Le maintien de l’intégrité du génome de l’ovocyte est nécessaire pour assurer la fidélité génétique de l’embryon résultant. Nous présentons ici un protocole précis pour détecter les cassures double brin de l’ADN dans les cellules germinales femelles de mammifères.
Les ovocytes sont parmi les cellules les plus grandes et les plus durables du corps féminin. Ils se forment dans les ovaires au cours du développement embryonnaire et restent arrêtés à la prophase de la méiose I. L’état de quiétude peut durer des années jusqu’à ce que les ovocytes reçoivent un stimulus pour se développer et obtenir la compétence nécessaire pour reprendre la méiose. Cet état d’arrêt prolongé les rend extrêmement susceptibles d’accumuler des insultes préjudiciables à l’ADN, qui affectent l’intégrité génétique des gamètes femelles et, par conséquent, l’intégrité génétique du futur embryon.
Par conséquent, le développement d’une méthode précise pour détecter les dommages à l’ADN, qui est la première étape pour l’établissement de mécanismes de réponse aux dommages à l’ADN, est d’une importance vitale. Cet article décrit un protocole commun pour tester la présence et la progression des dommages à l’ADN dans les ovocytes arrêtés en prophase pendant une période de 20 h. Plus précisément, nous disséquons des ovaires de souris, récupérons les complexes cumulus-ovocytes (COC), retirons les cellules cumulus des COC et cultivons les ovocytes dans un milieu Μ2 contenant de la 3-isobutyl-1-méthylxanthine pour maintenir l’état d’arrêt. Par la suite, les ovocytes sont traités avec le médicament cytotoxique et antinéoplasmique, l’étoposide, pour engendrer des cassures double brin (DSB).
En utilisant l’immunofluorescence et la microscopie confocale, nous détectons et quantifions les niveaux de la protéine centrale γH2AX, qui est la forme phosphorylée de l’histone H2AX. H2AX devient phosphorylé sur les sites des DSB après des dommages à l’ADN. L’incapacité à restaurer l’intégrité de l’ADN à la suite d’une lésion de l’ADN dans les ovocytes peut entraîner l’infertilité, des malformations congénitales et une augmentation des taux d’avortements spontanés. Par conséquent, la compréhension des mécanismes de réponse aux dommages de l’ADN et, en même temps, la mise en place d’une méthode intacte pour étudier ces mécanismes sont essentielles pour la recherche en biologie de la reproduction.
Le processus de méiose dans les cellules germinales femelles de mammifères est initié dans les ovaires avant la naissance. Le nombre total d’ovocytes est établi dans les ovaires principalement au cours de l’embryogenèse. Les ovocytes entrent en méiose et restent arrêtés à la prophaseI 1. Après le début de la puberté et la production et l’action endocrinienne de l’hormone folliculo-stimulante (FSH) et de l’hormone lutéinisante (LH), les ovocytes peuvent relancer et terminer la méiose2. Chez l’homme, l’arrêt de la prophase peut durer jusqu’à 50 ans3. Les divisions cellulaires qui suivent l’entrée en méiose I sont asymétriques, ce qui entraîne la production d’un petit corps polaire et d’un ovocyte qui conserve sa taille. Ainsi, la plupart des composants cytoplasmiques sont stockés dans l’ooplasme au début de l’embryogenèse4. Ensuite, les ovocytes entrent en méiose II, sans reformer leur noyau ni décondenser leurs chromosomes, et restent arrêtés à la métaphase II jusqu’à la fécondation5.
Une caractéristique unique qui distingue les ovocytes des cellules somatiques est l’état d’arrêt en prophase I, lorsque l’ovocyte possède un noyau intact (arrêt de la vésicule germinale [GV]), appelé stadeGV 6. Sur la base de l’organisation de la chromatine, les ovocytes de stade GV sont classés en deux catégories : le nucléole non entouré (NSN) et le nucléole entouré (SN)7,8. Dans les ovocytes au stade NSN GV, la chromatine se propage dans toute la région nucléaire et la transcription est active, tandis que dans les ovocytes SN, la chromatine forme un anneau compact qui entoure le nucléole, et la transcription est silencieuse9. Les deux types d’ovocytes au stade GV présentent une compétence méiotique ; ils entrent en méiose au même rythme, mais les ovocytes NSN présentent une faible capacité de développement et ne peuvent pas se développer au-delà du stade embryonnaire à deux cellules10.
L’état prolongé d’arrêt de la prophase I augmente l’incidence de l’accumulation de dommages à l’ADN11. Par conséquent, les mécanismes de réponse aux dommages de l’ADN dans les ovocytes sont essentiels pour permettre la production de gamètes avec une intégrité génétique et pour garantir que l’embryon résultant a un contenu chromosomique physiologique.
Un aspect central de la réponse aux dommages de l’ADN est la réparation de l’ADN. Les principales voies de réparation de la DSB dans les cellules eucaryotes comprennent la jonction d’extrémité non homologue (NHEJ), la recombinaison homologue (HR) et la NHEJalternative 12,13,14,15. Le NHEJ est un mécanisme plus rapide mais plus sujet aux erreurs, tandis que le HR nécessite plus de temps pour être complété mais a une haute fidélité16.
Il n’y a pas assez de connaissances sur les mécanismes que les ovocytes utilisent pour réparer les dommages à l’ADN. Des études ont montré que les dommages à l’ADN induits dans les ovocytes de mammifères adultes par l’utilisation d’agents génotoxiques, tels que l’étoposide, la doxorubicine, les UVB ou les rayonnements ionisants, n’affectent pas le moment et les taux de sortie de l’arrêt de la prophaseI 17. Les ovocytes peuvent subir une dégradation de la GV (GVBD) même en présence de niveaux élevés de dommages. Ces dommages peuvent être déterminés par l’observation de γH2AX. Cette forme phosphorylée de H2AX (γΗ2ΑΧ) est un marqueur DSB, qui est situé sur le site des cassures et fonctionne comme un échafaudage pour aider les facteurs de réparation et les protéines à s’accumuler aux extrémités cassées18.
L’absence d’arrêt du cycle cellulaire à la suite d’une lésion de l’ADN est due à un point de contrôle insuffisant des dommages à l’ADN qui permet aux ovocytes dont l’ADN n’est pas réparé de rentrer dans la méiose. À la suite de niveaux élevés de dommages à l’ADN, un point de contrôle peut maintenir l’arrêt de la prophase grâce à l’activation d’une voie dépendante de l’ATM/Chk1. La réponse limitée des points de contrôle aux ORD est due à l’activation limitée de l’ATM17,19. Dans la phase M de la méiose I, la recherche a montré que les dommages à l’ADN peuvent activer un point de contrôle de la méiose I induite par le point de contrôle de l’assemblage du fuseau (SAC), ce qui empêche l’activation du complexe promoteur de l’anaphase/cyclosome E3 ubiquitine ligase (APC/C) et, par conséquent, la sortie de la phase M. De plus, l’ablation des protéines SAC permet de surmonter l’état d’arrêt de la phase M, soulignant ainsi l’importance de la SAC dans l’établissement du point de chékpoint20 de la méiose I.
Comme le montrent clairement des recherches antérieures, les DSB ne peuvent pas induire un point de contrôle de prophase robuste dans les ovocytes de souris. Si ces dommages ne sont pas réparés, ils peuvent conduire à des embryons porteurs d’anomalies chromosomiques. Par conséquent, il est important d’étudier la réponse aux dommages de l’ADN à différents stades de la gamétogenèse féminine afin de mieux comprendre les voies uniques que les ovocytes utilisent pour faire face aux agressions génétiques potentielles.
Toutes les expériences sur les souris ont été approuvées par les autorités locales (région de Ioannina, Grèce) et menées conformément aux directives 2010/63/UE du Conseil des Communautés européennes. Des expériences ont été menées dans le respect des principes des 3R. Toutes les souris CD-1 utilisées pour les expériences ont été gardées dans l’animalerie de l’Université de Ioannina, en Grèce, dans une pièce à température contrôlée (22 °C) et à humidité (60%) et ont été nourries ad libitum. L’animalerie dispose d’une licence pour l’exploitation d’une installation d’élevage (EL33-BIObr01), d’approvisionnement (EL33-BIOsup01) et d’expérimentations (EL33BIO-exp01).
1. Préparation des réactifs
2. Prélèvement d’ovocytes GV à partir d’ovaires disséqués et induction de DSB
REMARQUE: Tous les outils et solutions doivent être stériles. La manipulation des ovocytes est effectuée à l’aide d’une pipette buccale sous un microscope stéréoscopique (voir le tableau des matériaux), et toutes les gouttes sont recouvertes d’huile minérale (voir le tableau des matériaux et la figure 1E).
Figure 1 : Processus d’isolement des ovocytes. (A) Prélèvement du tissu adipeux péri-ovarien et des segments restants des trompes de Fallope des ovaires dans un milieu M2 avec IBMX. Photographie obtenue à l’aide des oculaires du stéréomicroscope. Barre d’échelle = 1 mm. (B) Ovaires isolés dans un milieu M2 avec IBMX. Image obtenue à l’aide des oculaires du stéréomicroscope. Barre d’échelle = 1 mm. (C) Perforation mécanique des ovaires à l’aide d’une aiguille de 27 G en milieu M2 avec IBMX. Image obtenue à l’aide des oculaires du stéréomicroscope. Barre d’échelle = 1 mm. (D) COC libérés par les ovaires après perforation dans un milieu M2 avec IBMX. Image obtenue à l’aide des oculaires du stéréomicroscope. Barre d’échelle = 100 μm. (E) Prélèvement d’ovocytes à l’aide d’une pipette buccale. (F) Ovocytes dénudés, après l’ablation des cellules cumulus environnantes, en milieu M2 avec IBMX. Image obtenue à l’aide des oculaires du stéréomicroscope. Barre d’échelle = 100 μm. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
3. Fixation des ovocytes et immunofluorescence
REMARQUE: La manipulation des ovocytes est effectuée à l’aide d’une pipette buccale sous un microscope stéréoscopique, et toutes les gouttes sont recouvertes d’huile minérale.
4. Microscopie confocale
REMARQUE: La microscopie confocale doit être effectuée immédiatement pour éviter la réduction de l’intensité de fluorescence après la mise en place des ovocytes dans des boîtes à fond en verre. L’accès à un microscope confocal (voir le tableau des matériaux) avec une platine motorisée est nécessaire.
Figure 2 : Microscopie confocale. (A) Ovocytes fixés après avoir effectué le protocole d’immunofluorescence et la coloration de l’ADN, qui sont dans des gouttes séparées de tampon de lavage, recouvertes d’huile minérale, placées dans une boîte à fond en verre et préparées pour l’imagerie par microscopie confocale. Chaque goutte contient une catégorie expérimentale différente. Image obtenue à l’aide des oculaires du stéréomicroscope. Barre d’échelle = 1 mm/100 μm pour la partie agrandie. (B) Plaque à fond de verre placée sur la platine du microscope confocal. (C) Image en fond clair d’ovocytes obtenue par microscopie confocale. Barre d’échelle = 100 μm. (D) Le système de microscopie confocale. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
5. Analyse d’imagerie
À l’aide de la procédure démontrée ici, les ovaires de souris ont été disséqués, la graisse a été retirée et des ovocytes adultes au stade GV ont été collectés. Ensuite, les cellules de cumulus ont été retirées par pipetage répétitif à l’aide d’une pipette étroite et ont été placées dans des gouttes fraîches de milieu M2-IBMX et recouvertes d’huile minérale sur un bloc chaud (37 °C) (Figure 1A-F). Trois concentrations différentes d’étoposide ont été préparées (5 μg/mL, 20 μg/mL et 50 μg/mL) en utilisant une concentration d’étoposide mère de 20 mg/mL. Les ovocytes de stade GV ont été placés à trois concentrations distinctes d’étoposide pendant 1 h dans des gouttes recouvertes d’huile minérale et protégées de la lumière à 37 °C. Le protocole d’immunofluorescence a ensuite été suivi, tel que décrit en détail dans la section du protocole, et les ovocytes ont été placés dans des boîtes à fond de verre et observés par microscopie confocale (Figure 2).
Dans les ovocytes au stade SN GV, immédiatement après une lésion de l’ADN, la présence de γH2AX a augmenté à toutes les concentrations d’étoposides (5 μg/mL, 20 μg/mL et 50 μg/mL), et le γH2AX a été distribué dans toute la région de l’ADN (Figure 3). La quantification et l’estimation de l’ORD ont été réalisées en observant l’intensité de fluorescence γH2AX sur les sites de l’ADN. La fluorescence γH2AX s’est intensifiée proportionnellement avec l’augmentation des concentrations d’étoposides. De plus, après un arrêt prolongé de la prophase (20 h après le traitement par l’étoposide), les ovocytes du stade GV ont montré la capacité de réduire le nombre et l’intensité des foyers γH2AX, ce qui implique la présence de processus de réparation actifs dans les ovocytes arrêtés au stade GV (Figure 3E).
Contrairement aux ovocytes SN, dans lesquels la fluorescence γH2AX était distribuée à travers l’ADN, dans les ovocytes NSN, γH2AX a été montré dans les foyers immédiatement après le traitement par l’étoposide à 20 μg/mL. Nous avons estimé le nombre de foyers qui coïncidaient avec la zone de l’ADN, calculé la fluorescence de chaque foyer et présenté la fluorescence moyenne de tous les ovocytes. La fluorescence et le nombre de foyers ont montré des différences statistiquement significatives entre les deux catégories d’ovocytes (Figure 4).
La microscopie confocale fournit des informations sur le nombre et l’intensité des foyers dans différentes piles Z, aidant ainsi à identifier la présence de dommages à l’ADN et la dynamique de réparation à des moments distincts. Le balayage Galvano permet un balayage de précision avec un faible bruit de fond et une meilleure analyse des images numérisées.
Figure 3 : Réduction de γH2AX dans les ovocytes de stade SN GV traités avec trois concentrations différentes d’étoposide après un arrêt prolongé de GV. (A) Fluorescence γH2AX dans les ovocytes de stade SN GV 0 h après le traitement par étoposide. Le γH2AX augmente immédiatement après l’exposition à toutes les concentrations d’étoposides, et l’augmentation dépend de la concentration (vert : γΗ2ΑΧ, magenta : ADN). Les images sont des projections Z-stack, et la luminosité/contraste ont été ajustés pour chaque canal à l’aide de Fiji / ImageJ. Barre d’échelle = 10 μm. (B) Graphique de la fluorescence γH2AX dans les ovocytes du stade SN GV 0 h après le traitement avec des concentrations distinctes d’étoposides. Les données représentent la moyenne ± SEM. Chaque point représente un ovocyte (le nombre d’ovocytes est indiqué dans le graphique), (ns = non significatif, ** p < 0,005, **** p < 0,0001, ANOVA à un facteur avec le test de comparaisons multiples de Tukey). (C) Fluorescence γH2AX dans les ovocytes de stade SN GV 20 h après le traitement par étoposide. γH2AX diminue 20 h après l’exposition à toutes les concentrations d’étoposides (vert : γΗ2ΑΧ, magenta : ADN). Les images sont des projections Z-stack, et la luminosité/contraste ont été ajustés pour chaque canal à l’aide de Fiji/ImageJ. Barre d’échelle = 10 μm. (D) Graphique de la fluorescence γH2AX dans les ovocytes de stade SN GV 20 h après le traitement avec des concentrations distinctes d’étoposides. Les données représentent la moyenne ± SEM. Chaque point représente un ovocyte (le nombre d’ovocytes est indiqué dans le graphique), (ns = non significatif, * p < 0,05, ** p < 0,005, *** p < 0,0005, **** p < 0,0001, ANOVA à un facteur avec le test de comparaisons multiples de Tukey). (E) Graphique à barres de la réduction de la fluorescence γH2AX dans les ovocytes de stade SN GV après arrêt de la prophase dans les ovocytes traités par étoposide. Le nombre au-dessus de chaque colonne indique le pourcentage de déclin de la fluorescence γH2AX. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Figure 4 : Phosphorylation de Η2ΑΧ dans les ovocytes de stade NSN GV après traitement par l’étoposide à 20 μg/mL. (A) Images confocales représentatives d’un ovocyte témoin de stade NSN GV (vert : γΗ2ΑΧ, magenta : ADN). Les images sont des projections Z-stack, et la luminosité/contraste ont été ajustés pour chaque canal à l’aide de Fiji/ImageJ. Barre d’échelle = 10 μm. (B) Images confocales représentatives d’un ovocyte de stade NSN GV traité par étoposide (vert : γΗ2ΑΧ, magenta : ADN). Les ovocytes ont été fixés 0 h après le traitement par étoposide. Les images sont des projections Z-stack, et la luminosité/contraste ont été ajustés pour chaque canal à l’aide de Fiji/ImageJ. Barre d’échelle = 10 μm. (C) La fluorescence γΗ2ΑΧ normalisée dans les ovocytes de stade NSN GV après un traitement à l’étoposide à 20 μg/mL. Les données représentent la moyenne ± SEM. Chaque point représente un ovocyte (le nombre d’ovocytes est indiqué dans le graphique), tiré de deux expériences indépendantes (**** p < 0,0001, test t non paramétrique non apparié, test U de Mann-Whitney). (D) Nombre de foyers γΗ2ΑΧ dans les ovocytes du stade NSN GV après un traitement à l’étoposide à 20 μg/mL. Les données représentent la moyenne ± SEM. Chaque point représente un ovocyte (le nombre d’ovocytes est indiqué dans le graphique), tiré de deux expériences indépendantes (**** p < 0,0001, test t non paramétrique non apparié, test U de Mann-Whitney). Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
En utilisant la méthode décrite ici, nous avons détecté des DSB dans les ovocytes de mammifères. Cette méthode permet de détecter et d’étudier le processus de réparation de l’ADN dans les ovocytes. Le même protocole pourrait également être utilisé pour analyser d’autres protéines qui participent aux processus physiologiques dans les ovocytes de mammifères. Il est important d’étudier comment les ovocytes réagissent aux dommages potentiels de l’ADN afin de mieux comprendre la cause de l’hypofertilité féminine chez l’homme.
L’étude de la réponse aux dommages de l’ADN dans les ovocytes de mammifères peut être difficile en raison de la sensibilité des ovocytes. La manipulation des ovocytes nécessite des températures spécifiques et des concentrations de CO 2 et O2. Dans le même temps, les ovocytes doivent être protégés de la lumière. Toute manipulation doit être effectuée à l’aide de pipettes en verre qui ne sont pas trop étroites, car cela pourrait être nocif pour les ovocytes, mais aussi pas trop larges, car cela pourrait provoquer la dilution du milieu et, par conséquent, affecter négativement la procédure de fixation. À chaque étape de fixation, plusieurs gouttes de tampons sont utilisées pour minimiser l’effet de dilution. Une autre façon d’observer les DSB est le test Comet24. Même si cette technique est plus sensible, elle est plus compliquée. Dans le même temps, en utilisant le test Comet, il n’est pas possible de détecter la région exacte de l’ADN où les dommages se produisent, et dans les cellules avec des molécules d’ARN abondantes, comme les ovocytes au stade GV25, le bruit de fond pourrait être augmenté, conduisant à un faux signal de dommages à l’ADN26.
En utilisant le protocole d’immunofluorescence décrit ici, nous pouvons détecter les DSB avec précision et estimer les progrès de la réparation dans les ovocytes au stade GV, comme indiqué par la réduction de la fluorescence γH2AX au fil du temps. Néanmoins, l’une des limites de cette méthode est que certains anticorps peuvent présenter une distribution non spécifique dans tout l’ooplasme, conduisant ainsi à des images avec une fluorescence de fond élevée. Le tampon PFA-Tx-100 est utilisé à la place du PFA séquentiel et du Tx-100, car nous avons observé qu’il améliore le processus de fixation en permettant la détection de moins de bruit de fond et de fluorescence non spécifique. Une deuxième limite de l’utilisation de γH2AX pour la détection DSB est que les dommages ne peuvent pas être estimés après GVBD en raison de la phosphorylation spontanée de γH2AX dans la méiose23.
Dans ce protocole d’immunofluorescence, les ovocytes restent dans un tampon liquide et ne peuvent pas être stockés dans des lames. Ce fait rend difficile la conservation des cellules fixées pendant des jours après l’ajout de l’anticorps secondaire. Afin d’obtenir des images de bonne qualité et de ne pas perdre de signal, il est préférable d’effectuer l’imagerie dans les heures qui suivent l’ajout de l’anticorps secondaire. Il convient également de noter que le balayage des noyaux à travers l’axe Z pourrait affaiblir le signal en raison d’une surexposition. Pour cette raison, il est préférable de réduire la puissance du laser et d’augmenter la vitesse de numérisation.
Enfin, une autre limite du protocole d’immunofluorescence est qu’il ne peut être utilisé que pour les cellules fixes/non vivantes. Par conséquent, nous ne pouvons estimer que la présence et l’absence de facteurs à des moments précis sans savoir s’il y a des fluctuations dans leur concentration ou des changements dans leur comportement au fil du temps. Ce problème pourrait être résolu en utilisant l’imagerie de cellules vivantes et des marqueurs marqués par fluorescence.
Les auteurs n’ont aucun conflit d’intérêts.
Nous reconnaissons le soutien apporté à ce travail par le projet « Mise en place d’infrastructures de renforcement des capacités en recherche biomédicale (BIOMED-20) » (MIS 5047236), mis en œuvre dans le cadre de l’action « Renforcement de l’infrastructure de recherche et d’innovation », financé par le programme opérationnel « Compétitivité, entrepreneuriat et innovation » (CRSN 2014-2020) et cofinancé par la Grèce et l’Union européenne (Fonds européen de développement régional).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
3 mL Pasteur pipettes in LDPE, graduated | APTACA | 1502 | |
10 cc syringes | SoftCare | 114.104.21 | |
Alexa Fluor 488-conjugated goat anti-rabbit Secondary Ab | Biotium | 20012 | |
Anti-phospho-H2A.X (Ser139) | Merck Millipore | 07-164 | |
ARE Heating Magnetic Stirrer | VELP Scientifica | F20500162 | |
BD FALCON 5 mL Polystyrene Round-Bottom Tubes | BD Biosciences | 352054 | |
BD Microlance 3 Needles 27 G - 0.40 x 13 mm | Becton Dickinson | 300635 | |
Bovine Serum Albumin Fraction V | Roche | 10735078001 | |
DMSO Anhydrous | Biotium | 90082 | |
DRAQ7 DNA dye | BioStatus | DR71000 | |
EGTA | Sigma-Aldrich | E4378-25G | |
EMSURE MgCl2. 6H2O | Merck Millipore | 1058330250 | |
Etoposide | CHEMIPHARM | L01CB01 | |
FALCON 14 mL Polystyrene Round-Bottom Tubes | Corning Science | 532057 | |
FALCON Tissue Culture Dishes, Easy-Grip, 35 x 10 mm Style | Corning Science | 353001 | |
Glass Bottom Culture Dishes (35 mm Petri dish/ 14 mm Microwell, No. 0 coverglass) | MatTek Corporation | P35G-0-14-C | |
HEPES | Sigma-Aldrich | H6147-25G | |
HERACELL 150i CO2 Incubator | ThermoFisher Scientific | 50116048 | |
IBMX powder | Sigma-Aldrich | I5879-100MG | |
Leica M125 Stereo Microscope | Leica Microsystems | ||
M16 Medium | Sigma-Aldrich | M7292 | |
M2 Medium | Sigma-Aldrich | M7167 | |
Mineral Oil | Sigma-Aldrich | M5310 | |
NaN3 | Honeywell | 13412H | |
NaOH | Merck Millipore | 1064981000 | |
Nikon AX ECLIPSE Ti2 Confocal Microscope | Nikon Corporation | ||
Nikon SMZ800N Stereo Microscope | Nikon Corporation | ||
Paraformaldehyde | Sigma-Aldrich | 158127 | |
Pasteur pippettes, glass, long form 230 mm | DURAN WHEATON KIMBLE | 357335 | |
pH/ORP meter | Hanna Instruments Ltd | HI2211 | |
Phosphate buffered saline tablets | Sigma-Aldrich | P4417-100TAB | |
PIPES | Sigma-Aldrich | P1851 | |
PMSG Protein Lyophilised | Genway Biotech (now AVIVA Systems Biology) | GWB-2AE30A (now OPPA01037) | |
QBD4 Dry block heater | Grant Instruments (Cambridge) Ltd | A25218 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | |
Whatman Puradisc 25 mm 0.2 μm filters | GE Healthcare | 6780-2502 |
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