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La compartimentazione delle proteine sia all'interno della membrana plasmatica o in sedi intracellulari è un meccanismo di regolazione che possono influenzare notevolmente i risultati di segnalazione, di conseguenza, per comprendere la segnalazione è importante studiare il comportamento spaziale e temporale delle proteine coinvolte. Descriviamo qui un sistema basato TIRF microscopia a studiare trasduzione del segnale in cellule T, ma è ampiamente applicabile.
Signaling viene avviata tramite il recettore delle cellule T (TCR), quando è impegnato da frammenti di peptidi antigenici legati da Complesso Maggiore di Istocompatibilità (pMHC) proteine espresse sulla superficie delle cellule presentanti l'antigene (APC). Il complesso TCR è composto dell'eterodimero TCRαβ legame ligando che associa non covalentemente con CD3 dimeri (e le εδ εγ eterodimeri e la ζζ omodimero) 1. Dopo l'impegno del recettore, le catene zeta CD3 sono fosforilate chinasi della famiglia Src, Lck. Questo porta al reclutamento della famiglia Syk chinasi, ZAP70, che viene poi fosforilato e attivato da Lck. Dopo di che, l'adattatore ZAP70 fosforila proteine LAT e SLP76, avviare la formazione del complesso prossimale segnalazione contenente un gran numero di differenti molecole di segnalazione 2.
La formazione di questo complesso alla fine i risultati di calcio e di Ras-dipendente TRAnscription attivazione del fattore e la conseguente apertura di una complessa serie di programmi di espressione genica che danno luogo a differenziazione delle cellule T 2. Segnali TCR (e la conseguente stato di differenziazione) sono modulati da molti fattori, compresi potenza antigene e diafonia con co-stimulatory/co-inhibitory, chemochine, recettori di citochine e 3-4. Studiare l'organizzazione spaziale e temporale del complesso di segnalazione prossimale in condizioni di stimolazione è, quindi, la chiave per comprendere il percorso di TCR di segnalazione così come la sua regolamentazione attraverso vie di segnalazione di altri.
Un sistema modello molto utile per studiare segnalazione avviata dal TCR a livello della membrana plasmatica di cellule T è vetro supportate bistrati lipidici, come descritto in precedenza 5-6. Possono essere utilizzati per presentare pMHC complessi antigenici, adesione, e molecole co-stimolatorie di cellule T-serve come APC artificiali. Con imaging delle cellule T interagendo con labistrato lipidico totale utilizzando microscopia a fluorescenza riflessione interna (TIRFM), possiamo limitare la eccitazione di 100 nm all'interno dello spazio tra il vetro e la superficie cellulare 7-8. Questo ci permette di immagine in primo luogo gli eventi di segnalazione che si verificano a livello della membrana plasmatica. Come ci interessa nell'imaging l'assunzione di proteine di segnalazione al complesso TCR, descriviamo due telecamera TIRF sistema di imaging in cui il TCR, marcato con Fab fluorescente (frammento legante l'antigene) frammenti di anticorpo H57 (purificato da ibridoma H57-597 , ATCC, ATCC Number: HB-218) che è specifico per TCRβ, e proteine di segnalazione, etichettato con GFP, può essere ripreso simultaneamente e in tempo reale. Questa strategia è necessaria a causa della natura altamente dinamica sia delle cellule T e degli eventi di segnalazione che si verificano al TCR. Questa modalità di imaging ha permesso ai ricercatori di ligandi di immagini singole 9-11, nonché all'assunzione di molecole di segnalazione ai recettori attivati eè un sistema eccellente per studiare biochimica in-situ 12-16.
Procedura sperimentale:
1. Trasfezione con Amaxa mouse cellule T Nucleofector Kit
Descriviamo qui la transfezione di ingenui o attivate in vitro le cellule T primarie con plasmidi di espressione che codificano molecole di segnalazione taggati con GFP, utilizzando il mouse Amaxa cellule T Nucleofector Kit. In vitro attivazione delle cellule T mediante APC spleniche peptide-caricati viene eseguita come descritto prima 7. Tutte le cellule T utilizzati nei nostri studi esprimere la E TCR che riconosce MCC peptide (88-103) legato alla molecola MHC IE k. Trasfezione viene effettuata essenzialmente secondo le raccomandazioni del fabbricante, tuttavia, si presentano alcuni suggerimenti che promuovono la vitalità delle cellule T dopo la trasfezione. Sia la redditività e l'efficienza di trasfezione è molto più alta in vitro in cellule T attivate che in cellule naive.
- Pre-equilibratura del mezzo è molto importante, in quanto morte cellulare risulteranno dalla risospensione delle cellule dopo la trasfezione in mezzo che è freddo o ha un pH diverso da 7,2.
-È importante eseguire una titolazione della dose di plasmide per un numero fisso di celle per ogni costrutto da utilizzare per la trasfezione. Per alcuni costrutti più grandi, più DNA può essere richiesto. DNA dovrebbe essere libero di endotossine.
- I produttori consiglia di girare le cellule a meno di 90x g; nel nostro caso, questa velocità corrisponde a 75x g. La scelta forza centrifuga relativa (RCF) per ottenere un pellet di cellule è forse la variabile più importante, come centrifugazione a bassa RCF impedisce danno alla membrana cellulare.
- Dopo electroporating le cellule, è meglio trasferire immediatamente al pre-equilibrata terreno di coltura. I produttori raccomandano che le cellule essere tenuti in mezzo nucleofector per non più di 15 minuti.
- Da tre a quattro ore di incubazione sono generalmente sufficienti per cellule T di esprimere proteine rivelabile la GFP etichetta. Abbiamo scelto di celle di immagine a questo punto del perché il livello di espressione è basso e manufatti di sovra-espressione dovrebbe essere ridotto al minimo. Se sovra-espressione di una proteina particolare si desidera, tuttavia, le cellule T deve essere rimosso dal mezzo Amaxa dopo 4 ore. Questa operazione viene eseguita nuovamente pellettatura le cellule a RCF bassa e risospensione in pre-equilibrata mezzo di coltura cellulare T supplementato con 50 U / ml di interleuchina 2 (IL-2) ad una densità di 2 milioni di cellule / ml.
2. TIRF Microscopia
Descrizione del microscopio TIRF:
Di seguito viene descritto come allineare il microscopio per l'imaging due canali simultanei. I passaggi necessari sono allineando l'illuminazione TIRF, regolando la potenza del laser, e allineando le due immagini in uscita con risoluzione sub-microsfere.
T-cellule sono estremamente sensibili alle radiazioni laser, e l'illuminazione è limitata ad un totale di 50 μW.
3. Imaging
Una volta che il microscopio è costituito, il passo successivo è quello di preparare camere di flusso di vetro contenenti doppi strati lipidici supportati molecole che presentano l'antigene e l'adesione come descritto in precedenza 6 e quindi eseguire TIRFM delle cellule T trasfettate che interagiscono con ilsubstrato. Il protocollo pubblicato bistrato 5-6 è stata seguita come pubblicato eccetto che i liposomi non sono state incubate per 20 minuti sulla coverglass dopo la camera di flusso è stato assemblato. Invece, HBS-BSA tampone è stato fatto fluire nella cella di flusso immediatamente dopo l'assemblaggio.
4. Image Processing e Analisi dei Dati
Il software genera le immagini delle due telecamere in un singolo fotogramma. L'uscita di ogni telecamera è di 512 x 512 pixel, di conseguenza, l'immagine in uscita è di 1024 x 512 pixel. Le prime immagini devono essere suddiviso in singoli fotogrammi corrispondenti alle due telecamere. Le immagini di sub-risoluzione perle dei due canali sono sovrapposti e sono determinati parametri di allineamento. Una caratteristica specifica per il nostro sistema è un 1 ° di rotazione di un canale rispetto all'altro (vedere Figura 3). La fonte più probabile di questa rotazione è sugli spalti della fotocamera. Dopo tale rotazione trasformazioni lineari ulteriori relativi in X e Y devono essere svolte per allineare perfettamente le microsfere con uno rispetto all'altro. Le immagini di perle vengono ottenuti in ogni esperimento per determinare i parametri precisi per allineare i due canali. Queste trasformazioni lineari e di rotazione vengono poi applicati a tuttiimmagini e quindi essi sono soggetti ad algoritmi di segmentazione e di co-localizzazione di analisi.
5. Risultati rappresentativi
Il sistema qui descritto può essere adattato per studiare valle segnalazione di qualsiasi recettore alla membrana plasmatica. E 'particolarmente informativo in studio TCR di segnalazione in quanto la segnalazione avviene in gruppi otticamente risolti chiamate TCR microcluster o in endosomi, come recentemente descritto 18. Se la segnalazione si è verificato in risoluzione sub-gruppi di recettori o in un-cluster recettori ulteriori esperimenti avrebbe dovuto essere fatto per interpretare i dati. Come già accennato, le catene CD3 del complesso TCR subiscono fosforilazione di Lck chinasi della famiglia Src sulla impegno del TCR di peptide-MHC complessi. La catena CD3ζ fosforilato recluta la chinasi della famiglia Syk ZAP70. Visualizzare il reclutamento di Zap70 riferisce quindi sullo stato di fosforilazione di catena CD3ζ. La forza di stimolazione TCR possono essere modificati mediante peptidi mutati a livello dei residui di contatto dei TCR. Tali peptidi sono chiamati ligandi peptidici alterati (APL). Un esperimento rappresentativo è mostrato in Figura 4, dove i peptidi agonisti recluta robusta ZAP70 ai microcluster TCR, mentre minore è la potenza peptide T102L non riesce a reclutare ZAP70 al TCR microcluster, dimostrando che la catena CD3ζ non è fosforilata in questo caso. Potremmo trarre questa conclusione, perché abbiamo dovuto osservare solo il reclutamento di ZAP70 ai cluster TCR che sono stati facilmente individuati dai TIRFM. Un algoritmo di segmentazione automatica è stato utilizzato per contare il numero di ZAP70 microcluster per cella. Anche mostrato nel film supplementare è l'imaging simultanea di TCR e ZAP70 fluorescenza associata. Si noti la natura dinamica del lamelipodium.
Figura 1. immagine e schematica del lancio TIRF personalizzato. Pannello A mostra la fotografia del lancio TIRF come installato sul microscopio, e pannello B è uno schema di lancio TIRF dimostrare il percorso della luce. L'immagine e schematica che mostra la posizione della lente collettore, il divisore di fascio, il lancio fibra con X, Y e Z regolazioni, la lente collimatrice L1, e la lente di focalizzazione L2 installato nel cubo dicroico e l'obiettivo TIRF. L'inserto mostra la lente di focalizzazione installato nel cubo dicroico.
Figura 2. Immagine e schematica del sistema di due telecamere. Pannello A mostra la fotografia del sistema a due fotocamera collegata al microscopio, e pannello B è una vista schematica dello stesso. L'immagine e schematica mostrano la posizione dell'obiettivo, specchio, dicroico, lenti tubo TL1 e TL2, emissione filtri F1 e F2, le due telecamere C1 e C2 su terede sta con loro rispettivi X, Y e Z regolazioni.
Figura 3. Uso della sub-risoluzione perline per allineare i due canali. Pannelli A e B mostrano sovrapposizioni di sub-risoluzione perline prima (pannello A) e dopo (Panel B) allineamento. Pannello A mostra che uno dei canali è ruotato rispetto all'altro. I pannelli C e D sono una sezione sub delle immagini in A e B. E Panel mostra una sovrapposizione di immagini due canali delle cellule senza trattamento. Parametri utilizzati in allineamento pannello D sono stati applicati all'immagine mostrata in comunicazione pannello F. come il lamelipodium dai due canali è perfettamente allineato in F pannello e non in bar pannello E. Scala 4 um per tutti i pannelli.
Figura 4. ZAP70 reclutamento TCR microcluster in risposta a diversi APL. In-vitro attivato e T cellule sono state trasfettate con un plasmide codificante ZAP70 fuso GFP e sono stati incubati su vetro supportate Ni-NTA bistrati contenente 6 molecole / 2 micron di peptide caricato His-tag k-IE, 100 molecole / 2 micron di Alexa647 coniugato His-tagged ICAM- 1 e 100 molecole / um 2 di GPI-ancorata CD80. I peptidi caricati sono indicati nel cestello. ICAM-1 si riferisce a cellule di bistrati contenenti 100 molecole / um 2 di Alexa-647 coniugato His-tag ICAM-1. Doppio canale di acquisizione simultanea di microscopia TIRF è stata eseguita in presenza continua di Alexa546 coniugato H57 frammento Fab (non-blocking) per colorare il TCR. Le cellule sono state ripreso fino ad un'ora dopo il contatto iniziale con il doppio strato. Numero di ZAP70 cluster per cella sono stati analizzati utilizzando un sistema automatico di conteggio software cluster. Almeno 40 cellule sono state analizzate in ciascun caso. Scala grafica 2 pm per tutte le immagini.
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Figura 5. Allineamento del sistema a due telecamera utilizzando due diversi tipi di telecamere. Questo pannello mostra la sovrapposizione allineata di sub-risoluzione perline fotografato utilizzando il sistema a due camera in cui le due fotocamere hanno dimensioni di pixel differenti (Verde: 6,45 micron ripreso dimensione del pixel a binning 2x2 e Rosso: 16 micron pixel size ripreso senza binning). Inserto mostra la vista ingrandita della scatola quadrato al centro del campo. Scala grafica 5 micron.
Movie supplementare. ZAP70 reclutamento microcluster TCR in risposta al peptide agonista. In-vitro attivate e le cellule T sono state trasfettate con un plasmide codificante ZAP70 fuso GFP e sono stati incubati su vetro supportate Ni-NTA bistrati contenente 6 molecole / 2 micron di peptide caricato His-tag k-IE, 100 molecole / 2 micron di Alexa647 coniugato His-tagged molecole ICAM-1 e 100/2 micron di GPI-ancorata CD80. Dual channel simultanea unocquisition microscopia TIRF è stata eseguita in presenza continua di Alexa546 coniugato H57 frammento Fab (non-blocking) per colorare il TCR. Un campo di cellule trasfettate è stato ripreso più volte 40 volte con una risoluzione temporale di 10 secondi per fotogramma. Scala grafica 2 micron. Clicca qui per vedere il film supplementari .
Descriviamo qui un sistema di segnalazione per studiare in antigene-specifiche cellule T primarie topo usando TIRFM e bistrati lipidici vetro supportate come APC artificiali. La tecnica si basa sul successo esprimenti proteine GFP etichetta in queste cellule. Trasfezione delle cellule T è sempre un compito impegnativo. Tipicamente, consegna elettroporazione o gene usando retrovirus o lentivirus vengono utilizzati. Una tecnica non è superiore rispetto all'altra, entrambi hanno i loro limiti e vantaggi. Troviamo che elettroporazione presenta i seguenti vantaggi: 1) non è necessario che le cellule attivamente divisione come è richiesto per i retrovirus ma non lentivirus, e 2) Il livello di espressione può essere controllato variando il tempo di incubazione le cellule sono prima di imaging. Il più grande svantaggio è che ci trovano molto difficile esprimere proteine che sono di grandi dimensioni in cellule primarie. Abbiamo presentato un metodo che ci dà la vitalità cellulare molto buono dopo l'elettroporazione. Come risultato è applicable di usarlo per raggiungere mediata silenziamento del gene siRNA.
Noi descriviamo anche qui una personalizzata due canali simultanei microscopio TIRF acquisizione che è cromaticamente corretto e non richiede l'allineamento separato per diverse lunghezze d'onda. Queste funzionalità, tuttavia, sono disponibili commercialmente. Il nostro sistema si basa su principi di microscopia TIRF pubblicato da esperti del settore ed è più economica rispetto alle alternative commerciali. Una possibile critica del nostro progetto è che stiamo usando lo stesso angolo di incidenza per le diverse lunghezze d'onda di eccitazione. Ciò comporterebbe una diversa profondità di penetrazione TIRF per lunghezze d'onda di eccitazione differenti. Riteniamo che questi effetti sono piccole perché l'onda evanescente è un campo di decadimento esponenziale e la profondità del campo TIRF è una funzione lineare di lunghezza d'onda. Fluorofori vicino alla superficie di vetro non si è avuta differenza di intensità tra i laser due lunghezze d'onda. Per fluorofori vicino al peprofondità netration, la differenza di intensità sarà 1,3 volte per le due lunghezze d'onda 488 e 640 nm e 1,15 volte per il due lunghezze d'onda 488 e 561 nm. Lo stesso sistema può essere utilizzato in combinazione con tecniche di risoluzione super che fanno uso di illuminazione TIRF.
Abbiamo anche descritto un sistema a due fotocamera che è costruito su misura. Come il sistema TIRF, apparati simili sono anche commercialmente disponibili. Il nostro sistema offre flessibilità per cambiare i filtri ei dicroici, consentendone l'uso con diverse combinazioni di lunghezze d'onda. L'inconveniente del nostro sistema è un grado di rotazione necessaria per allineare le due immagini. Questo problema può essere risolto utilizzando stand della fotocamera che vengono guidati piezo e offrono gradi di rotazione di allineamento. Abbiamo anche implementato con successo un sistema a due telecamera sul microscopio, in cui le telecamere sono diversi e hanno dimensioni differenti pixel. Un sistema come questo sarebbe utile se quella necessaria sensibilità in un canale ed un grande dygamma dinamica in un altro, entrambi i quali sono raramente disponibili nella camera stessa. Abbiamo usato la HQ-2 Photometrics fotocamera binning 2x2 darci una dimensione in pixel effettivi di 12,9 micron con la Quant-EM camera Photometrics che ha una dimensione del pixel di 16 micron. A mm 180 focale lunghezza del tubo è stato utilizzato per la Quant-EM e 145 millimetri di lunghezza focale lente del tubo è stato utilizzato per la HQ-fotocamera da 2. La HQ-2 è stato controllato tramite Metamorph software e la Quant-EM è stato controllato tramite micro-manager software su un computer separato in modalità trigger esterno. Il trigger esterno è stato fornito al Quant-EM fotocamera utilizzando un uscita digitale della scheda DAC misura di calcolo, che è stato implementato come uno scatto aggiuntivo di configurazione delle impostazioni di illuminazione di Metamorph. Il rapporto tra le lunghezze focali delle lenti tubo corrisponde al rapporto tra le dimensioni effettive pixel. Un allineamento rappresentante è illustrato nella figura 5.
Tutti gli animali utilizzati in questi esperimenti sono state mantenute in uno specifico ambiente privo di agenti patogeni, e gli esperimenti sono stati approvati dal National Institutes of Health Care degli animali e del Comitato uso.
Questa ricerca è stata sostenuta dalla Divisione di Ricerca intramurale dell'Istituto Nazionale per le allergie e malattie infettive, National Institutes of Health. Siamo grati a Johannes Huppa e Mark Davis per averci fornito con il scFv di H57 utilizzato in questi studi. RV ringrazia Keir Neumann di discussione utile durante lo sviluppo di questa tecnica.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Nome del reattivo | Azienda | Numero di catalogo | Comments |
Amaxa Nucleofector Kit per mouse cellule T | Lonza Inc. | VPA-1006 | |
PureLink HiPure plasmide Midiprep Kit | Life Technologies | K2100-05 | Per le preparazioni di DNA endotossine gratis |
Amaxa Nucleofector dispositivo | Lonza Inc. | AAD-1001 | |
Ricombinante murino IL-2 | Peprotech Inc. | 212-12 | |
Fluoresbrite Multifluorescent Microsfere 0.20μm | Polysciences, Inc. | 24050-5 | |
Lab-Tek II 8-ben chambered coverglass | Thermo Scientific, Nunc | 155409 |
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