Doğrusal alkanların moleküler iyonları, iç bağın kopması kararlı bir karbokatyon ve kararlı bir radikal oluşturduğundan, zincirin ucundan uzaktaki karbon-karbon bağında parçalanmayı tercih eder. Sonuç olarak, doğrusal alkanların kütle sinyalleri, kütle-yük oranı grafiğinin ortasında yoğun tepe noktaları ve her iki uçta daha zayıf tepe noktaları içerir. Her bir karbon-karbon bağının, her bölünmede bir metil grubunun serbest bırakılmasıyla parçalanması, kütle spektrumlarında 14 u ile ayrılmış belirgin tepe noktalarına yol açar. Her belirgin tepe noktasının yakınındaki daha küçük kütle sinyalleri, karbon-hidrojen bağındaki ikincil parçalanmadan kaynaklanır.

Örneğin, Şekil 1'de gösterilen n-heksanın parçalanma desenini ve Şekil 2'deki karşılık gelen kütle spektrumlarını ele alalım.

Şekil 1: n-heksan moleküler iyonunun parçalanması.

Şekil 2: n-heksanın kütle spektrumu

71, 57, 43, 29 ve 15 kütle-yük oranındaki sinyaller, kopmanın moleküldeki tüm karbon-karbon bağlarında meydana gelebileceğini gösterir. Ancak, bu tepe noktalarının göreceli bolluğu değişir. Moleküler iyon sinyali ile 71'deki sinyal arasındaki fark, moleküler iyonlardan metil gruplarının (M.W. = 15 u) ayrıldığını gösterir. Bu parçadan (M.W. = 14 u) bir CH_2 grubunun daha fazla salınması, 57'de bir sinyale neden olur. 43, 29 ve 15'teki sinyaller, CH_2 gruplarının sonraki salınmalarından kaynaklanır. 15 ve 71'deki sinyallerin bolluğu, sırasıyla kararsız metil karbokatyon veya bir metil radikalinin oluşma olasılığının en düşük olması nedeniyle minimumdur. 43'teki baz tepe noktası en çok tercih edilen parçalanmayı gösterir ve bu da kararlı karbokatyon ve radikal çifti verir.