Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliği gereklidir. Oturum açın veya ücretsiz deneme sürümünü başlatın.

Özet

Pseudomonas aeruginosa, ramnolipid biyoyüzey aktif maddelerini üretir. İnce tabaka kromatografisi, her bir suş tarafından üretilen mono- ve di-ramnolipidlerin oranını tespit eder ve belirler. Toplam ramnolipidlerin miktar tayini, orsinol yöntemi kullanılarak kültür süpernatanlarından ekstrakte edilen bu biyoyüzey aktif maddelerde bulunan ramnoz eşdeğerlerinin değerlendirilmesini içerir.

Özet

Çevresel bakteri Pseudomonas aeruginosa, sağlık açısından tehlike oluşturan yüksek antibiyotik direncine sahip fırsatçı bir patojendir. Bu bakteri, önemli biyoteknolojik değere sahip moleküller olan ancak aynı zamanda virülans özellikleriyle ilişkili olan ramnolipidler (RL) olarak bilinen yüksek düzeyde biyoyüzey aktif maddeler üretir. Bu bağlamda, RL'nin tespiti ve miktarının belirlenmesi hem biyoteknoloji uygulamaları hem de biyomedikal araştırma projeleri için yararlı olabilir. Bu makalede, ince tabaka kromatografisi (TLC) kullanılarak P. aeruginosa tarafından üretilen iki RL formunun üretimini tespit etme tekniğini adım adım gösteriyoruz: mono-ramnolipidler (mRL), bir ramnoz parçasına bağlı yağ asitlerinin (esas olarak C10-C10) bir dimerinden oluşan moleküller ve di-ramnolipidler (dRL), iki ramnoz parçasına bağlı benzer bir yağ asidi dimerinden oluşan moleküller. Ek olarak, bir P. aeruginosa kültür süpernatantından ekstrakte edilen bu biyoyüzey aktif maddelerin asit hidrolizine ve ardından orsinol ile reaksiyona giren ramnoz konsantrasyonunun tespitine dayalı olarak toplam RL miktarını ölçmek için bir yöntem sunuyoruz. Her iki tekniğin kombinasyonu, burada PAO1 (filogrup 1), PA14 (filogrup 2) ve PA7 (filogrup 3) tip suşları ile örneklendiği gibi, belirli bir suş tarafından üretilen mRL ve dRL'nin yaklaşık konsantrasyonunu tahmin etmek için kullanılabilir.

Giriş

Pseudomonas aeruginosa, virülansla ilişkili özelliklerin üretilmesi ve yüksek antibiyotik direnci 1,2 nedeniyle çevresel bir bakteri ve büyük endişe kaynağı olan fırsatçı bir patojendir. Bu bakteri tarafından üretilen karakteristik bir ikincil metabolit, redoks aktivitesine sahip bir antibiyotik olan fenazin piyosiyanin ve proteazelastaz 3 gibi virülansla ilişkili çeşitli özelliklerle koordineli bir şekilde üretilen biyosürfaktan RL'dir. RL'nin tensio-aktif ve emülsifikasyon özellikleri farklı endüstriyel uygulamalarda kullanılmıştır ve şu anda ticarileşti....

Protokol

Bu prosedür Ek Şekil 1'de şematize edilmiştir. Çalışma için kullanılan reaktifler ve ekipmanlar Malzeme Tablosunda listelenmiştir.

1. TLC kullanılarak P. aeruginosa'nın kültür süpernatantlarında mRL ve dRL'nin saptanması

  1. 24 saat boyunca sıvı ortamda yetiştirilen P. aeruginosa ilgilenilen suşun santrifüjlenmiş suyu ile başlayın (RL'nin üretildiği sabit büyüme fazına ulaşmak için). Tipik olarak, bu kültürler mL başına 1 x 109 bakteri içerir.
  2. Konsantre HCl kullanarak kültürün pH'ını 2'ye ayarlayın.
  3. 50 ....

Temsili Sonuçlar

Bu makalede, her biri farklı RL üretim seviyelerine ve mRL ve dRL oranlarına sahip üç filogrubu temsil etmek için üç farklı P. aeruginosa tipi suş kullanılmıştır. Bu suşlar arasında PAO1 (Avustralya'dan bir yara izolatı, 195522), PA14 (ABD'den bir bitki izolatı, 197723) ve PA7 (Arjantin'den bir klinik izolat,2010 24) bulunur. Negatif bir kontrol olarak, RL üretimi yapamayan PAO1 rhlA mutantı kullanıldı. Tüm suşlar, 37.......

Tartışmalar

RL'yi tespit etmek ve ölçmek için en doğru yöntem, kütle spektrometresi (MS) ile birleştirilmiş HPLC'dir7,8,27; Bununla birlikte, birçok araştırmacı tarafından erişilemeyebilecek özel ve pahalı ekipman gerektirir. Burada açıklanan yöntemler, RL konsantrasyonlarını tespit etmek ve tahmin etmek için temel laboratuvar malzemeleri ve ekipmanları ile rutin olarak gerçekleştirilebilir, ancak özellikle mRL ve .......

Açıklamalar

Yazarların ifşa edecek herhangi bir çıkar çatışması yoktur.

Teşekkürler

GSCh laboratuvarı kısmen Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación e Innovación Tecnológica (PAPIIT), Dirección General de Asuntos del Personal Académico -UNAM'dan hibe IN201222 ile desteklenmektedir.

....

Malzemeler

NameCompanyCatalog NumberComments
1-NAPHTHOLSIGMA-ALDRICH70442
ACETIC ACIDJ.T. BAKER9508-02
CENTRIFUGEFor centrifuging tubes 1.5 mL and  50 mL
CHLOROFORMJ.T. BAKER9180-02
DRYING OVEN
ETHERJ.T. BAKER9244-02
GLASS PIPETTESIGMA-ALDRICHCLS706510
HYDROCHLORIC ACIDJ.T. BAKER5622-02
LB
L-RHAMNOSE MONOHYDRATESIGMA-ALDRICHR-3875
METHANOLJ.T. BAKER9049-02
ORCINOL MONOHYDRATESIGMA-ALDRICHO1875
PPGAS BrothTris HCL (0.12M), Potassium Chloride ( 0.02M) Ammonium Chloride (0.02M),  Peptone (1%), pH 7.4   Autoclaved. Add  Glucose (5%) and Magnesium Sulfate (0.0016M)
QUARTZ CELL (CUVETTE)SIGMA-ALDRICHZ276669
RECTANGULAR TLC DEVELOPING TANKFISHER SCIENTIFICK4161801020
RHAMNOLIPIDS SIGMA-ALDRICHR-90
SPECTROPHOTOMETERVIS
SPRAYERSIGMA-ALDRICHZ529710-1EA
SULFURIC ACIDJ.T. BAKER9681-02
TES TUBES 5mLCORNING352002
TLC SILICA GEL 60 F254MERCK1.05554.0001
WATER BATH> 80 °C

Referanslar

  1. Moradali, M. F., Ghods, S., Rehm, B. H. A. Pseudomonas aeruginosa lifestyle: A paradigm for adaptation, survival, and persistence. Frontiers in Cell Infection and Microbiology. 7, 1-29 (2017).
  2. Gellatly, S. L., Hancock, R. E. W.

Yeniden Basımlar ve İzinler

Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi

Izin talebi

This article has been published

Video Coming Soon

Sitemizdeki deneyiminizi iyileştirmek için çerezleri kullanıyoruz

Sitemizi kullanmaya devam ederek ya da "Devam et" butonuna tıklayarak, çerezleri kabul edebilirsiniz.