Lizozomlar, Golgi aygıtından türetilen zarla çevrili küresel keselerdir. Lizozomun en önemli işlevi, salgı, endositik, otofajik ve fagositik yollar gibi zar kaçakçılığı olayları sırasında açığa çıkan makromolekülleri ve biyolojik polimerleri parçalamaktır. Bozunma, lizozomal lümenin asidik bir ortamında aktif olan birkaç hidrolitik enzim tarafından gerçekleştirilir. Bu asit hidrolazlar, hücre sinyalizasyonu, enerji metabolizması, plazma zarının restorasyonu, boşaltılan malzemelerin sayılması gibi hücresel süreçlerde rol oynar.

Birincil lizozomlar olarak adlandırılan iç Golgi keselerinden türetilen yeni oluşan lizozomlar dinamiktir ve makromoleküller, diğer hücre altı organeller ve plazma zarı ile bölünebilir veya kaynaşabilir. Birincil lizozomlar, parçalanacak maddelerle birleştiğinde, ikincil lizozomlar haline gelirler. Dahil oldukları yola bağlı olarak fagozomlar, endolizozomlar, sindirim vakuolleri ve otofagozomlar haline gelirler. Farklı membran trafik yollarına dahil olmaları dışında aralarında net bir ayrım yoktur. Bu nedenle, hücre içi materyali parçalamanın ortak bir işlevi ile tanımlanan morfolojik olarak çeşitli organelleri temsil ederler.

Özel bir lizozom seti olan salgı lizozomları, hem geleneksel lizozomların hem de salgı granüllerinin özelliklerine sahiptir. Bu nedenle, makrofajlar, hematopoetik hücreler ve melanositler gibi bazı hücre tiplerinde bol miktarda bulunurlar. Salgı lizozomları, lizozomal enzimlere ek olarak antimikrobiyal proteinler ve sitokinler salgılar. Bu nedenle pigmentasyon, pıhtılaşma, yara onarımı ve immünolojik fonksiyonlarda rol oynarlar.

Bitki hücreleri, lizozomlara benzer hidrolitik enzimlerle dolu vakuoller içerir, ancak işlevsel olarak çeşitlidir. Bozunmaya ek olarak, hem besin maddelerinin hem de atık ürünlerin depolanmasında ve turgor basıncının kontrol edilmesinde rol oynarlar.