Per iniziare, apri il software di analisi dei dati. Nell'angolo in alto a sinistra, fai clic sul pulsante del file e seleziona Apri. Per selezionare i file desiderati, fare clic con il pulsante destro del mouse sul nome del file e selezionare le proprietà.
Quindi selezionare lo stato della calibrazione. Nella casella a discesa, selezionare la calibrazione interna per lo spettrometro di massa. Assicurarsi che tutti gli errori siano inferiori a una parte per milione.
Successivamente, selezionare la calibrazione della mobilità interna e verificare che l'errore sia inferiore a una parte per milione. Quindi, fai clic con il pulsante destro del mouse su cromatogramma e seleziona Modifica cromatogramma. Al tipo, fare clic sulla casella a discesa e selezionare cromatogramma ionico estratto.
In filtro, selezionare tutti gli MS e, per la modalità di scansione, selezionare tutti per visualizzare i picchi della molecola di interesse anziché solo i suoi frammenti. Ci sono due opzioni di filtro per la selezione delle molecole, le masse o la formula. Se si seleziona la massa, scegliere la teorica M su Z della molecola di interesse, che in questo caso è 829,7985.
Se si seleziona la formula, scegliere la formula per la molecola e le forme ioniche di interesse, che in questo caso è l'ammonio. Per la larghezza, selezionare più o meno uno. Per la polarità, assicurarsi che mantenga la modalità positiva.
In mobilità, selezionare da 1,455 a 1,465 per isolare la molecola di interesse e filtrare le molecole che non rientrano in questi valori. Una volta selezionati i parametri, fai clic su modifica seguito da OK in alto a destra. Dopo un breve periodo di tempo, il software elaborerà le selezioni e produrrà un cromatogramma.
Fare clic con il pulsante destro del mouse sulla linea di base dell'origine del picco di interesse e trascinare tenendo premuto fino alla fine del picco per ottenere uno spettro di massa in tempo reale di frammenti entro quel tempo di ritenzione. Fare clic con il pulsante destro del mouse sulla sinistra dello schermo su mobilogram e selezionare Modifica mobilogram. Apparirà una finestra chiamata modifica tracce del mobilogramma.
Seguire i passaggi illustrati in precedenza. Per il tempo di conservazione, immettere il tempo di conservazione del picco di interesse. Una volta selezionati i parametri, fai clic su Aggiungi e OK in alto a destra.
Attendere che il software elabori le selezioni e produca un cromatogramma. Per estrarre gli ioni, ripetere i passaggi dimostrati in precedenza fino a formare un elenco di ioni. Nella parte inferiore della finestra MS, selezionare il profilo MS e il frammento MS per consentire una visualizzazione dello spettro degli ioni da una scansione completa e passiva.
Per la vista spettro, fare clic con il pulsante destro del mouse e selezionare Copia spettri composti. I dati dello spettro che appaiono a destra possono fornire ulteriori informazioni sul composto, come la risoluzione della risoluzione, la potenza, l'intensità e il rapporto segnale/rumore. Per elaborare i dati, è necessario integrare manualmente il cromatogramma e i picchi di mobilità per ottenere informazioni preziose sulla molecola di interesse.
Fare clic con il pulsante destro del mouse, trovare e selezionare i composti manualmente, cromatogramma o mobilogramma. Fare clic con il pulsante sinistro del mouse ed evidenziare il picco desiderato. Le informazioni ottenute includono il tempo di ritenzione, l'area, il rapporto segnale/rumore e la mobilità.