Analisi delle proteine delle cellule ospiti utilizzando perle di arricchimento accoppiate a digestione limitata

Abbiamo sviluppato un metodo altamente sensibile per rilevare quelle proteine della cellula ospite poco abbondanti dal prodotto farmaceutico utilizzando le perle di arricchimento del proteoma. Questo approccio ci aiuta a trovare la causa principale e il rischio associato al prodotto farmaceutico. Esistono diversi modi per migliorare il limite di rilevamento dell'analisi degli HCP, il metodo non mirato, tra cui, a titolo esemplificativo ma non esaustivo, la deplezione della proteina A, la digestione limitata, il cutoff del peso molecolare, l'immunoprecipitazione.

Il modo mirato per rilevare la proteina della cellula ospite, tra cui la cromatografia liquida, il monitoraggio delle reazioni multiple e il monitoraggio delle reazioni parallele della cromatografia non liquida. La sfida principale associata a queste analisi HCP è la significativa gamma dinamica tra il farmaco anticorpale e le proteine della cellula ospite. Quindi la maggior parte dei metodi mira a ridurre la quantità di anticorpi e arricchire l'HCP prima dell'analisi LCMS per diminuire l'intervallo dinamico tra i peptidi anticorpali e i peptidi HCP.

Quindi la tecnologia ProteoMiner e il protocollo di digestione limitato migliorano significativamente il limite di rilevamento dell'analisi HCP rispetto ad altri metodi. È imparziale rispetto all'immunoprecipitazione e può essere applicato a diversi moduli farmacologici rispetto al metodo di deplezione della proteina A. Anche questo protocollo è semplice e diretto.

Quindi la tecnologia ProteoMiner e il protocollo di digestione limitato ci aiutano a identificare diversi HCP che degradano il polisorbato e il farmaco anticorpale frammento. In combinazione con il metodo nano LCMPRM, il metodo di arricchimento può anche fornire risultati quantitativi per trovare la concentrazione biologicamente rilevante delle proteine problematiche della cellula ospite.