A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Method Article
تحديد وحدات تشكيل المستعمرات (CFU) هو الأسلوب القياسي الذهبي لقياس البكتيريا ، بما في ذلك المتفطرة السلية التي قد تستغرق أسابيع لتشكيل مستعمرات مرئية. هنا نصف وحدة CFU الصغيرة لتحديد CFU مع زيادة كفاءة الوقت ، وتقليل مساحة المختبر وتكلفة الكاشف ، وقابلية التوسع في تجارب الإنتاجية المتوسطة والعالية.
قتل السل (TB) ، وهو السبب الرئيسي للوفاة في جميع أنحاء العالم بسبب عامل معدي ، 1.6 مليون شخص في عام 2022 ، ولم يتجاوزه سوى COVID-19 خلال جائحة 2019-2021. هذا المرض ناجم عن بكتيريا المتفطرة السلية (M.tb). سلالة المتفطرة البوفية Bacillus Calmette-Guérin (BCG) ، لقاح السل الوحيد ، هي أقدم لقاح مرخص في العالم ، ولا يزال قيد الاستخدام. حاليا ، هناك 12 لقاحا في التجارب السريرية وعشرات اللقاحات قيد التطوير قبل السريري. الطريقة المفضلة المستخدمة لتقييم فعالية لقاحات السل في الدراسات قبل السريرية هي تعداد المستعمرات البكتيرية بواسطة فحص وحدات تكوين المستعمرات (CFU). يستغرق هذا الفحص الذي يستغرق وقتا طويلا من 4 إلى 6 أسابيع حتى ينتهي ، ويتطلب مساحة كبيرة للمختبر والحاضنة ، وله تكاليف كاشف عالية ، وعرضة للتلوث. نصف هنا طريقة محسنة لتعداد المستعمرات ، وهي micro-CFU (mCFU) ، والتي تقدم حلا بسيطا وسريعا لتحليل نتائج فعالية لقاح السل . يتطلب اختبار mCFU كواشف أقل بعشرة أضعاف ، ويقلل من فترة الحضانة ثلاثة أضعاف ، ويستغرق من 1 إلى 2 أسابيع للانتهاء ، ويقلل من مساحة المختبر وتكلفة الكاشف ، ويقلل من مخاطر الصحة والسلامة المرتبطة بالعمل مع أعداد كبيرة من M.tb. علاوة على ذلك ، لتقييم فعالية لقاح السل ، يمكن الحصول على عينات من مجموعة متنوعة من المصادر ، بما في ذلك الأنسجة من الملقحة المصابة بالمتفطرات. كما وصفنا طريقة محسنة لإنتاج ثقافة متفطرات أحادية الخلية وموحدة وعالية الجودة لدراسات العدوى. وأخيرا، نقترح اعتماد هذه الأساليب عالميا في الدراسات قبل السريرية لتحديد فعالية اللقاح، مما يؤدي في نهاية المطاف إلى تقليل الوقت في تطوير لقاحات ضد السل.
السل (TB) هو السبب الرئيسي للوفاة في جميع أنحاء العالم من قبل عامل معدي واحد ، بكتيريا المتفطرة السلية (M.tb) ، مما يؤدي إلى مقتل عدد أكبر من الناس أكثر من أي ممرض آخر. في عام 2021 ، كان السل مسؤولا عن 1.6 مليون حالة وفاة وتجاوزه COVID-19 خلال جائحة 2019-20211. علاوة على ذلك ، وفقا لتقرير السل العالمي الصادر عن منظمة الصحة العالمية لعام 2022 ، كانت جائحة COVID-19 مسؤولة عن زيادة حالات السل الجديدة. كما أبلغت منظمة الصحة العالمية عن انخفاض كبير في عدد الأشخاص الذين تم تشخيص إصابتهم بالسل خلال هذه الفترة ، مما قد يزيد من عدد حالات السل1.
Bacillus Calmette-Guérin (BCG) هي سلالة حية موهنة من المتفطرة البوفية المسببة للأمراض ، والتي استخدمت لأول مرة كلقاح منذ أكثر من 100 عام. هذا هو اللقاح الوحيد ضد السل وهو أقدم لقاح مرخص في العالم لا يزال قيد الاستخدام 2,3. حاليا ، هناك 12 لقاحا في مراحل مختلفة من التجارب السريرية4 ، وعشرات اللقاحات قيد التطوير قبل السريري 5,6. يشمل التقييم قبل السريري للقاحات ضد السل تقييم السلامة والمناعة7 ، والتي يمكن الحصول عليها في نماذج حيوانية متنوعة مثل الزرد والفئران وخنازير غينيا والأرانب والماشية والرئيسيات غير البشرية8،9،10. بالإضافة إلى ذلك ، يتطلب تقييم قدرة اللقاح على تحفيز الحماية من عدوى السل المتعدد الأطراف و / أو انتقاله ، أي فعالية اللقاح ، تحدي السل متعدد السل في الجسم الحي 5,11. ومن المثير للاهتمام ، أن تطعيم BCG يحفز تأثيرات غير محددة تؤثر على بقاء مسببات الأمراض البكتيرية والفيروسية الأخرى12,13 من خلال آلية المناعة المدربة14. لتحديد العبء البكتيري القابل للحياة في مصاب ، فإن الطريقة المفضلة هي تعداد المستعمرات البكتيرية من خلال فحص وحدات تكوين المستعمرات (CFU) 5,15. CFU هي وحدة تقدر عدد الكائنات الحية الدقيقة (البكتيريا أو الفطريات) التي تشكل مستعمرات في ظل ظروف نمو محددة. تنشأ وحدات CFU من الكائنات الحية الدقيقة القابلة للحياة والقابلة للتكرار ، ويصعب تقدير العدد المطلق للكائنات الحية الدقيقة داخل كل مستعمرة. من غير المؤكد ما إذا كانت المستعمرة قد نشأت من واحد أو أكثر من الكائنات الحية الدقيقة. تعكس وحدة CFU عدم اليقين هذا ، وبالتالي يمكن ملاحظة تباين كبير في النسخ المتماثلة لنفس العينة. يتطلب هذا الفحص الذي يستغرق وقتا طويلا فنيين متخصصين مدربين للعمل في مرفق من مستوى السلامة الأحيائية 3 (BSL3) ، ومساحة كبيرة للمختبر والحاضنة ، ويستغرق من 4 إلى 6 أسابيع للانتهاء ، وهو عرضة للتلوث.
في هذه الدراسة ، وصفنا طريقة محسنة لتعداد المستعمرات ، micro-CFU (mCFU) ، ونقدم حلا بسيطا وسريعا لتحليل النتائج15،16،17،18،19،20. يتطلب اختبار mCFU كواشف أقل بعشرة أضعاف ، ويقلل من فترة الحضانة ثلاثة أضعاف ، ويستغرق من 1 إلى 2 أسابيع للانتهاء ، ويقلل من مساحة المختبر وتكلفة الكاشف ، ويقلل من مخاطر الصحة والسلامة المرتبطة بالعمل مع أعداد كبيرة من M.tb. نقترح اعتماد هذه الطريقة عالميا للدراسات قبل السريرية لتحديد فعالية اللقاح ، مما يؤدي في النهاية إلى تقليل الوقت في تطوير لقاحات ضد السل. أخيرا ، تم استخدام هذه الطريقة المثلى لتعداد CFU لتحديد ليس فقط المتفطرات ولكن أيضا البكتيريا الأخرى ، مثل الإشريكية القولونية ورالستونيا سولاناسيروم21.
ملاحظة: البروتوكول الموضح هنا خاص ب BCG ولكن يمكن تطبيقه على أي متفطرات. يمكن استخدام BCG كبكتيريا بديلة لتجارب السل عندما لا تتوفر مرافق BSL322. يجب تنفيذ الإجراءات التالية باستخدام BCG في مختبر مستوى السلامة البيولوجية 2 (BSL2) واتباع إرشادات السلامة البيولوجية المناسبة والممارسات المختبرية الجيدة لمعالجة الكائنات الحية الدقيقة من المجموعة الخطرة 2.
1. إعداد الإعلام الثقافي
2. إعداد عينة
3. إنتاج ثقافة BCG
ملاحظة: بالنسبة للدراسات في الجسم الحي للقاحات السل ، فإن الهدف هو تحسين فعالية BCG. لذلك ، عادة ما تستخدم المجموعات الملقحة ضد BCG كعنصر تحكم. تعتبر سلالات BCG المستخدمة للتطعيم البشري مثالية للاختبار في النماذج الحيوانية. في هذه الحالة ، يجب إعادة تشكيل ثقافة BCG وفقا لتعليمات المورد27. ومع ذلك ، يمكن أيضا إنتاج ثقافة BCG للدراسات في الجسم الحي داخليا11. تم إنتاج زراعة BCG أحادية الخلية وموحدة وعالية الجودة لبروتوكولات العدوى في المختبر بنجاح كبير في العديد من الدراسات11،16،18،19،20،26،28،29 ، باستخدام البروتوكول التالي ، والذي يمكن استخدامه أيضا لدراسات التحدي الحيواني.
4. فحص وحدة تشكيل المستعمرة الدقيقة
ملاحظة: بعد الانتهاء من تجربة العدوى في الجسم الحي أو في المختبر ، يمكن إجراء تعداد البكتيريا بواسطة mCFU. بالنسبة للدراسات في الجسم الحي ، يجب أولا تجانس العينات في مضرب حبة أو خالط آخر للأنسجة. بالنسبة للمزارع المختبرية للبلاعم / الخلايا المتغصنة / العدلات المصابة ب BCG ، يجب تحليل العينات باستخدام منظف غير أيوني (على سبيل المثال ، محلول 0.05٪ من منظف غير أيوني وغير مسخ).
الشكل 1. تمثيل تخطيطي لبروتوكول mCFU. (أ) التخفيفات المتسلسلة بمقدار 10 أضعاف للمحللات المحتوية على BCG في صفيحة 96 بئرا. (ب) طبق بتري مربع يحتوي على وسط استزراع صلب ومغطى ب 96 قطرة كل منها 5 ميكرولتر. يتم سحب القطرات مباشرة من لوحة 96 بئرا باستخدام ماصة متعددة القنوات. تم إنشاؤها باستخدام BioRender.com. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 2. وحدات تشكيل مستعمرة صغيرة من BCG بعد 10 أيام من الحضانة. على اليسار ، صورة لطبق بتري مربع مغطى ب 96 قطرة كل منها 5 ميكرولتر ، كما هو موضح سابقا في الشكل 1ب. على اليمين ، تتوافق الصور الفردية المكونة من 3 قطرات مع محللة أصلية (100) وتخفيفين (101 ، 102). تم التقاط الصور باستخدام كاميرا DSRL مزودة بعدسة تكبير 18-55 مم (لوحة) أو عدسة ماكرو 105 مم (قطرات). يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
5. عد وحدات تشكيل المستعمرات الصغيرة في فيجي (ImageJ)
ملاحظة: تسمح طريقة mCFU بتحديد كمية CFU لمجموعات كبيرة من العينات. يمكن تسجيل صور القطرات للتحليل الخلفي لتسهيل عد المستعمرات. يمكن للعديد من أجهزة التصوير الفوتوغرافي إنتاج صور بجودة كافية لهذا الغرض. وتشمل هذه الكاميرات الرقمية وكاميرات الويب والمجاهر المرفقة بالكاميرا والنظارات المكبرة والهواتف المحمولة. يوفر برنامج تحليل الصور المجاني مثل ImageJ إمكانية عد المستعمرات يدويا أو آليا في تلك الصور. لإثبات كلتا الطريقتين ، سيتم استخدام فيجي ، وهو توزيع ل ImageJ الذي يحزم عدة أدوات لتحليل الصور العلمية30. يمكن تنزيل فيجي من https://fiji.sc/.
الشكل 3. طريقة يدوية لحساب mCFU باستخدام المكون الإضافي لعداد الخلايا على برنامج فيجي. تشير النقاط الزرقاء إلى المستعمرات التي نقر عليها المستخدم بالفعل. تعرض القائمة الموجودة على اليمين عدد المستعمرات التي تم حسابها حتى الآن (العدد هو 41). يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 4. طريقة آلية لحساب mCFU باستخدام برنامج فيجي. (أ، ب) يتم تحديد المنطقة ذات الأهمية مع المستعمرات باستخدام أداة التحديد البيضاوي ، ويتم إزالة المنطقة الخارجية باستخدام الأمر الخارجي الواضح. (ج، د) يتم إنشاء صورة بالأبيض والأسود للمستعمرات باستخدام أداة العتبة. (ه، واو) يتم تحديد عدد المستعمرات باستخدام أداة تحليل الجسيمات. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
يزيد اختبار mCFU الموصوف هنا من كمية المعلومات التي يمكن استرجاعها من طبق بتري واحد إلى 96 ضعفا على الأقل. يصور الشكل 5 مقارنة بين طريقتين لتوصيل الدواء للاستخدام المعاد استخدامه لساكوينافير (SQV)31,32 كدواء موجه للمضيف لعلاج السل. في هذا الفحص ، تم...
السل مشكلة صحية عمومية هامة تزداد أهميتها، ولا سيما في البلدان المنخفضة والمتوسطة الدخل. تسبب تعطل أماكن الرعاية الصحية لتشخيص السل وعلاجه أثناء جائحة كوفيد-19 في تأثير سلبي على حدوث الحالات الجديدة1. وبالإضافة إلى ذلك، يجب التصدي على وجه الاستعجال لسلالات السل المتعددة ...
تعلن DP و PJGB أن الدراسة أجريت في غياب أي علاقات تجارية أو مالية يمكن تفسيرها على أنها تضارب محتمل في المصالح.
تم دعم هذا العمل بتمويل داخلي من كلية الطب ، الجامعة الكاثوليكية البرتغالية ، وتمويل خارجي من Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT) ، في إطار المنح UIDP / 04279/2020 و UIDB / 04279/2020 و EXPL / SAU-INF / 0742/2021.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
96-well plates | VWR | 734-2781 | |
DSLR 15-55 mm lens | Nikon | AF-P DX NIKKOR 18-55mm f/3.5-5.6G VR | |
DSLR camera | Nikon | D3400 | |
DSLR macro lens | Sigma | MACRO 105mm F2.8 EX DG OS HSM | |
Fetal calf serum | Gibco | 10270106 | |
Fiji Software | https://fiji.sc/ | Fiji is an open-source software supported by several laboratories, institutions, and individuals. All the required plugins are included. | |
Igepal CA-630 | Sigma-Aldrich | 18896 | |
L-glutamine | Gibco | 25030-081 | |
Middlebrook 7H10 | BD | 262710 | |
Middlebrook 7H9 | BD | 271310 | |
Multichannel pipette (0.5 - 10 µl) | Gilson | FA10013 | |
Multichannel pipette (20 - 200 µl) | Gilson | FA10011 | |
Mycobacterium bovis BCG | American Type Culture Collection | ATCC35734 | strain TMC 1011 [BCG Pasteur] |
OADC enrichment | BD | 211886 | |
Phosphate buffered saline (PBS) | NZYTech | MB25201 | |
RPMI 1640 medium | Gibco | 21875091 | |
Sodium pyruvate | Gibco | 11360-070 | |
Spectrophotometer UV-6300PC | VWR | 634-6041 | |
Square Petri dish 120 x 120 mm | Corning | BP124-05 | |
Tyloxapol | Sigma-Aldrich | T8761 | |
Ultrasound bath Elma P 30 H | VWR | 142-0051 |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved