Dissociação de amostras de tecido tumoral humano e de camundongo para sequenciamento de RNA de célula única

O escopo de nossa pesquisa é estudar os mecanismos de resposta ou resistência em imunoterapias padrão de tratamento. Nosso laboratório está tentando entender o que impulsiona uma resposta imune bem-sucedida contra tumores e se podemos identificar esses preditores de terapia para encontrar alvos que possam superar a resistência. O maior avanço nos últimos anos foi o desenvolvimento e integração de técnicas de sequenciamento de RNA de célula única.

Eles nos permitem, em tempo real, estudar sistematicamente as características moleculares em células individuais de maneira imparcial, o que é útil na dissecação desses ecossistemas tumorais complexos e em evolução. Embora muitos modelos pré-clínicos estejam sendo usados para estudar os mecanismos de resposta à imunoterapia, ainda não conhecemos os determinantes imunológicos que são importantes na imunidade humana. Processar e analisar amostras de pacientes em tempo real é crucial para nossa capacidade de investigar todos os compartimentos celulares dentro de um determinado tumor.

Usando técnicas genômicas e transcriptômicas imparciais, nosso laboratório descobriu que defeitos na maquinaria de apresentação do antígeno estão associados à resistência à imunoterapia no melanoma. Mais recentemente, usando abordagens de célula única, descobrimos estados únicos de células T e polaridades de células mieloides associadas aos resultados dos pacientes em melanoma e câncer de cabeça e pescoço, respectivamente. A maior vantagem do nosso protocolo está em sua simplicidade.

É um protocolo universal ajustado para a dissociação de amostras tumorais pequenas e grandes de vários tipos de câncer em um curto período de tempo, terminando na geração de suspensões unicelulares altamente viáveis.