Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliği gereklidir. Oturum açın veya ücretsiz deneme sürümünü başlatın.
Pseudomonas aeruginosa, ramnolipid biyoyüzey aktif maddelerini üretir. İnce tabaka kromatografisi, her bir suş tarafından üretilen mono- ve di-ramnolipidlerin oranını tespit eder ve belirler. Toplam ramnolipidlerin miktar tayini, orsinol yöntemi kullanılarak kültür süpernatanlarından ekstrakte edilen bu biyoyüzey aktif maddelerde bulunan ramnoz eşdeğerlerinin değerlendirilmesini içerir.
Çevresel bakteri Pseudomonas aeruginosa, sağlık açısından tehlike oluşturan yüksek antibiyotik direncine sahip fırsatçı bir patojendir. Bu bakteri, önemli biyoteknolojik değere sahip moleküller olan ancak aynı zamanda virülans özellikleriyle ilişkili olan ramnolipidler (RL) olarak bilinen yüksek düzeyde biyoyüzey aktif maddeler üretir. Bu bağlamda, RL'nin tespiti ve miktarının belirlenmesi hem biyoteknoloji uygulamaları hem de biyomedikal araştırma projeleri için yararlı olabilir. Bu makalede, ince tabaka kromatografisi (TLC) kullanılarak P. aeruginosa tarafından üretilen iki RL formunun üretimini tespit etme tekniğini adım adım gösteriyoruz: mono-ramnolipidler (mRL), bir ramnoz parçasına bağlı yağ asitlerinin (esas olarak C10-C10) bir dimerinden oluşan moleküller ve di-ramnolipidler (dRL), iki ramnoz parçasına bağlı benzer bir yağ asidi dimerinden oluşan moleküller. Ek olarak, bir P. aeruginosa kültür süpernatantından ekstrakte edilen bu biyoyüzey aktif maddelerin asit hidrolizine ve ardından orsinol ile reaksiyona giren ramnoz konsantrasyonunun tespitine dayalı olarak toplam RL miktarını ölçmek için bir yöntem sunuyoruz. Her iki tekniğin kombinasyonu, burada PAO1 (filogrup 1), PA14 (filogrup 2) ve PA7 (filogrup 3) tip suşları ile örneklendiği gibi, belirli bir suş tarafından üretilen mRL ve dRL'nin yaklaşık konsantrasyonunu tahmin etmek için kullanılabilir.
Pseudomonas aeruginosa, virülansla ilişkili özelliklerin üretilmesi ve yüksek antibiyotik direnci 1,2 nedeniyle çevresel bir bakteri ve büyük endişe kaynağı olan fırsatçı bir patojendir. Bu bakteri tarafından üretilen karakteristik bir ikincil metabolit, redoks aktivitesine sahip bir antibiyotik olan fenazin piyosiyanin ve proteazelastaz 3 gibi virülansla ilişkili çeşitli özelliklerle koordineli bir şekilde üretilen biyosürfaktan RL'dir. RL'nin tensio-aktif ve emülsifikasyon özellikleri farklı endüstriyel uygulamalarda kullanılmıştır ve şu anda ticarileşti....
Bu prosedür Ek Şekil 1'de şematize edilmiştir. Çalışma için kullanılan reaktifler ve ekipmanlar Malzeme Tablosunda listelenmiştir.
1. TLC kullanılarak P. aeruginosa'nın kültür süpernatantlarında mRL ve dRL'nin saptanması
Bu makalede, her biri farklı RL üretim seviyelerine ve mRL ve dRL oranlarına sahip üç filogrubu temsil etmek için üç farklı P. aeruginosa tipi suş kullanılmıştır. Bu suşlar arasında PAO1 (Avustralya'dan bir yara izolatı, 195522), PA14 (ABD'den bir bitki izolatı, 197723) ve PA7 (Arjantin'den bir klinik izolat,2010 24) bulunur. Negatif bir kontrol olarak, RL üretimi yapamayan PAO1 rhlA mutantı kullanıldı. Tüm suşlar, 37.......
RL'yi tespit etmek ve ölçmek için en doğru yöntem, kütle spektrometresi (MS) ile birleştirilmiş HPLC'dir7,8,27; Bununla birlikte, birçok araştırmacı tarafından erişilemeyebilecek özel ve pahalı ekipman gerektirir. Burada açıklanan yöntemler, RL konsantrasyonlarını tespit etmek ve tahmin etmek için temel laboratuvar malzemeleri ve ekipmanları ile rutin olarak gerçekleştirilebilir, ancak özellikle mRL ve .......
Yazarların ifşa edecek herhangi bir çıkar çatışması yoktur.
GSCh laboratuvarı kısmen Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación e Innovación Tecnológica (PAPIIT), Dirección General de Asuntos del Personal Académico -UNAM'dan hibe IN201222 ile desteklenmektedir.
....Name | Company | Catalog Number | Comments |
1-NAPHTHOL | SIGMA-ALDRICH | 70442 | |
ACETIC ACID | J.T. BAKER | 9508-02 | |
CENTRIFUGE | For centrifuging tubes 1.5 mL and 50 mL | ||
CHLOROFORM | J.T. BAKER | 9180-02 | |
DRYING OVEN | |||
ETHER | J.T. BAKER | 9244-02 | |
GLASS PIPETTE | SIGMA-ALDRICH | CLS706510 | |
HYDROCHLORIC ACID | J.T. BAKER | 5622-02 | |
LB | |||
L-RHAMNOSE MONOHYDRATE | SIGMA-ALDRICH | R-3875 | |
METHANOL | J.T. BAKER | 9049-02 | |
ORCINOL MONOHYDRATE | SIGMA-ALDRICH | O1875 | |
PPGAS Broth | Tris HCL (0.12M), Potassium Chloride ( 0.02M) Ammonium Chloride (0.02M), Peptone (1%), pH 7.4 Autoclaved. Add Glucose (5%) and Magnesium Sulfate (0.0016M) | ||
QUARTZ CELL (CUVETTE) | SIGMA-ALDRICH | Z276669 | |
RECTANGULAR TLC DEVELOPING TANK | FISHER SCIENTIFIC | K4161801020 | |
RHAMNOLIPIDS | SIGMA-ALDRICH | R-90 | |
SPECTROPHOTOMETER | VIS | ||
SPRAYER | SIGMA-ALDRICH | Z529710-1EA | |
SULFURIC ACID | J.T. BAKER | 9681-02 | |
TES TUBES 5mL | CORNING | 352002 | |
TLC SILICA GEL 60 F254 | MERCK | 1.05554.0001 | |
WATER BATH | > 80 °C |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
ISSN 2578-2037
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır
Sitemizdeki deneyiminizi iyileştirmek için çerezleri kullanıyoruz
Sitemizi kullanmaya devam ederek ya da "Devam et" butonuna tıklayarak, çerezleri kabul edebilirsiniz.