Superexpressão de tropomodulina 3 como marcador de resistência à platina e infiltração imunológica no câncer de ovário

Resumo

A tropomodulina 3 (TMOD3) tem sido cada vez mais estudada em tumores nos últimos anos. Este estudo é o primeiro a relatar que o TMOD3 é altamente expresso no câncer de ovário e está intimamente associado à resistência à platina e infiltração imunológica. Esses resultados podem ajudar a melhorar os resultados terapêuticos para o câncer de ovário.

Resumo

O citoesqueleto desempenha um papel importante na resistência à platina no câncer de ovário. A tropomodulina 3 (TMOD3) é crítica no desenvolvimento de muitos tumores, mas seu papel na resistência aos medicamentos do câncer de ovário permanece inexplorado. Ao analisar dados dos bancos de dados Gene Expression Omnibus (GEO), The Cancer Genome Atlas (TCGA) e Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC), este estudo comparou a expressão de TMOD3 em câncer de ovário e tecidos normais e examinou a expressão de TMOD3 após o tratamento com platina em cânceres de ovário sensíveis e resistentes à platina. O método de Kaplan-Meier foi usado para avaliar o efeito do TMOD3 na sobrevida global (OS) e na sobrevida livre de progressão (PFS) em pacientes com câncer de ovário. microRNAs (miRNAs) direcionados ao TMOD3 foram previstos usando o TargetScan e analisados usando o banco de dados TCGA. O Tumor Immune Estimation Resource (TIMER) e um portal de repositório integrado para interações tumor-sistema imunológico (TISIDB) foram usados para determinar a relação entre a expressão de TMOD3 e a infiltração imunológica. As redes de coexpressão de TMOD3 no câncer de ovário foram exploradas usando LinkedOmics, a ferramenta de pesquisa para a recuperação de genes/proteínas em interação (STRING) e o banco de dados para anotação, visualização e descoberta integrada (DAVID) Bioinformática. Os resultados mostraram que o TMOD3 foi altamente expresso no câncer de ovário e foi associado à classificação, estadiamento e metástase do câncer de ovário. A expressão de TMOD3 foi significativamente reduzida em células de câncer de ovário tratadas com platina e pacientes. No entanto, a expressão de TMOD3 foi maior em células e tecidos de câncer de ovário resistentes à platina em comparação com os sensíveis à platina. A maior expressão de TMOD3 foi significativamente associada a menor SG e PFS em pacientes com câncer de ovário tratadas com quimioterapia à base de platina. A regulação pós-transcricional mediada por miRNA é provavelmente responsável pela alta expressão de TMOD3 em câncer de ovário e tecidos ovarianos resistentes à platina. A expressão do mRNA de TMOD3 foi associada à infiltração imunológica no câncer de ovário. Esses achados indicam que o TMOD3 é altamente expresso no câncer de ovário e está intimamente associado à resistência à platina e infiltração imunológica.

Introdução

O câncer de ovário é o segundo maior na taxa de mortalidade de tumores ginecológicos em todo o mundo¹. Pode ser classificado em três tipos com base na histopatologia: tumores de células germinativas, mesenquimais gonadal e epiteliais, dos quais 90% dos pacientes são câncer de ovário epitelial. Os fatores de risco associados ao câncer de ovário incluem ovulação persistente, aumento da exposição à gonadotrofina e citocinas inflamatórias². Mais de 75% dos casos de câncer de ovário não são detectados até estágios avançados, resultando na falta de tratamento eficaz. Pacientes com câncer de ov....

Protocolo

1. Omnibus de Expressão Gênica (GEO)

NOTA: A expressão de TMOD3 no câncer de ovário, no câncer de ovário tratado com medicamentos de platina e no câncer de ovário resistente a medicamentos foi derivada dos conjuntos de dados GEO. O tipo de estudo de todos os conjuntos de dados foi o perfil de expressão por array, e os organismos foram Homo sapiens.

1. Vá para o banco de dados GEO (consulte a Tabela de Materiais) e insira palavras-chave como TMOD3, câncer de ovário e resistente a medicamentos ou

Discussão

O citoesqueleto tem sido considerado essencial no desenvolvimento e progressão, tratamento e prognóstico de vários tumores⁵². Comparado com o TMOD1, que é restrito aos eritrócitos e ao sistema cardiovascular⁵³, e o TMOD2, que é restrito ao sistema nervoso⁵⁴, o TMOD3 tem uma distribuição ubíqua, o que torna o estudo do TMOD3 em tumores sistêmicos mais popular^{14,15,16,17,18,19}

Materiais

Name	Company	Catalog Number	Comments
cBioportal	Memorial Sloan Kettering Cancer Center		Correlation analysis of  TMOD3 with targeted miRNAs (https://www.cbioportal.org)
CTD database	North Carolina State University		To analyze the relationships between chemistry, genes, phenotype, disease, and environment (https://ctdbase.org/)
Cytoscape	National Institute of General Medical Sciences of the National Institutes of Health		Network Data Integration, Analysis, and Visualization (www.cytoscape.org/)
DAVID	Frederick National Laboratory for Cancer Research		A comprehensive set of functional annotation tools for investigators to understand the biological meaning behind large lists of genes(https://david.ncifcrf.gov/)
GEO	NCBI		Gene expression analysis (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ )
HPA	Knut & Alice Wallenberg foundation		The Human Protein Atlas (HPA) database helped analyze the distribution of TMOD3 in various immune cells (https://www.proteinatlas.org/)
KM-plotter	Department of Bioinformatics of the Semmelweis University		Prognostic Analysis (https://kmplot.com/analysis/)
LinkedOmics	Baylor College of Medicine		A platform for biologists and clinicians to access, analyze and compare cancer multi-omics data within and across tumor types (http://www.linkedomics.org/)
PubChem database	U.S. National Library of Medicine		To determine the definitive molecular structure of the drug
ROC Plotter	Department of Bioinformatics of the Semmelweis University		Validation of the interest gene as a predictive marker (http://www.rocplot.org/)
STRING	Swiss Institute of Bioinformatics		Coexpression networks analysis(https://string-db.org)
TargetScan	Whitehead Institute for Biomedical Research		Prediction of miRNA targets (www.targetscan.org/)
TIMER	Harvard University		Systematical analysis of immune infiltrates across diverse cancer types (https://cistrome.shinyapps.io/timer/)
TISIDB	The University of Hong Kong		A web portal for tumor and immune system interaction(http://cis.hku.hk/TISIDB/)
TNMplot	Department of Bioinformatics of the Semmelweis University		Gene expression analysis (https://www.tnmplot.com/ )
UALCAN	The University of ALabama at Birmingham		Gene expression analysis (http://ualcan.path.uab.edu)