Onkogen amplifikasyonu, kanserin kritik bir itici gücüdür. FFPE örneklerinde sitogenetik karakterizasyon, onkogen amplifikasyonunu incelemek için uygun maliyetli bir yoldur. Fokal gen amplifikasyonu ve FFPE örneklerini araştırmak için sağlam ve kapsamlı talimatlar sunuyoruz.
FISH sinyal modelini inceleyerek, bir gen lokusunun amplifiye edilip edilmediği ve nasıl yükseltildiği kesin olarak netleşir. Ekstra kromozomal DNA olarak amplifiye edilen onkogenlerin, akciğer, meme ve beyin kanseri gibi insan kanserlerinde yaygın olduğu bulunmuştur. Tüm genom dizileme ve FISH, ekstrakromozomal DNA'yı tespit etmek için en yaygın kullanılan yöntemlerdir.
FISH'i FFPE dokularına uygulamak zordur çünkü çapraz bağlama artefaktları ve arka plan otofloresansı genellikle veri kalitesini düşürür. Protokolümüz, FFPE örneklerinde FISH sırasında veri kalitesini iyileştirmek için protein ekstraksiyonu ve sindirimi, ısıyla denatüre etme ve otofloresan söndürme teknikleri dahil olmak üzere optimize edilmiş prosedürleri içerir ve bu da hastalarda kanserin ilerlemesi hakkında değerli bilgiler verecektir. Ekstrakromozomal DNA'nın moleküler fonksiyonlarını ve kanser hücrelerinin ekstrakromozomal DNA'yı nasıl koruduğunu inceleyeceğiz.
Sonuçta, kanseri tedavi etmek için onları ortadan kaldırmayı amaçlıyoruz.
