Materiales y métodos
Cepas de levadura y las condiciones de crecimiento
La cepa de tipo salvaje BY4742 (MATα his3Δ1 leu2Δ0 lys2Δ0 ura3Δ0) fue cultivada en medio rico en YEPD (1% extracto de levadura, 2% de peptona, 2% de glucosa). Las células fueron cultivadas a 30 ° C con rotación agitación a 200 rpm en frascos de Erlenmeyer en un "frasco de volumen / volumen medio de" proporción de 5:1.
El aislamiento de la fracción mitocondrial crudo
- Crecer 1 L de la cultura de la cepa de tipo salvaje BY4742 durante 48 h.
- Vierta la cultura en 500 ml de tubos de centrifugación Nalgene. Equilibrar la carga de la cosecha y las células por centrifugación durante 5 minutos a 3000 xg a temperatura ambiente.
- Decantar células sedimentadas sobrenadante y resuspender en 250 ml de dH2O. Pellet células por centrifugación durante 5 minutos a 3000 xg a temperatura ambiente.
- Decantar células sedimentadas sobrenadante y resuspender en 250 ml de dH2O. Pellet células por centrifugación durante 5 minutos a 3000 xg a temperatura ambiente.
- Determinar el peso húmedo del sedimento celular.
- Volver a suspender las células sedimentadas en un tampón de TDT [2 ml de buffer / g (peso húmedo), las células].
- La transferencia de la suspensión celular a 50 ml tubos de plástico Falcon.
- Gire los tubos a 70 rpm en un agitador durante 20 min a 30 ° C.
- Las células de la cosecha por centrifugación durante 5 minutos a 3000 xg a temperatura ambiente.
- Volver a suspender las células sedimentadas en tampón Zymolyase sin Zymolyase [7 ml de tampón / g (peso húmedo), las células].
- Pellet células por centrifugación durante 5 minutos a 3000 xg a temperatura ambiente.
- Volver a suspender las células sedimentadas en tampón Zymolyase sin Zymolyase [7 ml de tampón / g (peso húmedo), las células].
- Transferencia de suspensión celular a un frasco de vidrio.
- Añadir el polvo de Zymolyase-100T [1 mg de Zymolyase-100T / g (peso húmedo), las células] a la suspensión celular.
- Gire el frasco con la suspensión de células a 70 rpm en un agitador durante 30 min a 30 ° C.
- Esferoplastos transferencia formado debido a la digestión de la pared celular con Zymolyase-100T de 50 ml tubos plásticos de centrífuga.
- Pellet esferoplastos por centrifugación durante 8 minutos a 2200 xg a 4 ° C.
** Todos los pasos posteriores deben llevarse a cabo a 4 ° C o en hielo. Las suspensiones de esferoplastos deberá ser manejado suavemente con pipetas con las puntas cortadas para evitar romper orgánulos .**
- Resuspender esferoplastos pellets en tampón de homogeneización helada [6,5 ml de buffer / g (peso húmedo), las células].
- Pellet esferoplastos por centrifugación durante 8 minutos a 2200 xg a 4 ° C.
- Resuspender esferoplastos pellets en tampón de homogeneización helada [6,5 ml de buffer / g (peso húmedo), las células].
- La transferencia de células a un pre-refrigerados en hielo de vidrio homogeneizador.
- El uso de un mortero apretado, homogeneizar las células, haciendo 15 golpes de la mano del mortero.
- Añadir 1 volumen de tampón de homogeneización helada.
- Transferencia de esferoplastos homogeneizada a 50 ml tubos plásticos de centrífuga.
- Pellet células sin romper, los núcleos y los desechos grandes por centrifugación durante 5 minutos a 1500 xg a 4 ° C.
- Centrifugar el sobrenadante resultante durante 5 minutos a 3000 xg a 4 ° C.
- Centrifugar el sobrenadante resultante durante 15 minutos a 12.000 xga 4 ° C.
- Decantar el sobrenadante y el precipitado se resuspende en helado de tampón de homogeneización [6,5 ml de buffer / g (peso húmedo), las células].
- Centrifugar durante 5 minutos a 3000 xg a 4 ° C.
- Centrifugar el sobrenadante resultante durante 15 minutos a 12.000 xga 4 ° C.
- Decantar el sobrenadante y el precipitado se resuspende en 3 ml de tampón helado SEM.
** A pesar de esta suspensión se enriquece en la mitocondria, que también contiene otros orgánulos como el retículo endoplasmático (microsomas), aparato de Golgi y vacuolas. Para obtener puro mitocondrias, esta fracción mitocondrial crudo puede ser objeto de fraccionamiento adicional, tal como se describe a continuación .**
La purificación de las mitocondrias desprovistas de contaminación por otros orgánulos
- Coloque 1,5 ml de helado de 60% (w / v) de sacarosa en tampón de EM en un tubo de centrífuga Beckman ultra claro.
- Superposición del 60% (w / v) de sacarosa con 4 ml de 32%, 1,5 ml de 23%, 1,5 ml de 15% de sacarosa (todos buffer p / v en EM).
- Colocar 3 ml de la fracción mitocondrial crudo en el SEM de amortiguación en la parte superior del 15% (w / v) de sacarosa.
- Centrífuga en un Beckman SW41 Ti pivotar-Rotor durante 1 hora a 134.000 xg (33.000 rpm) a 4 ° C.
- La forma de la mitocondria intacta una banda de color marrón en el 60% / interfaz de sacarosa del 32%.
- Retire con cuidado sacarosa hasta llegar a la banda mitocondrial.
- Retire la banda mitocondrial utilizando una pipeta con una punta corta y colóquela en un tubo de centrífuga Beckman de la MLS-5 rotor.
- Llenar el tubo con tampón SEM.
- Pellet de las mitocondrias puro por centrifugación en un rotor MLS-5 durante 30 minutos a 10.000 xg (31.000 rpm) durante 30 minutos a 4 ° C.
- Sobrenadante se decanta conuna pipeta.
- Utilice el puro mitocondrias para el análisis de las funciones mitocondriales, y proteoma mitocondrial lipidome, y el ADN mitocondrial.
Reactivos
- TDT buffer [100 mM Tris/H2SO4 (pH 9,4), 10 mM ditiotreitol] (por 15 ml)
- 1,5 ml de 1 M de tampón Tris/H2SO4 (pH 9,4)
- 150 ml de 1 M de TDT
- Volumen de 15 ml
- Buffer Zymolyase [20 mM fosfato de potasio (pH 7,4), 1,2 M sorbitol] (por 100 ml)
- 2 ml de una solución amortiguadora de fosfato de potasio M (pH 7,4)
- 60 ml de 2 M de sorbitol
- Volumen de 100 ml
- Tampón de homogeneización [10 mM Tris / HCl (pH 7,4), 0,6 M sorbitol, 1 mM EDTA, 0,2% (w / v) BSA] (por 250 ml]
- 2,5 ml de 1 M Tris / HCl buffer (pH 7,4)
- 75 ml de 2 M de sorbitol
- 500 l de 500 mM EDTA
- 0,5 g de BSA
- Volumen de 250 ml
- SEM buffer [10 mM MOPS / KOH (pH 7,2), 250 mM de sacarosa, 1 mM EDTA] (por 250 ml)
- 2,5 ml de 1 M MOPS / KOH (pH 7.2)
- 31,25 ml de 2 M de sacarosa
- 500 l de 500 mM EDTA
- Volumen de 250 ml
- EM buffer [10 mM MOPS / KOH (pH 7,2), 1 mM EDTA] (por 250 ml)
- 2,5 ml de 1 M MOPS / KOH (pH 7.2)
- 500 l de 500 mM EDTA
- Volumen de 250 ml