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요약

이 분석은 3D 콜라겐 젤에서 배양된 배아체로 분화된 마우스 배아 줄기 세포를 활용하여 시험관 내에서 발아 혈관신생을 제어하는 생물학적 과정을 분석합니다. 이 기술은 약물 테스트, 질병 모델링 및 배아적으로 치명적인 결실의 맥락에서 특정 유전자를 연구하는 데 적용될 수 있습니다.

초록

유도만능줄기세포(iPSC) 및 유전자 편집 기술의 최근 발전으로 표현형 약물 발견(PDD) 프로그램을 위한 새로운 인간 세포 기반 질병 모델을 개발할 수 있습니다. 이러한 새로운 장치는 인간에서 시험용 약물의 안전성과 효능을 보다 정확하게 예측할 수 있지만, 클리닉으로의 개발은 여전히 포유류 데이터, 특히 마우스 질병 모델의 사용에 크게 의존하고 있습니다. 따라서 인간 오가노이드 또는 장기 온 칩 질병 모델과 병행하여 관련 시험관 내 마우스 모델의 개발은 종과 생체 내 및 시험관 내 조건 간의 직접적인 약물 효능 및 안전성 비교를 평가하기 위한 충족되지 않은 요구입니다. 여기에서는 배아체(EB)로 분화된 마우스 배아줄기세포를 활용하는 혈관 발아 분석법을 설명합니다. 3D 콜라겐 젤에 배양된 혈관화된 EB는 확장되는 새로운 혈관을 발달시키는데, 이를 발아 혈관신생이라고 합니다. 이 모델은 내피 팁 세포 선택, 내피 세포 이동 및 증식, 세포 유도, 튜브 형성 및 벽화 세포 모집을 포함하여 기존 혈관 네트워크에서 혈관의 생체 내 발아 혈관 신생의 주요 특징을 요약합니다. 혈관신생을 조절하는 약물 및 유전자를 스크리닝할 수 있으며 인간 iPSC 기술을 기반으로 하는 최근 설명된 3차원(3D) 혈관 분석과 유사성을 보여줍니다.

서문

지난 삼십 년 동안 표적 기반 약물 발견(TDD)은 제약 산업의 약물 발견에 널리 사용되었습니다. TDD는 질병에서 중요한 역할을 하는 정의된 분자 표적을 통합하고 약물 스크리닝을 위한 비교적 간단한 세포 배양 시스템 및 판독값의 개발에 의존합니다1. TDD 프로그램에 사용되는 가장 일반적인 질병 모델에는 암세포 또는 인공 환경 및 비생리학적 기질 내에서 성장한 불멸화된 세포주와 같은 전통적인 세포 배양 방법이 포함됩니다. 이러한 모델 중 다수가 성공적인 약물 후보를 식별하기 위한 실행 가능한 도구를 제공했지만, 질병 관련성이 낮기 때문에 이러한 시스템의 사용은 의심스러울 수 있다2.

대부분의 질병에서 기본 메커니즘은 실제로 복잡하며 다양한 세포 유형, 독립적인 신호 전달 경로 및 여러 유전자 세트가 특정 질병 표현형에 기여하는 것으로 종종 발견됩니다. 이것은 주요 원인이 단일 유전자의 돌연변이인 유전 질환의 경우에도 마찬가지입니다. 최근 인간 유도만능줄기세포(iPSC) 기술과 유전자 편집 도구의 출현으로 이제 생체 내 인간 복잡성을 더 잘 요약할 수 있는 3D 오가노이드 및 장기 칩 질병 모델을 생성할 수 있습니다 3,4. 이러한 기술의 개발은 표현형 약물 발견(phenotypic drug discovery, PDD) 프로그램에 대한 관심의 부활과 관련이 있다1. PDD는 특정 약물 표적의 정체성에 대한 지식이나 질병에서의 역할에 대한 가설에 의존하지 않기 때문에 경험적 스크리닝과 비교할 수 있습니다. PDD 접근법은 이제 first-in-class 약물 발견에 크게 기여하는 것으로 점점 더 인식되고 있다5. 인간 오가노이드 및 장기 온 칩 기술의 개발은 아직 초기 단계에 있기 때문에 iPSC 모델(혁신적인 이미징 및 기계 학습 도구6,7로 보완됨)은 가까운 장래에 TDD 접근 방식의 낮은 생산성을 극복하기 위해 약물 스크리닝 및 관련 PDD 프로그램을 위한 여러 새로운 복합 세포 기반 질병 모델을 제공할 것으로 예상됩니다8, 9입니다.

인간 오가노이드 및 장기 칩 모델은 질병의 복잡성과 신약 식별에 대한 중요한 통찰력을 제공할 수 있지만, 약물을 새로운 임상 실습에 도입하는 것은 효능과 안전성을 평가하기 위해 동물 모델의 데이터에 크게 의존합니다. 그 중에서도 유전자 변형 마우스는 확실히 가장 선호되는 포유류 모델입니다. 그들은 포유류의 생성 시간이 비교적 짧고 인간 질병과 유사한 표현형이 많으며 유전적으로 쉽게 조작할 수 있기 때문에 많은 장점이 있습니다. 따라서 약물 발견 프로그램10에서 광범위하게 사용된다. 그러나 생쥐와 인간 사이의 격차를 해소하는 것은 여전히 중요한 과제로 남아 있습니다11. 인간 오가노이드 및 장기 칩 모델과 동등한 시험관 내 마우스 모델의 개발은 생체 내 마우스와 체외 인간 데이터 간의 직접적인 약물 효능 및 안전성 비교를 허용하기 때문에 이 격차를 적어도 부분적으로 채울 수 있습니다.

여기서, 마우스 배아체(EB)의 혈관 발아 분석이 설명됩니다. 혈관은 내피 세포(혈관벽의 내벽), 벽화 세포(혈관 평활근 세포 및 혈관주위세포)로 구성됩니다12. 이 프로토콜은 새로운 내피 세포 및 벽화 세포 분화를 요약하는 매달린 물방울을 사용하여 마우스 배아 줄기 세포(mESC)를 혈관화된 EB로 분화하는 것을 기반으로 합니다13,14. 마우스 배반포는 상이한 유전적 배경을 갖는 3.5일째 마우스 배반포로부터 배양물에서 쉽게 확립될 수 있다15. 그들은 또한 클론 분석, 혈통 추적에 대한 가능성을 제공하며 질병 모델13,16을 생성하기 위해 유전적으로 쉽게 조작할 수 있습니다.

혈관이 모든 장기에 영양을 공급하기 때문에 전부는 아니더라도 많은 질병이 미세 혈관 구조의 변화와 관련이 있다는 것은 놀라운 일이 아닙니다. 병리학적 상태에서, 내피 세포는 활성화된 상태를 채택하거나 기능 장애를 일으켜 벽화 세포 사멸 또는 혈관으로부터의 이동을 초래할 수 있다. 이들은 과도한 혈관신생 또는 혈관 희박화를 초래할 수 있고, 비정상적인 혈류를 유도할 수 있고, 면역 세포 유출 및 염증을 유발하는 혈관 장벽 결함을 유발할 수 있다12,17,18,19. 따라서 혈관을 조절하는 약물 개발에 대한 연구가 많이 이루어지고 있으며 치료 표적화에 대한 여러 분자 플레이어와 개념이 이미 확인되었습니다. 이러한 맥락에서 설명된 프로토콜은 내피 팁 및 줄기 세포 선택, 내피 세포 이동 및 증식, 내피 세포 안내, 튜브 형성 및 벽화 세포 모집을 포함하여 생체 내 발아 혈관신생의 주요 특징을 요약하기 때문에 질병 모델 구축 및 약물 테스트에 특히 적합합니다. 또한 인간 iPSC 기술20을 기반으로 최근에 기술된 3D 혈관 분석과 유사성을 보여줍니다.

프로토콜

1. mESC의 배지 준비 및 배양

  1. 보충제를 사용하여 컨디셔닝된 배지 +/-(CM+/-)를 준비합니다. 10%(vol/vol) 열 비활성화 태아 소 혈청(FBS), 0.05mM β-메르캅토에탄올, 1x 비필수 아미노산(NEAA 1x), 2mM L-글루타민 및 1mM 피루브산나트륨이 포함된 1x Glasgow MEM(G-MEM BHK-1) 배지.
  2. 백혈병 억제 인자(LIF)(1,500U/mL) 및 0.1mM β-메르캅토에탄올이 포함된 보충 CM+/- 배지를 사용하여 조건화된 배지 +/+(CM+/+)를 준비합니다.
  3. 1μM PD0325901 및 3μM CHIR99021과 함께 보충 CM+/+ 배지를 사용하여 두 가지 억제제(CM+/+ 2i)가 있는 상태에서 조건화된 배지 +/+를 준비합니다.
  4. 칼슘과 마그네슘(DPBS)이 없는 인산염 완충 식염수 500mL에 미리 예열된 2% 젤라틴 용액 25mL를 혼합하여 0.1% 젤라틴 용액을 준비합니다.
  5. 트립신(2.5%)과 TVP 1x(9.5% 10x DPBS, 1mM EDTA, 0.01% 치킨 혈청, 0.01% 트립신(2.5%) H2O)(1:10 비율, vol/vol).
    알림: 0.22μm 기공 필터를 통해 모든 용액을 필터링합니다. 배양 배지를 -20°C에서 장기간 보관하고 다른 시약은 4°C에서 최대 3주 동안 보관합니다( 재료 표 참조).
  6. 2개의 12-웰 세포 배양 플레이트를 0.1% 젤라틴 용액(웰당 500μL)으로 코팅하고 CO2 인큐베이터(37°C, 5%CO2, 습한 분위기)에서 30분 동안 배양합니다.
  7. PBS로 젤라틴 코팅된 플레이트를 세척하고 500μL의 CM+/- 배지를 추가합니다.
  8. 37°C에서 1 x 106 냉동 보존된 방사선 조사된 마우스 배아 섬유아세포(MEF)의 두 바이알을 해동하고 세포 현탁액을 5mL의 CM+/- 배지가 있는 원뿔형 튜브로 옮깁니다.
  9. 실온(RT)에서 5분 동안 200 x g 에서 세포를 원심분리합니다. 배지를 흡인하고 mL당 1.67 x 105 세포의 농도로 CM+/- 배지 12mL에 세포 펠릿을 부드럽게 재현탁합니다.
  10. 500 μL의 MEF 현탁액을 12-웰 세포 배양 플레이트(2.4 x 10 cm2당5개 세포)에 시드하고, 플레이트를CO2 인큐베이터에서 밤새(o/n) 배양한다.
  11. 냉동보존된 mESC 바이알 1개(1 x 106)를 CM+/+ 2i 배지에서 해동합니다.
  12. 1mL의 CM+/+ 2i 배지에서 MEF로 미리 세척된 12웰 플레이트에 mESC 현탁액을 시딩하고 플레이트를CO2 인큐베이터로 옮깁니다. 매일 매체를 새로 고칩니다.
  13. 70% 밀도에서 mESC 콜로니를 DPBS로 세척합니다. 따뜻한 10x TVP 버퍼 150μL를 추가하고 RT에서 30초 동안 배양하여 효소 해리를 시작합니다.
  14. TVP 버퍼를 조심스럽게 제거하고 1mL의 CM+/+ 2i 배지에 세포를 재현탁하고 부드러운 피펫팅으로 콜로니를 단일 세포로 해리합니다.
  15. 세포를 MEF가 있는 새로운 12웰 세포 배양 플레이트로 옮겨 계대배양합니다(분할 비율: 1:3-1:5). 세포를 분산시키기 위해 부드럽게 혼합하고CO2 인큐베이터에서 배양합니다.
  16. 배양 배지(2-3mL)를 새로 고치고 매일 세포 성장/형태를 관찰합니다. 2일마다 70% 밀도로 연속 패시징을 반복합니다. 세포 분화를 시작하기 전에 두 계대 동안 CM+/+ 배지로 전환합니다.

2. 거는 하락에 있는 EB 형성

  1. CM+/- 배지에 염기성 섬유아세포 성장 인자(bFGF)(50ng·mL-1)와 골형성 단백질 4(BMP-4)(5ng·mL-1)를 보충하여 신선한 중배엽 분화 배지를 준비하고 사용할 때까지 4°C에서 유지합니다.
  2. 6-웰 세포 배양 플레이트의 한 웰을 0.1% 젤라틴 용액 500μL로 코팅하고 30분 동안CO2 인큐베이터에 넣습니다.
  3. PBS로 젤라틴 코팅된 플레이트를 세척하고 500μL의 CM+/- 배지를 추가합니다.
  4. mESC의 순수한 집단을 얻기 위해, 세포 배양 플레이트를 RT에서 30초 동안 10x TVP 완충액으로 트립신화하고, 세포를 1mL 중배엽 분화 배지에 재현탁한 다음, 30분 동안 젤라틴으로 코팅된 6웰 플레이트로 옮겨 mESC가 현탁액에 머무르는 동안 MEF가 부착되도록 합니다.
  5. 50mL 원뿔형 튜브에 세포 현탁액을 수집하고 Neubauer 혈구계와 Trypan blue 염료를 사용하여 세포 수를 계수하여 살아있는/죽은 세포를 배제합니다.
  6. RT에서 5분 동안 200 x g 에서 세포를 원심분리하고, 상층액을 제거하고, 세포 펠릿을 중배엽 분화 배지에 재현탁하여 mL당 4.55 x 104 세포에 도달하도록 한다.
  7. 94mm 저부착 폴리스티렌 접시의 바닥을 15mL의 멸균수로 채웁니다.
    참고: 3D 발아 혈관신생 분석을 사용하여 하나의 특정 조건을 테스트하려면 매달린 방울(3.52mL 배지에 1.6 x 105 세포)이 포함된 4개의 접시가 필요합니다.
  8. 세포 현탁액을 멸균 플라스틱 저장소로 옮기고 채널당 22 μL의 세포 현탁액(22 μL 방울당 1 x 103 세포)과 함께 다중 채널 피펫의 4개 위치를 로드합니다.
  9. 94mm 접시의 뚜껑을 들어 올려 뒤집어 내부가 위를 향하도록 플로우 캐비닛의 깨끗한 표면에 놓습니다.
  10. 각 뚜껑의 내부 표면에 세포 현탁액 40 방울을 떨어 뜨립니다. 방해받지 않고 뚜껑을 조심스럽게 뒤집어 접시에 다시 올려 놓아 방울이 물을 향하도록 합니다.
  11. 접시를CO2 인큐베이터에서 배양합니다. 이것을 차별화 0일로 간주하십시오. 플레이트를 4일 동안 유지하여 EB를 형성합니다.

3. 팁 셀 위치에 대한 경쟁 분석

  1. 13개의 앞서 기술한 바와 같이 하나의 형광 및 하나의 비형광 mESC 라인을 배양한다. 예를 들어, 노란색으로 표시된 7ACS/EYFP mESC와 R1 mESC가 사용됩니다.
  2. 동일한 양의 두 mESC 라인(1:1 비율)을 혼합하여 모자이크 EB를 준비하고 2단계에 설명된 대로CO2 인큐베이터에서 행잉 드롭 접시를 배양합니다.

4. 혈관 분화를 위한 Floating EBs 배양

  1. 매달린 방울에서 EB를 수집하기 전에 다음을 준비하십시오.
    1. H2O중 5% 한천 용액을 제조하고 이를 오토클레이빙(120°C에서 20분)하여 멸균한다.
    2. 따뜻한 5% 한천 용액을 사용하여 1% 한천을 함유한 G-MEM BHK-21 배지를 준비하고 60mm 폴리스티렌 접시 중 하나에 3mL를 빠르게 붓습니다. 한천이 RT에서 1시간 동안 굳도록 합니다. 사용할 때까지 접시를 4°C에서 보관하십시오.
  2. CM+/- 배지에 bFGF(100ng·mL-1) 및 VEGF-A(50ng·mL-1)를 보충하여 신선한 2x 혈관 분화 배지를 준비합니다. 사용할 때까지 배지를 4°C에서 보관하십시오.
  3. P1000 피펫을 사용하여 15mL 원뿔형 튜브에 매달린 방울을 수집하고 EB 침전 몇 분 후에 상층액을 제거합니다.
  4. 3mL의 2x 혈관 분화 배지에 EB를 재현탁하고 EB 현탁액을 한천으로 코팅된 하나의 접시에 옮기고 응집을 피하기 위해 EB를 균질하게 분배합니다.
  5. 접시를CO2 인큐베이터에서 배양하고, bFGF(50 ng·mL-1) 및 VEGF-A(25 ng·mL-1)의 존재 하에 1x 혈관 분화 배지를 사용하여 9일까지 2일마다 배지를 상쾌하게 한다.
  6. 또는 혈소판 유래 성장 인자-BB(PDGF-BB)(4일에 10ng·mL-1 , 6일 및 8일에 5ng·mL-1 )를 혈관 분화 배지에 추가하여 벽화 세포 분화를 촉진합니다.

5. 유세포 분석

  1. P1000 피펫을 사용하여 15mL 원뿔형 튜브에 9일 된 EB를 수집하고 따뜻한 PBS로 한 번 세척합니다.
  2. 0.2mg·mL-1 의 콜라게나제 A를 함유한 G-MEM BHK-21 배지 1mL를 넣고CO2 인큐베이터에서 5분 동안 세포를 배양합니다.
  3. P1000 피펫으로 위아래로 부드럽게 피펫팅하여 EB를 분리합니다.
  4. 10% FBS가 함유된 차가운 G-MEM BHK-21 배지 1mL를 첨가하여 콜라게나제 활성을 중지합니다.
  5. 실온에서 5분 동안 200 x g 에서 세포를 원심분리합니다.
  6. 세포를 2% FBS와 함께 500μL의 PBS에 재현탁합니다.
  7. Neubauer 혈구계를 사용하여 세포를 계수합니다.
  8. 400,000개의 세포를 염색 조건당 2% FBS로 100μL의 PBS에 재현탁합니다.
  9. 세포를 다음 항체와 함께 4°C에서 45분 동안 인큐베이션한다: APC 접합 래트 항-마우스 PECAM-1 항체 (클론 MEC13.3) 및 FITC 접합 래트 항-마우스 CD45 (클론 30-F11) 또는 이소타입 대조군 항체.
  10. 세포를 2% FBS를 함유하는 PBS 1mL로 2회 세척한다.
  11. mL당 5 x 106 세포의 최종 농도에 도달하도록 세포를 재현탁합니다.
  12. 세포 스트레이너 스냅 캡이 있는 둥근 바닥 폴리스티렌 시험관을 사용하여 세포를 여과합니다.
  13. 유세포 분석을 통해 20,000개의 PECAM-1(+) 이벤트를 분석합니다.

6.3D 발아 혈관신생 분석 및 면역형광 염색

  1. 9일째에 10% FBS(vol/vol), bFGF(50ng·mL-1), VEGF-A(25ng·mL-1), 인간 재조합 에리스로포이에틴(hEPO)(20ng·mL-1), 인간 인터루킨-6(IL-6)(10ng·mL-1), 0.05mM β-메르캅토에탄올, NEAA(1x), L-글루타민(1x), 피루브산나트륨(1x), I형 쥐꼬리 콜라겐(1.25mg·mL-1), 및 NaOH (3.1 mM)를 GMEM BHK-1 배지에 첨가하였다.
  2. 콜라겐 겔화를 방지하려면 발아 배지를 사용할 때까지 얼음 위에 유지하십시오.
  3. 프로/항-혈관신생 분자의 효과를 평가하기 위해, 선택된 약물 또는 비히클을 선택된 농도의 발아 배지에 첨가한다.
  4. 15mL 원뿔형 튜브(한 가지 조건에 해당)에 있는 60mm 한천 접시 하나에서 9일 된 EB를 수집하고 몇 분 동안 침전된 후 상층액을 제거합니다.
  5. 35mm 배양 접시의 바닥을 발아 배지 1mL로 덮고 37°C에서 5분 동안 배양하여 겔화를 유도합니다.
  6. EB를 2mL의 저온 발아 배지에 재현탁합니다.
  7. 현탁액을 발아 배지의 첫 번째 층으로 코팅된 35mm 배양 접시로 옮깁니다.
  8. EB를 플레이트 전체에 분배하고 서로 동일한 거리에 있는지 확인합니다. 접시를CO2 인큐베이터에서 배양합니다. 첫 번째 새싹 형성은 24-48 시간 내에 발생합니다.
  9. 12일째에 EB를 함유한 콜라겐 젤을 주걱을 사용하여 유리 슬라이드(75 x 26mm)로 조심스럽게 옮깁니다.
  10. 피펫(P1000)을 사용하여 과량의 액체를 제거하고 나일론 린넨의 거즈 시트와 흡수성 필터 카드(겔 블로팅 페이퍼)를 겔 위에 올려 놓음으로써 겔을 탈수시킨다. 무게추(250g)를 2분 동안 가하여 압력을 가합니다. 나일론/여과지를 조심스럽게 제거하고 슬라이드를 실온에서 30분 동안 자연 건조시킵니다.
  11. 슬라이드를 RT에서 5분 동안 PBS로 3회 세척한다.
  12. 4°C에서 아연 용액( 재료 표 참조) o/n을 사용하여 EB를 고정합니다. 또는 모자이크 형광 EB를 파라포름알데히드(PFA)(4%) o/n으로 4°C에서 어두운 곳에서 고정합니다.
  13. 고정액을 제거하십시오. 슬라이드를 RT에서 5분 동안 PBS로 5회 세척한다.
  14. RT에서 15분 동안 0.1% Triton-X100을 함유한 PBS에서 EB를 투과화합니다.
  15. 투과화 용액을 제거합니다. 슬라이드를 PBS로 5분 동안 5회 세척합니다.
  16. EB를 블로킹 완충액(PBS with 2% Bovine Serum Albumin, BSA)에서 RT에서 1시간 동안 배양합니다.
  17. 내피 새싹을 염색하려면 4°C에서 차단 완충액 o/n에 쥐 항-마우스 항-PECAM-1 1차 항체(1:100 희석)를 사용합니다.
  18. 슬라이드를 PBS로 5분 동안 5회 세척합니다.
  19. 슬라이드를 블로킹 완충액(1:250 희석)에서 염소 항-쥐 Alexa 555 2차 항체와 함께 배양하고, 필요한 경우 블로킹 완충액(1:250 희석)에서 FITC 접합 항-α-SMA 항체와 함께 암흑 RT에서 2시간 동안 벽화 세포를 염색합니다.
  20. 슬라이드를 장착하기 전에 PBS로 5분 동안 세 번, H20으로 한 번 세척합니다.

7. EB 내피 새싹의 공초점 이미징, 형태 측정 및 정량 분석

  1. 컨포칼 현미경을 사용하여 초점면 병합(z-stacking)을 통해 면역염색된 EB의 고해상도 이미지를 획득합니다. 10x 배율 대물렌즈를 사용하여 전체 EB를 이미지화합니다.
  2. ImageJ를 사용하여 획득한 이미지를 분석하여 형태를 평가하고 확립된 정량화 방법 13,14,21에 따라 PECAM-1 양성 내피 새싹의 특성을 정량화합니다.
    1. 개별 EB당 총 새싹 수를 수동으로 계산하여 EB당 평균 내피 새싹 수를 계산합니다.
    2. ImageJ 그리기 도구를 사용하여 개별 새싹 길이를 측정합니다. EB 코어 영역에서 시작하여 내피 새싹의 기저부를 정의하고 새싹 끝이 끝날 때까지 수동으로 선을 그립니다.
    3. 개별 새싹 당 팁 세포 수를 수동으로 계산하여 새싹 당 평균 팁 세포 수를 계산 한 다음 EB 당 평균을 계산합니다.
    4. 부모 새싹의 축을 수동으로 결정하여 필로포디아 방향을 계산하고 ImageJ 소프트웨어 각도 도구를 사용하여 새싹 사이의 예각을 측정합니다. >50° 방향의 새싹 수를 계산하고 관심 있는 EB의 총 새싹 수로 나눕니다.
      알림: 각도는 항상 0°에서 90° 사이였습니다.
  3. 컨포칼 현미경을 사용하여 면역염색된 EB의 고해상도 이미지를 획득합니다. 40x 배율 대물렌즈를 사용하여 단일 내피 새싹의 고해상도 이미지를 실현합니다.
  4. ImageJ 소프트웨어를 사용하여 α-SMA 양성 MC로 둘러싸인 PECAM-1 양성 EC 새싹의 혈관 커버리지를 정량화합니다.
    1. 병합된 이미지를 별도의 빨강 및 녹색 채널로 분할합니다.
    2. 이미지를 이진 형식으로 변환합니다.
    3. PECAM-1(빨간색으로 표지된 내피세포)과 α-SMA(녹색으로 표지된 벽세포) 양성세포가 각각 차지하는 새싹의 총 세포 면적을 측정합니다.
    4. 이미지 계산기 함수와 AND 연산자를 사용하여 병합된 이미지를 생성합니다. 이미지의 전체 세포 영역을 측정합니다. 커버리지를 계산하려면 공국소화된 영상의 면적을 PECAM-1 이진 영상의 면적으로 나눕니다.
  5. 모자이크 EB에 의해 개발된 새싹의 내피 팁/줄기 세포 위치에 대한 세포 경쟁을 분석하기 위해 팁 세포의 수를 수동으로 점수화하고 형광 신호를 기반으로 유전형 기원을 표시합니다. EB당 평균값을 계산합니다.

결과

혈관 발아 분석의 프로토콜 개요는 그림 1에 나와 있습니다. 3개의 독립적인 129/Ola mESC 라인(Z/Red, R1 및 E14)에서 유래한 9일 된 EB를 콜라게나제 A를 사용하여 단일 세포로 효소적으로 해리시켰습니다. 모든 세포주는 강력한 내피 분화를 나타내었고, 내피 세포로 분화하는 능력의 차이는 관찰되지 않았다. 모든 세포주는 내피 세포의 약 10.5% ± 1.3%를 생산하였다(?...

토론

이 프로토콜은 혈관신생을 조절하는 약물 및 유전자를 스크리닝할 수 있는 편향되지 않고 강력하며 재현 가능한 3D EB 기반 혈관 발아 분석을 설명합니다. 이 방법은 이동(측면 스크래치 분석 또는 Boyden 챔버 분석)22,23 또는 증식(세포 수 계산, DNA 합성 검출, 증식 마커 검출 또는 대사 분석)24을 모니터링하기 위해 HUVEC(Human Umbilical Vein Endothelial Cells)와 같은...

공개

저자는 공개 할 것이 없습니다.

감사의 말

이 작업은 Nederlandse organisatie voor gezondheidsonderzoek en zorginnovatie (ZonMW 446002501), Health Holland (LSHM19057-H040), Leading Fellows Program Marie Skłodowska-Curie COFUND 및 Association Maladie de Rendu-Osler (AMRO)의 보조금으로 지원되었습니다.

자료

NameCompanyCatalog NumberComments
2-mercaptoethanolMilipore, Merck805740Biohazard: adequate safety instructions should be taken when handling
Agar NobleDifco, BD Pharmigen214220
Alexa Fluo 555 goat anti rat IgGLife technologiesA21434
APC conjugated rat anti-mouse PECAM-1 antibody (clone MEC13.3)BD Biosciences551262
APC Rat IgG2a κ Isotype Control (Clone  R35-95)BD Biosciences553932
Axiovert 25 inverted phase contrast tissue culture microscopeZEISS
Basic Fibroblast Growth Factor-2 (bFGF)Peprotech450-33
Benchtop Centrifuge, Allegra X-15RBeckman Coulter392932
Biosafety cabinet BioVanguard (Green Line)Telstar133H401001
Bovine Serum Albumin (BSA)Sigma-AldrichA9418
Cell counting chamber, Buerker, 0.100mmMarienfeld640211
Cell culture dishes 60 x 15mmCorning353802
Cell culture dishes, 35 x 10 mmCorning353801
Cell culture plates 12-wellCorning3512
CFX96 Touch Real-Time PCR Detection SystemBiorad1855196
Chicken serumSigma-AldrichC5405
CHIR-99021 (CT99021) HClSelleckchemS2924
Collagen I, High Concentration, Rat Tail, 100mgCorning354249
Collagenase ARoche10103586001
Confocal Laser Scanning Microscope, TCS SP5Leica
Cover glasses, 24 × 50 mmVwr631-0146
DAPT γ?secretase inhibitorSigma AldrichD5942
DC101 anti mouse VEGFR-2 CloneBioXcellBP0060
DC101 isotype rat IgG1BioXcellBP0290
Dimethyl sulfoxide (DMSO)Sigma-AldrichD2438-5XBiohazard: adequate safety instructions should be taken when handling
DPBS (10x), no calcium, no magnesiumGibco, Thermofisher scientific14200067
EDTA 40 mMGibco, Thermofisher scientific15575-038
Embryonic stem-cell Fetal Bovine SerumGibco, Thermofisher scientific16141-079Should be lot-tested for maximum ES cell viability and growth. Heat inactivate at 60°C and store at −20 °C for up to 1 year
Eppendorf Microcentrifuge 5415REppendorf AG Z605212
Erythropoietin, human (hEPO), 250 U (2.5 µg) (1 mL)Roche11120166001
ESGRO Recombinant Mouse LIF Protein (10? units  1 mL)Milipore, MerckESG1107
Falcon tubes 15 mLGreiner Bio-One188271
Falcon tubes 50 mLGreiner Bio-0ne227270
Filter tip ,clear ,sterile F.Gilson, P-200Greiner Bio-One739288
Filter tip ,clear ,sterile F.Gilson, P10Greiner Bio-One771288
Filter tip ,clear ,sterile F.Gilson, P1000Greiner Bio-One740288
FITC conjugated anti-α Smooth Muscle Actin (SMA) (clone 1A4)Sigma AldrichF3777
FITC conjugated rat anti-mouse CD45 (clone 30-F11)Biolegend103107
FITC Rat IgG2b, κ Isotype Ctrl Antibody (clone RTK4530)Biolegend400605
Fluorscent mounting mediaDAKOS3023
GascompressCutisoft45846
Gauze Cutisoft 10 x 10 cmBsn Medical45844_00
Gel blotting paper, Grade GB003WhatmanWHA10547922
Gelatin solution, type BSigma-AldrichG1393-100 ml
Glasgow's MEM (GMEM)Gibco, Thermofisher scientific21710082
IHC Zinc FixativeBD Pharmigen550523
IncuSafe CO2 IncubatorPHCBiMCO-170AICUV-PE
Interleukin-6, human (hIL-6)Roche11138600001
L-Glutamine 200 mMGibco, Thermofisher scientific25030-024
MEM Non-Essential Amino Acids Solution (100x)Gibco, Thermofisher scientific11140035
Microscope slide boxKartell Labware278
Microscope slide, StarfrostKnittel glassVS113711FKB.0
Mm_Cdh5_1_SG QuantiTect Primer AssayQiagenQT00110467
Mm_Eng_1_SG QuantiTect Primer AssayQiagenQT00148981
Mm_Epha4_1_SG QuantiTect Primer AssayQiagenQT00093576
Mm_Ephb2_1_SG QuantiTect Primer AssayQiagenQT00154014
Mm_Flt1_1_SG QuantiTect Primer AssayQiagenQT00096292
Mm_Flt4_1_SG QuantiTect Primer AssayQiagenQT00099064
Mm_Gapdh_3_SG QuantiTect Primer AssayQiagenQT01658692
Mm_Kdr_1_SG QuantiTect Primer AssayQiagenQT00097020
Mm_Notch1_1_SG QuantiTect PrimerQiagenQT00156982
Mm_Nr2f2_1_SG QuantiTect Primer AssayQiagenQT00153104
Mm_Pecam1_1_SG QuantiTect PrimerQiagenQT01052044
Mm_Tek_1_SG QuantiTect Primer AssayQiagenQT00114576
Mouse (ICR) Inactivated Embryonic Fibroblasts  (2 M)Gibco, Thermofisher scientificA24903Store vials in liquid nitrogen (195.79 °C) indefinitely
Mouse embryonic stem cell line 7AC5/EYFP (ATCC SCRC-1033)ATCCSCRC-1033Generated by Dr A Nagy, Samuel Lunenfeld Research Institute, Mount Sinai Hospital, 600 University Ave, Toronto, Ontario, M5G 1X5, Canada. [Hadjantonakis, A. K., et al. Mechanisms of Development. 76 (1–2), 79–90 (1998)].
Mouse embryonic stem cell lines Acvrl1 +/- and Acvrl1 +/+Generated at Leiden University Medical Centre [Thalgott, J.H. et al. Circulation. 138 (23), 2698–2712 (2018)].
Mouse embryonic stem cells line E14Provided by M Letarte laboratory and generated according to Cho, S. K., et al. Blood. 98 (13), 3635–3642 (2001).
Mouse embryonic stem cells line R1 (ATCC SCRC-1011)ATCCSCRC-1011Generated by Dr A Nagy, Samuel Lunenfeld Research Institute, Mount Sinai Hospital, 600 University Ave, Toronto, Ontario, M5G 1X5, Canada. [Nagy, A., et al. Procedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 90 (18), 8424–8428 (1993)].
Mouse embryonic stem cells line Z/Red (strain 129/Ola)Generated by Dr A Nagy, Samuel Lunenfeld Research Institute, Mount Sinai Hospital, 600 University Ave, Toronto, Ontario, M5G 1X5, Canada [Vintersten, K., et al. Genesis. 40 (4), 241–246 (2004)].
NanoDrop 1000 UV/VIS SpectrophotometerThermo Fischer ScientificND-1000
PD0325901SelleckchemS1036
PDGF-BB, Recombinant HumanPeprotech100-14B
Pecam-1 antibody, Rat Anti-MouseBD Biosciences550274
Penicillin-streptomycin (10,000 U/mL)Gibco, Thermofisher scientific15140122
Petri dish, PS, 94/16 mm, standard ,with vents, sterileGreiner Bio-One633181
Pipetboy acu 2Integra-Biosciences155 019
Pipetman G Multichannel P8 x 200GGilsonF144072
Pipetman G Starter Kit, 4 Pipette Kit, P2G, P20G, P200G, P1000GGilsonF167360
Recombinant Human BMP-4 ProteinR&D Systems314-BP
RNeasy Plus mini KitQIAGEN74134
Serological pipettes, 10 mLGreiner Bio-One607 180
Serological pipettes, 25 mLGreiner Bio-One760 180
Serological pipettes, 5 mLGreiner Bio-One606 180
Sodium hydroxide (NaOH)Merck106498
Sodium pyruvate 100 mMGibco, Thermofisher scientific11360039
Test tubes 5ml round-bottom with cell-strainer capCorning352235
Thermal cycler, T100Biorad1861096
Triton X-100 (BioXtra)Sigma AldrichT9284
Trypan Blue Solution, 0.4%Gibco, Thermofisher scientific15250061
Trypsin (2.5%)Gibco, Thermofisher scientific15090046
Vacuum Filter/Storage Bottle System, 500 mLCorning430758
VEGFA165 , recombinant murinePeprotech450-32
Water, SterileFresenius-KabiB230531
Waterbath, Lab-Line DigitalThermo Fischer Scientific18052A

참고문헌

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