Bu çalışma, Çin Ulusal Doğa Bilimleri Vakfı'ndan (No. 81800207) J.H.'ye verilen hibelerle desteklenmiştir. Beckman Coulter, Inc.'in akış sitometrisi ve parametre kalibrasyonu için destek sağlamadaki yardımı büyük beğeni topluyor. Sichuan Üniversitesi, Batı Çin Stomatoloji Hastanesi, Devlet Ağız Hastalıkları Laboratuvarı'ndan Jiao Chen'e ve Sichuan Üniversitesi, Batı Çin Hastanesi Rejeneratif Tıp Araştırma Merkezi'nden Yu Qi'ye akış sitometrisi veri toplamadaki yardımları için teşekkür ederiz.

Bu çalışmadaki deneylerde, yaşları 8 ila 12 hafta arasında değişen toplam 10 C57BL / 6 fare kullanılmıştır. Deneysel işlemler, Sichuan Üniversitesi Kurumsal Hayvan Bakımı ve Kullanımı Komitesi (#201609309) tarafından onaylanan bir protokole uygun olarak gerçekleştirildi. Bu makalede kullanılan deneysel materyaller ve akış sitometrisi parametreleri Malzeme Tablosunda listelenmiştir.
1. Fare kemik iliği hücrelerinin izolasyonu ve toplanması
<ol><li>Fareleri kurumsal yönergelere sıkı sıkıya bağlı olarak ötenazi yapın. Farede bilinç kaybına neden olmak için,% 2 izofluran ile başlayan inhalasyon anesteziklerini uygulayın, ardından solunumun kesilmesine kadar% 5 izoflurana dozajda kademeli bir artış yapın.</li>
	<li>Fareleri cerrahi süitte veya Çeker Ocakta inceleyin. Fareleri% 70 etanol ile temizleyin ve sterilize edin.</li>
	<li>Bacağın derisini ve kasını keskin bir makasla tamamen kesin ve uyluk kemiğini inceleyin.</li>
	<li>Femuru bir havanda öğütme çubuğuyla nazikçe ezin ve kemik beyazlaşana kadar kemik iliği hücrelerini DMEM ortamı ile yıkayın.</li>
	<li>Elde edilen kemik iliği hücrelerini 100 μm'lik bir filtre ile 15 mL'lik tüplere süzün. 800 x g'da 4 °C'de 5 dakika santrifüjleyin.</li>
	<li>Süpernatan ve lizaz kalıntı kırmızı kan hücrelerini 1 mL kırmızı kan hücresi lizis tamponu ile 4 ° C'de 1 dakika boyunca atın. 800 x g'da 4 °C'de 5 dakika santrifüjleyin. Santrifüjlemeden sonra tekrar DMEM ortamı ile yıkayın.</li>
	<li>Hücreleri 2 mL inkübasyon çözeltisinde (DMEM ortamı +% 5 FBS) yeniden süspanse edin, hücreleri otomatik hücre sayacı ile sayın ve hücre konsantrasyonunu inkübasyon çözeltisi ile 1.0 x 106 hücre / mL'ye ayarlayın.</li>
</ol>2. Hücresel lekelenme
<ol><li>Her fareden 2 mL kemik iliği hücresi süspansiyonunu 5 μg / mL Hoechst 33342 ile destekleyin. Başka bir 1 mL alikot'a, negatif kontrol olarak 100 μM verapamil ekleyin.</li>
	<li>37 ° C'de bir su banyosunda 90 dakika boyunca her 30 dakikada bir hafif çalkalama ile inkübe edin.</li>
	<li>İnkübasyondan sonra, hücreleri 5 dakika buz üzerinde soğutun ve ardından 4 ° C'de 5 dakika boyunca 250 x g'da santrifüjleyin. Hücreleri soğuk çalışan bir çözelti içinde (HBSS +% 2 FBS) yeniden süspanse edin. 4 ° C'de 5 dakika santrifüjleyin ve süpernatanı atın.</li>
	<li>Elde edilen hücre peletini numune başına 500 μL çalışan çözelti içinde yeniden süspanse edin. FCM analizinden önce, hücreleri 2 μg / mL propidyum iyodür (PI) ile destekleyin ve yaklaşık 5 dakika boyunca buzun üzerine koyun.</li>
</ol>3. Akış sitometrisi
NOT: Kullanılan çeşitli sistemlerin ve konfigürasyonların bir özeti için lütfen Tablo 1'e bakın.
<ol><li>FCM'lerde günlük kalite kontrol (QC) florosferlerini kullanarak gerekli kanalların Varyasyon Katsayısı (CV) değerlerini kalibre edin ve kalite kontrolünün başarıyla tamamlanmasını takiben numune testi yapın.<ol><li>Yazılımın masaüstü kısayolunu seçin ve yazılımı başlatın.</li>
		<li>QC deneyine erişmek için QC/Standardization (Kalite Kontrol/ Standartlaştırma) menüsünde Start QC/Standardization (Kalite Kontrolünü Başlat) öğesini seçin.</li>
		<li>QC florosfer numune tüpünü tüp tutucuya yerleştirin.</li>
		<li>Örneği yüklemek ve QC prosedürünü çalıştırmaya başlamak için Başlat'ı seçin. FCM'ler, kalite kontrol geçtikten sonra kullanıma hazırdır.</li>
	</ol></li>
	<li>690/50 nm kanalında Hoechst kırmızısı ve 450/50 nm kanalında Hoechst mavisinin tespiti için aynı numunelerin Hoechst 33342 boyasını sırasıyla 355 nm, 375 nm ve 450 nm lazerle uyarın.<ol><li>Dosya menüsünde Yeni Deneme'yi seçerek yeni bir deneme oluşturun, dosya yolunu belirtin ve denemeyi kaydedin.</li>
		<li>Ayarlar menüsünde Kanal Ayarla'yı seçin. Kanal sinyali onay kutusunu seçin (Y585, V450, V660, NUV450, NUV660, UV450, UV660), ardından Etiket sütununa reaktif adını ekleyin (Y585: PI; V450: Hoechst Mavisi-405 nm; V660: Hoechst kırmızı-405 nm; NUV450: Hoechst Mavisi-375 nm; NUV660: Hoechst Mavisi-375 nm; UV450: Hoechst Mavisi-355nm; UV660: Hoechst Mavisi-355 nm).</li>
		<li>Çizimler oluşturmak için çizim alanındaki Sahte Renk Grafikleri simgelerini tıklatın. Hangi kanalın görüntüleneceğini değiştirmek için bir eksen adı seçin.</li>
		<li>Yeni numune tüpleri oluşturmak ve adlarını değiştirmek için Test Tüpü ekranında Tüp Ekle'ye tıklayın.</li>
		<li>Örneği yüklemek, grafikleri görüntülemek ve geçitleri oluşturmak için Çalıştır'ı seçin. Kazanç ve eşik ayarlarını yapın. Verileri kaydetmek için Kaydet'i seçin.</li>
	</ol></li>
	<li>Kapı ayar mantığını tasarlayın.<ol><li>İlk çizim için, FSC-W'yi seçmek için X eksenine tıklayın ve FSC-A'yı seçmek için Y eksenine tıklayın. Tek tek hücreyi daire içine almak ve bitişik hücreleri dışlamak için A kapısını çizmek için Çokgen Kapısı'nı seçin (Şekil 1A).</li>
		<li>İkinci çizim için, FSC-A'yı seçmek için X eksenine tıklayın ve SSC-A'yı seçmek için Y eksenine tıklayın. Parçalı olmayan hücreleri ayırmak ve hücresel kalıntıları dışlamak için B kapısını çizmek için Çokgen Kapısı'nı seçin (Şekil 1B).</li>
		<li>Üçüncü çizim için, PI-A'yı seçmek için X eksenine tıklayın ve SSC-A'yı seçmek için Y eksenine tıklayın. D kapısını çizmek için Çokgen Kapısını seçin. Negatif PI sergileyen Canlı hücreleri seçin (Şekil 1C) ve canlı hücreler elde etmek için C kapısını çizin.</li>
		<li>Dördüncü iki boyutlu çizim için, Hoechst Red'i seçmek için X eksenine tıklayın ve Hoechst Blue'yu seçmek için Y eksenine tıklayın. Grafiği sağ tıklayın ve açılır menüden Özellik'i seçin. Doğrusal Biçim f'yiveya hem X ekseni hem de Y eksenini seçin. SP hücrelerini almak için SP kapısını çizmek için Çokgen Kapısı'nı seçin (Şekil 1D).</li>
	</ol></li>
	<li>Numune uygunluğunu değerlendirmek için, SP hücresi tespiti için 355 nm spesifik bir akış sitometresi23 kullanın.</li>
	<li>Hem kontrol hücrelerini (verapamil eklenmiş) hem de deney hücrelerini tespit etmek için 355 nm (lazer gücü: 20 mW) ve 405 nm (lazer gücü: 80 mW) lazerleri aynı anda kullanın.</li>
	<li>İki lazere karşılık gelen 690/50 nm ve 450/50 nm kanallarında floresan sinyalleri elde edin. Hoechst 33342 boyasının berrak SP hücreleri ile 355 nm ve 405 nm lazerlerle etkili stimülasyonunu gözlemleyin (Şekil 2B-C).</li>
	<li>Aynı numuneler için, hücre tespiti için 375 nm (lazer gücü: 60 mW) ve 405 nm (lazer gücü: 80 mW) lazerleri kullanın.</li>
</ol>

Kolay yan popülasyon hücresi tespiti için alternatif lazer uyarma yöntemi

<ol>
	<li>Goodell, M. A., Brose, K., Paradis, G., Conner, A. S., Mulligan, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+and+functional+properties+of+murine+hematopoietic+stem+cells+that+are+replicating+in+vivo.">Isolation and functional properties of murine hematopoietic stem cells that are replicating in vivo.</a> J Exp Med. 183 (4), 1797-1806 (1996).</li><li>Zhou, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+ABC+transporter+Bcrp1/ABCG2+is+expressed+in+a+wide+variety+of+stem+cells+and+is+a+molecular+determinant+of+the+side-population+phenotype.">The ABC transporter Bcrp1/ABCG2 is expressed in a wide variety of stem cells and is a molecular determinant of the side-population phenotype.</a> Nat Med. 7 (9), 1028-1034 (2001).</li><li>Camargo, F. D., Chambers, S. M., Drew, E., McNagny, K. M., Goodell, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hematopoietic+stem+cells+do+not+engraft+with+absolute+efficiencies.">Hematopoietic stem cells do not engraft with absolute efficiencies.</a> Blood. 107 (2), 501-507 (2006).</li><li>Challen, G. A., Boles, N. C., Chambers, S. M., Goodell, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Distinct+hematopoietic+stem+cell+subtypes+are+differentially+regulated+by+TGF-beta1.">Distinct hematopoietic stem cell subtypes are differentially regulated by TGF-beta1.</a> Cell Stem Cell. 6 (3), 265-278 (2010).</li><li>Asakura, A., Seale, P., Girgis-Gabardo, A., Rudnicki, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Myogenic+specification+of+side+population+cells+in+skeletal+muscle.">Myogenic specification of side population cells in skeletal muscle.</a> J Cell Biol. 159 (1), 123-134 (2002).</li><li>Terrace, J. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Side+population+cells+in+developing+human+liver+are+primarily+haematopoietic+progenitor+cells.">Side population cells in developing human liver are primarily haematopoietic progenitor cells.</a> Exp Cell Res. 315 (13), 2141-2153 (2009).</li><li>Martin, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Adult+lung+side+population+cells+have+mesenchymal+stem+cell+potential.">Adult lung side population cells have mesenchymal stem cell potential.</a> Cytotherapy. 10 (2), 140-151 (2008).</li><li>Challen, G. A., Bertoncello, I., Deane, J. A., Ricardo, S. D., Little, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kidney+side+population+reveals+multilineage+potential+and+renal+functional+capacity+but+also+cellular+heterogeneity.">Kidney side population reveals multilineage potential and renal functional capacity but also cellular heterogeneity.</a> J Am Soc Nephrol. 17 (7), 1896-1912 (2006).</li><li>Mouthon, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neural+stem+cells+from+mouse+forebrain+are+contained+in+a+population+distinct+from+the+'side+population'.">Neural stem cells from mouse forebrain are contained in a population distinct from the 'side population'.</a> J Neurochem. 99 (3), 807-817 (2006).</li><li>Cordon-Cardo, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cancer+stem+cells.">Cancer stem cells.</a> Ann Oncol. 21 (Suppl 7), 93-94 (2010).</li><li>Lapidot, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+cell+initiating+human+acute+myeloid+leukaemia+after+transplantation+into+SCID+mice.">A cell initiating human acute myeloid leukaemia after transplantation into SCID mice.</a> Nature. 367 (6464), 645-648 (1994).</li><li>Yun, E. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Targeting+cancer+stem+cells+in+castration-resistant+prostate+cancer.">Targeting cancer stem cells in castration-resistant prostate cancer.</a> Clin Cancer Res. 22 (3), 670-679 (2016).</li><li>Lupia, M., Cavallaro, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ovarian+cancer+stem+cells:+still+an+elusive+entity.">Ovarian cancer stem cells: still an elusive entity.</a> Mol Cancer. 16 (1), 64 (2017).</li><li>Zhao, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=AQP5+complements+LGR5+to+determine+the+fates+of+gastric+cancer+stem+cells+through+regulating+ULK1+ubiquitination.">AQP5 complements LGR5 to determine the fates of gastric cancer stem cells through regulating ULK1 ubiquitination.</a> J Exp Clin Cancer Res. 41 (1), 322 (2022).</li><li>Liu, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+novel+lncRNA+ROPM-mediated+lipid+metabolism+governs+breast+cancer+stem+cell+properties.">A novel lncRNA ROPM-mediated lipid metabolism governs breast cancer stem cell properties.</a> J Hematol Oncol. 14 (1), 178 (2021).</li><li>Ho, M. M., Ng, A. V., Lam, S., Hung, J. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Side+population+in+human+lung+cancer+cell+lines+and+tumors+is+enriched+with+stem-like+cancer+cells.">Side population in human lung cancer cell lines and tumors is enriched with stem-like cancer cells.</a> Cancer Res. 67 (10), 4827-4833 (2007).</li><li>Chiba, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Side+population+purified+from+hepatocellular+carcinoma+cells+harbors+cancer+stem+cell-like+properties.">Side population purified from hepatocellular carcinoma cells harbors cancer stem cell-like properties.</a> Hepatology. 44 (1), 240-251 (2006).</li><li>Haraguchi, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+a+side+population+of+cancer+cells+from+human+gastrointestinal+system.">Characterization of a side population of cancer cells from human gastrointestinal system.</a> Stem Cells. 24 (3), 506-513 (2006).</li><li>Zhou, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Activation+of+the+PTEN/mTOR/STAT3+pathway+in+breast+cancer+stem-like+cells+is+required+for+viability+and+maintenance.">Activation of the PTEN/mTOR/STAT3 pathway in breast cancer stem-like cells is required for viability and maintenance.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 104 (41), 16158-16163 (2007).</li><li>Ota, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=ADAM23+is+downregulated+in+side+population+and+suppresses+lung+metastasis+of+lung+carcinoma+cells.">ADAM23 is downregulated in side population and suppresses lung metastasis of lung carcinoma cells.</a> Cancer Sci. 107 (4), 433-443 (2016).</li><li>Wang, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=ALCAM+regulates+multiple+myeloma+chemoresistant+side+population.">ALCAM regulates multiple myeloma chemoresistant side population.</a> Cell Death Dis. 13 (2), 136 (2022).</li><li>Wang, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Homoharringtonine+synergizes+with+quizartinib+in+FLT3-ITD+acute+myeloid+leukemia+by+targeting+FLT3-AKT-c-Myc+pathway.">Homoharringtonine synergizes with quizartinib in FLT3-ITD acute myeloid leukemia by targeting FLT3-AKT-c-Myc pathway.</a> Biochem Pharmacol. 188, 114538 (2021).</li><li>Dong, X. L., Wei, Y. Y., Xu, T., Tan, X. Y., Li, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+of+side+population+in+solid+tumor+cell+lines.">Analysis of side population in solid tumor cell lines.</a> J Vis Exp. (168), e60658 (2021).</li><li>Bhowmick, D., Sheridan, R. T. C., Bushnell, T. P., Spalding, K. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Practical+guidelines+for+optimization+and+characterization+of+the+Beckman+Coulter+CytoFLEX+platform.">Practical guidelines for optimization and characterization of the Beckman Coulter CytoFLEX platform.</a> Cytom Part A. 97 (8), 800-810 (2020).</li></ol>

Herhangi bir çıkar çatışması beyan edilmedi.

Her biri 3-4 fare içeren ve toplam 10 fare ile sonuçlanan üç deney yapmak için açıklanan protokolü kullandık. SP hücrelerinin oranı %0.05 ile %0.76 arasında değişmektedir. Fareler arasında bireysel farklılıkların gözlendiğine dikkat etmek önemlidir. Hoechst örneklerini analiz etmek için dört akış sitometresi kullandık. Akış sitometrisinin yeni versiyonunda 20 mW 355 nm'lik bir lazerle Hoechst boyasının uyarılmasının, eski moda akış sitometrisindeki 100 mW 355 nm'lik bir lazere eşdeğe...

Yan popülasyon (SP) hücreleri, Hoechst 33342 boyama ile tanımlanır ve akış sitometrisi (FCM) kullanılarak analiz edilir. SP hücreleri, floresan DNA boyasının ATP bağlayıcı kaset (ABC) taşıyıcıları 1,2 aracılığıyla hücrelerden dışarı pompalanması ile karakterize edilir. Yöntem başlangıçta murin kemik iliği hematopoetik kök hücrelerini (HSC'ler) izole etmek için kurulmuştur1. Kemik iliği SP hücreleri, CD117 + Sca-1 + Lin-Thy1 düşük ekspresyonu 3,4 ile karakterize edilen bir HSC popülasyonu ile zenginleştirildi. Daha sonra yöntem, kalp kası5, karaciğer6, akciğer7, böbrek8 ve ön beyin9 dahil olmak üzere diğer dokulardan kök hücreleri izole etmek ve zenginleştirmek için yaygın olarak kullanıldı. Özellikle, yöntem son on yılda kanser kök hücrelerini (CSC'ler) izole etmek için uygulanmıştır. CSC'ler, tümör başlatma, kendini yenileme, kemoterapiye direnç ve metastatik potansiyel özelliklerine sahip küçük bir hücre popülasyonunu temsil eder10. CSC'ler ilk olarak hematopoetik malignitelerde11 tanımlanmış ve daha sonra prostat12, over13, mide14, meme15 ve akciğer16 karsinomu gibi çeşitli solid tümörlerde gözlenmiştir. CSC tanımlaması için çeşitli tekniklerin mevcut olmasına rağmen, SP tekniği, çeşitli dokular ve hücre hatları boyunca geniş uygulanabilirliği nedeniyle tercih edilen bir seçenek olmaya devam etmektedir. Ayrıca, floresanla aktive edilen hücre sıralama (FACS) kullanarak CSC'leri izole eden değerli bir tekniktir16,17,18. Deneysel bulgular, SP hücrelerinin belirgin tümörjenite sergilediğini ve kök hücre ile ilişkili genlerin yüksek ekspresyon seviyelerini gösterdiğini göstermektedir19,20. Önceki çalışmamız21 ayrıca, multipl miyelomda izole SP hücrelerinin transkriptomik analizinin, kirpi yolu gibi kök hücrelerle ilişkili sinyal yollarının zenginleşmesini ortaya çıkardığını göstermiştir. Bu arada, akut miyeloid lösemi22'nin SP hücrelerinde diferansiyel olarak eksprese edilen genler üzerinde yol zenginleştirme analizleri yaptık. Değiştirilmiş genler, kök hücre ile ilgili yolaklarda (Wnt / β-katenin, TGF-β, Kirpi, Çentik) zenginleştirildi. 1 x 105 SP hücrelerinin BALB / c boş farelerde22 tümör oluşturabildiğini, SP olmayan hücrelerin ise oluşturamadığını bulduk, bu da SP hücrelerinin lösemi kök hücrelerinin özelliklerine sahip olduğunu gösteriyor. CSC'lerin tanımlanmasında Hoechst SP yönteminin etkinliği açıktır.
Hoechst SP protokolü, araştırmanın ilerlemesi yoluyla rafine edilmiş ve geliştirilmiştir. Protokol, boya konsantrasyonunun, hücre yoğunluğunun, inkübasyon sıcaklığının ve süresinin, tampon bileşiminin ve pH değerinin sıkı kontrolünü gerektirir. Bu protokole uygun olarak hazırlanan hücre örnekleri akım sitometrik analize tabi tutuldu. Hoechst boyasının 355 nm'de bir UV lazerle uyarılması ve hem 690/50 nm filtre (Hoechst Red) hem de 450/50 nm filtre (Hoechst Blue) kullanılarak floresan emisyonunun tespit edilmesi nedeniyle, FCM için 350 nm'lik bir lazer gereklidir. Bununla birlikte, 350 nm lazerler, yüksek maliyetleri nedeniyle çoğu FCM'de yaygın olarak donatılmamaktadır. Bu nedenle, SP hücrelerinin akış sitometrisi ile etkili bir şekilde saptanması için boya uyarımı için alternatif bir yaklaşım bulmaya çalıştık. Bu çalışmada, 375 nm ve 405 nm lazerlerin SP hücrelerini tespit etme yeteneği değerlendirildi ve 355 nm lazer ile karşılaştırıldı. Bulgularımız, 355 nm, 375 nm ve 405 nm lazerler tarafından tespit edilen SP hücreleri arasında dikkate değer bir benzerlik olduğunu göstermektedir. Bu sonuçlar, yüksek güçlü 375 nm ve 405 nm lazerlerin, SP hücre tespiti için 355 nm lazere uygun alternatifler olarak hizmet edebileceğini göstermektedir. Hoechst 33342 için ek uyarma ışık kaynaklarının dahil edilmesi, daha fazla akış sitometrisi modelinin kullanılmasını kolaylaştırır.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Automatic cell counter</td>
			<td>Countstar</td>
			<td>1M1200</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cell Filter(100 &#181;m)</td>
			<td>BIOFIL</td>
			<td>CSS-013-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Daily quality control fluorospheres</td>
			<td>Beckman Coulter</td>
			<td>B5230</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dulbecco&#39;s Modification of Eagle&#39;s Medium with 4.5g/L glucose (DMEM medium)</td>
			<td>CORNING</td>
			<td>10-013-CVRC</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fetal bovine serum</td>
			<td>CORNING</td>
			<td>35-081-CV</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HBSS</td>
			<td>Hyclone</td>
			<td>SH30030.02</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hoechst 33342</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>B2261</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Propidium iodide (PI)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>P4170</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Red blood cell lysis buffer</td>
			<td>Beyotime</td>
			<td>C3702</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Verapamil</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>V4629</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

effective detection of hoechst side population cells by flow cytometry

Yan popülasyon (SP) hücreleri, Hoechst 33342 boyama ile tanımlanır ve akış sitometrisi (FCM) kullanılarak analiz edilir. Hoechst SP yöntemi, ATP bağlayıcı kaset (ABC) taşıyıcılarının boya akış özelliklerine dayalı olarak kök hücrelerin izolasyonu için kullanılır. Yöntem başlangıçta hematopoetik kök hücrelerin (HSC'ler) tanımlanması ve izolasyonu için kullanıldı, ancak şimdi öncelikle kanser kök hücrelerinin (CSC'ler) tanımlanması ve izolasyonuna odaklanmak için gelişti. FCM'nin geleneksel algılama yöntemi, SP hücrelerini tespit etmek için boyayı uyarmak için 355 nm'lik bir lazer kullanır. Bu çalışma sayesinde, 355 nm lazer kullanarak SP hücrelerinin tespitinin yerini alabilecek boya uyarımı için alternatif yaklaşımları başarıyla belirledik. Bu, yüksek güçlü 375 nm veya 405 nm lazerlerin kullanılmasıyla elde edilir. Bu, yalnızca 355 nm lazer akış sitometrisi ile sınırlı kalmak yerine, SP hücrelerinin tespitinde gelişmiş seçicilik uygulamamıza izin verir.

The side population (SP) cells are identified through Hoechst 33342 staining and analyzed using flow cytometry (FCM). The SP cells are characterized by the pumping of the fluorescent DNA dye out of the cells through their ATP-binding cassette (ABC) transporter1,2. The method was originally established for isolating murine bone marrow hematopoietic stem cells (HSCs)1. The bone marrow SP cells were enriched with a population of HSCs characterized by &#160;CD117+Sca-1+Lin-Thy1low&#160;expression3,4. Thereafter, the method was widely used to isolate and enrich stem cells from other tissues, including cardiac muscle5, liver6, lung7, kidney8, and forebrain9. In particular, the method has been applied to isolate cancer stem cells (CSCs) in the past decade. CSCs represent a small population of cells that possess the properties of tumor initiation, self-renewal, resistance to chemotherapy, and metastatic potential10. CSCs were initially identified in hematopoietic malignancies11 and subsequently observed in various solid tumors such as the prostate12, ovarian13, gastric14, breast15, and lung16 carcinomas. Despite the availability of various techniques for CSC identification, the SP technique remains a favored choice owing to its broad applicability across diverse tissues and cell lines. Moreover, it is a valuable technique that isolates CSCs using fluorescence-activated cell sorting (FACS)16,17,18. The experimental findings demonstrate that SP cells exhibit pronounced tumorigenicity and display elevated expression levels of stem cell-associated genes19,20. Our previous study21 has also demonstrated that transcriptomic analysis of isolated SP cells in multiple myeloma reveals enrichment of signaling pathways associated with stem cells, such as the hedgehog pathway. Meanwhile, we performed pathway enrichment analyses on the genes differentially expressed in the SP cells of acute myelogenous leukemia22. The altered genes were enriched in stem cell-related pathways (Wnt/&#946;-catenin, TGF-&#946;, Hedgehog, Notch). We found that 1 x 105 SP cells could form tumors in BALB/c null mice22, whereas non-SP cells could not, indicating that SP cells had characteristics of leukemia stem cells. The efficacy of the Hoechst SP method in the identification of CSCs is evident.
The Hoechst SP protocol has been refined and enhanced through the progression of research. The protocol entails stringent control of the dye concentration, cell density, incubation temperature and duration, buffer composition, and pH value. The cell samples prepared in accordance with this protocol were subjected to flow cytometric analysis. Due to the excitation of Hoechst dye with a UV laser at 355 nm and detection of its fluorescence emission using both a 690/50 nm filter (Hoechst Red) and 450/50 nm filter (Hoechst Blue), a 350 nm laser is required for FCM. However, 350 nm lasers are not commonly equipped in most FCMs because of their high cost. Hence, we attempted to find an alternate approach for&#160;dye excitation for the effective detection of SP cells by flow cytometry. In this study, the capability of the 375 nm and 405 nm lasers in detecting SP cells was assessed and compared with that of the 355 nm laser. Our findings demonstrate a remarkable similarity between the SP cells detected by the 355 nm, 375 nm, and 405 nm lasers. These results suggest that the high-power 375 nm and 405 nm lasers can serve as feasible alternatives to the 355 nm laser for SP cell detection. The inclusion of additional excitation light sources for Hoechst 33342 facilitates the use of more flow cytometry models.

Yazar Spotlight: Yan Popülasyon Hücrelerini Analiz Etmek için Hoechst Boyama için Yenilikçi Lazer Teknikleri

Hoechst Yan Popülasyon Hücrelerinin Akış Sitometrisi ile Etkili Tespiti

Şekil 2'de, kontrol grubu, Hoechst 33342'nin eliminasyonunu önlemek için kök hücrelerde ABC taşıyıcılarını bloke eden verapamil ile tedavi edildi. Böylece, verapamil olmayan gruptaki kök hücreler Hoechst 33342'yi dışarı atar ve SP hücreleri olarak bilinen negatif bir hücre popülasyonu oluşturur. 355 nm lazer, Hoechst 33342 boyasını etkili bir şekilde uyardı ve kemik iliğinin SP hücrelerinin net bir şekilde gözlemlenmesine neden oldu (Şekil 2...

Burada, yüksek güçlü 375 nm ve 405 nm lazerlerin Hoechst 33342'yi etkili bir şekilde uyarabileceğini ve yan popülasyon (SP) hücre tespiti için 355 nm lazere uygun bir alternatif olarak hizmet edebileceğini ve böylece akış sitometrisi uygulamalarında mevcut lazer yelpazesini genişletebileceğini gösteriyoruz.

The side population (SP) cells are identified through Hoechst 33342 staining and analyzed using flow cytometry (FCM). The Hoechst SP method is utilized ...

effective-detection-of-hoechst-side-population-cells-by-flow-cytometry

Research

JoVE Journal

Cancer Research

Effective Detection of Hoechst Side Population Cells by Flow Cytometry

578 Görüntüleme.  Sichuan University. Tümör başlatan hücreleri tespit etmek için Hoechst boyama popülasyonu yöntemini kullanıyoruz. Bu yazıda, Hoechst uyarımı için alternatif yaklaşımlar bulmaya çalışıyoruz. Yüksek güçlü 375 nanometre ve 405 nanometre lazerlerin, geleneksel 355 milimetre lazere uygun alternatifler olarak hizmet edebileceğini gördük.Geleneksel olarak, Hoechst boyası 355 nanometrede bir UV lazeri ile uyarılır. UV lazerlerin yüksek maliyeti nedeni...

Video: Yazar Spotlight: Yan Popülasyon Hücrelerini Analiz Etmek için Hoechst Boyama için Yenilikçi Lazer Teknikleri

The side population (SP) cells are identified through Hoechst 33342 staining and analyzed using flow cytometry (FCM). The Hoechst SP method is utilized for the isolation of stem cells based on the dye efflux properties of ATP-binding cassette (ABC) transporters. The method was initially employed for the identification and isolation of hematopoietic stem cells (HSCs), but it has now evolved to primarily focus on the identification and isolation of cancer stem cells (CSCs). The traditional detection method of FCM uses a 355 nm laser to excite the dye to detect SP cells. Through this study, we have successfully identified alternative approaches for dye excitation that can effectively replace the detection of SP cells using a 355 nm laser. This is achieved through the utilization of high-power 375 nm or 405 nm lasers. This allows us to exercise enhanced selectivity in the detection of SP cells rather than being solely limited to the 355 nm laser flow cytometry.

Here, we show that high-power 375 nm and 405 nm lasers can effectively excite Hoechst 33342 and serve as a viable alternative to the 355 nm laser for side population (SP) cell detection, thereby expanding the range of available lasers in flow cytometry applications.