ट्यूमर माइक्रोएन्वायरमेंट के नैदानिक और जैविक मूल्यांकन के लिए स्थानिक छवि विश्लेषण के साथ संयुक्त मल्टीप्लेक्स इम्यूनोफ्लोरेसेंस

ट्यूमर माइक्रोएन्वायरमेंट (टीएमई) विभिन्न सेल प्रकारों से बना है, जैसे साइटोटोक्सिक प्रतिरक्षा कोशिकाएं और इम्यूनोमॉड्यूलेटरी कोशिकाएं। इसकी संरचना और कैंसर कोशिकाओं और पेरी-ट्यूमरल कोशिकाओं के बीच बातचीत के आधार पर, टीएमई कैंसर की प्रगति को प्रभावित कर सकता है। ट्यूमर और उनके जटिल माइक्रोएन्वायरमेंट के लक्षण वर्णन कैंसर रोगों की समझ में सुधार कर सकते हैं और वैज्ञानिकों और चिकित्सकों को नए बायोमाकर्स की खोज करने में मदद कर सकते हैं।

हमने हाल ही में कोलोरेक्टल कैंसर, सिर और गर्दन स्क्वैमस सेल कार्सिनोमा, मेलेनोमा और फेफड़ों के कैंसर में टीएमई के लक्षण वर्णन के लिए टायरामाइड सिग्नल प्रवर्धन (टीएसए) पर आधारित कई मल्टीप्लेक्स इम्यूनोफ्लोरेसेंस (एमआईएफ) पैनल विकसित किए हैं। एक बार संबंधित पैनलों का धुंधला पन और स्कैनिंग पूरी हो जाने के बाद, नमूनों का विश्लेषण एक छवि विश्लेषण सॉफ्टवेयर पर किया जाता है। प्रत्येक सेल की स्थानिक स्थिति और धुंधलापन तब इस परिमाणीकरण सॉफ्टवेयर से आर में निर्यात किया जाता है। हमने आर स्क्रिप्ट विकसित की जो हमें न केवल कई ट्यूमर डिब्बों (जैसे ट्यूमर का केंद्र, ट्यूमर का मार्जिन और स्ट्रोमा) में प्रत्येक सेल प्रकार के घनत्व का विश्लेषण करने की अनुमति देती है, बल्कि विभिन्न सेल प्रकारों के बीच दूरी-आधारित विश्लेषण भी करती है।

यह विशेष वर्कफ़्लो शास्त्रीय घनत्व विश्लेषण में एक स्थानिक आयाम जोड़ता है जो पहले से ही कई मार्करों के लिए नियमित रूप से किया जाता है। एमआईएफ विश्लेषण वैज्ञानिकों को कैंसर कोशिकाओं और टीएमई के बीच जटिल बातचीत की बेहतर समझ रखने और उपचार के लिए प्रतिक्रिया के नए पूर्वानुमानित बायोमाकर्स की खोज करने की अनुमति दे सकता है, जैसे कि प्रतिरक्षा चेकपॉइंट इनहिबिटर, और लक्षित उपचार।