Method Article
Этот протокол описывает диссекции и иммуноокрашивания взрослых Drosophila melanogaster тканей мозга. В частности этот протокол подчеркивается использование дрозофилы грибные тела и фоторецепторных нейронов как пример нейрональных подмножества, которые точно можно выявить общие принципы, лежащие в основе многих аспектов развития нервной системы.
Развитие нервной системы включает в себя серию последовательных событий, которые координируются несколько сигнальных путей и регулирования сети. Многие из белков, участвующих в этих путей эволюционно консервируют между млекопитающих и других эукариот, например плодовой мушки Drosophila melanogaster, предполагая, что аналогичные организационные принципы существуют в ходе разработки этих организмов. Важно отметить, что дрозофилы широко используется для идентификации молекулярных и клеточных механизмов, регулирующих процессов, которые требуются в млекопитающих, включая нейрогенез, дифференциация, аксональное руководство и synaptogenesis. Мухи также успешно используются для моделирования различных заболеваний человека психомоторного развития. Здесь мы описываем протокол для поэтапного microdissection, фиксации и immunofluorescent Локализация белков в мозге взрослого дрозофилы . Этот протокол фокусируется на два примера нейрональных популяций, грибные тела нейронов и фоторецепторов сетчатки и включает в себя дополнительные шаги для отслеживания отдельных грибные тела нейронов, с помощью анализа мозаика с техникой Repressible маркер клеток (MARCM). А также краткое описание скоринга критерии аксональное руководство дефектов приводятся данные пример из дикого типа и мутантов мозги. Хотя этот протокол выделяет два устоявшихся антител для изучения морфологии грибные тела и фоторецепторных нейронов, другие Drosophila регионов мозга и Локализация белков в других регионах мозга может также быть расследование, используя этот протокол.
Хотя дрозофилы нервной системы меньше, чем людей и грызуны, его сложности обеспечивает мощный, доступный модель лучше понять его позвоночных коллегами. Во многих случаях геном позвоночных и мух кодирования очень похожие белки, которые определяют механизмы развития нервной системы. В самом деле многие из генов, необходимых для развития нервной системы позвоночных Ортологи в мух, включая те, которые участвовали в сигнальных путей, управления структурирования, нейрогенез и аксональной руководство1,2,3 ,4,5. Например Нетрины является лигандом для аксональное руководства в млекопитающих и D. melanogaster6,,78. В то время как Нетрины был первоначально изолирован от зародышевых куриных мозг ткани6, последующие исследования показали, что Нетрины играет роль сохраняется во время разработки эмбриональных центральной нервной системы (ЦНС) в дрозофилы8. Другие исследования использовали генетических экраны в эмбриональных дрозофилы ЦНС для выявления сохранившихся лигандов и рецепторы, необходимые для поиска пути в9 дрозофилы и позвоночных.
В то время как эмбриональные лету ЦНС широко используется в прошлом для идентификации лиганды рецепторов и внутриклеточных сигнальных белков, необходимых для аксональное руководство8,9, недавняя работа исследовала способов, в котором многие из Эти белки также контролировать Поиск пути решения на более поздних стадиях развития. В частности расследование грибные тела (МБ) и сетчатки фоторецепторных нейрон развития (рис. 1) предоставил заглянуть в механизмы, поиск пути управления, формирования синапсов, обрезка аксона и несколько других аспектов нейронов Разработка10,11,12,13,14,,1516,17. Фоторецептор нейронов Подключите летать сетчатки в регионы взрослого мозга называется пластинки и продолговатого мозга и имеют решающее значение для передачи визуальной информации в мозг (рассмотрен1918,), а грибные тела нейронов Отель расположен в лету мозга и необходимы для обучения и памяти20,21. Фоторецептор нейронов и встроенные нейронов Грибовидные тела, называемые клетки Кеньон, использовать механизмы эволюционно сохраняется diffusible и контакт зависимой аксональное руководства найти их пост синаптических целей. Помимо видимых в взрослых мух, фоторецептор и MB нейроны могут также быть непосредственно визуализирована в личинки и куколки с антителами или репортер генов22,23,24,25. Способность легко визуализировать эти два вида нейронов в разное время развития пунктов способствовал их использования превосходным образцом для многих аспектов развития нервной системы.
Помимо использования как модель для понимания механизмов развития нормальных нервной системы, недавние исследования показали, что мухи могут также служить точные модели широкого спектра заболеваний человека, включая синдром хрупкий X (FXS)26 , Интеллектуальной инвалидности (ID)27,28,,2930,31и другие32. Например для изучения молекулярных функции ZC3H14, ген недавно связаны с человеческой умственной инвалидности, мы создали модель fly ID с помощью null аллеля лету ZC3H14 ortholog, называется Nab230. Мухи не хватает Nab2 имеют серьезные памяти нарушениями и расширенный poly(A) хвосты, изложив что наблюдается у людей больных или пациентом производных клеток линии33,34. Главное мух, также не хватает Nab2 отображения тяжелых мозга морфология дефекты в их взрослых Грибовидные тела34, похож на то, что наблюдается в мух, не хватает FXS ген синдрома, FMR135. Таким образом мухи может служить организма важной моделью для изучения развития нормального мозга и заболеваний, которые сорвать его.
Наконец доступность методов высокой пропускной способности контролировать поведение, в сочетании с широкий спектр имеющихся генетических инструменты, сделать дрозофилы модельный организм выбора для выявления областях мозга, которые контролируют сложные поведения, такие как обучения и памяти, сна, ухаживания, жажда и другие36,37,,3839. Один особенно полезным инструментом, который находится в центре летать генетик «Инструментарий» является системой GAL4/Уан (рис. 2). 40,эта система41 использует конкретное выражение ткани transcriptional Gal4 активатора для увеличения выражение генов или трансгенов вниз по течению вверх по течению активации последовательности (Уан). Модификации этой системы позволило исследователям, например, точно контролировать возбудимость нейронов определенных42,43, overexpress или специфических генов нокдаун интерес44, 45, анализировать динамику реального времени кальция в vivo46и выразить репортер генов в ознаменование нейрональных линий41. Сочетание GAL4/Уан системы с митотическая рекомбинации, также допускается для создания мозаики анализа с12,Repressible маркер клеток (MARCM) в системе47. MARCM широко используется в один нейрон трассировки для выявления клеточных сигналов компонентов, необходимых для аксональное руководство12,47. Хотя эти и другие методы предоставили ряд ценную информацию о клеточных механизмов, необходимых для функции нервной системы, большинство требуют, что мозг дрозофилы сначала быть расчленены; тщательное удаление мозга требуется сохранить правильный мозг морфологии и связи моделей между областями мозга. Следующий протокол использует грибные тела и фоторецепторных нейронов, какПример нейрональных популяций как он проведет вас через вскрытие и immunofluorescent окрашивание взрослого дрозофилы мозги.
1. генетики дрозофилы и факультативные процедуры теплового шока
Пересекли2. Рассечение станции подготовки
3. Взрослый процедура диссекции мозга
4. Фиксация и Immunofluorescent процедуры окрашивания
5. Монтаж взрослых D. melanogaster мозги на Микроскоп слайды и изображения
Метод, описанный выше позволяет для надежных и воспроизводимых визуализации практически любого региона взрослого мозга дрозофилы . Здесь мы сосредоточились на Грибовидные тела и фоторецепторных нейроны, но другие исследования использовали аналогичные методы для визуализации мозга регионов, таких как Парс intercerebralis52, Будильник нейронов53,54и усиков Лепесток проекции нейронов55, среди многих других. Важно отметить, что этот метод может использоваться для визуализации структуры всего мозга, а также отдельных нейронов в рамках этих структур, с помощью таких методов, как MARCM12,47. Рисунок 4, Рисунок 5и Рисунок 6 показать несколько различных типов данных из Грибовидные тела и фоторецепторных нейронов в взрослых мозги, которые могут быть созданы с помощью этой техники рассечения и иммуноокрашивания.
Во-первых непосредственно визуализировать морфология грибные тела с использованием антител, которые признают Fasciculin 2 (Fas2) или репортер генов, выраженная в грибные тела нейронов34может использоваться метод, описанный выше. Как показано в рисунке 4A и Рисунок 4B, Fas2 антител может использоваться для визуализации α, β и (в меньшей степени) γ лопастями Грибовидные тела взрослых дрозофилы мозги. Fas2 является белок адгезии клеток необходимые для нейрона подрагивание и выражается в высоких уровнях в α и β лопастями23,56,57, что делает его надежным и хорошо налаженные маркер этих грибов тела нейронов. Примечательно циркуляр образный эллипсоид тела, расположенная в регионе Центральной взрослого мозга также могут быть визуализированы с помощью этой антитела (рис. 4A).
Дефекты в аксональное руководство белки часто вызывают неполно капиллярный грибные тела мутанта фенотипов15,34,35. Таким образом в большинстве случаев, несколько десятков мозги должны отражаться и проанализированы. Например грибные тела β доли аксоны Nab2 null мух ненадлежащим образом крест срединной мозга. Этот «crossing over» или β доли «фьюжн» фенотип обычно наблюдается в ~ 80% взрослого Nab2 null, летает, но в основном отсутствует одичал тип элементов управления и могут быть классифицированы как незначительные, умеренной или завершить слияние34. «Фьюжн» β долей по всей средней линии результатом неправильного контралатеральной проекция аксоны в противоположном полушарии мозга. Как показано на рисунке 4C и подробно в34,35, небольшие фьюжн относится к β долей соединены «тонкую прядь Fas2-позитивных волокон,» хотя умеренный фьюжн относится к более существенно подключенных β лопастями в средней линии, которые показывают толщиной чуть снижение доли. Полный (или «Экстрим») фьюжн относится к β лопастями, которые полностью подключены и показать не снижение доли толщины или Fas2 пятнать в средней линии. Степени грибные тела β доли фьюжн можно количественно и отображается, как показано в 34,35 или как таблица, показывающая процент мозги, показаны каждый тип дефекта морфологии.
В дополнение к окрашиванию Fas2 антител, MARCM технику12,,4748 также может использоваться для визуализации аксона руководством решения индивидуальных GFP+ нейронов в грибные тела лопастями. MARCM использует митотическая рекомбинации во время разработки для создания отдельных нейронов, или клонально связанных групп нейронов, отмеченные GFP (рис. 5A). MARCM предоставляет способ для генерации небольшое количество нейронов, которые полностью лишены белков в противном случае гетерозиготных летать. Таким образом эта техника была особенно полезной при анализе аксональное руководство функции белков, которые также важны для общего научные жизнеспособности12,47. Гомозиготная null нейронов, отмеченные GFP можно непосредственно по сравнению с контролировать нейронов, отмеченные GFP в генетический фон одичал тип. Кроме того в зависимости от того, когда развивающихся личинок и куколок, тепло шокирован, различные классы грибные тела нейронов может быть объектом (рис. 5B).
Пример типа данных, получаемых с помощью этого метода показан на рис. 5C, где одичал тип (то есть, управления) MARCM клоны создаются в качестве примера. Для создания отдельных нейронов грибные тела GFP+ , показанный на рис. 5C, разработке F1 личинки были первоначально размещены при 25 ° C. Приблизительно 5-6 дней после вылупления личинок (ALH), куколки были тепло шокирован на 30 минут при 37 ° C и затем вернулся в 25 ° C до eclosion. После взрослых штриховкой, мозги были расчленены в PTN, фиксированной и одновременно инкубировали с антителами, признавая Fas2 (1 d 4, разбавленный 1:20 в PTN) и GFP (разбавленных 1: 500 в PTN). Мозги были затем инкубируют с вторичные антитела и монтируется на слайдах, как описано выше. GFP+ клетки были выявлены и образы с помощью сканирования лазерного конфокального микроскопа и максимальная интенсивность прогнозы были созданы с использованием ImageJ. Как продемонстрировано в Рисунок 5C, управления GFP+ нейронов, сгенерирована α и β лопастями colocalize с Fas2 и прекратить до связавшись по средней линии, которая отделяет два полушария мозга дрозофилы . Один Аксон проекты кпереди, может разветвлять каждой присваивать и затем проектов оба дорсально и медиально к форме α и β лопастями. Несколько предыдущих исследований использовали этот метод для расследования, должны ли определенные белки для изучения клеточного деления автономно для многих аспектов axonogenesis, включая расширение, поиск пути, ветвление или обрезка10, 11,12,13,14,,1516,17,34.
В дополнение к Грибовидные тела аксональное Поиск пути решения нейронов сетчатки фоторецептор (R-клетки) могут также быть визуализированы с помощью метода рассечение, описанный выше (а также де метод вскрытиявписать в ссылку48). Каждый фасеточном в лету глаз содержит 8 фоторецепторных нейронов, которые можно подразделить на три группы (рис. 1): R1 R6 клетки, которые проект аксоны к поверхностным пластинки зрительного доли мозга; R7 клетки, которые проект аксоны глубокого слоя M6 продолговатого мозга; и R8 клетки, которые проект аксоны промежуточного слоя м3 продолговатого19,58. Подробно изучено проекции шаблон каждого класса фоторецепторных и вместе эти нейроны успешно используются как модель для понимания сигнальных путей, участвующих в аксона руководство19,59. Важно отметить, что все фоторецепторных аксоны могут быть легко визуализированы в расчлененных дрозофилы мозги иммуноокрашивания взрослого, куколки, или личинок тканей, с использованием антител, признает chaoptin, клеток поверхности гликопротеина24, 60 , 61. репортер генов GFP или β-галактозидазы в каждом типе Р-клетки (клетки, R1-R6 и R7 R8) также были построены и может использоваться для визуализации каждого класса фоторецепторных62. Поскольку каждый тип R-клеток прекращается в другой слой зрительного доли развивающихся, эти журналисты позволили детальное сравнение сигнальных путей, необходимых для каждого типа клеток, чтобы правильно найти свою цель. Пример выражения моделей, производимых два из этих генов репортер в сочетании с chaoptin локализацией (которая может использоваться в качестве маркера всех нейронов фоторецепторных) показан на рисунке 6. Чтобы визуализировать R7 фоторецепторов, мозги, содержащие R7-специфических Rhodopsin4-LacZ Репортер ген были расчлененные и витражи с антителами к chaoptin и β-галактозидазы. Родопсин 4 (Rh4) выражается именно в подмножество R7 клетки63; Rh4 промоутер таким образом может использоваться для привода репортер экспрессии генов в только эти клетки. Как и ожидалось, R7 клетки прекратить в глубокий слой M6 medulla (обозначается желтой пунктирной линией на рисунке 6). Аналогичным образом, мозги, выражая β-галактозидазы от промоутера родопсин 6 (Rh6), которая выражается именно в R8 фоторецепторов63, были расчленены и immunostained с использованием антител, признавая chaoptin и Β-галактозидазы. Как показано на рисунке 6, R8 фоторецепторов прекращено в R3 слойпродолговатого. Хотя здесь не показан, Rh1-LacZ также может использоваться для визуализации прекращение R1 R6 фоторецепторов в пластинки.
Рисунок 1: Взрослый Drosophila melanogaster мозга состоит из функционально различных, но взаимосвязанных областей. (A) краткое изложение взрослых D. melanogaster мозг показано, подчеркнув расположен Грибовидные тела и периферийных сетчатки фоторецепторных нейронов. (B) расширенное диаграмма взрослого гриба тела аксона связки (также называемый лепестков), которые распознаются Fas2 антител. Внутренняя нейронов Грибовидные тела, называемые клетки Кеньон, проект аксоны кпереди от дорзально расположен клеток органов (клеток тела, исключены из этой схемы) и образуют структуры отдельных лепестков. В взрослого мозга, γ лопастями (показано красным) формы от одного медиальной пучок аксонов, а спинной α и медиальной β лопастями (показано в синий) формы от одного аксона, может разветвлять каждой присваивать во время процесса поиска пути. Α ' / β' нейронов развивать аксональное лопастями, которые частично совпадают с теми α/β нейронов, но не распознаются Fas2 антител и исключены из этой схемы. Нейроны сетчатки (C) имеют решающее значение для ретрансляции визуальной информации на лоб зрительный от сетчатки. Проект аксоны ячейки органов, расположенных в сетчатки (бежевый) и образуют соединения с пост синаптических целевых ячеек в пластинки или Продолговатый мозг. R1-R6 фоторецепторных клеток (показано красным цветом) формы определенных подключений с ячейками в наружном слое лоб зрительный, называемые пластинки. R7 фоторецепторных клеток (желтый) синапса с целевыми показателями в слое M6 продолговатого мозга, в то время как клетки R8 (показано зеленым) проект аксоны чуть более поверхностный слой м3 Продолговатый мозг. Часть C, адаптированных с разрешения от Macmillan Publishers Ltd: Природа Neuroscience (ссылка64, авторские права (2011)). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 2: GAL4/Уан система может использоваться для выражения целевого гена. Чтобы получить мух, выражая ген интереса («ген X») в ткани шаблону, мухи должны содержать трансген, выражая Gal4 transcriptional Активатор белков под контролем ткани конкретных усилитель и трансген, содержащие Gal4 ДНК Обязательные последовательности (вверх по течению активации последовательности или UAS) рядом с гена X. как правило, это сочетание достигается путем скрещивания родительских мух, каждый из которых содержит один трансген и выбрав для потомства1 F, которые содержат оба. В результате F1 поколения Gal4 будет выражаться и будет привязан к UAS для того чтобы активировать транскрипцию генов X определенным образом ткани. Важно отметить, что различные UAS-содержащих трансгенов может использоваться в сочетании с же GAL4 «драйвер». Например трансген, выражая Gal4 в Грибовидные тела (MBs) могут быть объединены с бас содержащих трансген Экспресс GFP, трансген, который сбивает экспрессии гена интереса, с помощью РНК-интерференция, или UAS-трансген, который производит репортер. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 3 : Монтажа мозги в рамках подготовки к иммунофлюоресценции изображений. (A) мозги монтируются на SuperFrost плюс слайды с моста крышкой для предотвращения уплощение мозги. Два «базовый» скользит крышка привязаны к Superfrost плюс положительно заряженных слайд с четкой ноготь польский и расчлененных мозги затем помещаются на слайде между ними. Скольжения обложки ясно «мост» помещается выше мозги и придерживаться базового скользит крышка. (B) когда ноготь польский высохнет, Vectashield медленно накапаны под мостом для сохранения флуоресценции вторичное антитело. Четкие ногтей лак затем используется для герметизации верхней и нижней крышки выскальзования «мост». Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 4: Гриб аксоны тела могут быть визуализированы четко, с использованием антител, которые признают Fas2. (A) взрослых дрозофилы мозги были расчленены, фиксированной и инкубировали с антителами, признавая Fas2. Первичного антитела были признаны с помощью Alexa488-сочетании коза анти мышь вторичные антитела и мозги были смонтированы на положительно заряженный слайды и образы, используя лазерный Сканирующий конфокальный микроскоп. Bisymmetrically расположен грибные тела клетки органов продлить аксоны кпереди, раздвоить и образуют пучки аксона (также называемый лепестков). Аксоны, которые формируют дорсально проектирование α лопастями и медиально проектирование β лопастями Экспресс Fas2. Критически β лопастями одичал тип мух прекратить до срединной линии мозга. Расположен эллипсоид тела также могут быть визуализированы с помощью 4 1 d антитела. (B) медиально проектирование γ доли аксоны взрослых дрозофилы грибные тела также выразить Fas2 и могут быть визуализированы с помощью 4 1 d антитела. Выражение Fas2 в γ доли аксоны обычно меньше чем α и β лопастями. (C) грибные тела аксоны Nab2-null мозги (генотип: Nab2ex3/Nab2ex3) неправильно проекта contralaterally и часто не хватает лопастями. Nab2-значение null мозги были расчленены, фиксированной и витражи с 1 d 4 антитела для визуализации грибные тела α, β и γ лопастями. Максимальная интенсивность Z-стек прогнозы, а также отдельные разделы оптических сосредоточена на регионе срединной линии отображаются. Грибные тела одичал тип β доли аксоны редко пересекать срединной мозга, мозги Nab2-null имеют различную неправильного проекции всей срединной линии в полушарии контралатеральной мозга, что приводит к «плавленый» β лопастями. Как определено в ссылки34,35, мягкий фьюжн относится к < β лопастями с только несколько «нити» аксоны пересечения срединной линии, умеренные фьюжн относится к ситуациям, где нейронов доли положительных β Fas2 крест срединной но β доли мозга Ширина в средней линии уменьшается, и полное слияние относится к ситуациям, где нет сокращения β доли толщины как долей мозга средней линии. Так как эллипсоид тело выражает также Fas2, оптические секции показаны midline часто являются более полезными в визуализации β доли фьюжн. Примечательно недостающие лопастями также часто наблюдаются (обозначается здесь с белая звездочка). Данные в части C используется в квантификации фенотипов грибные тела от ведения34, с разрешения. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 5 : MARCM может использоваться для визуализации одного нейронов. (A) анализ мозаика с маркер Repressible клеток (MARCM) использует ФЛП рекомбиназа опосредованной митотическая рекомбинации в FRT мест для создания двух отдельных клеток дочи. В этом примере все клетки содержат Грибной белок GAL4 орган специфических на отдельном хромосоме. После митотическая рекомбинации во время деления клеток, одна дочь клеток (вверху) выражает GFP (или мембраны связаны CD8-GFP) и содержит два мутантные аллели гена интереса, в то время как другие клетки дочь (внизу) наследует две аллели одичал тип (WT) и в трансген, выражая белка Gal80, с помощью промоутера тубулина. Gal80 ингибирует Gal4, так что любой клетки, вырабатывающие Gal80 будет не люминесцентные и должно быть у гетерозиготных мышей или гомозиготных одичал тип. Только те клетки, которые являются GFP+ будет содержать две копии аллеля мутанта. Обратите внимание, что отображается только один из нескольких методов для создания GFP+ клетки, которые также содержат два мутантных аллелей гена интереса; Пожалуйста, смотрите12,45,56 для других примеров. (.B) поскольку разработка грибные тела нейронов начинается с γ нейронов, а затем α'/ β' нейронов и заканчивается с α/β нейронов, каждый класс нейрон можно выборочно целевых и визуализированное тепла шокирует в разное время развития точках. Как описано в 12, 40 мин теплового шока при 37 ° C, что происходит ≤2.5 дней после вылупления личинок (ALH) будет конкретно γ; нейронов, а теплового шока, который происходит 3.5-4.5 дней ALH (в конце личиночной стадии L3) будет направлена α'/ β' нейронов и тепловой шок что o ccurs между 5-7 дней ALH (во время развития куколки) пристрелет α/β нейронов. (C) отдельных одичал тип аксоны были визуализируется с помощью MARCM. Одичал тип ~ 5-6 день старого куколки (генотип: hsFLP, бас-CD8-GFP; FRT82B, бас-CD8-GFP/FRT82B, Ванна > Gal80; OK107-GAL4/+) были шокированы при 37 ° C 40 мин побудить митотическая рекомбинации тепла. Мозги были расчленены, фиксированной и витражи с антителами, признавая GFP (1: 500) и Fas2 (1:20). Мозги были затем инкубируют с дневно обозначенные вторичные антитела и визуализированное confocal микроскопии. В этом примере данные из генотипа «контроль» GFP позитивные клетки с помощью MARCM одичал тип и вместо содержащих двух аллелей генаМут , содержат две аллели генаWT . Грибные тела β лопастями (визуализируется с использованием антител, признавая Fas2) прекратить до достижения мозга средней; Также присутствуют α доли нейронов. Чтобы показать более подробно, увеличено с учетом одного мозга полушария отображается в нижней строке изображений. Часть C был адаптирован с разрешения ссылки34. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 6 : Фоторецептор аксоны также могут быть визуализированы. Взрослый мозг выражая β-галактозидазы в R7 фоторецепторов (слева, с помощью Rh4-LacZ) или R8 фоторецепторов (правая, с помощью Rh6-LacZ) были расчленены, фиксированной и инкубировали с антителами, признавая β-галактозидазы или chaoptin. Мозги были затем инкубируют с дневно обозначенные вторичные антитела и визуализированное лазерная сканирующая конфокальная микроскопия. Один оптический секции показываются от каждого мозга. На левой стороне можно увидеть несколько R7 фоторецепторных аксоны (стрелки) прекращения в глубокий слой M6 medulla (показано желтой пунктирной линией). Справа R8 фоторецепторных аксоны (стрелки) прекратить в наружном слое м3 мозга (показано зеленой пунктирной линией). R7 фоторецепторов Экспресс либо Rh3 или Rh4 и R8 фоторецепторов Экспресс Rh5 или Rh663, все R7 или R8 фоторецепторов нельзя быть визуализированы с помощью один Репортер ген LacZ . Масштаб баров = 10 мкм. пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рассечение и визуализации методом, описанным выше может быть использован в широком спектре иммуноокрашивания и жить графических приложений. Мы наметили протокол общего иммуноокрашивания и показали один из способов, в которых MARCM может использоваться для визуализации аксональное морфология отдельных грибные тела нейронов. Кроме того эти общие процедуры могут также использоваться для визуализации других регионов мозга в фиксированных или свежей расчлененных взрослого мозги48,65. Живой изображений может обеспечить более эффективный подход при анализе моделей выражение усилитель ловушки, репортер генов или имитировать линии66, например. Для предотвращения захвата артефакты от смерти клетки во время живых изображений GFP в незаписанных тканей, мозги следует расчлененный в 1 x фосфат буфер солевой (PBS) или HL3 СМИ48, установленный на мост слайды в 1 x PBS (или HL3) и отражаться в менее чем 15-20 минут Уход следует также удалить столько трахеи как можно дальше от расчлененных мозга до изображений, так как это может помешать с визуализацией GFP флуоресценции.
В то время как окрашивание условия для оценки морфологии грибные тела и фоторецепторных нейронов, относительно устоявшихся24,61,67, локализация специфического протеина интереса в эти ячейки типы могут потребовать диагностики и оптимизации. В частности несколько критических шагов, включая разбавления антитела, блокирующий буфер компонента концентрации и фиксации, должны быть оптимизированы для создания наиболее надежные и воспроизводимые результаты. Во-первых должны быть определены оптимальная концентрация основное антитело. Хотя коммерчески доступных антител часто имеют предлагаемые разрежения (и мы часто сначала начать с помощью этой концентрации), эти значения редко определяются эмпирически на ткани дрозофилы . Таким образом тестирование серию разведений первичных антител, которые диапазон выше и ниже производителя начиная предложение часто приводит к более специфического окрашивания. Хотя основное антитело разрежения может иметь значительное влияние на окрашивание точность и следует точно определить, время мозги инкубируют в основное антитело содержащие решения может значительно изменяться с незначительное воздействие на общий результат. Например мы наблюдаем аналогичные результаты при инкубации расчлененный мозги с Fas2 антитела основное антитело для два, три или даже четыре дня при 4 ° C. Хотя мы рекомендуем по крайней мере две ночи, мы также инкубировали мозги в раствор первичных антител на одну ночь и получить воспроизводимые пятнать. Важно отметить, что ограничивает количество времени, которое мозги инкубируют в вторичное антитело до 3 ч при комнатной температуре (или одну ночь при 4 ° C) помогает предел привязки неспецифических вторичных антител ткани мозга.
Во-вторых это может быть необходимо использовать дополнительные «блокирование» реагенты для устранения нежелательного фонового сигнала. Параметры включают в себя повышение концентрации NGS ~ 10%, добавив 1-10% бычьим сывороточным альбумином (БСА) для блокировки и первичные/вторичные антитела решения, или предварительно адсорбции первичных антител на ночь при 4 ° C с дрозофилы эмбрионов (см. Ссылка68, разделе 2.9, шаг 3).
Хотя мы писали выше протокол, с помощью PTN как предлагаемые буфер для всех фиксации, мыть и Антитело инкубации шаги, фиксация ткани в других буферов (например ПЛП и PEM, перечисленные в Таблице материалов) может привести к глубокие различия в Сила сигнала. Например предыдущие исследования показали, что циклин E обнаруживается в личиночных имагинальных дисков, когда ткани фиксируются в традиционных параформальдегида 4%, разбавленных в PBS, но хорошо видна, когда ткани фиксируются в буфере ПЛП (Ken Моберг, личное коммуникации и ведения69). Помимо изменения в буфере компоненты, изменяя время и температура для фиксации ткани может также существенно повлиять на immunofluorescent окрашивание и может определяться эмпирически в случае необходимости. Как правило фиксации времени должно быть достаточно долго, чтобы обеспечить достаточную сшивки клеточных компонентов и долгосрочное поддержание общей клеточной морфологии будучи ограничены достаточно, чтобы предотвратить более сшивки и «захоронение» epitopes белка. Таким образом когда первоначально оптимизации окрашивание условия для вновь приобретенного основного антитела, мы обычно ограничивают время фиксации до примерно 20 мин и часто будет исправить тканей при холодных температурах.
Несколько элементов управления должны быть включены в любой иммунофлюоресценции эксперимента исследовать специфику первичных и вторичных антител, а также влияние трансгенов/генетический фон на наблюдаемых фенотип. Чтобы определить, распознает ли основное антитело, используются специально протеина интереса, ткани от мух не хватает этот белок и/или тканей, экспрессирующих белка должны быть включены как элементы управления. Добавление избыток антигена очищенный протеин также могут быть включены чтобы определить, распознает ли основное антитело другие epitopes в лету мозга. Наконец любой флуоресцентные сигнал, когда первичного антитела опущены представляет уровень неспецифической привязки выбранного вторичные антитела.
Несколько важных элементов управления также должны быть включены для оценки вклада генетический фон или наличие трансгенов интенсивности окрашивания или нейронов морфологии. Например, мухи, используемые в MARCM эксперименте на рисунке 5 содержат несколько трансгенов (hsFLP, бас-CD8-GFP, FRT82B, Ванна > GAL80 и OK107-GAL4), каждая из которых должны быть проанализированы отдельно для воздействия на морфологию грибные тела. В очень минимальные, грибные тела морфология мух содержащие OK107-GAL4 и бас-CD8-GFP должны быть проанализированы. Она также может быть необходимо оценить влияние теплового шока и ФЛП рекомбиназа производства на развитие грибные тела, анализируя летит, содержащий hsFLP и FRT82B. Хотя MARCM может обеспечить значительное понимание ли данный белок самостоятельно управляет аксональное руководство, количество элементов управления, требуется точно сделать этот вывод может быть незначительные ограничения этой техники. В менее сложных экспериментов также применимы аналогичные элементы управления. Например возьмем эксперимент, где GAL4/Уан система используется в сочетании с RNAi трансген нокдаун выражение протеина интереса к всех нейронов. В этом эксперименте, будет присутствовать по крайней мере два трансгенов: Пан нейронов GAL4 драйвер, например Elav-GAL4 и трансген UAS-РНК-интерференции . Морфология грибные тела нейронов в мух, содержащие каждый из этих трансгенов только должны быть расследованы в дополнение к экспериментальной условие, где мухи гавани оба трансгенов в том же ходу.
Наконец чтобы определить, является ли протеина интереса выражается в грибные тела нейронов это обычно необходимо совместно пятно мозги с антителами к Fas2. В качестве альтернативы флуоресцентных белков, таких как CD8-GFP связаны GFP, ППП или мембраны могут также выражаться с помощью системы GAL4/Уан и используется в сочетании с антителами, признавая протеина интереса. Fas2 распознает только fasciculated аксонов, которые формируют грибные тела α и β лопастями, использование ориентированных на GAL4, мембрана прыгните CD8-GFP пор особенно полезно для маркировки грибные тела нейронов.
Дефекты в аксональное руководство часто не 100% проникающей и даже мозги же генотипа может показать некоторые изменчивости. Таким образом при анализе недавно мутантные аллели дефекты в грибные тела или фоторецепторных пути, следует использовать сочетание различных аллелей и подходы. Большинство исследований в литературе использовать несколько различных подходов расследовать ли белок играет клетки автономная роль в управлении аксональное руководство: я) анализ пути дефекты в гомозиготной null мух (желательно с использованием различных нюLL аллели), ii) анализ пути дефекты мух, не хватает белка интерес только в нейронах (обычно через RNAi), iii) MARCM анализ дефектов пути и iv) спасти эксперименты, где ген повторно выраженную в нейронах гомозиготных null мух. В идеале несколько десятков мозги на генотип должны быть проанализированы для дефектов в нейрональных морфологии.
Хотя Протокол описан здесь главным образом фокусируется на immunofluorescent Локализация белков в рамках фиксированных тканей, несколько будущего применения этой техники разрабатываются для изображения живой мозговой ткани. Как только мозги разделяются (обычно в СМИ культуры клеток), они может быть культивировали в течение нескольких дней при температуре 25 ° C. Эти ex vivo культивирования методы в настоящее время разрабатываются для того, чтобы исследовать широкий спектр биологических процессов, таких как активность белка, способствует регенерации аксона, после травмы70,71, внутриклеточной Сигнальный динамика72и развития нервной системы73.
Авторы заявляют, что они не имеют никаких финансовых интересов.
Мы хотели бы поблагодарить Чангху Пак и Alysia Врайлас Мортимер первоначально преподавания СМК технику рассечения мозга. Мы также благодарим членов группы лаборатории Кен Моберг, особенно Крис раундов, за критически читать рукопись. Антитела, признавая Fas2 (1 d 4) и chaoptin (24B10) были получены от развития банка гибридомной исследования. 24B10 антитела к DSHB сданный Сеймур Бензер и гастрольный Colley24,,6061, антитела 1 d 4 был сдан на хранение до DSHB Кори Гудман 22,23,56. Покупать акции были получены от центра Bloomington складе. Мы также хотели бы поблагодарить Огайо сельскохозяйственных исследований и развития центр (OARDC) MCIC центр изображений для использования Конфокальный микроскоп изображение мозги в рисунке 4A и B. SMK поддерживается грант от NICHD (1 R15 HD084241-01A1).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Microdissection forceps/tweezers | Ted Pella | 505-NM | |
Sylgard dishes | Living Systems Instrumentation | DD-50-S-BLK | Available from amazon.com |
Fas2 Antibody | Developmental Studies Hybridoma Bank | 1D4 | |
Chaoptin Antibody | Developmental Studies Hybridoma Bank | 24B10 | |
GFP Antibody | Aves Lab | GFP-1010 | |
Alexa488 goat anti-mouse secondary antibody | ThermoFisher | A-11001 | |
Alexa488 goat anti-chicken secondary antibody | ThermoFisher | A-11039 | |
Alexa647 goat anti-mouse secondary antibody | ThermoFisher | A-21236 | |
20% paraformaldehyde | Electron Microscope Services | RT15713 | |
VectaShield | Vector Labs | H-1000 | |
SuperFrost Plus Slides | ThermoFisher | 99-910-01 | |
Coverslips | ThermoFisher | 12-553-454 | |
Na Phosphate Buffer monobasic | Sigma | S3139 | |
Na phosphate Buffer dibasic | Sigma | S3264 | |
Triton X 100 | Sigma | X100-100ml | |
fingernail polish | Electron Microscope Services (EMS) | 72180 | |
stereomicroscope | Leica S6D with KL300 LED light source | ||
9-well dish (spot plate) | VWR | 89090-482 | |
nutator/rocker | Fisher | 22-363-152 or 88-861-041 | |
35mm dish | Genesee Scientific | 32-103 | |
Sylgard | Fisher | 50-366-794 | |
Kimwipe | Fisher | 06-666 | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Potential Fixation Buffers | |||
PTN Buffer | 0.1M NaPhosphate, pH 7.2, 0.1% Triton-X-100, Typically make up 0.5 L of 0.1M NaPhosphate buffer and aliquote 50ml at a time as needed | ||
PLP buffer | 2% paraformaldehyde, 0.01M NaI04, 0.075M Lysine, 0.037M NaPO4, pH 7.2, Dissolve 0.36 g lysine in 10 ml H2O + 7.5 ml 0.1 M NaH2PO4 pH 7.2 + 2.5 ml 0.1 M Na2HPO4 on ice. Immediately before use, mix 15 ml of this buffered lysine solution with 50 mg NaIO4 (sodium periodate) + 2ml of the 20% high grade paraformaldehyde (EMS) + 3ml H2O | ||
PEM buffer | 0.1M PIPES pH 7.0, 2mM MgS04, 1mM EGTA, This buffer can be conveniently made as a 2x stock and diluted with 8% paraformaldehyde (PFA) to give a final concentration of 4% PFA | ||
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Fly Stocks available from Bloomington | |||
elav (c155)-GAL4 | BL458 | Pan-neuronal GAL4 driver | |
w*;;;OK107-GAL4 | BL 854 | GAL4 driver for all mushroom body neurons (OK107-GAL4 insertion is on the 4th chromosome) | |
y(1), w(67c23); c739-GAL4 | BL 7362 | GAL4 driver for alpha and beta lobes (on 2nd chromosome) | |
y(1), w(67c23); c739-GAL4, UAS-CD8-GFP | BL 64305 | GAL4 driver for alpha and beta lobes, also contains UAS-CD8-GFP | |
w*; 201Y-GAL4 | BL 4440 | GAL4 driver for primarily the gamma lobes of mushroom body (on 2nd chromosome) | |
y(1), w(67c23); 201Y-GAL4, UAS-CD8-GFP | BL 64296 | GAL4 driver for mushroom body gamma lobes, also contains UAS-CD8-GFP | |
w*, elav (c155)-GAL4, hsFLP; FRTG13, Tub>Gal80/CyO | BL 5145 | MARCM stock, contains FRT site and GAL80 on 2nd chromosome | |
w*, elav (c155)-GAL4, hsFLP, UAS-CD8-GFP | BL5146 | MARCM stock, contains hsFLP, pan-neuronal GAL4, and CD8-GFP on X chromosome | |
y(1), w*, hsFLP, UAS-CD8-GFP;;FRT82B, Tub>GAL80/TM3, Sb(1);OK107-GAL4 | BL 44408 | MARCM stock for flipping 3rd chromosome | |
y(1), w*, hsFLP, UAS-CD8-GFP;FRT40A, Tub>GAL80;OK107-GAL4 | BL44406 | MARCM stock for flipping 2nd chromosome | |
w*, hsFLP, tub>GAL80, FRT19A; UAS-CD8-GFP/CyO;;OK107-GAL4 | BL 44407 | MARCM stock for flipping X chromosome | |
y(1), w*; UAS-CD8-GFP/CyO | BL 5137 | GFP labels cell surface (CD8 is a transmembrane protein) | |
y(1), w*; FRTG13, UAS-CD8-GFP | BL 5139 | MARCM stock, contains FRT site and CD8-GFP on 2nd chromosome | |
y(1), w*, hsFLP, UAS-CD8-GFP; Pin(1)/CyO | BL 28832 | MARCM stock, contains hsFLP and CD8-GFP on X chromosome | |
w*; FRTG13, Tub>GAL80 | BL 5140 | MARCM stock, contains FRT site and GAL80 on 2nd chromosome | |
y(1), w*;; FRT82B, Tub>GAL80 | BL 5135 | MARCM stock, contains FRT site and GAL80 on 3rd chromosome |
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены