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요약

이 연구는 미토콘드리아 부피, 미토콘드리아 막 전위, 활성 산소 종 수준, 미토콘드리아 호흡 사슬 조성 및 미토콘드리아 DNA의 변화를 감지하기 위해 두 개의 형광 리포터 또는 항체를 사용한 유세포 분석 및 이중 염색을 기반으로 여러 미토콘드리아 기능 매개 변수를 측정하는 새로운 접근 방식을보고합니다.

초록

미토콘드리아는 많은 신경 퇴행성 질환의 병태생리학에서 중요하다. 미토콘드리아 부피, 미토콘드리아 막 전위 (MMP), 활성 산소 종 (ROS)의 미토콘드리아 생산 및 미토콘드리아 DNA (mtDNA) 복제 수의 변화는 종종 이러한 과정의 특징입니다. 이 보고서는 인간 유도 만능 줄기 세포(iPSC) 및 iPSC 유래 신경 및 신경교 세포를 포함한 다양한 세포 유형에서 여러 미토콘드리아 매개변수를 측정하기 위한 새로운 유세포 분석 기반 접근 방식을 자세히 설명합니다. 이 흐름 기반 전략은 살아있는 세포를 사용하여 미토콘드리아 부피, MMP 및 ROS 수준을 측정하고 고정 세포를 사용하여 미토콘드리아 호흡 사슬(MRC) 및 미토콘드리아 전사 인자 A(TFAM)와 같은 mtDNA 관련 단백질의 구성 요소를 추정합니다.

MitoTracker Green(MTG), 테트라메틸로다민 에틸 에스테르(TMRE) 및 MitoSox Red를 포함한 형광 리포터와의 공동 염색을 통해 미토콘드리아 부피, MMP 및 미토콘드리아 ROS의 변화를 정량화하고 미토콘드리아 함량과 관련시킬 수 있습니다. MRC 복합체 서브유닛 및 외부 미토콘드리아 막 20(TOMM20)의 트랜스로카제에 대한 항체를 이용한 이중 염색은 MRC 서브유닛 발현의 평가를 허용한다. TFAM의 양은 mtDNA 복제 수에 비례하므로 TOMM20 당 TFAM의 측정은 미토콘드리아 부피 당 mtDNA의 간접적 인 측정을 제공합니다. 전체 프로토콜은 2-3 시간 내에 수행 할 수 있습니다. 중요하게도, 이러한 프로토콜은 유세포 분석을 사용하여 미토콘드리아 부피 당 전체 수준과 특정 수준 모두에서 미토콘드리아 매개 변수를 측정 할 수 있습니다.

서문

미토콘드리아는 거의 모든 진핵 세포에 존재하는 필수 세포 기관입니다. 미토콘드리아는 산화적 인산화를 통해 아데노신 삼인산(ATP)을 생성하여 에너지 공급을 담당하고 생합성 및 대사를 위한 대사 매개체 역할을 합니다. 미토콘드리아는 ROS 생성, 세포 사멸 및 세포 내Ca2+ 조절과 같은 다른 많은 중요한 세포 과정에 깊이 관여합니다. 미토콘드리아 기능 장애는 파킨슨병(PD), 알츠하이머병(AD), 헌팅턴병(HD), 프리드라이히 운동실조증(FRDA) 및 근위축성 측삭 경화증(ALS)1을 비롯한 다양한 신경퇴행성 질환과 관련이 있습니다. 증가된 미토콘드리아 기능 장애 및 mtDNA 이상도 인간의 노화에 기여하는 것으로 생각됩니다 2,3.

다양한 유형의 미토콘드리아 기능 장애가 신경 퇴행성 질환에서 발생하며 미토콘드리아 부피의 변화, MMP 탈분극, ROS 생성 및 mtDNA 복제 수의 변화가 일반적입니다 4,5,6,7. 따라서 이러한 기능 및 기타 미토콘드리아 기능을 측정하는 능력은 질병 메커니즘을 연구하고 잠재적 인 치료제를 테스트 할 때 매우 중요합니다. 더욱이, 인간 신경퇴행성 질환을 충실하게 복제하는 동물 모델의 부족을 고려할 때, 뇌 세포에서 인간 질병을 요약하는 적절한 시험관내 모델 시스템을 확립하는 것은 이러한 질병에 대한 더 큰 이해와 새로운 치료법의 개발을 향한 중요한 단계입니다 2,3,8,9.

인간 iPSC는 뉴런 및 비뉴런 세포(즉, 신경교 세포)를 비롯한 다양한 뇌 세포를 생성하는데 사용될 수 있으며, 신경퇴행성 질환과 관련된 미토콘드리아 손상은 두 세포 유형 3,10,11,12,13 모두에서 발견되었다. 신경 및 신경교 계통으로의 iPSC 분화를 위한 적절한 방법이 이용가능하다14,15,16. 이 세포는 시험관 내 질병 모델링 및 약물 스크리닝을 위한 고유한 인간/환자 플랫폼을 제공합니다. 또한 환자에서 파생되기 때문에 iPSC 유래 뉴런과 신경교 세포는 인간에서 일어나는 일을보다 정확하게 반영하는 질병 모델을 제공합니다.

현재까지 iPSC, 특히 살아있는 뉴런과 신경교 세포에서 여러 미토콘드리아 기능 파라미터를 측정하는 편리하고 신뢰할 수 있는 방법은 거의 없습니다. 유세포 분석의 사용은 과학자에게 단일 세포에서 미토콘드리아 기능을 포함한 생물학적 매개 변수를 측정하기위한 강력한 도구를 제공합니다. 이 프로토콜은 iPSC의 신경 줄기 세포(NSC), 뉴런 및 신경교 성상세포를 포함한 다양한 유형의 뇌 세포 생성에 대한 세부 정보와 iPSC 및 iPSC 유래 신경 및 신경교 세포를 포함한 다양한 세포 유형에서 여러 미토콘드리아 매개변수를 측정하는 새로운 유세포 분석 기반 접근 방식을 제공합니다. 이 프로토콜은 또한 유세포분석을 사용하여 미토콘드리아 부피, MMP, 미토콘드리아 ROS 수준, MRC 복합체 및 TFAM을 측정하기 위한 공동염색 전략을 제공합니다. 미토콘드리아 부피 또는 질량의 측정을 통합함으로써, 이러한 프로토콜은 또한 미토콘드리아 단위 당 총 수준과 특정 수준의 측정을 허용합니다.

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프로토콜

참고: 이 프로토콜에 사용된 모든 매체 및 솔루션의 레시피에 대해서는 재료 표 및 보충 표 S1 을 참조하십시오.

1. 인간 iPSC를 NCS, 도파민성(DA) 뉴런 및 성상세포로 분화

  1. 매트릭스 코팅 플레이트를 준비하십시오.
    1. 매트릭스 5mL가 담긴 바이알을 얼음에서 밤새 해동합니다. 1mL의 매트릭스를 차가운 고급 Dulbecco의 변형 된 독수리 배지 / Ham의 F-12 (고급 DMEM / F12) (1 % 최종 농도)로 희석하십시오. 1mL 분취량을 만들어 -20°C에서 보관합니다.
    2. 매트릭스 용액을 4°C에서 해동하고(차갑게 유지) 6웰(6웰 플레이트에서 웰당 1mL)을 코팅합니다.
    3. 매트릭스 코팅 플레이트를 37°C에서 가습된 5% CO2/95% 공기 인큐베이터에 1시간 동안 놓습니다. 인큐베이터에서 플레이트를 꺼내 실온 (RT)과 평형을 이루십시오.
      알림: 코팅 후 3일 이내에 플레이트를 사용하는 것이 좋습니다. 그러나, 코팅된 플레이트는 4°C에서 최대 2주 동안 저장될 수 있다. 사용하기 전에 꺼내서 RT로 예열하는 것을 잊지 마십시오. 장기간 보관하려면 매트릭스의 건조를 방지하기 위해 코팅된 플레이트에 1mL의 iPSC 배양 배지를 추가합니다.
  2. iPSC 해동
    1. 매트릭스 코팅 플레이트를 RT 또는 37°C의 인큐베이터에서 20-30분 동안 예열합니다. RT에서 필요한 양의 iPSC 배양 배지를 예열합니다.
    2. 예열된 iPSC 배양 배지 6mL를 Y-27632 ROCK 억제제 12μL와 혼합하여 최종 농도 10μM을 얻습니다.
    3. iPSCs의 냉동 바이알을 수조에서 37°C에서 작은 얼음 조각이 남을 때까지 부분적으로 해동합니다.
    4. 12μL의 ROCK 억제제와 함께 예열된 iPSC 배양 배지 1mL를 세포에 천천히 추가합니다. iPSC가 있는 바이알의 액체 함량을 5mL 피펫을 사용하여 6웰 사전 코팅된 플레이트의 한 웰에 적가합니다.
    5. 플레이트를 수직 방향으로 움직여 우물 내용물을 혼합하고 플레이트를 인큐베이터로 되돌립니다. Dulbecco의 인산염 완충 식염수(DPBS)(1x)(Ca 2+/Mg 2+-free)(6웰 플레이트에서 웰당 4mL)로 세척한 후24시간 후에 iPSC 배양 배지를 교체합니다.
      알림: 후속 급지에 ROCK 억제제를 첨가하지 마십시오. iPSC 배양 배지를 매일 교체하십시오.
  3. iPSC의 계대 배양
    1. 매트릭스 코팅 플레이트를 RT 또는 37°C의 인큐베이터에서 20-30분 동안 예열합니다. RT에서 필요한 양의 iPSC 배양 배지를 예열합니다.
    2. 세포를 함유하는 플레이트로부터 배양 배지를 흡인한다. iPSC를 DPBS(1x)(Ca 2+/Mg2+-free)(6웰 플레이트에서 웰당 4mL)로 헹굽니다.
    3. EDTA(0.5mM)(6웰 플레이트에서 웰당 1mL)를 추가합니다. 콜로니의 가장자리가 웰에서 들어 올려지기 시작할 때까지 플레이트를 37 ° C에서 배양합니다 (보통 3-5 분). EDTA를 흡인합니다.
    4. 예열된 iPSC 배양 배지(6웰 플레이트에서 웰당 4mL)를 추가하고 10mL 멸균 피펫을 사용하여 iPSC 콜로니를 한 번 강제로 분리합니다. 세포 덩어리가 단일 세포로 부서질 수 있으므로 위아래로 피펫팅하지 마십시오.
    5. 각 웰의 내용물을 매트릭스 코팅된 6-웰 플레이트(6-웰 플레이트에서 웰당 2mL)의 2개의 개별 웰로 옮기고 37°C에서 배양합니다. 피펫팅하는 동안 현탁액에 기포가 발생하지 마십시오.
      알림: 인큐베이터에 보관하기 전에 플레이트를 부드럽게 흔듭니다. 분할 비율은 1:2(하나의 웰을 2개의 새 웰로)에서 1:4(웰 하나를 4개의 새 웰로)일 수 있습니다.
    6. 식민지가 좋은 크기와 연결로 60 % 합류점에 도달 할 때까지 매일 배지를 교체하십시오.
  4. 신경 유도 및 신경 전구 생성
    1. 500mL의 화학적으로 정의된 배지(CDM), 500mL의 신경 유도 배지(NIM) 및 500mL의 신경 줄기 세포 무혈청(NSC SF) 배지를 준비합니다.
    2. 세포를 DPBS(1x)(Ca 2+/Mg2+-free)(6-웰 플레이트에서 웰당 4mL)로 헹구고 NIM(6-웰 플레이트에서 웰당 3mL)을 추가합니다. Day 0으로 설정합니다.
    3. 1일차, 3일째 및 4일째에 NIM(6웰 플레이트에서 웰당 3mL)을 교체하고 매일 현미경 검사로 관찰합니다.
    4. 5일째에 아래 설명된 대로 신경 로제트를 현탁액 배양으로 분리합니다.
      1. DPBS(1x)(Ca 2+/Mg2+-free)(6웰 플레이트에서 웰당 4mL)로 부드럽게 한 번 세척합니다. 콜라게나제 IV (6 웰 플레이트에서 웰 당 1mL)를 넣고 인큐베이터에서 1 분 동안 유지합니다. 콜라게나제 IV를 흡인하고 DPBS(1x)(6웰 플레이트에서 웰당 4mL)로 부드럽게 한 번 세척합니다.
      2. 웰당 2mL의 NSC SF 배지를 6웰 플레이트에 추가합니다. 200μL 피펫 팁을 사용하여 그리드를 그려 웰의 바닥을 긁어 세포를 분리합니다.
      3. 6-웰 플레이트로부터 세포 현탁액을 10cm 비부착성 접시에 모은다. NSC SF 배지로 부피를 12mL로 구성합니다.
      4. 응집을 방지하기 위해 인큐베이터의 궤도 셰이커에서 65-85rpm으로 부착되지 않은 접시를 흔듭니다.
  5. DA 뉴런 분화
    1. 7일째에 100ng/mL 섬유아세포 성장 인자-8b(FGF-8b)가 보충된 CDM 12mL를 넣고 인큐베이터의 안와 셰이커에 접시를 놓습니다.
    2. 8-13 일에 2 일마다 배지를 교체하고 매일 현미경 검사로 관찰하십시오.
    3. 14일째에 100ng/mL FGF-8b 및 1μM 푸르모르파민(PM)이 보충된 CDM 12mL를 추가합니다. 인큐베이터의 궤도 셰이커에 접시를 놓습니다.
    4. 15-20 일에 2 일마다 배지를 교체하고 매일 현미경으로 세포를 관찰하십시오.
    5. 더 큰 구를 분해하기 위해 1000μL 팁을 사용하여 구를 기계적으로 통과시킵니다.
      알림: 비율은 1:2일 수 있습니다(한 접시에서 2개의 새 요리로).
  6. 차별화 종료
    1. 6웰 플레이트 또는 커버슬립을 아래 설명된 대로 Poly-L-오르니틴(PLO) 및 라미닌으로 코팅합니다.
      1. 6-웰 플레이트를 웰당 1mL의 PLO로 코팅하고, 플레이트를 37°C에서 20분 동안 인큐베이션한다. PLO 용액을 흡인합니다.
      2. UV 하에서 플레이트를 20분 동안 소독합니다. DPBS(1x)(6웰 플레이트에서 웰당 4mL)로 웰을 두 번 헹굽니다.
      3. 5μg/mL 라미닌 용액(6웰 플레이트에서 웰당 1mL)을 웰에 넣고 37°C에서 2시간 동안 배양합니다. 라미닌을 흡입하고 플레이팅하기 전에 DPBS(1x)(6웰 플레이트에서 웰당 4mL)로 웰을 한 번 잠시 세척합니다.
    2. 50mL 튜브에 모든 구체(1.5.5단계)를 수집하고 DPBS(1x)를 채웁니다. 300× g 에서 5분 동안 회전합니다. 상청액을 흡인하십시오.
    3. 수조에서 37°C에서 10분 동안 2mL의 세포 해리 시약( 재료 표 참조)과 함께 배양한 후 200μL 피펫으로 부드럽게 분쇄합니다(거품 형성을 피하면서 구의 크기에 따라 20-50회).
    4. 세포 해리 시약을 10% 소 태아 혈청(FBS)으로 Dulbecco의 변형 독수리 배지(DMEM) 2mL로 중화하고 세포가 포함된 50mL 원추형 튜브를 RT에서 5 분 동안 300×g으로 원심분리합니다. 상청액을 흡인합니다.
    5. 10ng/mL 뇌 유래 신경영양 인자(BDNF) 및 10ng/mL 신경교 세포주 유래 신경영양 인자(GDNF)가 보충된 CDM 1mL를 추가하여 위아래로 부드럽게 피펫팅하여 세포 펠릿을 재현탁하여 단일 세포 현탁액을 얻습니다.
    6. 플레이트에서 라미닌 용액을 흡입하고(단계 1.6.1.3), DPBS(1x)(6웰 플레이트에서 웰당 4mL)로 간단히 세척하고, 10ng/mL BDNF 및 10ng/mL GDNF가 보충된 3mL의 CDM에 미리 코팅된 플레이트 또는 커버슬립에 세포를 시드합니다(단계 1.6.5에서). 4 일마다 세포를 먹이십시오.
      참고: 차별화 문화는 몇 주에서 최대 3개월 동안 유지할 수 있습니다. 신경 형태는 일반적으로 종료 후 2주 후에 나타나며 그 시점부터 다운스트림 분석에 사용할 수 있습니다. BDNF 및 GDNF는 더 긴 유지 관리 (최대 2 개월)를 위해 배양에 필요하지 않습니다.
  7. NSC 생성
    1. 코트 매트릭스 플레이트.
    2. 50mL 튜브에 모든 신경구(1.4단계에서 생성됨)를 수집하고 DPBS(1x)(Ca 2+/Mg2+-free)를 채웁니다. 300 × g 에서 5 분 동안 회전하십시오. 상청액을 흡인하십시오.
    3. 펠릿을 수조에서 37°C에서 10분 동안 2mL의 세포 해리 시약과 함께 배양한 다음 200μL 피펫으로 부드럽게 분쇄합니다(기포 형성을 피하면서 구의 크기에 따라 20-50회).
    4. 10% FBS로 2mL의 DMEM으로 중화하고 RT에서 5분 동안 300× g 의 세포가 포함된 50mL 원추형 튜브를 원심분리합니다. 상청액을 흡인합니다. 단일 세포 현탁액을 얻기 위해 위아래로 부드럽게 피펫팅하여 세포 펠릿을 재현탁합니다.
    5. 사전 코팅된 플레이트에서 매트릭스 용액을 흡인하고 NSC SF 배지(6웰 플레이트에서 웰당 3mL)에서 프리코팅된 플레이트의 세포를 시드합니다. 2-3 일마다 세포를 먹이고 합류 할 때 세포를 나눕니다.
      참고: 이 단계부터 NSC를 확장하고 동결할 수 있습니다.
  8. 아교 세포 분화
    1. NSC에서 성상 세포 분화
      1. 500mL의 성상 세포 분화 배지를 준비합니다.
      2. NSC SF 배지로 폴리 -D- 라이신 (PDL) 코팅 플레이트 / 커버 슬립에 NSC를 시드합니다.
      3. 다음 날, 세포를 DPBS(1x)(Ca 2+/Mg2+-free)(6웰 플레이트에서 웰당 4mL)로 헹구고 성상세포 분화 배지(6웰 플레이트에서 웰당 3mL)를 추가합니다. Day 0으로 설정합니다.
      4. 매일 현미경으로 NSC를 관찰하고 1일부터 27일까지 2일마다 성상세포 분화 배지(6웰 플레이트에서 웰당 3mL)를 교체합니다.
    2. 성상 세포 성숙
      1. 성상 세포 성숙 배지를 준비하십시오.
      2. 28일째에 세포를 DPBS(1x)(6웰 플레이트에서 웰당 4mL)로 헹구고 성상세포 성숙 배지(6웰 플레이트에서 웰당 3mL)를 추가합니다.
      3. 29일 이후에는 매일 현미경으로 세포를 관찰하고 2일마다 성상세포 성숙 배지(6웰 플레이트에서 웰당 3mL)를 교체합니다.
      4. 성숙 1 개월 후, 세포를 확장하고이 단계부터 냉동 보존하십시오.
        참고: 이 단계에서는 셀 수가 증가합니다. 세포를 분할 할 때, PDL 코팅 커버 슬립은 배양에 필요하지 않습니다.

2. 면역세포화학 및 면역형광염색에 의한 세포 특성 분석

  1. 배양 기간이 끝나면 세포와 함께 커버 슬립을 12 웰 플레이트로 옮깁니다.
    세포를 인산염 완충 식염수(PBS)(1x)로 2회 헹구고 RT에서 4% 파라포름알데히드(PFA)(12웰 플레이트에서 웰당 0.5mL)에서 10분 동안 배양합니다.
    참고: 고정된 샘플은 2mL의 PBS(1x)로 덮고 면역 염색에 필요할 때까지 4°C에서 보관할 수 있습니다. PFA는 독성이 있으며 암을 유발하는 것으로 의심됩니다. 피부와 눈에 노출되는 것을 방지하고 화학 흄 후드 아래에서 작업하십시오.
  2. 세포를 차단 및 투과화하고, PBS(1x), 0.3% 트리톤 X-100, 및 10% 정상 염소 혈청을 함유하는 블로킹 완충액과 함께 RT에서 1시간 동안 인큐베이션한다.
  3. 항-옥타머-결합 전사 인자 4(Oct4) 및 항-단계 특이적 배아 항원-4(SSEA4)를 갖는 iPSC, 항-성 결정 영역 Y 박스-2(Sox2) 및 항-네스틴을 갖는 NSC, 항-쌍을 이루는 박스-6(Pax6) 및 항-네스틴을 갖는 신경구체, 항-신경교세포-섬유소 산성 단백질(GFAP) 및 항-S100 칼슘-결합 단백질 β(S100β)을 갖는 성상세포, 항-티로신 하이드록실라제(TH)를 갖는 DA 뉴런을 염색하고, 항-β III 튜불린(Tuj 1), 항-시냅토피신 및 항-PSD-95(12웰 플레이트에서 웰당 1차 항체 용액 0.5mL, 자세한 내용은 재료 표 참조).
  4. 샘플을 PBS(1x)로 3회 10분 동안 부드럽게 흔들면서 세척합니다.
  5. 2차 항체 용액(블로킹 버퍼 중 1:800, 12웰 플레이트에서 웰당 Alexa Fluor 2차 항체 용액 0.5mL)과 함께 RT에서 부드럽게 흔들면서 1시간 동안 배양합니다.
  6. 세포를 PBS (1x) 중 Hoechst 33342 (12 웰 플레이트에서 웰 당 0.5 mL)로 RT에서 15 분 동안 배양하여 핵을 표지합니다.
  7. 세포를 장착 매체로 장착하고 RT에서 밤새 건조시켜 어둠 속에서 형광 현미경으로 이미징합니다. 현미경 설정 및 매개변수에 대해서는 보충 그림 S1 을 참조하십시오.

3. 살아있는 세포에서 미토콘드리아 부피, MMP 및 미토콘드리아 ROS의 유세포 분석 측정

  1. 세포가 50%-60% 컨플루언시에 도달할 때까지 6웰 플레이트의 4웰에 세포를 별도로 시드합니다. 이 네 개의 우물에 #1, #2, #3 및 #4라는 레이블을 지정합니다.
  2. 배양 기간이 끝나면 다음과 같이 5개의 개별 염색 용액(6웰 플레이트에서 웰당 500μL)을 준비합니다: #1 전용 배양 배지(대조군을 위한 세포만을 포함하는 웰 #1); FCCP (100 μM)를 포함하는 # 2-1; 배양 배지에 FCCP (100 μM) + TMRE (100 nM) + MTG (150 nM)를 함유하는 #2-2; TMRE (100 nM) + MTG (150 nM)를 함유하는 #3 배지; #4는 10% FBS를 가진 PBS(1x) 중 미토삭스 레드(10μM) + MTG(150nM)를 함유합니다. 이러한 화합물 및 유세포분석 설정에 대한 자세한 내용은 그림 1A, 보충 표 S2 및 재료 표를 참조하십시오.
    알림: 배양 배지를 사용하여 염색 용액을 준비하십시오. 사용하기 전에 RT에서 배지와 PBS(1x)를 예열하십시오. FCCP는 독성이 있습니다. 피부와 눈의 노출을 방지하고 화학 흄 후드 아래에서 작업하십시오.
  3. #2 웰에서 배지를 흡입하고 #2-1 용액을 추가합니다(FCCP만 해당). 세포를 37°C에서 10분 동안 배양합니다.
  4. #2 및 #3 웰에서 배지를 흡입하고 #2 웰에 #2-2 용액(FCCP + TMRE + MTG)을 추가하고 #3 웰에 #3 용액(TMRE + MTG)을 추가합니다. 세포를 37°C에서 45분 동안 배양한다.
  5. #4 웰에서 배지를 흡입하고 #4 용액(MitoSox Red + MTG)을 추가합니다. 세포를 37°C에서 15분 동안 배양한다.
  6. 모든 우물에서 매체를 흡인하십시오. PBS(1x)(6웰 플레이트에서 웰당 4mL)로 세척합니다. 37°C에서 5분 동안 1mL의 세포 해리 시약(6웰 플레이트에서 웰당 1mL)을 사용하여 세포를 분리합니다. 1mL의 DMEM에서 세포 해리 시약을 10% FBS(6웰 플레이트에서 웰당 2mL)로 중화합니다.
  7. 15mL 원추형 튜브에 모든 웰의 내용물을 수집합니다. 튜브를 300×g에서 5 분 동안 원 심분리합니다. 펠릿을 PBS(1x)로 한두 번 씻습니다.
  8. 상청액을 흡입하되 튜브에 약 100μL를 남겨 둡니다. 세포 펠릿을 300μL의 PBS(1x)에 재현탁시킨다. 세포를 1.5mL 마이크로 원심분리 튜브로 옮깁니다. RT에서 튜브를 어둠 속에 보관하십시오.
  9. 유세포 분석기 (3 개의 파란색 및 1 개의 빨간색 레이저 구성)를 사용하여 세포를 분석합니다. 530/30 대역통과 필터를 사용하여 필터 1(FL1)에서 MTG, 대역통과 필터 585/40을 사용하여 필터 2(FL2)의 TMRE, 510/580 대역통과 필터를 사용하여 필터 3(FL3)에서 MitoSox Red를 검출합니다.

4. 고정 세포에서 MRC 복합체 서브유닛 및 TFAM의 유세포분석 측정

  1. 배양 기간이 끝나면 세포 해리 시약을 추가하여 세포를 분리합니다 (~ 106). 그런 다음 펠릿을 넣고 15mL 튜브에서 세포를 수집합니다. PBS(1x)로 원심분리하여 세포를 300 ×g에서 5분 동안 2회 원심분리하여 세척한다.
  2. 세포를 RT에서 10분 동안 1.6% PFA(15mL 튜브에 1.6% PFA 1mL)에 고정합니다. PBS(1x)로 원심분리하여 세포를 300 ×g에서 5분 동안 2회 원심분리하여 세척한다.
  3. -20°C에서 20분 동안 얼음처럼 차가운 90% 메탄올(15mL 튜브에 90% 메탄올 1mL)로 세포를 투과시킵니다.
  4. PBS (1x) 중 분획 V(15mL 튜브 중 블로킹 완충액 1mL)-0.3M 글리신, 5% 염소 혈청 및 1% 소 혈청 알부민(BSA)을 함유하는 블로킹 완충액에서 샘플을 차단한다. 세포를 PBS(1x)로 원심분리하여 세포를 2회 세척한다(단계 3.7에서와 같이).
  5. 복합체 I 서브유닛의 측정을 위한 항-NDUFB10 (1:1,000), 콤플렉스 II 서브유닛의 측정을 위한 항숙시네이트 탈수소효소 복합체 플라보단백질 서브유닛 A (SDHA, 1:1,000) 및 콤플렉스 IV 서브유닛의 측정을 위한 항-COX IV (1:1,000), 및 Alexa Fluor 488 (1:400)과 접합된 항-TFAM 항체. Alexa Fluor 488(1:400)과 접합된 anti-TOMM20 항체로 동일한 수의 세포를 30분 동안 별도로 염색합니다(15mL 튜브에 1차 항체 용액 1mL, 항체에 대한 자세한 내용은 재료 표 참조).
  6. 세포를 PBS(1x)로 한 번 세척하고 300× g 에서 5분 동안 원심분리합니다. NDUFB10, SDHA 및 COX IV의 튜브에 2차 항체(1:400)를 추가하고 이러한 용액으로 세포를 30분 동안 배양합니다.
  7. 세포를 PBS(1x)로 300×g에서 5 분 동안 원 심분리하여 한 번 세척합니다. 상청액을 흡인하여 튜브에 약 100μL를 남깁니다. 세포 펠릿을 300μL의 PBS(1x)에 재현탁시킨다. 얼음 위의 어두운 곳에 보관된 1.5mL 미세 원심분리 튜브로 세포를 옮깁니다.
  8. 유세포 분석기에서 세포를 분석합니다 (3 개의 파란색 및 1 개의 빨간색 레이저 구성). 530/30 대역통과 필터를 사용하여 필터 1(FL1)에서 신호를 검출합니다. 현미경 설정 및 매개변수에 대해서는 보충 그림 S2 를 참조하십시오.

5. 유세포 분석 획득 및 분석

  1. 염색되지 않은 컨트롤 튜브를 사용하여 분석된 세포 집단의 크기와 복잡성을 기반으로 전방 산란 영역(FSC-A) 및 측면 산란 영역(SSC-A) 산점도를 설정합니다. 현미경 설정 및 매개변수에 대해서는 보충 그림 S2 를 참조하십시오.
    참고: 개별 세포 유형에 대해 염색되지 않은 컨트롤을 설정합니다.
  2. 비염색 제어 튜브를 사용하여 포지티브 게이트를 선택하고 단색 제어 튜브를 사용하여 다색 유세포분석에서 MTG(형광단-1[FL-1])와 TMRE(FL-2) 간의 형광 스펙트럼 중첩을 보정합니다. 음성 대조군에 이소타입 제어를 사용하여 MRC 및 TFAM 샘플의 배경 염색을 모니터링합니다. FCCP 튜브를 TMRE 염색을 위한 탈분극 제어로 사용하십시오.
  3. 외부 파편을 차단하여 전방 및 측면 산점도에서 살아있는 세포와 주 게이팅을 선택합니다(그림 2A). 전방 산란 높이(FSC-H) 대 FSC-A 밀도 플롯을 사용하여 이중선을 게이트 아웃하여 더블릿을 제외하고 측면 산란 높이(SSC-H) 대 SSC-A 플롯을 구성합니다(그림 2A).
  4. 데이터 수집(유세포분석기)
    1. 염색되지 않은 또는 이소타입 샘플을 음성 대조군으로 사용하여 SSC-A 및 다양한 필터(FL1, FL2, FL3, FL4)를 보면서 단일 세포 이벤트의 주요 집단 위에 게이트를 만듭니다(그림 1B 및 그림 2B).
  5. 데이터 분석 (CFlow 소프트웨어)
    1. 게이트의 위치를 염색된 세포 샘플 상에 복사하고, 양성 염색을 위해 양성으로 염색된 세포의 양을 기록한다.
    2. 각 세포 부분모집단에 대해 히스토그램 플롯을 선택하고 다양한 필터 채널(FL1, FL2, FL3, FL4)(x축)의 중간 형광 강도(MFI)를 분석합니다.
      1. 아래의 식 (1)과 같이 히스토그램의 #3 TMRE 염색 샘플에서 FL2의 MFI로부터 #2 FCCP 처리된 세포의 FL2의 MFI를 빼서 TMRE 수준을 계산한다.
        TMRE 수준 = #3 TMRE-염색된 샘플에서 추출한 FL2의 MFI - #2 FCCP 처리된 세포의 FL2의 MFI (1)
      2. MMP 및 미토콘드리아 ROS에 대한 특정 값을 TMRE 또는 MitoSox Red에서 MFI로 계산하여 미토콘드리아 부피 지시지 MTG로 나눕니다.
      3. 복소수 표현식 또는 TFAM에서 MFI를 사용하여 복소 서브유닛 및 TFAM에 대한 특정 값을 계산하고 미토콘드리아 부피 지표 TOMM20을 나눕니다.

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결과

분화 방법 및 유세포 분석 전략에 대한 개략적인 설명이 그림 3에 나와 있습니다. 인간 iPSC는 신경 로제트로 분화된 다음 신경 영역으로 분화하기 위해 서스펜션 배양으로 들어 올려집니다. 신경 영역은 DA 뉴런으로 더욱 분화되고 성숙됩니다. 신경 구체는 단일 세포로 해리되어 신경교 성상 세포를 생성하고 NSC로 단층으로 재 도금 된 다음 성상 세포로 분화됩니다. 이 프로토...

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토론

본원에는 iPSC 유래 뉴런 및 성상세포를 생성하고 유세포분석을 사용하여 미토콘드리아 기능의 여러 측면을 평가하기 위한 프로토콜이 있습니다. 이러한 프로토콜을 통해 인간 iPSC를 뉴런과 신경교 성상 세포로 효율적으로 변환하고 대부분 살아있는 세포에서 미토콘드리아 기능을 자세히 특성화할 수 있습니다. 이 프로토콜은 또한 살아있는 세포의 부피, MMP 및 미토콘드리아 ROS 수준과 고정 세포?...

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공개

저자는 공개 할 이해 상충이 없습니다.

감사의 말

노르웨이 베르겐 대학교의 분자 이미징 센터와 유세포 분석 핵심 시설에 감사드립니다. 이 연구는 노르웨이 연구위원회 (보조금 번호 : 229652), Rakel og Otto Kr.Bruuns legat 및 중국 장학위원회 (프로젝트 번호 : 201906220275)의 자금으로 지원되었습니다.

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자료

NameCompanyCatalog NumberComments
anti-Oct4Abcamab19857, RRID:AB_445175Primary Antibody; use as 1:100, 10 μL in 1000 μL staining solution; use Alexa Fluor ® 488 goat anti-rabbit IgG  (1:400, Thermo Fisher Scientific, Catalog # A-11008) as secondary antibody.
anti-SSEA4Abcamab16287, RRID:AB_778073Primary Antibody; use as 1:100, 10 μL in 1000 μL staining solution; use Alexa Fluor ® 594 goat anti-mouse IgG (1:800, Thermo Fisher Scientific, Catalog # A-11005) as secondary antibody.
anti-Sox2Abcamab97959, RRID:AB_2341193Primary Antibody; use as 1:100, 10 μL in 1000 μL staining solution; use Alexa Fluor ® 488 goat anti-rabbit IgG  (1:400, Thermo Fisher Scientific, Catalog # A-11008) as secondary antibody.
anti-Pax6Abcamab5790, RRID:AB_305110Primary Antibody; use as 1:100, 10 μL in 1000 μL staining solution; use Alexa Fluor ® 488 goat anti-rabbit IgG  (1:400, Thermo Fisher Scientific, Catalog # A-11008) as secondary antibody.
anti-NestinSanta Cruz Biotechnologysc-23927, RRID:AB_627994Primary Antibody; use as 1:50, 20 μL in 1000 μL staining solution; use Alexa Fluor ® 594 goat anti-mouse IgG (1:800, Thermo Fisher Scientific, Catalog # A-11005) as secondary antibody.
anti-GFAPAbcamab4674, RRID:AB_304558Primary Antibody; use as 1:100, 10 μL in 1000 μL staining solution;  use Alexa Fluor ® 594 goat anti-chicken IgG (1:800, Thermo Fisher Scientific, Catalog # A-11042) as secondary antibody.
anti-S100β  conjugated with Alexa Fluor 488Abcamab196442, RRID:AB_2722596Primary Antibody; use as 1:400, 2.5 μL in 1000 μL staining solution;
anti-THAbcamab75875, RRID:AB_1310786Primary Antibody; use as 1:100, 10 μL in 1000 μL staining solution; use Alexa Fluor ® 488 goat anti-rabbit IgG  (1:400, Thermo Fisher Scientific, Catalog # A-11008) as secondary antibody.
anti-Tuj 1Abcamab78078, RRID:AB_2256751Primary Antibody; use as 1:1000, 1 μL in 1000 μL staining solution; use Alexa Fluor ® 594 goat anti-mouse IgG (1:800, Thermo Fisher Scientific, Catalog # A-11005) as secondary antibody.
anti-SynaptophysinAbcamab32127, RRID:AB_2286949Primary Antibody; use as 1:100, 10 μL in 1000 μL staining solution; use Alexa Fluor ® 488 goat anti-rabbit IgG  (1:400, Thermo Fisher Scientific, Catalog # A-11008) as secondary antibody.
anti-PSD-95Abcamab2723, RRID:AB_303248Primary Antibody; use as 1:100, 10 μL in 1000 μL staining solution;  use Alexa Fluor ® 594 goat anti-chicken IgG (1:800, Thermo Fisher Scientific, Catalog # A-11042) as secondary antibody.
anti-TFAM conjugated with Alexa Fluor 488Abcamab198308Primary Antibody; use as 1:400, 2.5 μL in 1000 μL staining solution; use mouse monoclonal IgG2b  Alexa Fluor® 488 as an isotype control.
anti-TOMM20 conjugated with Alexa Fluor 488Santa Cruz BiotechnologyCat# sc-17764 RRID:AB_628381Primary Antibody; use as 1:400, 2.5 μL in 1000 μL staining solution; use mouse monoclonal IgG2a  Alexa Fluor® 488 as an isotype control.
anti-NDUFB10Abcamab196019Primary Antibody; use as 1:1000, 1 μL in 1000 μL staining solution; use Alexa Fluor ® 488 goat anti-rabbit IgG  (1:400, Thermo Fisher Scientific, Catalog # A-11008) as secondary antibody; use rabbit monoclonal IgG as an isotype control.
anti-SDHAAbcamab137040Primary Antibody; use as 1:1000, 1 μL in 1000 μL staining solution;  use Alexa Fluor ® 488 goat anti-rabbit IgG  (1:400, Thermo Fisher Scientific, Catalog # A-11008) as secondary antibody; use rabbit monoclonal IgG as an isotype control.
anti-COX IVAbcamab14744, RRID:AB_301443Primary Antibody; use as 1:1000, 1 μL in 1000 μL staining solution; use  Alexa Fluor ® 488 goat anti-mouse IgG  (1:400, Thermo Fisher Scientific, Catalog # A-11001) as secondary antibody; use mouse monoclonal IgG as an isotype control.
Activin APeproTech120-14EAstrocyte differentiation medium ingredient
ABM Basal MediumLonzaCC-3187Basal medium for astrocyte culture
AGM SingleQuots Supplement PackLonzaCC-4123Supplement for astrocyte culture
Antibiotic-AntimycoticThermo Fisher Scientific15240062CDM ingredient
Advanced DMEM/F-12Thermo Fisher Scientific12634010Basal medium for dilute Geltrex
Bovine Serum AlbuminEuropa BioproductsEQBAH62-1000Blocking agent to prevent non-specific binding of antibodies in immunostaining assays and CDM ingredient
BDNFPeproTech450-02DA neurons medium ingredient
B-27 SupplementThermo Fisher Scientific17504044Astrocyte differentiation medium ingredient
BD Accuri C6 Plus Flow CytometerBD Biosciences, USA
Chemically Defined Lipid ConcentrateThermo Fisher Scientific11905031CDM ingredient
Collagenase IVThermo Fisher Scientific17104019Reagent for gentle dissociation of human iPSCs
CCD Microscope Camera Leica DFC3000 GLeica Microsystems, Germany
Corning non-treated culture dishesSigma-AldrichCLS430589Suspension culture
DPBSThermo Fisher Scientific14190250Used for a variety of cell culture wash
DMEM/F-12, GlutaMAX supplementThermo Fisher Scientific10565018Astrocyte differentiation basal Medium
EDTAThermo Fisher Scientific15575020Reagent for gentle dissociation of human iPSCs
Essential 8 Basal MediumThermo Fisher ScientificA1516901Basal medium for iPSC culture
Essential 8 Supplement (50X)Thermo Fisher ScientificA1517101Supplement for iPSC culture
EGF Recombinant Human ProteinThermo Fisher ScientificPHG0314Supplement for NSC culture
FGF-basic (AA 10–155) Recombinant Human ProteinThermo Fisher ScientificPHG0024Supplement for NSC culture
Fetal Bovine SerumSigma-Aldrich12103CMedium ingredient
FGF-basicPeproTech100-18BAstrocyte differentiation medium ingredient
FCCPAbcamab120081Eliminates mitochondrial membrane potential and TMRE staining
Fluid aspiration system BVC controlVacuubrand, Germany
Formaldehyde (PFA) 16%Thermo Fisher Scientific28908Cell fixation
GeltrexThermo Fisher ScientificA1413302Used for attachment and maintenance of human iPSCs
GlutaMAX SupplementThermo Fisher Scientific35050061Supplement for NSC culture
GDNFPeprotech450-10DA neurons medium ingredient
GlycineSigma-AldrichG8898Used for blocking buffer
Ham's F-12 Nutrient MixThermo Fisher Scientific31765027Basal medium for CDM
Heregulin beta-1 humanSigma-AldrichSRP3055Astrocyte differentiation medium ingredient
Hoechst 33342Thermo Fisher ScientificH1399Stain the nuclei for confocal image
Heracell 150i CO2 IncubatorsFisher Scientific, USA
IMDMThermo Fisher Scientific21980032Basal medium for CDM
InsulinRoche1376497CDM ingredient
InSolution AMPK InhibitorSigma-Aldrich171261Neural induction medium ingredient
Insulin-like Growth Factor-I humanSigma-AldrichI3769Astrocyte differentiation medium ingredient
KnockOut DMEM/F-12 mediumThermo Fisher Scientific12660012Basal medium for NSC culture
LamininSigma-AldrichL2020Promotes attachment and growth of neural cells in vitro
Leica TCS SP8 STED confocal microscopeLeica Microsystems, Germany
MonothioglycerolSigma-AldrichM6145CDM ingredient
MitoTracker Green FMThermo Fisher ScientificM7514Used for mitochondrial volume indicator
MitoSox RedThermo Fisher ScientificM36008Used for mitochondrial ROS indicator
N-Acetyl-L-cysteineSigma-AldrichA7250Neural induction medium ingredient
N-2 SupplementThermo Fisher Scientific17502048Astrocyte differentiation medium ingredient
Normal goat serumThermo Fisher ScientificPCN5000Used for blocking buffer
Orbital shakers - SSM1Stuart Equipment, UK
Poly-L-ornithine solutionSigma-AldrichP4957Promotes attachment and growth of neural cells in vitro
Poly-D-lysine hydrobromideSigma-AldrichP7405Promotes attachment and growth of neural cells in vitro
PurmorphamineSTEMCELL Technologies72204Promotes DA neuron differentiation
ProLong Gold Antifade MountantThermo Fisher ScientificP36930Mounting the coverslip for confocal image
PBS 1xThermo Fisher Scientific18912014Used for a variety of wash
Recombinant Human/Mouse FGF-8b ProteinR&D Systems423-F8-025/CFPromotes DA neuron differentiation
SB 431542Tocris BioscienceTB1614-GMPNeural Induction Medium ingredient
StemPro Neural SupplementThermo Fisher ScientificA10508-01Supplement for NSCs culture
TrypLE Express EnzymeThermo Fisher Scientific12604013Cell dissociation reagent
TransferrinRoche652202CDM ingredient
TRITON X-100VWR International9002-93-1Used for cells permeabilization in immunostaining assays
TMREAbcamab113852Used for mitochondrial membrane potential staining
Water Bath Jb Academy Basic Jba5 JBA5 Grant InstrumentsGrant Instruments, USA

참고문헌

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