Trazar las curvas de gemación antes de la alineación utilizando la función de utilidad Python introduciendo el comando en una nueva celda. A continuación, trace las curvas en ciernes después de la alineación. Usando la función de utilidad de Python.
Utilice la comparación de gráfico de líneas de trazado proporcionada en el vial de utilidades de Python para realizar comparaciones de gráficos de líneas en el marco de datos original, alineado o alineado e interpolado. Al escribir el comando en una nueva celda, importe un archivo de lista de genes CSV o TSV en el bloc de notas utilizando el comando en una nueva celda. A continuación, utilice la comparación de mapa de calor de gráfica de función proporcionada en el archivo de utilidades de Python para realizar una comparación de mapa de calor en el marco de datos interpolado alineado y alineado de fase escribiendo el comando en una nueva celda.
Una comparación de los datos transcriptomáticos alineados y no alineados mostró que antes de la alineación, la primera expresión máxima de los experimentos de microarrays parecía alineada con el segundo pico del experimento RNA-seq. Sin embargo, después de la alineación, los primeros picos del ciclo celular de cada conjunto de datos se alinean adecuadamente. La comparación de los datos de fase del ciclo celular a través de experimentos con períodos variables mostró diferencias visibles en el período en las curvas de gemación no alineadas.
Mientras que la alineación de los relojes hizo que las tres curvas se vieran notablemente similares, haciendo posibles las comparaciones de datos experimentales, los datos de fase del ciclo celular para cada punto de línea de vida comparable no fueron idénticos entre las dos condiciones. La comparación de los datos transcriptómicos a través de experimentos con períodos variables mostró que antes de la alineación la dinámica de transcripción de CDC20 no se superponía. Pero después de la alineación, los picos ocurrieron en la misma fase del ciclo celular, pero las formas de las curvas eran diferentes.
Los genes se trazaron como mapas de calor en el mismo orden para las tres condiciones tanto para los no alineados como para los alineados.
