積は、時間とともに着実に増加し、細胞死プログラムの誘導、いくつかの病状、および老化プロセスに関連しています2,3,4,6。
好気性生物は、細胞や組織における過剰なROS蓄積に対処するための効率的な分子機構を着実に進化させてきました。これらのメカニズムには、分子状酸素と過酸化水素へのスーパーオキシドラジカル変異を触媒するスーパーオキシドジスムターゼ(SOD)タンパク質ファミリーのメンバー、および抗酸化プールを使用するさまざまなカタラーゼとペルオキシダーゼ(グルタチオン、NADPH、ペルオキシレドキシン、チオレドキシン7,8)が含まれますその後の過酸化水素の水および分子状酸素への変換を触媒します。
しかし、いくつかの報告は、増殖、分化、移動性などの重要な細胞機能を調節する分子回路の重要な構成要素としてのROSの役割を支持しています2,3,4。この概念は、リポキシゲナーゼ、シクロオキシゲナーゼ、NADPHオキシダーゼなど、好気性生物における専用のROS産生メカニズムの初期同定と特性評価によってさらに裏付けられています9,10。この意味で、ROSは脊椎動物の胚発生中に積極的な役割を果たし11、12、13、ショウジョウバエの造血前駆細胞の分化プログラム14、ゼブラフィッシュの治癒誘導、アフリカツメガエルの尾の再生など、さまざまな実験系で報告されています15.哺乳類では、ROSはニューロスフェアモデルにおける神経幹細胞の自己複製/分化能16および結腸直腸癌開始時の腸幹細胞機能の調節解除に関与しています17。皮膚では、ROSシグナル伝達は表皮分化と皮膚幹細胞ニッチおよび毛包成長サイクルの調節に関連しています18,19。
この観点から、正常状態または病理学的状態の両方における生物学的システムにおけるROSの生理学的役割を決定するための主要な実験的制限は、細胞および組織におけるこれらの分子の制御された産生を誘導するための適切な実験ツールの欠如であり、それらの生理学的産生に正確に類似しています第二のシグナル伝達メッセンジャーとして。現在、ほとんどの実験的アプローチは、主に過酸化水素の形での外因性ROSの投与を含む。我々は最近、内因性光増感剤プロトポルフィリンIX(PpIX;例えば、アミノラエブリン酸またはそのメチル誘導体メチルアミノレブリン酸)の前駆体を投与し、さらに赤色光を試料に照射して細胞内分子状酸素からのROSのその場形成を誘導することに基づいて、マウス皮膚における内因性ROSの一過性の非致死性in vivo産生をオンにする実験的アプローチを実施した(図1).この光線力学的手順は、常在する幹細胞ニッチを刺激するために効率的に使用され得、したがって、組織の再生プログラムを活性化し19、20、皮膚再生医療における新しい治療モダリティへの道を開く。ここでは、毛包19,21のバルジ領域における長期の5-ブロモ-2'-デオキシウリジン(BrdU)標識保持細胞(LRC)の数の増加、およびその後の一過性によって誘発される再生プログラムの活性化(発毛および火傷治癒プロセスの加速)として測定される幹細胞ニッチの刺激の代表例を示すプロトコルの詳細な説明を提示します。 C57Bl6マウス系統の皮膚における非致死性ROS産生。

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:812px;" width="811">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:432px;">2&#8242;,7&#8242;-Dichlorofluorescin diacetate</td>
			<td style="width:104px;">Sigma Aldrich</td>
			<td style="width:115px;">D6883-50MG</td>
			<td style="width:161px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:432px;">5&#39;-bromo-2&#39;-deoxiuridine</td>
			<td style="width:104px;">Sigma Aldrich</td>
			<td style="width:115px;">B5002-500MG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:432px;">Anti-Bromodeoxyuridine-Fluorescein</td>
			<td style="width:104px;">Roche</td>
			<td>11202693001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Depilatory cream (e.g., Veet)</td>
			<td style="width:104px;">Veet</td>
			<td style="width:115px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:432px;">Dihydroethidium</td>
			<td style="width:104px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>37291-25MG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:432px;">In Vivo imaging system, e.g., IVIS Lumina 2</td>
			<td style="width:104px;">Perkin Elmer</td>
			<td style="width:115px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:432px;">mALA in the form of topical cream, e.g.,METVIX Crema 160 mg/g</td>
			<td style="width:104px;">Galderma</td>
			<td style="width:115px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:432px;">Power energy meter (e.g., ThorLabs Model PM100D)</td>
			<td style="width:104px;">ThorLabs</td>
			<td style="width:115px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:432px;">Red light source, e.g., 636 nm Aktilite LED lamp</td>
			<td style="width:104px;">Photocure ASA</td>
			<td style="width:115px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

stimulation of stem cell niches and tissue regeneration in mouse skin by switchable protoporphyrin ix-dependent photogeneration of reactive oxygen species in situ

ここでは、マウス皮膚において内因性活性酸素種(ROS)の切り替え可能なin vivo光生成を誘導するためのプロトコルについて述べる。この一過性のROSのin situ産生は、幹細胞ニッチにおける細胞増殖を効率的に活性化し、熱傷治癒および毛包成長プロセスの促進を通じて強く現れる組織再生を刺激する。このプロトコルは、内因性光増感剤プロトポルフィリンIXの前駆体で組織を処理し、さらに厳密に制御された物理化学的パラメータの下で組織に赤色光を照射する調節可能な光線力学治療に基づいています。全体として、このプロトコルは、ROS生物学を分析するための興味深い実験ツールを構成します。

マウスの背中と尾の皮膚にmALA前駆体を局所投与すると、青色光(407 nm)励起下でのこの化合物の赤みがかったピンク色の蛍光によって示されるように、組織全体、そして顕著なことに毛包にPpIXが有意に蓄積されます(図2A、C)。その後、2.5−4 J/cm 2のフルエンスで赤色光(636 nm)を治療した組織に照射すると、組織、特に毛包のバルジ領域におけるROSの一?...

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Stimulation of Stem Cell Niches and Tissue Regeneration in Mouse Skin by Switchable Protoporphyrin IX-Dependent Photogeneration of Reactive Oxygen Species In Situ

このプロトコルの目的は、マウスの皮膚で非致死レベルの活性酸素種(ROS)の一時的なin vivo産生を誘導し、組織内の生理学的応答をさらに促進することです。

切り替え可能なプロトポルフィリンIX依存性活性酸素種のin situ光生成によるマウス皮膚における幹細胞ニッチの刺激と組織再生

Here, we describe a protocol to induce switchable in vivo photogeneration of endogenous reactive oxygen species (ROS) in mouse skin. This transient ...

stimulation-stem-cell-niches-tissue-regeneration-mouse-skin

Research

JoVE Journal

Biology

1.9K ビュー.  Ramón y Cajal University Hospital. このプロトコルの目的は、マウスの皮膚で非致死レベルの活性酸素種(ROS)の一時的なin vivo産生を誘導し、組織内の生理学的応答をさらに促進することです。

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Fate Mapping of Human Embryonic Stem Cells by Teratoma Formation

Human embryonic stem cells (hESCs) have an unlimited capacity for self-renewal, and the ability to differentiate into cells derived from all three embryonic germ layers (1). Directed differentiation of hESCs into specific cell types has generated much interest in the field of regenerative medicine (e.g., (2-5)), and methods for determining the in vivo fate of selected or manipulated hESCs are essential to this endeavor. We have adapted a highly efficient teratoma formation assay for this purpose. A small number of specifically selected hESCs is mixed with undifferentiated wild type hESCs and Phaseolus vulgaris lectin to form a cell pellet. This is grafted beneath the kidney capsule in an immunodeficient mouse. As few as 2.5 x 105 hESCs are needed to form a 16 cm3 teratoma within 8-12 weeks. The fate of the originally selected hESCs can then be determined by immunohistochemistry. This method provides a valuable tool for characterizing tissue-specific reagents for cell-based therapy.

Directed differentiation of hESCs into specific cells has generated much interest in regenerative medicine. We provide a concise, step-by-step protocol for determining the in vivo fate of selected hESCs that provides a valuable tool for characterizing tissue-specific reagents for cell-based therapy.

テラトーマ形成により、ヒト胚性幹細胞の運命のマッピング

Human embryonic stem cells (hESCs) have an unlimited capacity for self-renewal, and the ability to differentiate into cells derived from all three ...

生物学

Quantitative Comparison of cis-Regulatory Element (CRE) Activities in Transgenic Drosophila melanogaster

Gene expression patterns are specified by cis-regulatory element (CRE) sequences, which are also called enhancers or cis-regulatory modules. A typical CRE possesses an arrangement of binding sites for several transcription factor proteins that confer a regulatory logic specifying when, where, and at what level the regulated gene(s) is expressed. The full set of CREs within an animal genome encodes the organism&prime;s program for development1, and empirical as well as theoretical studies indicate that mutations in CREs played a prominent role in morphological evolution2-4. Moreover, human genome wide association studies indicate that genetic variation in CREs contribute substantially to phenotypic variation5,6. Thus, understanding regulatory logic and how mutations affect such logic is a central goal of genetics. 
Reporter transgenes provide a powerful method to study the in vivo function of CREs. Here a known or suspected CRE sequence is coupled to heterologous promoter and coding sequences for a reporter gene encoding an easily observable protein product. When a reporter transgene is inserted into a host organism, the CRE&prime;s activity becomes visible in the form of the encoded reporter protein. P-element mediated transgenesis in the fruit fly species Drosophila (D.) melanogaster7 has been used for decades to introduce reporter transgenes into this model organism, though the genomic placement of transgenes is random. Hence, reporter gene activity is strongly influenced by the local chromatin and gene environment, limiting CRE comparisons to being qualitative. In recent years, the phiC31 based integration system was adapted for use in D. melanogaster to insert transgenes into specific genome landing sites8-10. This capability has made the quantitative measurement of gene and, relevant here, CRE activity11-13 feasible. The production of transgenic fruit flies can be outsourced, including phiC31-based integration, eliminating the need to purchase expensive equipment and/or have proficiency at specialized transgene injection protocols. 
Here, we present a general protocol to quantitatively evaluate a CRE&prime;s activity, and show how this approach can be used to measure the effects of an introduced mutation on a CRE&prime;s activity and to compare the activities of orthologous CREs. Although the examples given are for a CRE active during fruit fly metamorphosis, the approach can be applied to other developmental stages, fruit fly species, or model organisms. Ultimately, a more widespread use of this approach to study CREs should advance an understanding of regulatory logic and how logic can vary and evolve.

Quantitative Comparison of cis-Regulatory Element CRE Activities in Transgenic Drosophila melanogaster

Phenotypic variation for traits can result from mutations in cis-regulatory element (CRE) sequences that control gene expression patterns. Methods derived for use in Drosophila melanogaster can quantitatively compare the levels of spatial and temporal patterns of gene expression mediated by modified or naturally occurring CRE variants.

の定量的比較シス</emトランスジェニックで> -調節エレメント（CRE）の活動キイロショウジョウバエ</em

Gene expression patterns are specified by cis-regulatory element (CRE) sequences, which are also called enhancers or cis-regulatory modules. A typical CRE ...

Reprogramming Human Somatic Cells into Induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs) Using Retroviral Vector with GFP

Human embryonic stem cells (hESCs) are pluripotent and an invaluable cellular sources for in vitro disease modeling and regenerative medicine1. It has been previously shown that human somatic cells can be reprogrammed to pluripotency by ectopic expression of four transcription factors (Oct4, Sox2, Klf4 and Myc) and become induced pluripotent stem cells (iPSCs)2-4 . Like hESCs, human iPSCs are pluripotent and a potential source for autologous cells. Here we describe the protocol to reprogram human fibroblast cells with the four reprogramming factors cloned into GFP-containing retroviral backbone4. Using the following protocol, we generate human iPSCs in 3-4 weeks under human ESC culture condition. Human iPSC colonies closely resemble hESCs in morphology and display the loss of GFP fluorescence as a result of retroviral transgene silencing. iPSC colonies isolated mechanically under a fluorescence microscope behave in a similar fashion as hESCs. In these cells, we detect the expression of multiple pluripotency genes and surface markers.

Reprogramming Human Somatic Cells into Induced Pluripotent Stem Cells iPSCs Using Retroviral Vector with GFP

A method to generate human induced pluripotent stem cells (iPSCs) via retrovirus-mediated ectopic expression of OCT4, SOX2, KLF4 and MYC is described. A practical way to identify human iPSC colonies based on GFP expression is also discussed.

GFPをレトロウイルスベクターを用いた誘導多能性幹細胞（性IPSC）にヒト体細胞を再プログラミングする

Human embryonic stem cells (hESCs) are pluripotent and an invaluable cellular sources for in vitro disease modeling and regenerative medicine1. It has ...

Detecting, Visualizing and Quantitating the Generation of Reactive Oxygen Species in an Amoeba Model System

Reactive oxygen species (ROS) comprise a range of reactive and short-lived, oxygen-containing molecules, which are dynamically interconverted or eliminated either catalytically or spontaneously. Due to the short life spans of most ROS and the diversity of their sources and subcellular localizations, a complete picture can be obtained only by careful measurements using a combination of protocols. Here, we present a set of three different protocols using OxyBurst Green (OBG)-coated beads, or dihydroethidium (DHE) and Amplex UltraRed (AUR), to monitor qualitatively and quantitatively various ROS in professional phagocytes such as Dictyostelium. We optimised the beads coating procedures and used OBG-coated beads and live microscopy to dynamically visualize intraphagosomal ROS generation at the single cell level. We identified lipopolysaccharide (LPS) from E. coli as a potent stimulator for ROS generation in Dictyostelium. In addition, we developed real time, medium-throughput assays using DHE and AUR to quantitatively measure intracellular superoxide and extracellular H2O2 production, respectively.

We adapted a set of protocols for the measurement of reactive oxygen species (ROS) that can be applied in various amoeba and mammalian cellular models for qualitative and quantitative studies.

、検出し可視化し、アメーバモデル系で活性酸素種の生成を定量

Reactive oxygen species (ROS) comprise a range of reactive and short-lived, oxygen-containing molecules, which are dynamically interconverted or ...

Profiling Individual Human Embryonic Stem Cells by Quantitative RT-PCR

Heterogeneity of stem cell population hampers detailed understanding of stem cell biology, such as their differentiation propensity toward different lineages. A single cell transcriptome assay can be a new approach for dissecting individual variation. We have developed the single cell qRT-PCR method, and confirmed that this method works well in several gene expression profiles. In single cell level, each human embryonic stem cell, sorted by OCT4::EGFP positive cells, has high expression in OCT4, but a different level of NANOG expression. Our single cell gene expression assay should be useful to interrogate population heterogeneities.

Single cell gene expression assay is needed for understanding stem cell heterogeneities.

定量的RT-PCRによって個々のヒト胚性幹細胞のプロファイリング

Heterogeneity of stem cell population hampers detailed understanding of stem cell biology, such as their differentiation propensity toward different ...

In Vivo 4-Dimensional Tracking of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells in Adult Mouse Calvarial Bone Marrow

Through a delicate balance between quiescence and proliferation, self renewal and production of differentiated progeny, hematopoietic stem cells (HSCs) maintain the turnover of all mature blood cell lineages. The coordination of the complex signals leading to specific HSC fates relies upon the interaction between HSCs and the intricate bone marrow microenvironment, which is still poorly understood[1-2].
We describe how by combining a newly developed specimen holder for stable animal positioning with multi-step confocal and two-photon in vivo imaging techniques, it is possible to obtain high-resolution 3D stacks containing HSPCs and their surrounding niches and to monitor them over time through multi-point time-lapse imaging. High definition imaging allows detecting ex vivo labeled hematopoietic stem and progenitor cells (HSPCs) residing within the bone marrow. Moreover, multi-point time-lapse 3D imaging, obtained with faster acquisition settings, provides accurate information about HSPC movement and the reciprocal interactions between HSPCs and stroma cells.
Tracking of HSPCs in relation to GFP positive osteoblastic cells is shown as an exemplary application of this method. This technique can be utilized to track any appropriately labeled hematopoietic or stromal cell of interest within the mouse calvarium bone marrow space.

In Vivo 4-Dimensional Tracking of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells in Adult Mouse Calvarial Bone Marrow

The nature of the interactions between hematopoietic stem and progenitor cells (HSPCs) and bone marrow niches is poorly understood. Custom hardware modifications and a multi-step acquisition protocol allow the use of two-photon and confocal microscopy to image ex vivo labeled HSPCs homed within bone marrow areas, tracking interactions and movement.

成体マウス頭蓋冠骨髄中の造血幹細胞および前駆細胞のin vivo 4次元トラッキングで

Through a delicate balance between quiescence and proliferation, self renewal and production of differentiated progeny, hematopoietic stem cells (HSCs) ...

Analysis of Cell Suspensions Isolated from Solid Tissues by Spectral Flow Cytometry

Flow cytometry has been used for the past 40 years to define and analyze the phenotype of lymphoid and other hematopoietic cells. Initially restricted to the analysis of a few fluorochromes, currently there are dozens of different fluorescent dyes, and up to 14-18 different dyes can be combined at a time. However, several limitations still impair the analytical capabilities. Because of the multiplicity of fluorescent probes, data analysis has become increasingly complex due to the need of large, multi-parametric compensation matrices. Moreover, mutant mouse models carrying fluorescent proteins to detect and trace specific cell types in different tissues have become available, so the analysis (by flow cytometry) of auto-fluorescent cell suspensions obtained from solid organs is required. Spectral flow cytometry, which distinguishes the shapes of emission spectra along a wide range of continuous wavelengths, addresses some of these problems. The data is analyzed with an algorithm that replaces compensation matrices and treats auto-fluorescence as an independent parameter. Thus, spectral flow cytometry should be capable of discriminating fluorochromes with similar emission peaks and can provide a multi-parametric analysis without compensation requirements.
This protocol describes the spectral flow cytometry analysis, allowing for a 21-parameter (19 fluorescent probes) characterization and the management of an auto-fluorescent signal, providing high resolution in minor population detection. The results presented here show that spectral flow cytometry presents advantages in the analysis of cell populations from tissues difficult to characterize in conventional flow cytometry, such as the heart and the intestine. Spectral flow cytometry thus demonstrates the multi-parametric analytical capacity of high-performing conventional flow cytometry without the requirement for compensation and enables auto-fluorescence management.

This article describes spectral cytometry, a new approach in flow cytometry that uses the shapes of emission spectra to distinguish fluorochromes. An algorithm replaces compensations and can treat auto-fluorescence as an independent parameter. This new approach allows for the proper analysis of cells isolated from solid organs.

スペクトラルフローサイトメトリーにより固形組織から単離された細胞懸濁液の分析

Flow cytometry has been used for the past 40 years to define and analyze the phenotype of lymphoid and other hematopoietic cells. Initially restricted to ...

Y-27632 Enriches the Yield of Human Melanocytes from Adult Skin Tissues

The isolation and culture of primary melanocytes from skin tissues is very important for biological research and has been widely used for clinical applications. Isolating primary melanocytes from skin tissues by the conventional method usually takes about 3 to 4 weeks to passage sufficiently. More importantly, the tissues used are usually newborn foreskins and it is still a challenge to efficiently isolate primary melanocytes from adult tissues. We recently developed a new isolation method for melanocytes that adds Y-27632, a Rho kinase inhibitor, to the initial culture medium for 48 h. Compared with the conventional protocol, this new method dramatically increases the yield of melanocytes and shortens the time required to isolate melanocytes from foreskin tissues. We now describe this new method in more detail using adult epidermis to efficiently culture primary melanocytes. Importantly, we show that melanocytes obtained from adult tissues prepared by this new method can function normally. This new protocol will significantly benefit studies of pigmentation defects and melanomas using primary melanocytes prepared from easily accessed adult skin tissues.

This paper reports that the addition of Y-27632 to TIVA medium can significantly increase the yield of melanocytes from adult skin tissues.

Y-27632 成人皮膚組織からのヒトメラノサイトの収穫量を豊かにする

The isolation and culture of primary melanocytes from skin tissues is very important for biological research and has been widely used for clinical ...

Inhibition of Wound Epidermis Formation via Full Skin Flap Surgery During Axolotl Limb Regeneration

Classical experiments in salamander regenerative biology over the last century have long established that the wound epidermis is a crucial signaling structure that forms rapidly post-amputation and is required for limb regeneration. However, methods to study its precise function at the molecular level over the last decades have been limited due to a paucity of precise functional techniques and genomic information available in salamander model systems. Excitingly, the recent plethora of sequencing technologies coupled with the release of various salamander genomes and the advent of functional genetic testing methods, including CRISPR, makes it possible to re-visit these foundational experiments at unprecedented molecular resolution. Here, I describe how to perform the classically developed full skin flap (FSF) surgery in adult axolotls in order to inhibit wound epidermis formation immediately following amputation. The wound epidermis normally forms via distal migration of epithelial cells in the skin proximal to the amputation plane to seal off the wound from the outside environment. The surgery entails immediately suturing full thickness skin (which includes both epidermal and dermal layers) over the amputation plane to hinder epithelial cell migration and contact with the underlying damaged mesenchymal tissues. Successful surgeries result in the inhibition of blastema formation and limb regeneration. By combining this surgery method with contemporary downstream molecular and functional analyses, researchers can begin to uncover the molecular underpinnings of wound epidermis function and biology during limb regeneration.

This article describes how to perform a surgical method to inhibit wound epidermis formation during axolotl limb regeneration by immediately suturing full thickness skin over the amputation plane. This method allows researchers to investigate the functional roles of the wound epidermis during the early stages of limb regeneration.

アキソロトル四肢再生中のフルスキンフラップ手術による創傷表皮形成の阻害

Classical experiments in salamander regenerative biology over the last century have long established that the wound epidermis is a crucial signaling ...

Analyzing Oxidative Stress in Murine Intestinal Organoids using Reactive Oxygen Species-Sensitive Fluorogenic Probe

Reactive oxygen species (ROS) play essential roles in intestinal homeostasis. ROS are natural by-products of cell metabolism. They are produced in response to infection or injury at the mucosal level as they are involved in antimicrobial responses and wound healing. They are also critical secondary messengers, regulating several pathways, including cell growth and differentiation. On the other hand, excessive ROS levels lead to oxidative stress, which can be deleterious for cells and favor intestinal diseases like chronic inflammation or cancer. This work provides a straightforward method to detect ROS in the intestinal murine organoids by live imaging and flow cytometry, using a commercially available fluorogenic probe. Here the protocol describes assaying the effect of compounds that modulate the redox balance in intestinal organoids and detect ROS levels in specific intestinal cell types, exemplified here by the analysis of the intestinal stem cells genetically labeled with GFP. This protocol may be used with other fluorescent probes.

The present protocol describes a method to detect reactive oxygen species (ROS) in the intestinal murine organoids using qualitative imaging and quantitative cytometry assays. This work can be potentially extended to other fluorescent probes to test the effect of selected compounds on ROS.