В центре внимания автора: Эффективное и надежное программное обеспечение для автоматизированного объединения нескольких методов доклинической визуализации

Мы разрабатываем программные инструменты для доклинической визуализации, включая реконструкцию изображений, слияние, сегментацию и количественную оценку. Наше программное обеспечение должно быть удобным в использовании, эффективным и совместимым с любым устройством визуализации мелких животных, чтобы обеспечить воспроизводимый количественный анализ полученных мультимодальных данных изображения. Автоматизация является важной темой в нашей области, потому что ручной анализ часто занимает слишком много времени, подвержен ошибкам и трудно воспроизводим.

Программная автоматизация может сделать анализ эффективным и воспроизводимым, но проблема заключается в том, чтобы сделать автоматизацию достаточно надежной. Устройства для визуализации мелких животных предоставляют объемные данные изображений лабораторных мышей и крыс, находящихся под наркозом, и позволяют неинвазивно оценивать патологические и физиологические изменения. Интегрированные мультимодальные устройства сочетают в себе преимущества нескольких методов, таких как микрокомпьютерная томография и ПЭТ.

Также есть возможность объединить два отдельных устройства. Мы разработали программное обеспечение для автоматизированного слияния специальных модальностей, таких как микро-КТ и ТФМ. Мы также предоставили эффективное программное обеспечение для интерактивного объединения изображений и определили новый формат файлов для хранения данных изображений, учитывая аспекты курирования данных.

В прошлом году мы опубликовали подход к ретроспективному респираторному гейтированию в условиях высокой пропускной способности. Наш протокол находится в матрице преобразования, которая генерируется с использованием шага калибровки, включающего видимые структуры, такие как реперные знаки. Затем слияние изображений может быть автоматизировано с помощью этой матрицы преобразования, что устраняет необходимость в маркерах.