이 작품은 세인트 조셉 재단 (AJF, LJI)과 미국 폐 협회, RG-224607-N (LJI)에서 교부금에 의해 지원되었다.

1. 셀 라인의 유지 보수 <ol><li> 불후의 성격 효소 (TERT) 단백질 11 반대로 인간 텔로 머라 아제의 안정적인 형질 전환에 의해 고급 이형성 (CP-B, CP-C, CP-D) 및 화생이 있으면서 (CP-A) 세포주합니다. </li><li> 유지 세포 소 뇌하수체 추출물 (BPE), 표피 성장 인자 (EGF), 5 % 태아 소 혈청 (FBS), 비 필수 아미노산 (NEAA), 페니실린 - 스트렙토 마이신-네오 마이신 (PSN)로 보충 각질 미디어 라인 및 표준 BE 조직 배양 조건 (37 ° C에서 5 % CO 2, 98 % 습도). </li></ol> 2. 셀 도금하고있다 <ol><li> 12 - 웰 플레이트 / 커버 슬립의 제조. 유리 페트리 접시와 오토 클레이브에 18mm 커버 슬립을 놓습니다. 전송 진공관에 부착 멸균 유리 피펫을 사용하여 12 - 웰 조직 배양 접시에 18mm 유리 커버 슬립을 멸균. 멸균 PBS 및 미디어 커버 슬립을 씻으십시오. </li><li> 를 Trypsinize 및 불후의 BE 세포를 계산합니다. 세포 USI를 계산자동 셀 카운터 또는 혈구를 겨. 20,000-40,000 세포 / ml의 농도로 배양 배지에서 세포를 희석. </li><li> 각이 잘 20,000-40,000 세포 / 웰의 총 세포 수에 대한 커버 슬립을 포함에 세포를 1 ㎖를 놓습니다. </li><li> 부드럽게 세포가 커버 슬립에 부착하도록 우물의 바닥에 커버 슬립을 밀어 멸균 피펫 팁을 사용합니다. </li></ol> BE 세포의 3. 약물 치료 <ol><li> 원하는 농도로 따뜻한 (37 ℃) 매체 선택 약을 희석 반복 튜브를 반전 또는 와류 믹서를 사용하여 잘 섞는다. 경험적으로 결정 약물 농도. 커버 슬립에 대한 세포의 부착을 허용하는 BE 세포의 초기 시딩 다음 치료 24 시간을 시작합니다 </li><li> 비교 및 제어를 위해, 배양 배지에 희석 0.1 % 차량 (디메틸 설폭 사이드 [DMSO] 또는 대리인이 화합물을 용해하는 데 사용)과 함께 세포의 추가 커버 슬립을 취급합니다. 약을 확인하고 Ve에 대한 실험실 펜 라벨 판차 량은 샘플을 처리. 37 ° C, 5 % CO 2, 98 %의 습도로 설정 세포 배양 인큐베이터에 세포를 넣고 원하는 시점에 품어. </li></ol> 4. 면역 형광 염색법 <ol><li> 정착 <ol><li> 약물 치료의 원하는 배양 시간에 따라, 미디어를 대기음 실온 (RT, 25 ° C)에서 1X 인산염 완충 생리 식염수 (PBS)으로 신속하게 커버 슬립을 씻는다. </li><li> PBS를 대기음도 각각 4 % PFA [4 % PFA / PBS를 함유하는 PBS 1 ㎖를 추가하고 실온에서 30 분 동안 배양한다. </li><li> 4 % PFA / PBS를 대기음 RT에서 PBS와 coverslips는 3 배, 5 분마다 씻어. 원하는 경우 4 ° C에서 PBS/0.1의 % PFA에 일 주일간 매장의 coverslips. </li></ol></li><li> Permeabilization / 차단 항체가 세포 내 표적 액세스 할 수 있도록 고정 PFA 세포를 투과. 세포는 단백질 표면의 경우, 1X의 PBS/0.5의 %의 BSA 용액에 첨가 사포닌하지 않고 이후의 모든 단계를 수행합니다. <ol><li> 실온에서 10 분 동안 PBS에 희석하는 50 mM NH 4 망할 CIA와 함께 배양하여 배경을 줄이고 5 분 동안 한 번 RT PBS로 세척. </li><li> 0.1 % 사포닌 및 0.5 % 소 혈청 알부민 (BSA)을 함유하는 PBS의 100-300 μL에 30 분 동안 BE 세포를 배양한다. , 필터 살균 10 %의 주식에서 사포닌을 희석 물을 준비하고 4 ℃에서 저장 </li></ol> 참고 :이 0.5 % BSA의 첨가에 의한 커버 슬립을 차단하여 세포 단백질에 대한 항체의 비특이적 결합 방지 할 수 있습니다. 또한, 항체의 비특이적 결합을 줄이기 위해 5 %로 희석 염소 혈청과 BSA를 대체합니다. </li><li> 인간의 상공 회의소의 준비 <ol><li> 젖은 종이 타월 챔버의 바닥을 적층하여 사각형 생물 검정 접시를 준비하고 위에 파라 필름의 층을 배치합니다. </li><li> 부드럽게 겸자 및 주사기 바늘을 이용하여 파라 필름 상으로 향하도록 커버 슬립, 세포를 옮긴다. </li><li> 커버 슬립을 식별 할 수있는 실험실 펜으로 파라 필름을 표시합니다. </li></ol></li><li>일차 항체 배양 <ol><li> 0.5 % BSA 및 0.1 % 사포닌을 모두 함유하는 PBS에 일차 항체를 희석. </li><li> 부드럽게 실험실 조직을 사용하여 차단 솔루션을 몰아 내고 차 항체 용액 100 μl를 추가합니다. 4 ℃에서 하룻밤 BE 세포의 일차 항체를 품어 </li></ol></li><li> 차 항체 보육 <ol><li> 슬라이드는 RT에서 5 분마다 PBS/0.5 %의 BSA/0.1 %의 사포닌으로 3 배 씻으십시오. </li><li> 차 항체는 일차 항체가 발생되었을 때의 종을 인식 PBS/0.5 %의 BSA/0.1 %의 사포닌에 형광 태그로 복합 이차 항체를 희석. </li><li> 각 coverslip에 희석 항체의 100 μl를 추가합니다. 실온에서 2 시간 동안 차 항체를 품어. </li></ol></li><li> 세척 및 Coverslips는 실장 <ol><li> PBS/0.5 %의 BSA/0.1 %의 사포닌에 coverslips는 3 배, 5 분마다 씻으십시오. 세척 버퍼를 제거하고 커버 슬립에 PBS의 100 ~ 300 μl를 추가합니다. 참고 : 더블 안티 들어몸의 얼룩, 반복 토론에 나와있는 정보에 따라 원하는 추가 기본 및 보조 항체 4.4-4.5 단계를 반복합니다. </li><li> 집게를 사용하여 부드럽게 커버 슬립을 들어 올려 실험실 조직이나 종이 타월을 사용하여 PBS를 얼룩. </li><li> 유리 현미경 슬라이드에 세포 아래로, 커버 슬립에 4를 포함하는 적절한 안티 페이드 설치 미디어 &#39;-1,6 - diamidino -2 - 페닐 인돌 (DAPI)의 15 μl를 추가하고, 커버 슬립을 반전. </li><li> 슬라이드 폴더에 슬라이드를 삽입하고 하드 설정 반대로 페이드 매체는 치료 할 수 있도록 RT에서 하룻밤 직사 빛에서 배양, 제조 업체의 지침에 따라. 반대로 페이드 매체가 설정되면, 슬라이드는 현미경 가시화 될 때까지 C ° 4 °의 C 또는 -20 하나에 저장할 수 있습니다. </li></ol></li></ol> Coverslips는 5. 현미경 시각화 염색 된 세포는 공 초점 현미경 또는 하나를 통해 이미지화 할 수있는 경우 가능한 수직 microscop전자. 공 초점 현미경은 불연속 깊이에 고해상도 이미지를 제공하지만, 직립 현미경 빠르고 유용한 이미지를 생산할 수있다. 간결하게, 영상의 방법은 표준 현미경을 제시하여 셀 BE 스테인드. 일반적으로 이미지 형광 이소 티오 시아 네이트 (FITC) 또는 유사한 형광 물질 (즉, 녹색 형광 단백질)로, 텍사스 레드와 DAPI,이 형광 물질을 구별 할 수있는 필터를 사용하여 현미경이 필요합니다. 호환 형광을 결정하는 프로토콜을 시작하기 전에 현미경을 확인합니다. <ol><li> 표준 IF 현미경 영상 <ol><li> -20 ° C ~ 4 ° C에서 저장 슬라이드 / 커버 슬립을 제거하고 실내 온도를 따뜻하게 할 수 있습니다. 현미경 및 수은 아크 램프의 전원을 켭니다. </li><li> 커버 슬립이 현미경 무대에 목표를 향과 현미경 슬라이드를 놓습니다. 오일 침지 목적의 사용을 위해, 커버 슬립 상에 침지 기름 방울을 추가한다. </li><li> DAPI 필터를 선택하고 셔터를 엽니 다. </li&gt; <li> 이미지가 나타날 때까지 접안 렌즈를 통해보고하는 동안 목표를 초점을 맞 춥니 다. 모든 셀 DAPI로 염색되므로, 핵은 쉽게 관찰되어야한다. </li><li> 각각의 화상 처리 소프트웨어를 사용하여 이미지를 수집한다. </li></ol></li></ol>

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	<li>Reid, B. J., Li, X., Galipeau, P. C., Vaughan, T. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Barrett's+oesophagus+and+oesophageal+adenocarcinoma:+time+for+a+new+synthesis.">Barrett's oesophagus and oesophageal adenocarcinoma: time for a new synthesis.</a> Nat. Rev. Cancer. 10, 87-101 (2010).</li><li>Hayeck, T. J., Kong, C. Y., Spechler, S. J., Gazelle, G. S., Hur, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+prevalence+of+Barrett's+esophagus+in+the+US:+estimates+from+a+simulation+model+confirmed+by+SEER+data.">The prevalence of Barrett's esophagus in the US: estimates from a simulation model confirmed by SEER data.</a> Dis. Esophagus. 23, 451-457 (2010).</li><li>Brown, L. M., Devesa, S. S., Chow, W. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Incidence+of+adenocarcinoma+of+the+esophagus+among+white+Americans+by+sex,+stage,+and+age.">Incidence of adenocarcinoma of the esophagus among white Americans by sex, stage, and age.</a> J. Natl. Cancer Inst. 100, 1184-1187 (2008).</li><li>Konturek, P. C., Burnat, G., Hahn, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Inhibition+of+Barret's+adenocarcinoma+cell+growth+by+simvastatin:+involvement+of+COX-2+and+apoptosis-related+proteins.">Inhibition of Barret's adenocarcinoma cell growth by simvastatin: involvement of COX-2 and apoptosis-related proteins.</a> J. Physiol. Pharmacol. 58 Suppl 3, 141-148 (2007).</li><li>Peng, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glutathione+peroxidase+7+protects+against+oxidative+DNA+damage+in+oesophageal+cells.">Glutathione peroxidase 7 protects against oxidative DNA damage in oesophageal cells.</a> Gut. 61, 1250-1260 (2012).</li><li>Vona-Davis, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MAPK+and+PI3K+inhibition+reduces+proliferation+of+Barrett's+adenocarcinoma+in+vitro.">MAPK and PI3K inhibition reduces proliferation of Barrett's adenocarcinoma in vitro.</a> Surg. Res. 127, 53-58 (2005).</li><li>Inge, L. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=a+small+molecule+inhibitor+of+the+Src+kinase,+reduces+the+growth+and+activates+apoptosis+in+pre-neoplastic+Barrett's+esophagus+cell+lines:+evidence+for+a+noninvasive+treatment+of+high-grade+dysplasia.">a small molecule inhibitor of the Src kinase, reduces the growth and activates apoptosis in pre-neoplastic Barrett's esophagus cell lines: evidence for a noninvasive treatment of high-grade dysplasia.</a> Thoracic Cardiovasc. Surg. 145, 531-538 (2013).</li><li>Jovov, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ion+transport+and+barrier+function+in+a+telomerase-immortalized+human+nondysplastic,+Barrett's+cell+line+(BAR-T).">Ion transport and barrier function in a telomerase-immortalized human nondysplastic, Barrett's cell line (BAR-T).</a> Dis. Esophagus. 22, 386-395 (2009).</li><li>Merlo, L. M., Kosoff, R. E., Gardiner, K. L., Maley, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+in+vitro+co-culture+model+of+esophageal+cells+identifies+ascorbic+acid+as+a+modulator+of+cell+competition.">An in vitro co-culture model of esophageal cells identifies ascorbic acid as a modulator of cell competition.</a> BMC Cancer. 11, 461 (2011).</li><li>Zhang, H. Y., Hormi-Carver, K., Zhang, X., Spechler, S. J., Souza, R. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+benign+Barrett's+epithelial+cells,+acid+exposure+generates+reactive+oxygen+species+that+cause+DNA+double-strand+breaks.">In benign Barrett's epithelial cells, acid exposure generates reactive oxygen species that cause DNA double-strand breaks.</a> Cancer Res. 69, 9083-9089 (2009).</li><li>Palanca-Wessels, M. C. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Extended+lifespan+of+Barrett's+esophagus+epithelium+transduced+with+the+human+telomerase+catalytic+subunit:+a+useful+in+vitro+model.">Extended lifespan of Barrett's esophagus epithelium transduced with the human telomerase catalytic subunit: a useful in vitro model.</a> Carcinogenesis. 24, 1183-1190 (2003).</li><li>Kumble, S., Omary, M. B., Cartwright, C. A., Triadafilopoulos, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Src+activation+in+malignant+and+premalignant+epithelia+of+Barrett's+esophagus.">Src activation in malignant and premalignant epithelia of Barrett's esophagus.</a> Gastroenterology. 112, 348-356 (1997).</li><li>Inge, L. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=alpha-Catenin+overrides+Src-dependent+activation+of+beta-catenin+oncogenic+signaling.">alpha-Catenin overrides Src-dependent activation of beta-catenin oncogenic signaling.</a> Mol. Cancer Ther. 7, 1386-1397 (2008).</li><li>Coluccia, A. M. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=SKI-606+Decreases+Growth+and+Motility+of+Colorectal+Cancer+Cells+by+Preventing+pp60(c-Src)-Dependent+Tyrosine+Phosphorylation+of+&#946;-Catenin+and+Its+Nuclear+Signaling.">SKI-606 Decreases Growth and Motility of Colorectal Cancer Cells by Preventing pp60(c-Src)-Dependent Tyrosine Phosphorylation of &#946;-Catenin and Its Nuclear Signaling.</a> Cancer Res. 66, 2279-2286 (2006).</li><li>Nam, J. -. S., Ino, Y., Sakamoto, M., Hirohashi, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Src+Family+Kinase+Inhibitor+PP2+Restores+the+E-Cadherin/Catenin+Cell+Adhesion+System+in+Human+Cancer+Cells+and+Reduces+Cancer+Metastasis.">Src Family Kinase Inhibitor PP2 Restores the E-Cadherin/Catenin Cell Adhesion System in Human Cancer Cells and Reduces Cancer Metastasis.</a> Clin. Cancer Res. 8, 2430-2436 (2002).</li><li>Chu, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=p27+phosphorylation+by+Src+regulates+inhibition+of+cyclin+E-Cdk2.">p27 phosphorylation by Src regulates inhibition of cyclin E-Cdk2.</a> Cell. 128, 281-294 (2007).</li><li>Inge, L. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Soluble+E-cadherin+promotes+cell+survival+by+activating+epidermal+growth+factor+receptor.">Soluble E-cadherin promotes cell survival by activating epidermal growth factor receptor.</a> Exp. Res. 317, 838-848 (2011).</li><li>Gan, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differential+roles+of+ERK+and+Akt+pathways+in+regulation+of+EGFR-mediated+signaling+and+motility+in+prostate+cancer+cells.">Differential roles of ERK and Akt pathways in regulation of EGFR-mediated signaling and motility in prostate cancer cells.</a> Oncogene. 29, 4947-4958 (2010).</li></ol>

저자는 더 경쟁 재정적 이익이 없다는 것을 선언합니다.

우리는이 세포에 따라 타겟 요법의 생리적 효과를 해명으로 BE 세포의 IF를 적용하는 방법을 설명했다. 우리는 BE 세포 향한 이러한 절차의 사용을 설명하는 동안, 우리는이 방법 또한 다른 세포 유형 13,17,18의 다양한 적용 할 수있는 것으로 나타났습니다. 또한, 이러한 절차는 특정 대상에 대한 염색을 최적화하는 여러 가지 방법으로 변경할 수 있습니다. 우리는 적절?...

바렛 식도 (BE)은 식도의 편평 상피 세포 및 정상적인 위 식도 역류 질환 (GERD) (1)로부터 얻어진 위 내용물에 대한 만성 노출의 결과에 화생이 있으면서 변화이다. BE는 GERD에 대한 응답으로 보호 메커니즘 것으로 생각됩니다, 그러나 BE의 존재는 식도 선암 (EAC), 현저하게 생존율 1을 전달하는 질병의 증가 위험을 부여. 현재 견적은 미국 인구의 최대 5.6 %가달라고하는 것이 좋습니다 BE는 종종 무증상으로, 그러나, BE의 대부분이이 진단되지 않은 남아 있다고 생각합니다. GERD와 EAC 모두의 발생률이 계속 성장 3 본 바와 같이,이 정보는 잠재적으로 EAC하는의 진행을 방지하는 방향으로 치료 방법을 제공 할 수있다, 특히로, EAC하는의 진행에 관여하는 분자 메커니즘을 이해하는 것이 중요 해지고있다. 1의 현재 패러다임에 성공. 만성 염증, 상처, 그리고 위의 내용에 장기간 노출로 인한 유전 독성 피해는 EAC에 종양의 진행을 촉진 BE 병변에 선택적 압력을 발휘. 유전 변경의 숫자는 동안 EAC 진행하는 확인되었습니다. 그러나 이것에도 불구하고 세포 신호의 정확한 변화와 세포의 구조와 기능에 따라 이후의 영향에 대한 이해의 명백한 부족하다. 특히 표적 치료 화합물의 효과를 조사에서, 세포 신호 전달의 효과를 연구하기위한 유용한 도구가 시험 관내 세포 라인에 불멸화. 불후의 BE 세포주의 최근 상용화는 연구 할 수 있습니다. 이러한 널리 사용 생존력 분석 높은 처리량 분석법은 세포 증식 및 스와시 타겟 요법의 효과를 평가하는데 유용 할 수 있지만rvival 4-6, 이러한 분석은 세포 형태에 따라 세포 신호 전달의 효과를 심문하는 데 유용하지 않습니다. 면역 형광 염색 (IF)는 세포의 형태학, 성장 및 생존 성과 관련된 단백질시 타겟 요법의 효과를 조사하기위한 유용한 기술이다. 우리 연구소는 약물 치료 7 가능한 화학적 예방법 처리 및 바이오 마커를 서술의 희망 BE 세포 라인에 따라 임상 적으로 사용 가능한 약물의 효과를 평가하는 경우에 사용하는, 불후의 BE 세포 라인으로 이러한 방법을 적용하고있다. 마찬가지로, EAC에서 이러한 기술의 응용 프로그램이 있고 그리고 불후의 식도 세포 라인은 EAC 진행 8-10 일 수에 관한 중요한 연구 결과를 서술하고있다. 표적으로 한 치료로 치료 세포의 분석은 세포 구조와 단백질 지방화의 변화 특성을 허용, 가치가 있다면, 우리는 찾을 수 있습니다. 여기, 우리는 우리의 방법을 제시 IF C로되어 영원 세포의약물 치료를 haracterize.

<table><tbody><tr><td>CP-A (Metaplastic Cell Line)</td><td>ATCC</td><td>CRL-4027</td><td></td></tr><tr><td>CP-B (High-grade Dysplastic Cell Line)</td><td>ATCC</td><td>CRL-4028</td><td></td></tr><tr><td>CP-C (High-grade Dysplastic Cell Line)</td><td>ATCC</td><td>CRL-4029</td><td></td></tr><tr><td>CP-D (High-grade Dysplastic Cell Line)</td><td>ATCC</td><td>CRL-4030</td><td></td></tr><tr><td>Keratinocyte-SFM (1x), Liquid</td><td>Life Technologies</td><td>17005-042</td><td></td></tr><tr><td>0.25% Trypsin-EDTA (1x), Phenol Red&amp;nbsp;</td><td>Life Technologies</td><td>25200056</td><td></td></tr><tr><td>Fetal Bovine Serum, Qualified, HI</td><td>Life Technologies</td><td>10438026</td><td></td></tr><tr><td>PSN antibiotic mixture</td><td>Life Technologies</td><td>15640</td><td></td></tr><tr><td>PBS - Phosphate-Buffered Saline</td><td>Life Technologies</td><td>10010049</td><td></td></tr><tr><td>Pro-long Gold Antifade Reagent with DAPI&amp;nbsp;</td><td>Life Technologies</td><td>P36931</td><td></td></tr><tr><td>Circular Glass Coverslip 18 mm</td><td>Fisher Scientific</td><td>15-183-86</td><td></td></tr><tr><td>&amp;beta;-catenin Primary Antibody (Rabbit)</td><td>Cell Signaling</td><td>9562S</td><td></td></tr><tr><td>Alexa Fluor 488 (Goat Anti-Rabbit)</td><td>Life Technologies</td><td>A11008</td><td></td></tr><tr><td>10 cm TC treated PS dish, sterile</td><td>USA Scientific</td><td>CC7682-3394</td><td></td></tr><tr><td>12-well TC treated PS plate, sterile</td><td>USA Scientific</td><td>5666-5180</td><td></td></tr><tr><td>DMSO</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>276855</td><td></td></tr><tr><td>Paraformaldehyde</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P6148</td><td></td></tr><tr><td>Ammonium chloride</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A9434</td><td></td></tr><tr><td>Saponin</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>47036</td><td></td></tr><tr><td>Bovine Serum Albumin - Fraction V</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>85040C</td><td></td></tr><tr><td>SKI-606 (Bosutinib)</td><td>Selleck Chemicals</td><td>S1014</td><td></td></tr><tr><td>Square Bioassay Dish&amp;nbsp;</td><td>Thermo Scientific</td><td>240835</td><td></td></tr><tr><td>Parafilm&amp;nbsp;</td><td>VWR</td><td>82024-546</td><td></td></tr><tr><td>Disposable Pasteur Pipettes, Flint Glass</td><td>VWR</td><td>14672-380</td><td></td></tr><tr><td>Nexcelom Mini Cell Counter</td><td>Nexcelom</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Cellometer Counting Chambers</td><td>Nexcelom</td><td>CHT4-SD100-014</td><td></td></tr><tr><td>Zeiss Apotome microscope&amp;nbsp;</td><td>Zeiss</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

an immunofluorescent method for characterization of barrett&#8217;s esophagus cells

식도 선암 (EAC)는 전체 생존보다 17 %의 속도와 EAC의 발병률은 지난 20 년 동안 극적으로 증가했다가 있습니다. EAC의 주요 위험 요인 중 하나는 바렛 식도 (BE), 만성 가슴 앓이에 대한 응답으로 정상 편평 식도의 화생이 있으면서 변화입니다. EAC 사이의 잘 설정된 연결에도 불구하고, 분자 이벤트의 진행을 포함 특히 변경된 신호 전달 경로의 심문은 EAC에, 제대로 이해 못할 것이다. 이 중 대부분은 이러한 질병을 연구하는 데 사용할 수 체외 모델에 적합한의 부족 때문이다. 최근 불후의 BE 세포주 BE의 생체 연구를 허용 시판되고있다. 여기서, 우리는 치료 화합물에 노출 된 후 세포 신호 및 구조의 시험 관내 특성화 있도록 BE 불멸화 세포주의 면역 염색을위한 방법을 제시한다. 이러한 기술의 적용은 그러는 것p는 EAC 진행하는에 관련된 메커니즘에 대한 통찰력을 개발하고 치료 및 EAC의 예방을위한 잠재적 인 수단을 제공합니다.

개시된 방법의 애플리케이션으로부터 얻어진 결과의 일례는도 1a-D에 도시되어있다. CP-D와 CP-C BE 세포와 커버 슬립은 Src에 가족 억제제 SKI-606, 또는 차량 (DMSO)의 1 μM로 24 시간 동안 처리하여 단백질, β 신호있는 adherens 접합 Wnt에 대해 위의 절차를 사용하여 염색 - 카테닌. 세포 핵의 라벨이 DAPI (파란색)로 표시하여 수행하는 동안 β-catenin의 시각화는, 녹색 형광체에 결합 된 항 토끼 IgG...

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An Immunofluorescent Method for Characterization of Barrett&#8217;s Esophagus Cells

바렛 식도의 분자 드라이버에 대한 개선 된 정보를 식별 할 필요가있다. 면역 형광 염색은 세포 형태에 세포 신호 전달의 효과를 이해하기위한 유용한 기술이다. 우리는 바렛 식도 세포의 치료 적 처치를 평가하기 위하여 면역 형광 염색법을 사용하기위한 간단한 효과적인 프로토콜을 제시한다.

바렛 식도 세포의 특성에 대한 면역 방법

Esophageal adenocarcinoma (EAC) has an overall survival rate of less than 17% and incidence of EAC has risen dramatically over the past two decades. One ...

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Research

JoVE Journal

Biology

14.0K 조회수.  St. Joseph's Hospital and Medical Center.  바렛 식도의 분자 드라이버에 대한 개선 된 정보를 식별 할 필요가있다. 면역 형광 염색은 세포 형태에 세포 신호 전달의 효과를 이해하기위한 유용한 기술이다. 우리는 바렛 식도 세포의 치료 적 처치를 평가하기 위하여 면역 형광 염색법을 사용하기위한 간단한 효과적인 프로토콜을 제시한다. 

비디오: An Immunofluorescent Method for Characterization of Barrett’s Esophagus Cells

Four-color Fluorescence Immunohistochemistry of T-cell Subpopulations in Archival Formalin-fixed, Paraffin-embedded Human Oropharyngeal Squamous Cell Carcinoma Samples

The four-color fluorescence immunohistochemistry (IHC) technique is a method to quantify cell populations of interest while taking into account their relative distribution and their localization in the tissue. This technique has been extensively applied to study the immune infiltrate in various tumor types. The tumor microenvironment is infiltrated by immune cells that are attracted to the tumor site. Different immune cell populations have been found to play different roles in the tumor microenvironment and to have a different impact on the outcome of disease. This manuscript describes the use of multiparameter fluorescence IHC on oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPSCC) as an example. This technique can be extended to other tissue samples and cell types of interest. In the presented study, we analyzed the intraepithelial and stromal compartment of a large OPSCC cohort (n = 162). We focused on total T lymphocytes (CD3+), immunosuppressive regulatory T cells (Tregs; i.e., FoxP3+), and T helper 17 (Th17) cells (i.e., IL-17+CD3+) using a nuclear counterstain to distinguish tumor epithelium from stroma. A high number of T cells was found to be correlated with improved disease-free survival in patients with a low number of intratumoral IL-17+ non-T cells. This suggests that IL-17+ non-T cells may be correlated with a poor immune response in OPSCC, which is in agreement with the correlation described between IL-17 and poor survival in cancer patients. Currently, novel multiparameter fluorescence IHC techniques are being developed using up to 7 different fluorochromes and will enable the more precise characterization and localization of immune cells in the tumor microenvironment.

Multiparameter fluorescence immunohistochemistry can be used to assess the number, relative distribution, and localization of immune cell populations in the tumor microenvironment. This manuscript describes the use of this technique to analyze T-cell subpopulations in oropharyngeal cancer.

포르말린 - 고정, 파라핀 - 임베디드 인간 구강 성 편평 세포 암종 샘플에서의 T 세포 아군의 4 색 형광 면역 조직 화학

The four-color fluorescence immunohistochemistry (IHC) technique is a method to quantify cell populations of interest while taking into account their ...

연구

암 연구학

Automated Multiplex Immunofluorescence Panel for Immuno-oncology Studies on Formalin-fixed Carcinoma Tissue Specimens

Continued developments in immuno-oncology require an increased understanding of the mechanisms of cancer immunology. The immunoprofiling analysis of tissue samples from formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) biopsies has become a key tool for understanding the complexity of tumor immunology and discovering novel predictive biomarkers for cancer immunotherapy. Immunoprofiling analysis of tissues requires the evaluation of combined markers, including inflammatory cell subpopulations and immune checkpoints, in the tumor microenvironment. The advent of novel multiplex immunohistochemical methods allows for a more efficient multiparametric analysis of single tissue sections than does standard monoplex immunohistochemistry (IHC). One commercially available multiplex immunofluorescence (IF) method is based on tyramide-signal amplification and, combined with multispectral microscopic analysis, allows for a better signal separation of diverse markers in tissue. This methodology is compatible with the use of unconjugated primary antibodies that have been optimized for standard IHC on FFPE tissue samples. Herein we describe in detail an automated protocol that allows multiplex IF labeling of carcinoma tissue samples with a six-marker multiplex antibody panel comprising PD-L1, PD-1, CD68, CD8, Ki-67, and AE1/AE3 cytokeratins with 4&#8242;,6-diamidino-2-phenylindole as a nuclear cell counterstain. The multiplex panel protocol is optimized in an automated IHC stainer for a staining time that is shorter than that of the manual protocol and can be directly applied and adapted by any laboratory investigator for immuno-oncology studies on human FFPE tissue samples. Also described are several controls and tools, including a drop-control method for fine quality control of a new multiplex IF panel, that are useful for the optimization and validation of the technique.

A detailed protocol for a six-marker multiplex immunofluorescence panel is optimized and performed, using an automated stainer for more consistent results and a shorter procedure time. This approach can be directly adapted by any laboratory for immuno-oncology studies.

포 르 말린 고정 암 조직 표본에 면역-종양학 연구를 위한 자동화 된 다중 면역 형광 패널

Continued developments in immuno-oncology require an increased understanding of the mechanisms of cancer immunology. The immunoprofiling analysis of ...

Diagnosis of Neoplasia in Barrett&#8217;s Esophagus using Vital-dye Enhanced Fluorescence Imaging

The ability to differentiate benign metaplasia in Barrett&#8217;s Esophagus (BE) from neoplasia in vivo remains difficult as both tissue types can be flat and indistinguishable with white light imaging alone. As a result, a modality that highlights glandular architecture would be useful to discriminate neoplasia from benign epithelium in the distal esophagus. VFI is a novel technique that uses an exogenous topical fluorescent contrast agent to delineate high grade dysplasia and cancer from benign epithelium. Specifically, the fluorescent images provide spatial resolution of 50 to 100 &#956;m&#160;and a field of view up to 2.5 cm,&#160;allowing endoscopists to visualize glandular morphology. Upon excitation, classic Barrett&#8217;s metaplasia appears as continuous, evenly-spaced glands and an overall homogenous morphology; in contrast, neoplastic tissue appears crowded with complete obliteration of the glandular framework. Here we provide an overview of the instrumentation and enumerate the protocol of this new technique. While VFI affords a gastroenterologist with the glandular architecture of suspicious tissue, cellular dysplasia cannot be resolved with this modality. As such, one cannot morphologically distinguish Barrett&#8217;s metaplasia from BE with Low-Grade Dysplasia via this imaging modality. By trading off a decrease in resolution with a greater field of view, this imaging system can be used at the very least as a red-flag imaging device to target and biopsy suspicious lesions; yet, if the accuracy measures are promising, VFI may become the standard imaging technique for the diagnosis of neoplasia (defined as either high grade dysplasia or cancer) in the distal esophagus.

Vital-dye enhanced fluorescence imaging (VFI) is a novel in vivo technique that combines high-resolution epithelial imaging with exogenous topical fluorescent contrast to highlight glandular morphology and delineate neoplasia (high grade dysplasia and cancer) in the distal esophagus.

The ability to differentiate benign metaplasia in Barrett&#8217;s Esophagus (BE) from neoplasia in vivo remains difficult as both tissue types can be flat ...

생체공학

Multiplexed Barcoding Image Analysis for Immunoprofiling and Spatial Mapping Characterization in the Single-Cell Analysis of Paraffin Tissue Samples

Multiplexed imaging technology using antibody barcoding with oligonucleotides, which sequentially detects multiple epitopes in the same tissue section, is an effective methodology for tumor evaluation that improves the understanding of the tumor microenvironment. The visualization of protein expression in formalin-fixed, paraffin-embedded&#160;tissues is achieved when a specific fluorophore is annealed to an antibody-bound barcode via complementary oligonucleotides and then sample imaging is performed; indeed, this method allows for the use of customizable panels of more than 40 antibodies in a single tissue staining reaction. This method is compatible with fresh frozen tissue, formalin-fixed, paraffin-embedded tissue, cultured cells, and peripheral blood mononuclear cells, meaning that researchers can use this technology to view a variety of sample types at single-cell resolution. This method starts with a manual staining and fixing protocol, and all the antibody barcodes are applied using an antibody cocktail. The staining fluidics instrument is fully automated and performs iterative cycles of labeling, imaging, and removing spectrally distinct fluorophores until all the biomarkers have been imaged using a standard fluorescence microscope. The images are then collected and compiled across all the imaging cycles to achieve single-cell resolution for all the markers. The single-step staining and gentle fluorophore removal not only allow for highly multiplexed biomarker analysis but also preserve the sample for additional downstream analysis if desired (e.g., hematoxylin and eosin staining). Furthermore, the image analysis software enables image processing-drift compensation, background subtraction, cell segmentation, and clustering-as well as the visualization and analysis of the images and cell phenotypes for the generation of spatial network maps. In summary, this technology employs a computerized microfluidics system and fluorescence microscope to iteratively hybridize, image, and strip fluorescently labeled DNA probes that are complementary to tissue-bound, oligonucleotide-conjugated antibodies.

Multiplexed barcoding image analysis has recently improved the characterization of the tumor microenvironment, permitting comprehensive studies of cell composition, functional state, and cell-cell interactions. Herein, we describe a staining and imaging protocol using the barcoding of oligonucleotide-conjugated antibodies and cycle imaging, which allows for the use of a high-dimensional image&#160;analysis technique.

파라핀 조직 샘플의 단일 세포 분석에서 면역 프로파일링 및 공간 매핑 특성 분석을 위한 멀티플렉스 바코드 이미지 분석

Multiplexed imaging technology using antibody barcoding with oligonucleotides, which sequentially detects multiple epitopes in the same tissue section, is ...

종양 미세환경의 다중 면역형광 및 공간 이미지 분석(Multiplex Immunofluorescence and Spatial Image Analysis of the Tumor Microenvironment)

Multiplex Immunofluorescence Combined with Spatial Image Analysis for the Clinical and Biological Assessment of the Tumor Microenvironment

The tumor microenvironment (TME) is composed of a plethora of different cell types, such as cytotoxic immune cells and immunomodulatory cells. Depending on its composition and the interactions between cancer cells and peri-tumoral cells, the TME may affect cancer progression. The characterization of tumors and their complex microenvironment could improve the understanding of cancer diseases and may help scientists and clinicians to discover new biomarkers.
We recently developed several multiplex immunofluorescence (mIF) panels based on tyramide signal amplification (TSA) for the characterization of the TME in colorectal cancer, head and neck squamous cell carcinoma, melanoma, and lung cancer. Once the staining and scanning of the corresponding panels are completed, the samples are analyzed on an image analysis software. The spatial position and the staining of each cell are then exported from this quantification software into R. We developed R scripts that allow us not only to analyze the density of each cell type in several tumor compartments (e.g. the center of the tumor, the margin of the tumor, and the stroma) but also to perform distance-based analyses between different cell types.
This particular workflow adds a spatial dimension to the classical density analysis already routinely performed for several markers. mIF analysis could allow scientists to have a better understanding of the complex interaction between cancer cells and the TME and to discover new predictive biomarkers of response to treatments, such as immune checkpoint inhibitors, and targeted therapies.

저자 스포트라이트: 종양 미세환경의 임상 및 생물학적 평가를 위한 공간 이미지 분석과 결합된 다중 면역형광  

In this article, a protocol for manual tyramide signal amplification (TSA) multiplex immunofluorescence (mIF) combined with image analysis and spatial analysis is described. This protocol can be used with formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) sections for the staining of two to six antigens per slide depending on the slide scanner available in the laboratory.

종양 미세 환경의 임상 및 생물학적 평가를 위한 공간 이미지 분석과 결합된 Multiplex Immunofluorescence

The tumor microenvironment (TME) is composed of a plethora of different cell types, such as cytotoxic immune cells and immunomodulatory cells. Depending ...

인간 식도 오가노이드 및 공기-액체 인터페이스 배양 프로토콜

Three-Dimensional Cell Culture Models to Investigate the Epithelial Barrier in Eosinophilic Esophagitis

The squamous epithelium of the esophagus is directly exposed to the environment, continuously facing foreign antigens, including food antigens and microbes. Maintaining the integrity of the epithelial barrier is critical for preventing infections and avoiding inflammation caused by harmless food-derived antigens. This article provides simplified protocols for generating human esophageal organoids and air-liquid interface cultures from patient biopsies to study the epithelial compartment of the esophagus in the context of tissue homeostasis and disease. These protocols have been significant scientific milestones in the last decade, describing three-dimensional organ-like structures from patient-derived primary cells, organoids, and air-liquid interface cultures. They offer the possibility to investigate the function of specific cytokines, growth factors, and signaling pathways in the esophageal epithelium within a three-dimensional framework while maintaining the phenotypic and genetic properties of the donor. Organoids provide information on tissue microarchitecture by assessing the transcriptome and proteome after cytokine stimulation. In contrast, air-liquid interface cultures allow the assessment of the epithelial barrier integrity through transepithelial resistance (TEER) or macromolecule flux measurements. Combining these organoids and air-liquid interface cultures is a powerful tool to advance research in impaired esophageal epithelial barrier conditions.

저자 스포트라이트: 호산구성 식도염의 병태생리학 조사

Here, a protocol for the culture of human esophageal organoids and air-liquid interface culture is provided. Esophageal organoids' air-liquid interface culture can be used to study the impact of cytokines on the esophageal epithelial barrier.

바렛 식도 세포의 특성에 대한 면역 방법

요약

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포르말린 - 고정, 파라핀 - 임베디드 인간 구강 성 편평 세포 암종 샘플에서의 T 세포 아군의 4 색 형광 면역 조직 화학

포 르 말린 고정 암 조직 표본에 면역-종양학 연구를 위한 자동화 된 다중 면역 형광 패널

Diagnosis of Neoplasia in Barrett’s Esophagus using Vital-dye Enhanced Fluorescence Imaging

파라핀 조직 샘플의 단일 세포 분석에서 면역 프로파일링 및 공간 매핑 특성 분석을 위한 멀티플렉스 바코드 이미지 분석

종양 미세 환경의 임상 및 생물학적 평가를 위한 공간 이미지 분석과 결합된 Multiplex Immunofluorescence

종양 미세 환경의 임상 및 생물학적 평가를 위한 공간 이미지 분석과 결합된 Multiplex Immunofluorescence

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호산구성 식도염의 상피 장벽을 조사하기 위한 3차원 세포 배양 모델

호산구성 식도염의 상피 장벽을 조사하기 위한 3차원 세포 배양 모델

호산구성 식도염의 상피 장벽을 조사하기 위한 3차원 세포 배양 모델