Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliği gereklidir. Oturum açın veya ücretsiz deneme sürümünü başlatın.
Method Article
Bu protokol Western Blot analizleri gerçekleştirerek son gelişmeleri araştırıyor. Bu yeni değişiklikler 35 dk elektroforez çalışma süresi, 7 dk kuru emme transfer sistemi ve yüksek çözünürlük, kalite, hassasiyet ve Batı verilerin gelişmiş doğruluğu üretir kızılötesi floresan protein algılama ve görüntüleme ile Bis-Tris jel sistemini kullanır.
Aslında 1970'lerin sonlarında kurulan Western Blot teknikleri hala aktif olarak bugün kullanılmaktadır. Ancak, Batılı beneklenmesinin bu geleneksel yöntem, düşük kaliteli çözünürlük, sahte bantları, duyarlılık azalması ve zayıf protein bütünlüğü dahil birçok sakıncaları vardır. Yeni gelişmeler büyük ölçüde yüksek nitel ve nicel veri üretmek için standart Batı benek protokolü birçok yönlerini düzeldi. Bis-Tris jel sistemi, geleneksel Laemli sistemine alternatif, daha iyi protein ayırma ve çözünürlük üretir protein bütünlüğünü korur ve bir 35 dk çalışma süresi elektroforezini azaltır. Ayrıca, iBlot kuru blot sistemi, büyük ölçüde sık sık uzun transfer süreleri daha verimsiz olan geleneksel protein transfer yöntemleri aksine, 7 dakika içinde zara transfer protein etkinliğini ve hızını artırır. Bu çok yenilikçi değişiklikler, protein D ile birlikteetection, yüksek kalitede kızıl ötesi floresan görüntüleme sonuçları kullanılarak daha hassas ve kemiluminesans standart Western blot tekniği ile karşılaştırıldığında veriler tutarlı. Bu teknoloji, aynı anda farklı flüoresan kanallar olarak görüntülenen iki renkli yakın kızıl ötesi boyalar kullanarak, aynı zar üzerinde iki farklı antijenlerini tespit edebilir. Ayrıca, flüoresan görüntüleme doğrusallık ve geniş dinamik aralık güçlü ve zayıf hem de protein bantlarının hassas ölçümü sağlar. Böylece, bu protokol, büyük ölçüde bu denemenin performans zaman azaltırken, bu gelişmelerin önemli verilerin kalitesini arttıran klasik Western lekeleme yöntemi için anahtar geliştirmeleri açıklar.
Western blot tekniği kullanılarak ilk antikorlar 1-3 proteinlerinin bulgulanması için daha iyi bir yöntem yaratmak için 1977 ve 1979 yılları arasında geliştirilmiştir. Bu prosedür, ikincil antikorlar kullanılarak görselleştirildi ve otoradyografi, UV ışığı veya bir peroksidaz reaksiyon ürünü 3 tarafından tespit hedef proteinler SDS-PAGE jelleri zarlara proteinlerinin elektroforetik transferi kullanılmıştır. Bu nedenle, bu aynı temel prensipler hala yaygın olarak bugünün Batı benek protokolleri kullanılır. Ancak, bu klasik Western lekeleme tekniği böyle yavaş elektroforez çalışma süreleri, düşük çözünürlükte ve yapay protein bantları, protein yıkımı yatkınlık, ve sınırlı duyarlılık yanı sıra zayıf veri kalitesi 4 olarak mevcut birçok dezavantajları yapar. Bu nedenle bu protokol daha doğru nitel ve nicel veriler üretir standart Batı benek prosedüre önemli ilerlemeler ve geliştirmeleri açıklar.
"> SDS-PAGE kullanılarak proteinlerin geniş bir ayrılması için Laemmli sistemi bu Western blotting sistemin popülerlik rağmen. Western blot 5 için en çok kullanılan jel sistemi olup, bu yöntem, bant bozulma, çözünürlük kaybı ve neden olabilir sahte bantları 4. bu ayırma jel, indirgenmiş disülfid jelin farklı redoks durumuna bağlı bağlar, ve aspartil-prolil bölgesinin parçalanmasının reoksidasyon yüksek pH (9.5) nedeniyle proteinlerin deaminasyon ve alkilasyon bir sonucu olabilir, Laemmli tampon maddesi (pH 5.2) 4,6 proteini ısıtılması nedeniyle peptid bağlar., nötr pH değerinde (7.0) ile çalışır Lamemmli sistemi üzerinde önemli avantajlar sağlar Bis-Tris jel sistemi. Bu sistem, protein stabilitesi, en aza artırır protein modifikasyonları, bunların düşük eyalette proteinleri muhafaza elektroforez sırasında aspartil-prolil bölünmesini önler ve daha da önemlisi, elektroforez çalışma süresi t, ek olarak. 35 dk 4,6,7 olduğuO Bis-Tris jel sistemi de daha güvenilir veri 4 sonuçlanan keskin bantlar, yüksek çözünürlük ve ayırma, ve artan duyarlılığı üretir.Bis-Tris jel sistemi ile bağlantılı olarak, iBlot kuru blot sistemi önemli ölçüde, 7 dakika içinde 8 zarının üzerine jellerinden proteinlerin devir süresini azaltmak için yüksek bir alan kuvveti ve akımlarını kullanır. Bu transfer sistemi proteinleri, 8, daha verimli ve güvenilir transferi oluşturur kuru lekeleme yöntem dayanmaktadır. : Konvansiyonel aktarım sistemlerine iBlot transfer sisteminin etkinliği ayrıntılı bir karşılaştırma için aşağıdaki web sitesine bakın http://www.invitrogen.com/site/us/en/home/Products-and-Services/Applications/Protein-Expression-and-Analysis/Western-Blotting/Western-Blot-Transfer/iBlot-Dry-Blotting-System/iBlot-Dry-Blotting-Comparison-to-Semi-Dry-and-Wet.html . Bu iyon rezervuar 8 olarak hareket uygun aktarma tamponlar içeren bir jel matrisinin oluşmaktadır bir anot ve katot yığını kullanmaktadır. Transferi sırasında, su elektroliz bant bozulma 8 neden olmadan daha tutarlı bir protein transferi ile sonuçlanan bakır anot oksijen üretilmesini engellemeye yardımcı olur. Ayrıca, bu transfer sistemi, aynı zamanda, elektrotlar 8 arasındaki mesafeyi azaltarak aktarım hızını artırır.
Kemiluminesan Western Blot protein tespiti analizleri için en yaygın ve geleneksel bir teknik olmasına rağmen, iki renkli kızılötesi floresan tespiti büyük ölçüde Western Blot veri duyarlılık, kalite, ve doğruluğunu artırır. Bu saptama metodu, iki uygun dalga boyunda, 700 nm olarak kızıl ötesi lazer kullanır uyarmave 800 nm, büyük sinyal-gürültü oranı ve yüksek duyarlılık 9 ile net bir veri görüntü oluşturmak için. Bu nedenle, iki hedef proteinler, 700 nm ve 800 nm floresan saptama kanalları kullanılarak, aynı zar üzerinde eş zamanlı olarak görüntülenebilir. Daha da önemlisi, kızıl ötesi floresan doğrusallık ve dinamik aralık güçlü ve zayıf hem de protein bantları 9 hassas kantitatif analiz için izin verir. Ayrıca, bu protokol bu işlemlerin etkinliğini tehlikeye ve daha nitel ve nicel Western blot verileri üretilmesi için, kızılötesi floresan protein algılama kullanmadan bu denemenin elektroforez ve transfer kez azaltarak klasik, Western lekeleme tekniği üzerinde büyük bir avantaj ve geliştirmeleri sağlar.
1.. Hücre Kültürü alınan bütün hücre lizatları hazırlanması
2. Numune Hazırlama ve Elektroforez
REAKTİF | DÜŞÜK NUMUNE |
Protein Numune | X ul |
4x LDS Sample Buffer | 6 ul |
500 nM DTT Reducing Ajan | 2.4 ul |
Deiyonize Su | Kadar 15.6 ul |
Toplam Hacim | 24 ul |
3. IBlot Kuru Blot Sisteminin Kullanılması Protein Transferi
4. Kızılötesi Floresan Protein Algılama
İki renkli kızılötesi floresan gelişmiş hassasiyet ve net Western Blot görüntüler üretmek için en yüksek sinyal-gürültü oranı ile aynı zar üzerindeki güçlü ve zayıf hem bantları algılar. 700 nm ve 800 nm flüoresan kanallar hem de görsel iki renkli Western blot algılama tarafından oluşturulan tipik sonuçlar, Şekil 1 ve 2'de örneklenmiştir. Şekil 1 'de üst Western blot insandan lizatlarının, iki kat seri dilüsyonları 700 nm k...
Bu protokole uygun olarak yüksek kaliteli, niceliksel Western blotları elde edilmesinde kritik adımlar aşağıdaki gibidir: 1) protein konsantrasyonlarının ölçülmesi, 2) örnek hazırlama, 3) bloke edilmesi ve, 4), birincil antikor kalite ve kalibre.
Toplam protein konsantrasyonları ölçüm doğruluğu kızılötesi floresan tespit olağanüstü duyarlılık örneklerin protein konsantrasyonu bulunan herhangi bir hafif farklılıkları büyütmektedir çünkü protein bantları mi...
Yazarlar ifşa hiçbir şey yok.
Biz onların yardım ve destek için McMahon laboratuvarın tüm üyelerine teşekkür etmek istiyorum. Bu araştırma bir NIH / NCI R01 CA176839-01 (MM) ve Kurumsal Araştırma ve Akademik Kariyer Geliştirme Ödülü (JS IRACDA) hibe tarafından desteklenmiştir.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
BCA Protein Assay Kit | Thermo Scientific/Pierce | 23225 | |
4x NuPAGE® LDS Sample Buffer | Invitrogen/Life Technologies | NP0007 | |
10x NuPAGE® Sample Reducing Agent | Invitrogen/Life Technologies | NP0004 | |
20x NuPAGE® MES SDS Running Buffer | Invitrogen/Life Technologies | NP0002 | |
20x NuPAGE® MOPS SDS Running Buffer | Invitrogen/Life Technologies | NP0001 | |
NuPAGE® Antioxidant | Invitrogen/Life Technologies | NP0005 | |
NuPAGE® Novex® 4-12% Bis-Tris Gel 1.5 mm, 10 well | Invitrogen/Life Technologies | NP0335BOX | |
NuPAGE® Novex® 4-12% Bis-Tris Gel 1.5 mm, 15 well | Invitrogen/Life Technologies | NP0336BOX | |
SeeBlue® Plus2 Pre-Stained Standard | Invitrogen/Life Technologies | LC5925 | |
XCell SureLock® Mini-Cell | Invitrogen/Life Technologies | EI0001 | |
iBlot® Transfer Stack, PVDF Regular | Invitrogen/Life Technologies | IB4010-01 | |
iBlot®Transfer Stack, PVDF Mini | Invitrogen/Life Technologies | IB4010-02 | |
iBlot® Transfer Stack, Nitrocellulose Regular | Invitrogen/Life Technologies | IB3010-01 | |
iBlot®Transfer Stack, Nitrocellulose Mini | Invitrogen/Life Technologies | IB3010-02 | |
iBlot® Gel Transfer Device | Invitrogen/Life Technologies | IB1001 | |
β-Actin | Sigma | A2228 | |
Phospho-BIM (S69) | BD Biosciences | N/A | |
Total BIM | Epitomics | 1036-1 | |
Phospho-ERK1/2 (T202/Y204) | Cell Signaling Technology | 4370 | |
Total ERK1/2 | Cell Signaling Technology | 9107 | |
Odyssey® Blocking Buffer | LI-COR Biosciences | 927-40000 | |
IRDye 800CW Goat anti-Rabbit IgG | LI-COR Biosciences | 926-32211 | |
IRDye 680LT Goat anti-Mouse IgG | LI-COR Biosciences | 926-68020 | |
Western Incubation Box, Medium | LI-COR Biosciences | 929-97205 | |
Odyssey® Classic Imaging System | LI-COR Biosciences | N/A | |
Odyssey® Application Software V3.0.30 | LI-COR Biosciences | N/A |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır