Method Article
우리는 빛 시트 형광 현미경 검사법과 생체 내 제브라피시 심장을 연구하는 최적화 된 도구를 설명합니다. 특히, 우리는 밝은 심장 형질 전환선을 제안하고 발달과 심장 결함을 피하는 새로운 부드러운 임베드 및 고정 기술을 제시합니다. 심장 이미징에 적응된 가능한 데이터 수집 및 분석 파이프라인도 제공됩니다.
배아 심장 연구는 생체 내 발광 형광 현미경 검사법 (LSFM)에서 빠른 발전에서 크게 혜택을 누리고 있다. ZEBRAfish, Danio rerio의 급속한 외부 발달, 기관 유전학 및 투명성과 결합된 LSFM은 상당한 광독성이나 광표백 없이 높은 공간 및 측두적인 해상도에서 심장 형태와 기능에 대한 통찰력을 제공했습니다. 구타 심장의 화상 진찰은 기존 견본 준비 및 현미경 기술에 도전합니다. 하나는 제한된 시야에서 건강한 샘플을 유지하고 심장 박동을 해결하기 위해 초고속 이미지를 수집해야합니다. 여기서 우리는 생체 내에서 제브라피시 심장을 연구하는 최적화된 도구와 솔루션을 설명합니다. 우리는 심장 성분을 라벨링하기위한 밝은 형질 전환선의 응용 프로그램을 시연하고 발달 결함과 심박수의 변화를 피하는 새로운 부드러운 임베드 및 고정 기술을 제시합니다. 또한 심장 이미징에 적합한 데이터 수집 및 분석 파이프라인도 제안합니다. 여기에 제시된 전체 워크플로우는 제브라피시 배아 심장 화상 진찰에 초점을 맞추고 있지만 다양한 다른 샘플 및 실험에도 적용 될 수 있습니다.
초기 박동 심장에 있는 복잡한 사건 및 상호 작용을 밝히기 위하여는, 전체 기관의 생체 내 화상 진찰에서 요구됩니다. 최소한의 광독성1,2,3, 낮은 광표백4, 고속으로, 광시트 현미경 검사는 배아 및 심장 발달을 위한 1차 화상 진찰 도구로 발전했습니다5,6. 그것은 높은 공간 및 측두해상도에서 심장 형태와 기능에 대한 통찰력을 제공하고 연구원은 고속으로 심장의 형광 표시 부분을 이미지와 추적 할 수 있습니다, 혈역학력을 연구, 개발 배아의 몸 내부 심장 발달을 따라 6,10,11,12.
시야에서 제브라피시를 정확하고 재현적으로 제한하기 위해, 단기 및 장기뿐만 아니라 단일 또는 다중 샘플 13,14,15,17,18,19뿐만 아니라, 라이트 시트에 대한 다양한 포함 프로토콜이 존재한다. 가장 일반적인 프로토콜은 유리 또는 플라스틱 튜브 내부에 트리카인 고정 및 아가로즈 장착을 포함한다. 그러나, 심박수가 온도, 마취제 및 포함 물질로 인해 변경될 수 있기 때문에 20,21,22로, 제브라피쉬 심장 이미징은 시료 건강을 보장하기 위해 구체적이고 부드러운 프로토콜이 필요합니다6,8,8,11,12,20,21,22,22,23 . 단기 이미징(최대 1시간)의 경우, 130 mg/L 트리카인에서 물고기를 마취하고 0.1% 아가로즈 용액및 플러그를 가진 플루오라이트 에틸렌 프로필렌(FEP) 튜브에 포함시킬 수 있습니다. 그러나, 트리카인이 발달 결함으로 이어질 수 있기 때문에20,22, 다른 프로토콜장기 화상 진찰을 위해 사용되어야 합니다.
여기에서 우리는 장기 심장 화상 진찰을 위한 새로운 전략을 기술합니다. 많은 광시트 구현이 존재하지만24, 우리는 T-SPIM 현미경 (하나의 검출 및 공통 초점에 수직으로 매달려 샘플과 수평 평면에 두 개의 조명 렌즈)에 매달려 샘플을 사용하는 것이 좋습니다. 이를 통해 정확한 시료 포지셔닝에 필요한 이동 및 회전의 자유를 제공합니다. 물고기는 1- 또는 2 세포 단계에서 30 pg α 분가로톡신 mRNA를 주입하여 고정됩니다. α 분가로톡신은 심혈관 발달이나 생리학에 영향을 미치지 않고 근육을 마비시키는 뱀 독입니다22. 정확하고 왜곡없는 이미징을 위해 물과 거의 동일한 굴절률을 가진 폴리머인 FEP로 만든 튜브에 물고기를 장착하는 것이 좋습니다. 화상 진찰 전에 이를 곧게 펴고 청소하여 FEP 튜브를 가장 잘 준비하는 방법에 대해 설명합니다. 물고기는 다음이 튜브에 장착, 아래로 머리, 미디어에, 튜브의 바닥은 2 % 아가로즈 플러그로 밀봉, 물고기 머리가 휴식하는. FEP 튜브의 구멍을 절단하면 가스 교환을 용이하게하고 어류의 성장을 보장합니다. 임베디드 된 물고기는 이미징 직전에 샘플 홀더에 장착 될 때까지 미디어에 보관 할 수 있습니다. 또한 재현 가능한 고속 이미징을 위한 데이터 수집 및 분석 파이프라인을 제안합니다. 또한, 우리는 강력한 심장 세포 라벨링을 위한 세포질 마커 형질 대사 대 세포질 마커 의 사용을, 뿐만 아니라 심혼을 정지하는 다른 선택권에 대해 토론합니다. 이러한 장착 기술은 시야에서 심장을 정확하고 재현적으로 제한할 수 있도록 하면서 샘플 상태를 보장합니다.
모든 제브라피쉬(Danio rerio) 성인과 배아는 UW-매디슨 기관 동물 관리 및 사용 위원회(IACUC)가 승인한 프로토콜에 따라 처리되었습니다.
1. 제브라피시 준비
2. FEP 튜브 준비
그림 1: FEP 튜브 청소 및 스트레이트. (a) 케이블 드럼에 FEP 튜브. (b) 곧게 펴기 전에 FEP 튜브. (c) 유리 및 강철 오토클레이브 안전 튜브FEP 튜브. (d) 곧게 펴고 식힌 후 FEP 튜브의 플러싱. (e) FEP 튜브는 초음파 처리를 위한 원심분리기 튜브의 크기로 절단한다. (f) 초음파 처리 후 FEP 튜브의 플러싱. (g) 원심분리기 튜브에 세척및 곧게 된 FEP 튜브의 저장. (h) 화상 진찰 전에 FEP 관을 절단합니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
3. 아가로즈 접시 2% 준비
4. 미디어 포함 준비
5. 샘플 마운팅
그림 2: FEP 튜브에 배아 장착. (a) 마운팅 미디어에서 마취 된 색소가없는 물고기. (b) 무딘 엔드 바늘과 FEP 튜브가 부착된 주사기. (c) FEP 튜브에서 미디어와 물고기를 채취하면 바늘 가장자리에서 튜브를 잘라냅니다. (d) 컷 튜브를 2% 아가로즈로 코팅한 접시에 찍어 끝을 연결합니다. (e) 연결된 FEP 튜브의 제브라피시. (f) FEP 튜브를 30°로 부드럽게 잘라 가스 교환 구멍을 만듭니다. (g) 페프 튜브에 임베디드 제브라피시 위에 4개의 구멍이 있습니다. (h) FEP 튜브에 내장된 제브라피시의 계획. 구멍과 한천 플러그가 표시됩니다. (i) 이미징을 위한 여러 개의 임베디드 제브라피쉬. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
6. 샘플 포지셔닝
그림 3: 샘플 챔버. (a) FEP 튜브가 샘플 홀더에 장착됩니다. (b) 단계와 목표가 있는 샘플 챔버. (c) T-SPIM 구성에서 조명 및 검출 목표를 가진 미디어 채워진 샘플 챔버의 최고 보기. (d) 챔버내 시료와 함께 현미경에 장착된 샘플 홀더. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 4: 심장 이미징을 위한 배아 포지셔닝. (a) 24 hpf Tg (kdrl:Hsa.HRAS-mCherry) 눈이 잘못 정렬된 제브라피시. (a') 같은 물고기, 눈이 정렬. (b) 동일한 물고기가 -100 ° 및 (b') -50 ° 회전하여 최적의 심장 이미징을 합니다. (c) 48 hpf 제브라피쉬와 눈이 잘못 정렬. (c') 같은 물고기, 눈이 정렬. (d) 최적의 심장 이미징을 위해 동일한 물고기가 30° 회전합니다. 검은 색 화살표는 심장을 가리킵니다. 배율 막대 100 μm. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
7. 이미지 수집
8. 이미지 처리
그림 5: 48 hpf 제브라피쉬 심장. (a) 여전히 하나의 z 프레임, 전방 복부 보기48 hpf Tg (kdrl:Hsa.HRAS-mCherry; myl7:lck-EGFP) 제브라피쉬, LSFM으로 이미지, (b) 영화 스택의 3D 재구성, 아트리움을 통해 보기를 잘라. (c) 하나의 z-비행기에서 전체 심장 박동을 통해 네 프레임의 몽타주. 원형 차트는 하트비트 중 시간을 나타냅니다. 배율 막대 50 μm. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
우리는 Tg의 심장을 치는 48 hpf (kdrl:Hsa.HRAS-mCherry; myl7:lck-EGFP) 제브라피쉬 위에 상세한 프로토콜에 따라 기록했습니다 (그림 5). 488 nm와 561 nm 레이저 라이트 시트는 샘플을 동시에 조명했습니다. 방출된 형광은 16x/0.8W 객관적렌즈와 과학금속 산화물 반도체(sCMOS) 카메라를 사용하여 수직으로 검출되었다.
48 hpf에서 심장은 막 반복을 거쳤으며 심실과 아트리움의 두 개의 챔버가 있지만 아직 밸브를 개발하지 못했습니다. 우리의 영화에서, 유입 도, 심실, 대실 운하 (AVC), 아트리움 및 유출 트랙과 같은 다른 심장 구조는 쉽게 구별 할 수 있습니다 (그림 5a, b). 이러한 데이터는 심장의 두 세포 층 사이의 정확한 박동 및 복합성 상호 작용을 보여줍니다: 심근, 단세포 근육 층 수축 및 생성힘 (그림 5c, 빨강), 및 내카르듐, 혈관에 심장을 연결하는 단일 세포 층 (그림 5c, 시안).
x, y,z(3D) + 시간(4D) + 색상(5D)의 심장 박동 재구성은 미켈릿 외.6에 따라 수행되었다. 재건은 두 가지 가설을 기반으로합니다 : 심장의 움직임은 반복적이며 데이터는 작은 z 단계로 획득해야합니다. 출력은 5D로 재구성된 단일 하트비트로, 하트비트당 30GB에서 80GB의 측정입니다. 데이터를 렌더링하기 위해 다차원 데이터 집합을 처리하고 셀 레이어와 개별 레이어(그림 5b)의 5D 동영상을 쉽게 렌더링하도록 설계된 개방형 오픈 소스 도구 FluoRender를 심층 렌더링31에 사용했습니다.
심장을 이미지화하는 트랜스제닉 라인
그림 6: 세포질 및 막 마커 제브라피시 형질대사의 비교. LSFM으로 이미지된 48hpf 제브라피쉬 하트의 전방 복부 보기. 흰색 화살표는 멤브레인 마커 형질 대사로만 보이는 구조를 나타냅니다. (a) 심장의 시안및 (a')에서 심실에서 Tg(kdrl:EGFP)32 신호. (b) Tg (kdrl:Hsa.HRAS-mCherry; myl7:dsRed)33 심장에 빨간색신호와 (b') 심실에. (c,c') Tg의 병합 (kdrl:Hsa.HRAS-mCherry; myl7:dsRed) 및 Tg (kdrl:EGFP) 신호. 배율 막대 50 μm. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
얼룩말 심장을 이미징하려면 정확한 심장 세포 라벨링이 필요합니다. 심근 두께는 세포 전체에 걸쳐 상대적으로 일정한 동안, 내막 세포는 핵 의 주위에 두껍지만 얇은 막 돌출이, 2 μm 보다는 더 얇은 몇몇 지구에서. Tg(kdrl:EGFP)32와 같은 세포질 형질선은 내막 핵 주위의 부위를 효과적으로 레이블을 지정하지만, 더 멀리, 얇은 세포질은 짧은 노출 시간으로 검출될 충분한 광자를 방출하지 않을 수 있으며, 이는 데이터에 인공적인 구멍으로 이어진다(도 6a). 대조적으로, Tg(kdrl:Hsa.HRAS-mCherry)와 같은 멤브레인 마커 형질대사(33)는 내카르듐에 효과적으로 라벨을 부착하고 자세한 내용을 밝힐 수 있다(그림 6b,c). 각 실험에 대해 가장 적합한 형질 전환선을 신중하게 선택합니다.
제브라피쉬 고정
고정 기술의 선택은 실험의 길이와 이미지물고기의 나이에 따라 달라집니다. 트리카인은 일반적으로 제브라피시 고정에 사용되어 왔으며, 대부분 사용편의성 때문입니다. 실제로, 단순히 추가 130 물고기 미디어에 mg/L 트리카인 결과 그들의 마취에 10 분. 그것은 발달 결함으로 이끌어 내고 심장 생리학에 영향을 미칠 수 있기 때문에20,22, 우리는 짧은 실험에 대해서만 트리사인을 사용하는 것이 좋습니다 (30 분 미만). 더 긴 이미징을 위해, 1-또는 2 세포 단계에서 α 분가로톡신 mRNA 주사는 심혈관 발달 또는 생리학에 영향을 미치지 않고 최대 3 일 후에 수정 (dpf)까지 물고기를 마비시킵니다.
올바른 FEP 튜브 선택
FEP 튜브는 다양한 직경과 두께로 제공됩니다. 이미지 0-5 dpf 물고기, 0.8 mm는 좋은 내부 직경; 두꺼운 벽 0.8 x 1.6mm 튜브 또는 얇은 벽 0.8 x 1.2 mm 튜브 중 하나를 선택합니다. 얇은 벽으로 둘러싸인 튜브를 추천합니다. 그러나, 두꺼운 벽은 증가 된 안정성과 강성을 제공, 샘플 챔버가 중단하고 얇은 튜브를 이동할 수있는 흐르는 매체가있는 경우 중요 할 수 있습니다. 더 큰 시료의 경우 1.6 x 2.4mm 및 2 x 3mm를 사용할 수 있습니다.
온도 및 가스 교환
제브라피시 배아의 웰빙의 필수적인 측면은 온도입니다. 이상적으로, 환경의 온도가 발달과 심박수34에 영향을 미치기 때문에 이미징하는 동안 물고기를 28.5 °C로 유지하십시오.
우리의 경험에서, 2 % 아가로즈 플러그를 통해 산소 교환은 3-4 dpf까지 안정적인 심박수를 유지합니다. 따라서 튜브의 구멍을 절단하면 산소 확산이 보장됩니다. 또한 원하는 경우 샘플에 약물 전달이 필요할 수 있습니다.
심장 박동의 정지.
적절한 장착 광 시트 현미경의 빠른 획득 속도는 생체 내에서 박동 심장의 기록을 허용합니다. 그러나 방해받지 않는 z 스택을 획득하려면 심장을 느리게 하거나 멈출 수 있습니다. 그러나, 심장을 중지 심장 근육 휴식에 이르게 하 고 심장의 붕괴 발생할 수 있습니다6. 심장 박동 현탁액은 모르폴리노, 저온, 근육 수축 또는 광유전학억제제를 사용하여 수행할 수 있습니다. 이러한 메서드는 각각 단점이 있으며 모든 실험에 대해 신중하게 평가해야 합니다.
한 세포 단계에서 침묵하는 심장(sih) 모르폴리노의 4ng의 주사는 sarcomere formation35에 결정적인 유전자 tnnt2a를 표적으로 하여 심장 박동을 멈출 수 있다35. sih zebrafish는 심장 박동이 없으며 배아가 산소화를 위해 혈액순환에 의존하기 시작할 때 7 dpf까지만 생존합니다. 심장 형태 발생은 유전 및 생체 역학 힘 36에 의해 구동으로, 이 물고기는 3 dpf의 주위에 심장 기형을 현재.
Ca2+의 흐름은 온도에 민감하기 때문에 온도는 배아 제브라피시21의 심박수에 영향을 미칩니다. 따라서 이미징 챔버의 온도를 낮추면 심장 박동이 느려집니다. 심장 박동을 중지하려면 15 °C 이하의 온도가 필요합니다. 제브라피쉬는 보통 28.5°C로 유지되기 때문에, 이러한 저온은 짧은 기간(10분 미만)만 유지할 수 있습니다.
근육 수축의 화학 억제제, 2,3-부-탄데디온 2단축(BDM)과 같은 약물은 제브라피쉬 미디어(50 nM37,38)에 추가되어 일시적으로 심장 박동을 중단할 수 있다. BDM은 15분 이내에 심장 수축을 멈추고 심장 기능을 복원하기 위해 씻을 수 있으므로 사용하기에 편리합니다. 그러나 BDM이 심장 작용 잠재력을 변경함에 따라 주의해서 사용해야 합니다37.
마지막으로, 심근에 있는 채널로독신 또는 할로호독신과 같은 빛 게이트 이온 채널 또는 펌프를 표현하는 형질 전환 제브라피쉬의 심장은 light39,70,40,41,9로 유입되는 관에서 맥박 조정기를 조명하여 조작및 중지할 수 있습니다.
전망
생체 내 제브라피시 심장을 연구하는 최적화된 도구와 솔루션은 초고속 심장 역학의 장기적이고 부드러운 이미징을 허용합니다. 샘플 포함은 공초점 현미경 검사법, 2광자 현미경 검사법 또는 광학 프로젝션 단층 촬영(OPT)과 같은 다양한 이미징 양식에 맞게 조정할 수 있습니다. 그러나 광시트 현미경 검사는 심장의 역학을 포착하기에 충분한 속도로 광학 단면을 제공하는 바람직한 기술일 가능성이 높습니다. 이 프로토콜은 제브라피시 배아 심장 이미징에 초점을 맞추고 있지만, 우리는 또한 다양한 다른 샘플과 실험에 적용 될 수 있다고 생각합니다. 유사한 포함 및 이미징 기술이 심장이 더 숨지고 애벌레가 덜 반투명할 때 개발 중 후기 단계에서도 사용될 수 있다면 미래에 보는 것은 흥미로워질 것입니다.
저자는 공개 할 것이 없습니다.
그림 2의 일러스트에 대해 매들린 노이펠트에게 감사드립니다. 이 작품은 막스 플랑크 소사이어티, 모드리지 연구소, 찬 주커버그 이니셔티브, 인간 프론티어 과학 프로그램(HFSP)에 의해 지원되었습니다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1.5mL Eppendorf | Eppendorf | 22364111 | To carry embedded samples |
15mL Falcon tubes | Falcon | 352095 | To carry embedded samples |
50mL centrifuge tubes | Falcon | 352070 | 50ml tubes for sonication step, and storing cleaned, straightened FEP tubes |
50mL syringe | BD | 309654 | 50ml syringe for FEP cleaning |
Agarose, low gelling temperature | Sigma Aldrich | 39346-81-1 | To make plug |
Blunt Tip Needles, 21 gauge | VWR | 89500-304 | Blunt end needle for 0.8 inner diameter FEP tube |
Borosilicate glass tube | McMaster-Carr | 8729K33 | Tubing for FEP tube straightening 9.5mm outer diameter, 5.6 inner diameter, 30cm long, other sizes available |
Borosilicate glass tube | McMaster-Carr | 8729K31 | Tubing for FEP tube straightening 6.35mm outer diameter, 4mm inner diameter, 30cm long, other sizes available |
Conventional needles, 21 Gauge | BD | 305165 | Conventional needle for 0.8 inner diameter FEP tube |
Disposable glass pipette | Grainger | 52NK56 | To transfer fish, use with pipette pump |
E3 medium for zebrafish embryos | |||
Ethanol | Sigma Aldrich | 64-17-5 | Ethanol for FEP cleaning |
FEP tube, 0.8 / 1.2 mm | ProLiquid | 2001048 | FEP tube with thin wall, other sizes available |
FEP tube, 0.8 / 1.6 mm | Bola | S1815-04 | FEP tube with thick wall, other sizes available |
FEP tube, 2/3mm | BGB | 211581 | Large FEP tube with thick wall, other sizes available |
Hot Hand Rubber Mitt | Cole-Parmer | 691000 | To carry hot equipment after autoclaving |
Omnifix 1mL Syringes | B Braun | 9161406V | 1ml syringe for embedding |
Petri dish, small | Dot Scientific | PD-94050 | To make agarose plug |
Pipette pumps | Argos Technologies | 04395-05 | To transfer fish, use with disposable glass pipette |
PTU | Sigma Aldrich | 103-85-5 | Also known as: N-Phenylthiourea, 1-Phenyl-2-thiourea, Phenylthiocarbamide |
Razor blades | Azpack | 11904325 | To cut FEP tubes |
Sodium Hydroxide | Dot Scientific | DSS24000 | NaOH for FEP cleaning |
Tricaine | Sigma Aldrich | E10521 | Also known as: MS-222, Ethyl 3-aminobenzoate methanesulfonate, Tricaine |
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