Biyobankalar temel translasyonel ve klinik araştırmalar için gerekli kaynaklardır, ancak aynı zamanda akademik araştırmaları ve ilaç-biyoteknoloji endüstrisini birbirine bağlayan kilit oyuncular olarak da hareket ederler. Bu protokol, biyoteknoloji, biyobankacılık ve biyobankalar için genel gereklilikler için en yeni standarda uygun olarak çalışan tam sertifikalı bir biyobanka olan IAO'daki biyobankanın standart çalışma prosedürlerini sunmaktadır. Kanser hastalarından elde edilen yüksek kaliteli biyoörneklerin mevcudiyeti, yeni nesil tanı araçlarının geliştirilmesi için kritik öneme sahiptir ve terapistler bunu bireysel hastalara uyarlar.
Kanser hastasından biyolojik materyalin biyobankacılığı uzman personel ve çok sayıda sertifika gerektirir. Personel sürekli eğitilmeli ve güncellenmelidir. Bu nedenle bu protokol, biyobanka kurmak isteyenler için başlangıç noktası olmalıdır.
Başlamak için, hastaları RPA'nın etkisinin önemi hakkında bilgilendirmek için bekleme odalarında eğitici bir çizgi film videosu yayınlayın. Tüm hastalara gadget yer imleri sağlayın. Tüm biyolojik örnekleri izlemek için LIMS yazılımını kullanın.
Kodları kullanarak hastaları tanımlayın. Her bireye tıbbi kayıt numarasıyla eşleşen benzersiz bir kod atayın. Her hasta profilindeki çalışma projesi alanını doğru bir şekilde tamamlayarak hastanın bir klinik araştırmaya mı yoksa belirli bir onaylanmış araştırma projesine mi kayıtlı olduğunu doğrulayın.
Enfeksiyon riski bilinmiyorsa teknisyenleri bilgilendirin. Olumlu sonuçları veya bilinmeyen riskleri olan örnekleri atın. Taze örnekler için, kan örneklerini biyobanka yazılımına kaydedin.
Vakumlayıcıları biyobanka kimlik kodu ile etiketleyin ve yetkili kullanıcılara teslim edin. Biyobankta depolanan dondurulmuş numuneler için, her biri 900 mikrolitre kandan oluşan iki kriyobank 2D kaplı tüp hazırlayın. Aliquot'ları biyobanka yazılımına kaydedin.
Bunları belirli bir barkod plakasına yerleştirin ve sabit bir sıcaklık sağlamak için eksi 80 santigrat derecede saklayın. EDTA toplama tüplerindeki kanı boş steril 50 mililitrelik konik tüpe dökün ve steril 1X PBS kullanarak seyreltin. Kan tüpünü durulamak için PBS'yi kullanın.
Tüpleri 400 RCF'de 20 santigrat derecede 30 dakika boyunca santrifüj edin ve tüpleri biyolojik tehlike başlığı altında işleyin. PBMC'leri içeren orta beyaz tabakayı bir Pasteur pipet kullanarak geri kazanın ve yeni steril 50 mililitrelik konik tüpe yerleştirin. PBMC'leri yıkamak için 45 mililitreye kadar PBS ekleyin.
Dört santigrat derecede 10 dakika boyunca 400 RCF'de karıştırın ve santrifüj yapın. Peleti geri kazanın ve PBS'de yeniden askıya alın. Daha sonra tek kullanımlık Burker odalarını kullanarak hücreleri sayın.
PBMC'ler için PBS yıkamasını metin makalesinde açıklandığı gibi tekrarlayın. PBMC'leri dondurucu ortamında seyreltin ve her kriyo tüpüne bir mililitre resusüspansiyonlu hücre aktararak kriyobank 2D kaplı tüpler hazırlayın. Numuneleri belirli bir kriyo kutusuna yerleştirin ve mümkün olan en kısa sürede eksi 80 santigrat derecede saklayın.
Tam kan örneklerini içeren vakumlayıcıyı 2.000 G'de dört santigrat derecede 10 dakika boyunca santrifüj edin. Üç mililitrelik bir Pasteur pipet kullanarak plazmanın üst tabakasını çıkarın ve steril 15 mililitrelik konik bir tüpe aktarın. Daha sonra kirletici kan hücrelerini ortadan kaldırmak için 16.000 RCF'de dört santigrat derecede 10 dakika boyunca santrifüj yapın.
Plazmayı bir mililitrelik kriyobank 2D kaplı tüplere aktarın. Aliquot'ları biyobanka yazılımına kaydedin. Bunları belirli bir barkod plakasına yerleştirin ve sabit bir sıcaklık sağlamak için eksi 80 derecede saklayın.
Teşhis prosedürleri için gerekli olmayan materyalin araştırma amaçları için yeterli olup olmadığını belirlemek için doku örneklerini bir patolog tarafından muayene ettirin. Mümkün olduğunda, patolojik dokunun patolojik olmayan muadilini bile toplayın. Numuneleri P ve NP olarak etiketlenmiş steril hücre kültürü Petri kaplarına yerleştirin. Dokuyu buz üzerinde dört santigrat derecede tutun ve her birini üç parçaya bölün.
Yeterli malzeme varsa A, B ve C. A olarak etiketlenmiş taze doku örnekleri için, P ve NP dokusunun taze alikotlarını, her bir spesifik protokolde tanımlanan uygun kültür ortamına sahip tüplere yerleştirin ve harici araştırma birimlerine gönderin. B olarak etiketlenmiş OCT doku örnekleri için, bunları OCT reçinesi ile doldurun ve hemen eksi 80 santigrat derecede bir flaş dondurma aparatına yerleştirin.
C olarak etiketlenmiş doku örnekleri için, kalan doku örneklerini flaş dondurma aparatındaki kriyobank 2D kaplı tüplere yerleştirin. Plakaları eksi 80 santigrat derecede saklayın. Nisan 2012'den Aralık 2021'e kadar toplam 38.446 açıklamalı biyolojik sıvı biyopsi ve 10.205 doku örneği toplanmıştır.
Toplanan örneklerin sayısı, özellikle 2020'den 2021'e kadar dokular, COVID-19 pandemisi ve buna bağlı olarak onkolojik prosedürlerdeki azalma nedeniyle azalmıştır. Üroloji, jinekoloji, sonoloji bölümlerinden elde edilen örnekler ile baş-boyun, karın, pelvik ve göğüs cerrahisi bölümlerinden elde edilen örnekler ayrıntılı olarak analiz edildi. En fazla doku örneği meme tümörlerinden toplandı.
İdrar, dışkı ve bukkal çubuklar gibi diğer biyolojik örneklerin toplanması, yıllar içindeki talebi takiben önemli ölçüde artmıştır. Bu seçenek, biyolojik numunelerin depolanması için temel bir platform sağlar ve kanser araştırma programlarının tekrarlanabilirliğini geliştirir. Bu örnekler, yeni nesil dizileme veya kütle spektrometrisi gibi farklı araştırma uygulamaları için kullanılabilir.
Platformumuz, kanser hastalarının tedavi edilme şeklini değiştirme potansiyeli olan yeni yapay zeka algoritmalarını translasyonel araştırmalara uygulayabiliyor.
