Para comenzar, descargue el repositorio de alineación CLOCCS ingresando el comando en el terminal. Cree un entorno conda usando conda.rec. yml introduciendo el comando en el terminal en la carpeta donde se clonó el repositorio de alineación CLOCCS.
Haga doble clic en el cloccs_v2023. jar ubicado en la carpeta CLOCCS en el repositorio de alineación CLOCCS y espere a que se abra una interfaz gráfica de usuario. La pantalla permite opciones de entrada para la ejecución de CLOCCS y muestra los resultados una vez ejecutado.
Introduzca las condiciones experimentales especificando la temperatura en grados Celsius utilizando el cuadro de texto etiquetado Temperatura y especifique el método de sincronización mediante el menú desplegable Synchro.method. Para ingresar la configuración de los datos de brotación, elija la opción Bud for yeff yeast en el menú desplegable del tipo de modelo. Importe los datos cargando un archivo con el botón Seleccionar archivo o escribiéndolo en los cuadros de entrada de texto del panel Importación de datos.
La primera columna especifica los puntos de tiempo y las otras dos columnas especifican los datos de gemación. Para introducir la configuración de los datos de citometría de flujo, seleccione la sección Flujo en el menú desplegable Tipo de modelo. Importe los datos mediante el panel Importación de datos y haga clic en Seleccionar archivo.
A continuación, seleccione los puntos de tiempo en el cuadro Tiempos de ajuste para los que se debe trazar un ajuste CLOCCS citométrico de flujo. Una vez que se hayan seleccionado todas las entradas para la citometría de gemación o de flujo, haga clic en el botón Aplicar y luego en el botón Muestra en la parte superior de la pantalla. Vea la curva en ciernes o los gráficos de citometría de flujo en la pestaña Ajustes previstos.
Obtenga los parámetros CLOCCS del ajuste seleccionando la ficha Parámetros posteriores. La tabla resultante tiene cada fila que consiste en el parámetro, siendo la última fila la posterior. Las columnas consisten en el parámetro previsto para la media, el intervalo de confianza 2,5% inferior, el intervalo de confianza superior del 97,5% y la tasa de aceptación.
Las curvas de gemación de CLOCCS se ajustaron correctamente, como lo demuestran los puntos de datos que superponen la curva de ajuste correspondiente con una pequeña banda de confianza del 95%. Con los datos de fase del ciclo celular de citometría de flujo, CLOCCS produce un ajuste CLOCCS para cada punto de tiempo seleccionado.
