Vitro çalışmalar için 3D benzeri platformlar olarak Fetal ve yetişkin kalp doku karşılaştırılabilir Decellularization Explants

Özet

Kardiyak hücre dışı Matriks (ECM) anahtar süreçlerinde doku ve organların fizyolojik hayatı boyunca remodeling kalıcı süre alacak moleküllerinin karmaşık bir ağdır. Fetal ve yetişkin kalplerin standart decellularization 3D bir bağlamda yerel mimari ve biyomekanik özellikleri yakalayarak karşılaştırmalı deneysel çalışmalar hem dokuların izin verir.

Özet

Geçerli hücre dışı Matriks (ECM) bilgisine-hücre iletişim çevirir büyük iki boyutlu (2D) tüp bebek kültür çalışmaları nerede ECM bileşenleri bir yüzey kaplama olarak sunulmaktadır. Bu kültür sistemleri biyokimyasal bileşimi, yapısı ve mekanik özellikleri kapsar ECM dokusunun karmaşık yapısı basitleştirilmesi oluşturmaktadır. Bütün fetal kalp decellularization için sağlayan bir protokol geliştirdiğimiz kardiyak microenvironment şekillendirme ECM-hücre iletişim daha iyi taklit etmek için ve yetişkin sol ventrikül doku aynı anda için karşılaştırmalı çalışmalar explants. Protokol Hipotonik bir arabellek, bir deterjan Anyonik yüzey aktif özellikleri ve Dnaz tedavi herhangi bir gereksinim olmadan kullanmak özel beceri ya da ekipman için birleştirir. Doku örnekleri arasında aynı decellularization stratejisi uygulamadan konularda çeşitli yaş karşılaştırmalı çalışmalar gerçekleştirmek için alternatif bir yaklaşımdır. Mevcut iletişim kuralı benzersiz yapısal farklılıkları tanımlaması fetal ve yetişkin kalp ECM mesh ve biyolojik hücresel yanıt izin verir. Ayrıca, burada daha geniş bir uygulama başarıyla diğer dokulara ve küçük ayarlamalar, bu türe gibi insan bağırsak biyopsisi ve fare akciğer uygulanan metodoloji gösterir.

Giriş

Hücre dışı Matriks (ECM) önemli hücresel süreçler, yani kader-karar, yayılmasını önleme ve farklılaşma^1,2düzenleyen molekülleri dinamik bir ağdır. Hücre-ECM etkileşimlerin incelenmesi esas olarak iki boyutlu (2D) in vitro kültürlerde ECM bileşenleri ile kaplı, hangi vivo içindebulunan yerel ECM özellikleri basitleştirilmesi teşkil yapıldı. Decellularization büyük ölçüde hücre dışı mimarisi ve kompozisyon yerel doku ve organları^3,4korumak acellular 3D benzeri ECM bioscaffolds oluşturur. Doku Mühendisliği için biyoaktif iskele olarak görev ek olarak, decellularized 3D ECM Biyomalzeme roman platformlar hücre-ECM Biyoloji değerlendirmek için o paralel içinde vivo ortamda ortaya çıkıyor.

ECM bileşenleri farklı dokular, organlar ve yaş fark rolünün değerlendirilmesi ile yerel bioscaffolds üretme benzer iletişim kurallarının kullanımını yararlanacaktır. Kalbinden, decellularization örnekleri, fetal ve yetişkin türetilmiş için çok yönlü bir iletişim kuralı organ microenvironment, karşılaştırmalı çalışmalar gerçekleştirmek için alternatif bir yaklaşım geliştirdik. Bu yöntemi kullanarak, biz yerel kardiyak microenvironment yakalanan ve fetal ECM kalp hücreleri⁵yüksek repopulation verimi teşvik gösterdi. Decellularization daha fazla lif kompozisyon⁵arasında fetal ve yetişkin ECM Bodrum lamina ve pericellular matris kafes düzenlemenin düzeyinde ikamet yapısal farklılıklar tanımlaması sağlanmıştır. Önce bu çalışmaları, aynı decellularization yaklaşımı kullanarak farklı ontogenic aşamalarında dokuların kafa kafaya karşılaştırma yalnızca al yanaklı maymun böbrekler ve kemirgen kalpler için bildirilmiştir. Buna ek olarak, sınırlı sayıda çalışmalar fetal doku/organ decellularization başına^5,6,7rapor. Bu SDS benzersiz decellularization Aracısı olarak kullanarak elde edilmiştir; Ancak, farklı SDS konsantrasyonları fetal ve yetişkin kalp dokusu^7,8decellularization için kullanıldı. SDS en etkili iyonik deterjanlar için izni sitoplazmik ve nükleer malzeme biridir ve yaygın olarak kullanılan farklı doku ve numuneler^9,10decellularization içinde. Yüksek SDS konsantrasyonları ve uzun süreli maruz kalma içeren çözümler proteini denatürasyon, glikozaminoglikan (gag) kaybı ve kollajen liflerinde^10,11, bozulma ile ilişkili ve bu nedenle bir ECM korunması ve hücre kaldırma arasında denge gereklidir. Fetal ve yetişkin kalp dokusu ile aynı yordamı uygulamak için burada açıklanan protokol üç sıralı adımları ayrılmıştır: hücre lizis ozmotik şok (Hipotonik arabellek); solubilization lipid-protein, DNA-protein ve protein-protein etkileşimlerinin (% 0,2 SDS); ve nükleer malzeme kaldırma (Dnaz tedavisi).

Bizim iletişim kuralı birkaç avantajları gösterir: Ben) aynı decellularization strateji; uygulama tarafından yaş özgü kardiyak dokuların eşdeğer decellularization olasılığı II) özel yöntemler veya ekipman gereksinim yoktur; III) diğer doku ve tür olarak bu hazır adaptasyon ile insan bağırsak biyopsisi¹² ve fare akciğer¹³' te küçük değişiklikler başarıyla uygulandı; ve önemlisi, IV) ECM biyomekanik özellikleri 3D benzeri organotypic kültürleri daha yakından yerel doku microenvironment moleküler özelliklerini taklit Meclisi etkinleştirilirken adresleyebilir.

Protokol

Açıklanan yöntemleri i3S hayvan Etik Komitesi ve Direção Geral de tarafından onaylanmış Veterinária (DGAV) ve are uygun olarak Avrupa Parlamentosu yönergesi 2010/63/AB.

1. decellularization çözümleri hazırlanması

Not: çözümleri 0,22 mikron membran filtre ile filtre ve dışında en fazla 3 ay için depolanan tüm decellularization aksi belirtilmediği.

1. 1 x PBS için: 8 gram NaCl, 1,01 g Na₂HPO₄ KCl, 200 mg Mix ve KH₂PO₄ 200 mg ile 900 mL deiyonize su (DI su). Çözüm pH 7.5 ve nihai çözüm Cilt 1 L. filtre, basınçlı kap ve mağaza oda sıcaklığında (RT) çözüm için ayarlayın.
2. Hipotonik arabellek (10 mM Tris, % 0,1 EDTA) için: 1.21 g TrisBASE ve EDTA 1 g 900 mL deiyonize su içinde çözülür. Çözüm pH 7.8 NaOH/HCl ile için ve nihai çözüm Cilt 1 L. filtre ayarlamak, otoklav tarafından sterilize ve RT. stok
3. İçin % 0,2 SDS eriyik (% 0,2 SDS, 10 mM Tris): 0,6 g TrisBASE ve 1 g Sodyum Lauryl Sülfat (SDS) 400 mL DI su ekleyin ve 60 ° C'de tam çözünen dağılmasına kadar karıştırın. Çözüm RT. ayarla çözüm pH 7.8 için ve 500 mL nihai çözüm birime soğumasını izin. Çözüm filtrasyon tarafından sterilize.
   Not: SDS çözüm kullanmadan önce hazırlanmalıdır. Filtre çözümü sonra SDS dağılması tamamlamak, aksi halde SDS erimeyen parçacıklar son SDS konsantrasyon değiştirme ve sonuç olarak doku decellularization verimliliği etkileyen filtre emdirmek.
4. Hipotonik yıkama arabellek (10 mM Tris) için: TrisBASE 1.21 g DI 900 ml su karıştırın. Çözüm pH 7.8 için ve son hacim 1 L. filtre ayarlamak, otoklav tarafından sterilize ve RT. stok
5. Dnaz tedavi (20 mM Tris, 2 mM MgCl₂, 50 U/mL Dnaz) için: 2.42 g TrisBASE ve 2 mL 1 M MgCl₂ 900 mL DI su içinde çözülür. PH 7.8 için ve nihai çözüm Cilt 1 L. filtre ayarlamak ve çözüm otoklav tarafından sterilize. Saklamak çözüm RT. eklemek Dnaz, ben (50 U/mL) kullanmak için önceden.
6. Dnaz için çözüm stok: % 50 gliserol, 20 mM Tris-HCl pH 7.5, 1 mM MgCl₂, içeren bir Dnaz arabellek hazırlamak ve DI su ile 10 mL nihai çözüm hacmiyle ayarlayın. Laminar akış mahallede Dnaz arabelleğe toz ve karışımı yavaşça kadar tam çözülme Dnaz ekleyin. Çözüm 0,22 mikron filtre üzerinden sterilize. 1 mL aliquots hazırlamak ve -20 ° C'de depolayın

2. doku hasat ve dondurma

1. Yetişkin hamile kadın, gebelik (E18 fetusa) CO₂ Havasızlıktan Boğulma yoluyla 18 gün ötenazi. Cerrahi makas kadınlarla bir sezaryen gerçekleştirmek ve eğri İpuçları (her iki boynuz ucu için bir cımbız) ile iki tırtıklı cımbız kullanarak buz gibi 1 x PBS ile fetal fareler için bir petri taşıyan rahim boynuzları toplamak.
   1. Rahim boynuzları ve amniyotik kese fetusa izole etmek için açın. Fetusa onları anestezi ve makas ile başını kesmek için buz gibi 1 x PBS ile yeni Petri kabına aktarın.
   2. 7-8 hafta yaşlı erkek C57BL/6 fareler CO₂ boğulma kullanarak ötenazi. Bir kesik her fare göğüs üzerinde gerçekleştirmek ve kalp toplamak.
   3. Kısaca fetal ve yetişkin kalplerini buz soğuk 1 x PBS ile yıkayın.
2. Yetişkin Kalp kulakçık bir neşter yardımıyla kaldırın. Bir kesik sağ ventrikül üzerinde gerçekleştirmek ve düz küçük makas kullanarak kaldırın. Sol ventrikül iç duvar septum kaldırarak maruz. Yeni Petri kabına, sol ventrikül ücretsiz-duvardaki uzunlamasına şeritler ile 2 mm kalınlığında bölmek ve Papiller kas bir neşter ve tırtıklı cımbız ile eğri ipuçlarını kullanarak kaldırın.
   1. 2 x 2 mm Kılavuzu (detaylı açıklama ek Resim 1⁵) kullanarak bir neşter yardımıyla özel tüketim küçük doku explants. Kısaca doku explants 1 x PBS ile yıkayın.
3. ~ 250 µL en uygun kesme sıcaklık (OCT) bileşik autoclaved 1.5 mL microcentrifuge tüpler için ekleyin. Bütün fetal kalp ve yetişkin kalp explants, Ekim 250 µL tüplerini transfer ve onları kuru buz soğutmalı isopentane ve mağaza-80 ° c (ile en fazla 6 ay) ile dondurma.
   Not: Kalp doku explants 6 aydan fazla cryopreserved kullanımını decellularization verimlilik, özellikle yetişkin kalp doku explants önemli ölçüde azaltır.

3. doku decellularization

Not: Kalp doku decellularization 24-iyi doku kültürü plaka başına iyi bir örnek ile gerçekleştirilir. Her decellularization çözüm 1 mL her birey için de eklenir. Tüm decellularization merdiven ile ajitasyon 165 RPM (kuluçka shaker bir yörünge çapı 20 mm) ve 25 ° c, aksi belirtilmedikçe yapılmalıdır. Daha fazla ayrıntı için lütfen şekil 1Adüzeni bakın. Amfoterisin B (örneğin fungizone) ve gentamisin taze 2.5 μg/mL ve 0,01 μg/mL, son bir konsantrasyon için kullanmadan önce tüm decellularization çözümler sırasıyla eklenir. Decellularized dokular, decellularization Protokolü başlamadan önce belirlenecek örnek kitle ihtiyaçlarını içinde muhafaza DNA miktarını ölçmek için. DNA miktar Protokolü daha ayrıntılı olarak açıklandığı 5.1 bölümdür.

1. 1. GÜN
   1. Doku örnekleri-80 ° C dondurucudan kaldırın. OCT kısmen erimiş hale gelinceye kadar 1.5 mL microcentrifuge tüpler RT bırakın. Kalp doku blok, hala donmuş Ekim 1 x PBS ile Petri kabına aktarın.
   2. OKT'yi erir sonra kalp doku yeni Petri kabına 1 x PBS ile taşıyın. 1 x PBS ve 10-15 dakika süreyle bir shaker ile 60 RPM yıkama örnekleri en az iki kez tekrarlayın.
   3. Hipotonik arabellek bir steril 24-iyi doku kültürü tabak iyi çalışma 1 mL ekleyin. Bir örnek de forseps yardımıyla başına aktarın.
   4. 25 ° C'de bir kuluçka shaker örnekleri ile 24-iyi doku kültürü plaka taşımak ve 18 h kuluçka Hipotonik arabellek ile başlar.
2. 2. GÜN
   1. % 0,2 SDS çözüm 1.3 bölümünde açıklandığı şekilde hazırlayın.
   2. Hipotonik arabellek Aspire edin ve 1 x PBS ile örnekleri için 1 h. tekrar 3 kez yıkayın.
      Not: Duraklat noktası: doku decellularization altında 1 x PBS için statik koşullarda 18 h 4 ° C'de içinde tutulur.
   3. 1 x PBS kaldırmak, 1 mL taze yapılmış SDS çözeltisi (Adım 1.3) iyi ücret eklemek ve örnekleri için 24 saat kuluçkaya.
      Not: (Kontrol noktası) Post SDS kuluçka, örnekleri bir beyaz yarı saydam bir görünüm için sergi emin olun. Bu adımda, SDS tedavi örnekleri tutarlılık jelatin gibi gösterilen DNA'SINDA boğulmuş. SDS çözüm yavaş yavaş örnek yapışma pipet ucu kaçınmak için kaldırın.
3. 3. GÜN
   1. Hipotonik yıkama arabelleği (iyi başına 1 mL) ile örnekleri için 20 dk. tekrar 3 kez yıkayın.
      Not: Bu adımda örnek boyutu hücre kalıntıları kaldırılması nedeniyle bir düşüş gözlemlemek için normaldir. DURMA noktası: Statik koşullarda 18 h için 4 ° C'de Hipotonik yıkama arabellekte doku decellularization altında tutulabilir.
   2. Dnaz tedavi çözüm iyi başına 1 mL ekleyin ve örnekleri 37 ° C'de 3 h için kuluçkaya
   3. Dnaz tedavi çözüm Aspire edin ve 1 x PBS (iyi başına 1 mL) ile örnekleri için 20 dk. tekrar 3 kez yıkayın. Son yıkama 1 x PBS (iyi başına 1 mL) ile bir gecede RT ve 60 rpm'de sallayarak gerçekleştirmek.
   4. (Kontrol noktası) Dnaz tedaviden sonra decellularized örnekleri jelatin benzeri tutarlılık kaybetmiş olun.
      Not: Dnaz tedavi sonra kaldırmak ve örnekleri kolaylıkla entrapped ve pipet ucu bağlı beri 1 x PBS yavaşça ekleyin.

4. decellularized doku hücre kaldırma değerlendirilmesi

1. RT taze yapılmış % 10 formalin tarafsız tampon % 0.03 sulu Eozin 2.5-3 h ile 1 mL ekleyerek örnekleri bir 24-iyi doku kültürü tabak, şey, başına 1 örnek fix
   Not: Decellularized doku leke ve örnek görselleştirme kesit ve histolojik boyama sırasında kolaylaştırmak için sabitleştirici Eozin eklenir. İkisi de histolojik lekeleri ile ne de ayirt teknikleri ile müdahale Eozin eklenmesi. Alternatif olarak, fiksasyon gecede 4 ° C'de gerçekleştirilebilir
2. Sabitleştirici çözümü kaldırmak ve 1 mL 1 x PBS örnek yıkamak için ekleyin.
3. Histoloji işleme jel üreticinin talimatlarına göre bir tek kullanımlık vinil numune kalıp kullanarak sabit bioscaffolds kapsüller.
4. Histoloji jel ile kalıp ve transfer için biyopsi işleme/katıştırma kaset kapağı ile gömülü örnek kaldırın.
   Not: Her örnekte iki biyopsi sünger küçük gözenekli işlemek için alternatif Histoloji içinde gömme ve jel işleme doku var. Örnekleri algılamasını etkinleştirmek için biyopsi sünger ortasına doğru yerelleştirilmiş. Belirtmek gerekirse bazı örnekler bu yaklaşımı kullanarak yerelleştirmek zor olabilir.
5. Art arda gelen incubations (çözüm başına 30 dk) aracılığıyla isoparaffinic Alifatik hidrokarbonlar çözüm (2 kuluçka istasyonu) alkol konsantrasyonu (% 70, %80, % 90'ı, % 100, % 100), bir dizi içinde katıştırma parafin ve parafin (2 kuluçka için örnekleri işleme 56 ° C'de istasyonları)
6. Parafin blok örneklerinde bağlayın.
7. 3 mikron kalınlığında parafin bölümleri bir microtome üzerinde kesme ve bölümleri cam mikroskop slaytlarda toplamak.
8. Kuru parafin kesitler 37 ° C'de gecede
   Not: (Duraklat noktası) parafin kesitler 4 ° C'de daha fazla kullanılmasını kadar saklanır.
9. İletişim kuralı verimliliği doğrulamak için Hematoxilin ve Eozin (H & E) ve (MT) decellularized örnek bölüm ve manipüle olmayan doku üreticinin yönergelerine uygun bölümlerine boyama Masson'ın Trichrome gerçekleştirin.
   Not: H & E lekeleri boyama hücre çekirdeği mavi/mor, sitoplazma koyu pembe/kırmızı ve kollajen soluk pembe ve MT mavi lekeleri nükleuslar siyah, kırmızı, sitoplazma ve kolajen ve müsin. Verimli decellularization gözenekli bir pembe zaman (H & E, MT) elde edilir ve mavi (MT) ağ, nükleer bir leke olmaması durumunda görülmektedir.

5. decellularized doku nükleer malzeme kaldırma değerlendirilmesi

Not: Decellularized doku DNA içeriğine miktar ilgili olmayan manipüle doku ile karşılaştırıldığında gerçekleştirilmesi gerekir.

1. Decellularization önce bir yüksek hassasiyetli digital ölçekte bir 1.5 mL microcentrifuge tüp tartın. Kalp doku transferi tüp, 1 x PBS ekstra miktar kaldırmak ve örnekleri ile tüp tartın. Örnekleri ıslak ağırlığını hesaplamak:
   Örnek_{ıslak ağırlık} ağırlık _{örnekleri ile tüp} -ağırlık _{boş tüp} =
2. 3. adımda açıklandığı gibi örnekleri decellularize.
3. Decellularization sonra decellularized doku microcentrifuge tüp içine toplamak.
   1. Küçük boyutları ve bireysel kardiyak örnekleri ve seti özellikleri kitle nedeniyle havuzu her örnek koşul decellularized dokuları (fetal kalp: 5 tüm kalpleri; yetişkin LV explants: 15 explants). Sigara manipüle doku ile aynı yordamı gerçekleştirin.
      Not: (Duraklat noktası) örnekleri olabilir DNA ekstraksiyon ve miktar gerçekleştirilir kadar-20 ° C de saklanmalıdır.
4. Sigara manipüle kesme ve temiz bir petri bir neşter yardımıyla küçük explants dokularda decellularized.
   Not: her örnek için bir bireysel neşter ve Petri kapları kullanın. Bir neşter ile örnekleri mekanik bozulma onların posterior Enzimatik sindirim ve sonraki DNA ekstraksiyon kolaylaştırır.
5. DNA ekstraksiyon için üreticinin yönergelerine uygun spin-sütun temel DNA ekstraksiyon yöntemi kullanın.
   1. Mekanik Disosiye örnekleri Petri kabına geniş orifis pipet ucu kullanarak üretici yönergelerine göre ana sindirim arabelleği (sindirim tampon ve İndinavir K) ile toplamak.
      Not: Doku lizis İndinavir K sindirim ile daha hızlı decellularized örnekleri var. Farklı örnekleri aynı anda işlemek için tüm örneklerini bozulması en aza indirmek için lysed kadar lysed örnekleri buz üzerinde tutun. Tam örnekleri lizis 4-6 h arasında elde edilir.
   2. Üreticinin yönergelerini göre protokolü ile devam edin.
   3. Decellularized ve sigara decellularized doku örneklerinin ayıklanan DNA verimi artırmak için DNA'sı 25-50 μL ve 100 μL elüsyon arabelleği, anılan sıraya göre elute. Eluted DNA toplamak ve spin-sütun yükleyin. RT santrifüj, 1 dk. için örnekleri üreticinin talimatlarına göre kuluçkaya.
      Not: (Duraklat noktası) DNA örneklerinden elde deposu-20 ° c kadar daha fazla kullanmak olabilir.
6. Ayıklanan DNA örneklerinden üreticinin yönergelerini izleyerek bir floresan dsDNA algılama kiti ile ölçmek.
7. DNA'ın nanogram miligram (decellularization önce) ilk örnek ıslak ağırlığının başı olarak DNA içeriği normalleştirmek.

6. decellularized iskele hücre tohumlama

Not: Tüm çözümleri/reaktifler steril olması gerekir ve tüm müdahalede steril koşullar.

1. Amfoterisin B ve %1 2.5 μg/mL ile 1 x DPBS hazırlamak P/S (penisilin, 100 IU; streptomisin 100 µg/mL).
2. 1 x PBS çözüm son decellularization çamaşır adımından (Adım 3.3.3) kaldırın ve taze hazırlanmış 1 x DPBS/2.5 μg/mL Amfoterisin B/1% P/S çözeltisi kuyu başına 500 μL ekleyin. Örnekler 1-7 gün 4 ° C'de depolayın.
   Not: Örnekleri depolama 4 ° C'de kısırlık korumak önemlidir.
3. P/S son konsantrasyonu % 1 (olmadan FBS ve takviyeleri) Bazal medya hücre ekleyin.
4. 1 x DPBS/2.5 μg/mL Amfoterisin B/1% P/S çözeltisi decellularized örneklerinden Aspire edin. Hücre Bazal media/1% P/S kuyu başına 500 μL eklemek ve 1 h 37 ° c veya daha 1 h için 4 ° C'de equilibrate örnekleri.
5. Faiz hücreleri bölme ve hücre istenen hücre yoğunluğu, küçük aliquots hazırlayın.
   Not: Decellularized doku tohum stereoskopik mikroskop altında ve steril koşullarda gerçekleştirilmesi gerekir. Hücre kültür medya %1 içermesi gerektiğini P/S.
6. Bir de bir 96-şey plaka ortasına DPBS 3-4 μL pipette. İnce ve düz cımbız kullanarak, DPBS damla decellularized iskele transfer, ilave DPBS aspirasyon tarafından kaldırmak ve örnek katlanmış buruşuk ya da değil emin olun. İyi yüzeye uymaları kenarlı kuru haline izin.
   Not: Alt tohum verimi müstakil iskele var.
7. Hücrelerin yavaş yavaş iyi kenarlarını karşı tek hücreli çözüm pipetting tarafından iskele için ekleyin.
   Not: Örneğin, Yenidoğan fare cardiomyocytes ile 7.500 hücreler/mm² ve ölümsüzleştirdi fare yoğunluğu 60-1.500 hücreler/mm²yoğunluğu, Lin⁻ Sca-1⁺ kardiyak progenitör hücre (ICPC^Sca-1) numaralı seribaşı. Hücre yoğunluğu deneysel mantığı göre ayarlayın.
8. DPBS hızlı ortam buharlaşma önlemek için komşu wells ekleyin.
9. kullanılan hücre tipi uydurdugunuz hikayeye bagli kaldim doku kültürü polistren levhalar (TCPS), bioscaffolds için yeni bir kuyu aktarırsanız hücre tohum, 24 saat sonrası. Aksi takdirde, yapışık olmayan hücreleri kaldırmak için orta yerine.
10. Dikkatli bir şekilde medya hücre tipi belirli gereksinimlerine göre değiştirin.

Sonuçlar

Decellularization verimliliği üç ana teknikleri sayesinde tespit edilebilir: makroskopik gözlem, Histoloji ve DNA miktar. Örnekleri yazı-SDS tedavi makroskopik görünümünü hücre kaldırma etkinliğini dolaylı olarak etkiler. SDS kuluçka sonra örnekleri beyazımsı (şekil 1 c) saydam görüntülenmesi gerekir. Fetal (E18) Yetişkin explants bir yarı saydam beyaz görünüşüyle varken decellularized doku tarafından son derece şeffaf bir yap?...

Tartışmalar

Hücre dışı Matriks (ECM) çok sayıda biyoaktif peptidler ve sıkışmışlık büyüme faktörleri bir rezervuar oluşan lifli ve yapışkanlı glikoproteinlerin, son derece dinamik ve karmaşık bir meshwork var. Büyük modülatör hücre adezyon, sitoiskeleti dynamics, hareketliliği/geçiş, nükleer silahların yayılmasına karşı farklılaşma ve Apoptozis ECM aktif olarak hücresel fonksiyon ve davranış düzenlemektedir. Hücresel davranış 2D ve 3D kültürlerde farklı olduğunu bilmek, doğru bir şek...

Malzemeler

Name	Company	Catalog Number	Comments
Equipment
Incubated Benchtop Shaker	Orbital Shakers	IKA:3510001	Recommended
Fluorimeter	-	-	Equipment available
Digital weight scale	-	-	Equipment available
Inverted Microscope	-	-	Equipment available
Cell culture incubator	-	-	Equipment available
Fridge (4ºC)	-	-	Equipment available
Deep freezer (-80ºC)	-	-	Equipment available
Microtome	-	-	Equipment available
Cirurgical Instruments
Vannas Spring Scissors - 2.5mm Cutting Edge	Fine Science Tools	5000-08	Recommended
Dumont 5 Fine Forceps - Biologie/Inox	Fine Science Tools	11254-20	Recommended
Dumont 7 forceps	Fine Science Tools	11272-30	Recommended
Dissecting Scissors, straight	-	-	Tool available
Forceps, serrated, curved	-	-	Tool available
Materials
24 well plates, individually wrapped	VWR	29442-044	-
96 well plates, individually wrapped	VWR	71000-078	-
Steriflip-GV, 0.22µm, PVDF, Radio-Sterilized	Millipore	SE1M179M6	-
Eppendorff	-	-	Material available
15 mL Falcon tubes	Fisher Scientific	430791	-
50 mL Falcon tubes	Fisher Scientific	430829	-
Four-Compartment Biopsy Processing/Embedding Cassettes with Lid	Electron Microscopy Science	70075-B	-
Fisherbrand Superfrost Plus Microscope Slides	Thermo Fisher Scientific	22-037-246	-
Tissue cryopreservation
Shandon Cryomatrix embedding resin	Thermo Scientific	6769006	-
2-METHYLBUTANE ANHYDROUS 99+% (isopentane)	Sigma-Aldrich	277258-1L	-
Dry ice	-	-	-
Decellularization
NaCl	BDH Prolabo	27810.364	-
Na2HPO4	Sigma-Aldrich	S-31264	-
KH2PO4	Sigma-Aldrich	P5379-100g	-
KCl	Sigma-Aldrich	P8041-1KG	-
TrisBASE	Sigma-Aldrich	T6066-500G	-
Sodium dodecyl sulfate	Sigma-Aldrich	L-4390	-
MgCl2	MERCK	1.05833.1000	-
DNAse I	AplliChem	A3778,0050	-
Gentamicin	Gibco	15710-049	-
Fungizone	Gibco BRL	15290-026	-
Deionized water (DI water)	-	-	-
Histology
10 % formalin neutral buffer	Prolabo	361387P	-
Eosin Y AQUEOUS	Surgipath	01592E	Can be replaced by alcoholic eosin
Richard-Allan Scientific HistoGel Specimen Processing Gel	Thermo Fisher Scientific	HG-4000-012	-
Ethanol ethilic alcohol 99,5% anydrous	Aga	4,006,02,02,00	-
Deionized water (DI water)	-	-	-
Clear Rite 3	Richard-Allan Scientific	6915	-
Shandon Histoplast	Thermo Fisher Scientific	RAS.6774006	-
Kits
PureLink Genomic DNA Mini Kit	Thermo Fisher Scientific	K182001	-
Quant-iT PicoGreen dsDNA kit	Invitrogen	P11496	-
Cell culture
DPBS	VWR	45000-434	-
Penicillin-Streptomycin Solution 100X	Labclinics	L0022-100	-
Fungizone	Gibco BRL	15290-026	-
Cell culture media of the cell of interest	-	-	-