トランスレーショナルメディシンのためのバイオバンク:最適なサンプル管理のための標準操作手順

バイオバンクは、基本的なトランスレーショナルおよび臨床研究に不可欠なリソースですが、学術研究と製薬バイオテクノロジー業界をつなぐ主要なプレーヤーとしても機能します。このプロトコルは、バイオテクノロジー、バイオバンキング、およびバイオバンクの一般的な要件に関する最新の基準に準拠して機能する完全に認定されたバイオバンクであるIAOのバイオバンクの標準運用手順を示しています。がん患者からの高品質の生体試料の入手可能性は、次世代の診断ツールの開発にとって重要であり、セラピストはそれを個々の患者に合わせて調整します。

がん患者からの生物学的材料のバイオバンキングには、専門の人員と多数の認証が必要です。担当者は常に訓練を受け、更新する必要があります。したがって、このプロトコルは、バイオバンクを設立したい人にとっての出発点でなければなりません。

まず、待合室で教育漫画のビデオを放送して、RPAの影響の重要性について患者に知らせます。すべての患者にガジェットのブックマークを提供します。LIMSソフトウェアを使用して、すべての生物学的サンプルを追跡します。

コードを使用して患者を識別します。医療記録番号と一致する一意のコードを各個人に割り当てます。各患者プロファイルの試験プロジェクトフィールドに正しく記入して、患者が臨床試験または指定された承認された研究プロジェクトに登録されているかどうかを確認します。

感染のリスクが不明な場合は技術者に通知します。肯定的な結果または未知のリスクを持つ標本を廃棄します。新鮮なサンプルの場合は、バイオバンクソフトウェアに血液サンプルを登録します。

バキュテイナーにバイオバンクIDコードのラベルを付け、許可されたユーザーに届けます。バイオバンクに保存されている凍結サンプル用に、それぞれ900マイクロリットルの血液のクライオバンク2Dコーティングチューブを2本用意します。バイオバンクソフトウェアにアリコートを登録します。

指定されたバーコードプレートに置き、摂氏マイナス80度で保管して、一定の温度を確保します。EDTA収集チューブからの血液を空の滅菌50ミリリットルコニカルチューブに注ぎ、滅菌1X PBSを使用して希釈します。PBSを使用して血管をすすぎます。

チューブを400 RCFで摂氏20度で30分間遠心分離し、バイオハザードフードの下でチューブを処理します。パスツールピペットを使用してPBMCを含む中央の白い層を回収し、新しい滅菌50ミリリットルの円錐形チューブに入れます。PBMCを洗浄するために最大45ミリリットルのPBSを追加します。

400 RCFで混合し、摂氏4度で10分間遠心分離します。ペレットを回収し、PBSに再懸濁します。次に、使い捨てのバーカーチャンバーを使用してセルを数えます。

テキスト原稿に記載されているように、PBMCのPBS洗浄を繰り返します。PBMCを冷凍庫培地で希釈し、1ミリリットルの再懸濁細胞を各クライオチューブに移してクライオバンク2Dコーティングチューブを準備します。サンプルを特定のクライオボックスに入れ、できるだけ早く摂氏マイナス80度で保管します。

全血サンプルを含む真空容器を2, 000 Gで摂氏4度で10分間遠心分離します。3ミリリットルのパスツールピペットを使用して血漿の上層を取り除き、それを滅菌された15ミリリットルの円錐形チューブに移します。その後、16, 000 RCFで摂氏4度で10分間遠心分離し、汚染された血球を除去します。

プラズマを1ミリリットルのクライオバンク2Dコーティングチューブに移します。バイオバンクソフトウェアにアリコートを登録します。それらを特定のバーコードプレートに置き、一定の温度を確保するためにマイナス80度で保管します。

病理医に組織サンプルを検査してもらい、診断手順に必要のない材料が研究目的に十分かどうかを判断します。可能な限り、病理学的組織の非病理学的対応物さえも集める。サンプルをPおよびNPとラベル付けした滅菌細胞培養ペトリ皿に入れます。組織を摂氏4度で氷の上に保ち、それぞれ3つの部分に分けます。

十分な材料が利用可能な場合は、A、B、およびC。Aとラベル付けされた新鮮な組織サンプルの場合、PおよびNP組織の新鮮なアリコートを、各特定のプロトコルで定義された適切な培養培地を含むチューブに入れ、外部の研究ユニットに送ります。Bと表示されたOCT組織サンプルの場合は、OCTレジンを充填し、直ちにマイナス80°Cの瞬間凍結装置に入れてください。

Cとラベル付けされた組織サンプルの場合、残りの組織サンプルをフラッシュフリーズ装置内のクライオバンク2Dコーティングチューブに入れます。プレートは摂氏マイナス80度で保管してください。2012年4月から2021年12月にかけて、合計38, 446件の注釈付き生物学的リキッドバイオプシーと10, 205件の組織サンプルが収集されました。

収集されたサンプル、特に2020年から2021年までの組織の数は、COVID-19のパンデミックとそれに関連する腫瘍学的処置の減少により減少しました。泌尿器科、婦人科、超音波科、頭頸部科、腹部外科、骨盤外科、胸部外科の部門から得られた採取サンプルを詳細に分析しました。最も多くの組織サンプルが乳房腫瘍から収集された。

尿、便、頬スワブなどの他の生物学的標本の収集は、長年にわたる需要に続いて大幅に増加しています。このオプションは、生物学的サンプルを保存するための基本的なプラットフォームを提供し、癌研究プログラムの再現性を向上させます。これらのサンプルは、次世代シーケンシングや質量分析などのさまざまな研究アプリケーションに使用できます。

私たちのプラットフォームは、新しい人工知能アルゴリズムをトランスレーショナルリサーチに実装することができ、がん患者の治療方法を変える可能性があります。