시작하려면 휴대용 기공 이미징 장치를 이미지 수집 소프트웨어가 장착된 컴퓨터에 연결합니다. 종이를 사용하여 애기장대(Arabidopsis thaliana) 식물의 슈도모나스 주사기 접종 잎에서 물방울을 조심스럽게 제거합니다. 이제 장치의 상단 덮개를 열고 나뭇잎을 s에 놓습니다.t, 그리고 덮개를 닫습니다.
조정 나사를 사용하여 초점을 조정하고 컴퓨터에서 이미지 저장을 클릭하여 이미지를 캡처합니다. 기공 구멍의 자동 측정을 수행하려면 Google Colaboratory 노트북을 엽니다. 파일을 클릭한 다음 드라이브에 사본 저장을 클릭하여 Google 드라이브에 로컬 복사본을 만듭니다.
새 탭이 열리면 원래 전자 필기장의 탭을 닫습니다. 노트북의 환경 설정 섹션 아래에 있는 실행 버튼을 누르면 셀 블록을 펼치지 않고 필요한 라이브러리를 가져올 수 있습니다. 디렉터리 설정 섹션에서 분석을 위해 Google Drive에 폴더 3개를 만듭니다.
획득한 이미지를 example_result 폴더로 이동하고 최종 그래프 생성을 위해 처리 또는 샘플별로 분류합니다. 학습된 모델 다운로드를 클릭하여 Zenodo에서 학습된 모델의 ONNX 파일을 다운로드합니다. 다운로드한 파일을 모델 디렉터리에 배치합니다.
노트북의 기공 조리개 부분의 추론 및 측정을 실행하여 개별 이미지에서 기공 조리개를 정량화합니다. 중첩된 추론과 example_result 있는 결과 이미지. CSV 파일이 inference_results 디렉토리로 내보내집니다.
그래프 생성 섹션을 실행하여 기공 조리개 비율에 대한 그래프를 생성합니다. 이 그래프를 inference_results 디렉토리로 내보냅니다. Pto를 접종한 식물은 모의 접종 식물에 비해 기공 구멍이 감소한 것으로 접종 후 1시간 후에 관찰되었습니다.
감염 후 3시간이 지났을 때, Pto를 접종한 식물과 모의 접종을 받은 식물의 기공 구멍은 거의 동일했습니다. 기공 조리개 자동 측정은 하나의 이미지를 처리하는 데 약 5초가 소요되어 측정 시간이 95% 단축되었습니다.
