JoVE Logo
Faculty Resource Center

Sign In

Abstract

Biology

Birincil Cilia'yı Değerlendirmede Yapay Zeka Yaklaşımları

Published: May 1st, 2021

DOI:

10.3791/62521

1Department of Biology, Indiana University-Purdue University Indianapolis, 2Nikon Instruments Inc., 3Stark Neurosciences Research Institute, Indiana University, 4Center for Diabetes and Metabolic Diseases, Indiana University School of Medicine

Cilia, birçok memeli hücre tipinde sinyal yolları çeşitliliği için sinyal merkezleri olarak işlev gösteren mikrotübül bazlı hücresel uzantılardır. Cilia uzunluğu yüksek oranda korunmuş, sıkı bir şekilde düzenlenmiştir ve farklı hücre tipleri ve dokular arasında değişir ve sinyal kapasitelerini doğrudan etkilemede suçlanmıştır. Örneğin, cilia'nın silier G protein bağlantılı reseptörlerin aktivasyonuna yanıt olarak uzunluklarını değiştirdiği gösterilmiştir. Bununla birlikte, çok sayıda cilia'nın uzunluklarını doğru ve tekrarlanabilir bir şekilde ölçmek zaman alıcı ve emek yoğun bir prosedürdür. Mevcut yaklaşımlar da hata ve önyargıya eğilimlidir. Yapay zeka (Ai) programları, kapsamlı veri kümelerinin asimilasyonuna, manipülasyonuna ve optimizasyonuna izin veren yetenekler nedeniyle bu zorlukların çoğunun üstesinden gelmek için kullanılabilir. Burada, bir Ai modülün hem in vivo hem de in vitro örneklerden görüntülerdeki cilia'yı tanımak için eğitilebileceğini gösteriyoruz. Cilia'yı tanımlamak için eğitilmiş Ai'yi kullandıktan sonra, uzunluk, floresan yoğunluğu ve birlikte lokalizasyon için yüzlerce cilia'yı tek bir örnekte analiz eden uygulamalar tasarlayabilir ve hızla kullanabiliriz. Bu tarafsız yaklaşım, farklı primer nöronal preps in vitro'dan ve bir hayvan içindeki ve hayvanlar arasındaki farklı beyin bölgelerinden örnekleri karşılaştırırken güvenimizi ve katılığımızı artırdı. Ayrıca, bu teknik, herhangi bir hücre tipinden ve dokudan cilia dinamiklerini birden fazla örnek ve tedavi grubunda yüksek verimli bir şekilde güvenilir bir şekilde analiz etmek için kullanılabilir. Sonuç olarak, çoğu alan görüntü alma ve analiz için daha az önyargılı ve daha tekrarlanabilir yaklaşımlara doğru ilerledikçe yapay zeka tabanlı yaklaşımlar büyük olasılıkla standart hale gelecektir.

Explore More Videos

Biyoloji

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2024 MyJoVE Corporation. All rights reserved